Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9545
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9545, 543 aa
1>>>pF1KB9545 543 - 543 aa - 543 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5228+/-0.00117; mu= -1.3215+/- 0.068
mean_var=370.3074+/-92.867, 0's: 0 Z-trim(109.3): 463 B-trim: 574 in 1/54
Lambda= 0.066649
statistics sampled from 10246 (10823) to 10246 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.332), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13799.1 ZNF280B gene_id:140883|Hs108|chr22 ( 543) 3699 370.6 2.6e-102
CCDS13800.1 ZNF280A gene_id:129025|Hs108|chr22 ( 542) 1919 199.5 8.6e-51
CCDS42041.1 ZNF280D gene_id:54816|Hs108|chr15 ( 966) 1433 153.0 1.5e-36
CCDS32245.1 ZNF280D gene_id:54816|Hs108|chr15 ( 979) 1433 153.1 1.5e-36
CCDS14622.1 ZNF280C gene_id:55609|Hs108|chrX ( 737) 1320 142.0 2.3e-33
CCDS44222.2 POGZ gene_id:23126|Hs108|chr1 (1315) 990 110.6 1.2e-23
CCDS53365.1 POGZ gene_id:23126|Hs108|chr1 (1348) 990 110.6 1.2e-23
CCDS998.1 POGZ gene_id:23126|Hs108|chr1 (1357) 990 110.6 1.2e-23
CCDS53366.1 POGZ gene_id:23126|Hs108|chr1 (1401) 990 110.6 1.2e-23
CCDS997.1 POGZ gene_id:23126|Hs108|chr1 (1410) 990 110.6 1.2e-23
>>CCDS13799.1 ZNF280B gene_id:140883|Hs108|chr22 (543 aa)
initn: 3699 init1: 3699 opt: 3699 Z-score: 1950.3 bits: 370.6 E(32554): 2.6e-102
Smith-Waterman score: 3699; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEQSCEEEKEPEPQKNIQETKQVDDEDAELIFVGVEHVNEDAELIFVGVTSNSKPVVSNI
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CCDS13 MEQSCEEEKEPEPQKNIQETKQVDDEDAELIFVGVEHVNEDAELIFVGVTSNSKPVVSNI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LNRVTPGSWSRRKKYDHLRKDTARKLQPKSHETVTSEAVTVLPASQLESRSTDSPIIIEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LNRVTPGSWSRRKKYDHLRKDTARKLQPKSHETVTSEAVTVLPASQLESRSTDSPIIIEP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LSKPDYRNSSPQVVPNNSSELPSPLITFTDSLHHPVSTALSVGGINESPRVSKQLSTFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSKPDYRNSSPQVVPNNSSELPSPLITFTDSLHHPVSTALSVGGINESPRVSKQLSTFEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NSINPKRAKLRDGIIEGNSSASFPSDTFHTMNTQQSTPSNNVHTSLSHVQNGAPFPAAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NSINPKRAKLRDGIIEGNSSASFPSDTFHTMNTQQSTPSNNVHTSLSHVQNGAPFPAAFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KDNIHFKPINTNLDRANELAKTDILSLTSQNKTFDPKKENPIVLLSDFYYGQHKGEGQPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KDNIHFKPINTNLDRANELAKTDILSLTSQNKTFDPKKENPIVLLSDFYYGQHKGEGQPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QKTHTTFKCLSCVKVLKNVKFMNHVKHHLEFEKQRNDSWENHTTCQHCHRQFPTPFQLQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QKTHTTFKCLSCVKVLKNVKFMNHVKHHLEFEKQRNDSWENHTTCQHCHRQFPTPFQLQC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 HIENVHTAQEPSTVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEMPYVCQVCHYRSSVFADVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HIENVHTAQEPSTVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEMPYVCQVCHYRSSVFADVET
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HFRTCHENTKNLLCPFCLKIFKTATPYMCHYRGHWGKSAHQCSKCRLQFLTFKEKMEHKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HFRTCHENTKNLLCPFCLKIFKTATPYMCHYRGHWGKSAHQCSKCRLQFLTFKEKMEHKT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 QCHQMFKKPKQLEGLPPETKVTIQVSLEPLQPGSVDVASITVSTSDSEPSLPRSKSKISK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QCHQMFKKPKQLEGLPPETKVTIQVSLEPLQPGSVDVASITVSTSDSEPSLPRSKSKISK
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KSH
:::
CCDS13 KSH
>>CCDS13800.1 ZNF280A gene_id:129025|Hs108|chr22 (542 aa)
initn: 2067 init1: 1596 opt: 1919 Z-score: 1025.3 bits: 199.5 E(32554): 8.6e-51
Smith-Waterman score: 2224; 65.6% identity (80.7% similar) in 535 aa overlap (8-537:8-525)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEQSCEEEKEPEPQKNIQETKQV--DDEDAELIFVGVEHVNEDAELIFVGVTSNSKPVVS
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CCDS13 MGDIFLCKKVESPKKNLRESKQREEDDEDPDLIYVGVEHVHRDAEVLFVGMISNSKPVVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 NILNRVTPGSWSRRKKYDHLRKDTARKLQPKSHETVTSEAVTVLPASQLESRSTDSPIII
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CCDS13 NILNRVTPGSNSRRKK-GHFRQYPAHVSQPANH--VTSMAKAIMPVSLSEGRSTDSPVTM
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 EPLSKPDYRNSSPQVV-PNNSSELPSPLITFTDSLHHPVSTALSVGGINESPRVSKQLST
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CCDS13 KSSSEPGYKMSSPQVVSPSSSDSLPPG----TQCL---VGAMVSGGGRNESSPDSKRLST
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 FEVNSINPKRAKLRDGIIEGNSSASFPSDTFHTMNTQQSTPSNNVHTSLSHVQNGAPFPA
..:: . ::.:::::: : : ::: :..: .:::... .: .:::::. ::
CCDS13 SDINSRDSKRVKLRDGIPGVPSLAVVPSDMSSTIST--NTPSQGICNSSNHVQNGVTFPW
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 AFPKDNIHFKPINTNLDRANE--LAKTDILSLTSQNKTFDPKKENPIVLLSDFYYGQHKG
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CCDS13 PDANGKAHFNL--TDPERASESALAMTDISSLASQNKTFDPKKENPIVLLSDFYYGQHKG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 EGQPEQKTHTTFKCLSCVKVLKNVKFMNHVKHHLEFEKQRNDSWENHTTCQHCHRQFPTP
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CCDS13 DGQPEQKTHTTFKCLSCVKVLKNIKFMNHMKHHLEFEKQRNDSWEDHTTCQHCHRQFPTP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 FQLQCHIENVHTAQEPSTVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEMPYVCQVCHYRSSVF
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CCDS13 FQLQCHIDSVHIAMGPSAVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEMPYVCQVCHYRSSVF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 ADVETHFRTCHENTKNLLCPFCLKIFKTATPYMCHYRGHWGKSAHQCSKCRLQFLTFKEK
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CCDS13 ADVETHFRTCHENTKNLLCLFCLKLFKTAIPYMNHCWRHSRRRVLQCSKCRLQFLTLKEE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 MEHKTQCHQMFKKPKQLEGLPPETKVTIQVSLEPLQPGSVDVASITVSTSDSEPSLPRSK
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CCDS13 IEHKTKDHQTFKKPEQLQGLPSETKVIIQTSV---QPGSSGMASVIVSNTDPQSSPVKTK
470 480 490 500 510 520
540
pF1KB9 SKISKKSH
.:
CCDS13 KKTAMNTRDSRLPCSKDSS
530 540
>>CCDS42041.1 ZNF280D gene_id:54816|Hs108|chr15 (966 aa)
initn: 1829 init1: 1145 opt: 1433 Z-score: 769.9 bits: 153.0 E(32554): 1.5e-36
Smith-Waterman score: 1868; 53.8% identity (76.3% similar) in 552 aa overlap (5-540:8-542)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEQSCEEEKEPEPQKNIQETKQVDDEDAELIFVGVEHVNEDAELIFVGVTSNSKPVV
:::: : :: . ...:.:.:.: : : :::: :.:::..
CCDS42 MAELFMECEEE-ELEPWQ--KKVKEVEDDD-------------DDEPIFVGEISSSKPAI
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SNILNRVTPGSWSRRKKYDHLRKDTARKLQPKSHETVTSEAVTVLPASQL----ESRSTD
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CCDS42 SNILNRVNPSSYSRGLKNGALSRGITAAFKPTSQH-YTNPTSNPVPASPINFHPESRSSD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 SPIIIEPLSKPDYRNSSPQVVPNNSSELPSPLITFTDSLHHPVSTALSVGGINESPRVSK
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CCDS42 SSVIVQPFSKPGYITNSSRVVSNKSSELLFDLTQDTGLSHYQGGPTLSMAGMSESSFLSK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 QLSTFEVNSINPKRAKLRDGIIEGNSSASFPSDTFHTMNTQQSTPSNNVHTSLSHVQNGA
. :: :::..:::. : ... .:::: .:: .....:. .....:: .. .::.
CCDS42 RPSTSEVNNVNPKKPKPSESVSGANSSAVLPSVKSPSVTSSQAMLAKGTNTSSNQSKNGT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB9 PFPAAFPKDNIHFK---PINTNL-----DRANE---LAKTDILSLTSQNKTFDPKKENPI
::: : :: ::::. :..... : :. ::::.. : ...: :.: .: . :
CCDS42 PFPRACPKCNIHFNLLDPLKNHMKYCCPDMINNFLGLAKTEFSSTVNKNTTIDSEKGKLI
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 VLLSDFYYGQHKGEGQPEQKTHTTFKCLSCVKVLKN-VKFMNHVKHHLEFEKQRNDSWEN
.:..:::::.:.:. : ::::::::::.::.:.::: ..::::.:::::.::: ..::::
CCDS42 MLVNDFYYGKHEGDVQEEQKTHTTFKCFSCLKILKNNIRFMNHMKHHLELEKQSSESWEN
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 HTTCQHCHRQFPTPFQLQCHIENVHTAQEPSTVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEM
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CCDS42 HTTCQHCYRQFPTPFQLQCHIESTHTPHEFSTICKICELSFETEHVLLQHMKDNHKPGEM
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 PYVCQVCHYRSSVFADVETHFRTCHENTKNLLCPFCLKIFKTATPYMCHYRGHWGKSAHQ
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CCDS42 PYVCQVCNYRSSSFSDVETHFRTSHENTKNLLCPFCLKVIKIATPYMHHYMKHQKKGIHR
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 CSKCRLQFLTFKEKMEHKTQCHQMFKKPKQLEGLPPETKVTIQVSLEPLQPGSVDVASIT
:.:::::::: ::::.:::: :. : :::::::::: :::::..:. ::: :. . ::.
CCDS42 CTKCRLQFLTCKEKMDHKTQHHRTFIKPKQLEGLPPGTKVTIRASVGPLQSGASPTPSIS
470 480 490 500 510 520
530 540
pF1KB9 VSTSDSEPSLPRSKSKISKKSH
.:.: . : ::.:. .:
CCDS42 ASASTLQLSPPRTKNITAKNPAKSNTSKPNTVKSNASKPNTSKPNGSKSKYKPKISNMQK
530 540 550 560 570 580
>>CCDS32245.1 ZNF280D gene_id:54816|Hs108|chr15 (979 aa)
initn: 1829 init1: 1145 opt: 1433 Z-score: 769.9 bits: 153.1 E(32554): 1.5e-36
Smith-Waterman score: 1868; 53.8% identity (76.3% similar) in 552 aa overlap (5-540:21-555)
10 20 30 40
pF1KB9 MEQSCEEEKEPEPQKNIQETKQVDDEDAELIFVGVEHVNEDAEL
:::: : :: . ...:.:.:.: : :
CCDS32 MGDNPFQPKSNSKMAELFMECEEE-ELEPWQ--KKVKEVEDDD-------------DDEP
10 20 30 40
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 IFVGVTSNSKPVVSNILNRVTPGSWSRRKKYDHLRKDTARKLQPKSHETVTSEAVTVLPA
:::: :.:::..:::::::.:.:.:: : : . . ..: :.. :. . . .::
CCDS32 IFVGEISSSKPAISNILNRVNPSSYSRGLKNGALSRGITAAFKPTSQH-YTNPTSNPVPA
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 SQL----ESRSTDSPIIIEPLSKPDYRNSSPQVVPNNSSELPSPLITFTDSLHHPVSTAL
: . ::::.:: .:..:.::: : ..: .:: :.:::: : : :. . .:
CCDS32 SPINFHPESRSSDSSVIVQPFSKPGYITNSSRVVSNKSSELLFDLTQDTGLSHYQGGPTL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 SVGGINESPRVSKQLSTFEVNSINPKRAKLRDGIIEGNSSASFPSDTFHTMNTQQSTPSN
:..:..:: .::. :: :::..:::. : ... .:::: .:: .....:. ..
CCDS32 SMAGMSESSFLSKRPSTSEVNNVNPKKPKPSESVSGANSSAVLPSVKSPSVTSSQAMLAK
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260
pF1KB9 NVHTSLSHVQNGAPFPAAFPKDNIHFK---PINTNL-----DRANE---LAKTDILSLTS
...:: .. .::.::: : :: ::::. :..... : :. ::::.. : ..
CCDS32 GTNTSSNQSKNGTPFPRACPKCNIHFNLLDPLKNHMKYCCPDMINNFLGLAKTEFSSTVN
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 QNKTFDPKKENPIVLLSDFYYGQHKGEGQPEQKTHTTFKCLSCVKVLKN-VKFMNHVKHH
.: :.: .: . :.:..:::::.:.:. : ::::::::::.::.:.::: ..::::.:::
CCDS32 KNTTIDSEKGKLIMLVNDFYYGKHEGDVQEEQKTHTTFKCFSCLKILKNNIRFMNHMKHH
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 LEFEKQRNDSWENHTTCQHCHRQFPTPFQLQCHIENVHTAQEPSTVCKICELSFETDQVL
::.::: ..:::::::::::.::::::::::::::..:: .: ::.::::::::::..::
CCDS32 LELEKQSSESWENHTTCQHCYRQFPTPFQLQCHIESTHTPHEFSTICKICELSFETEHVL
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 LQHMKDHHKPGEMPYVCQVCHYRSSVFADVETHFRTCHENTKNLLCPFCLKIFKTATPYM
::::::.:::::::::::::.:::: :.:::::::: ::::::::::::::..: :::::
CCDS32 LQHMKDNHKPGEMPYVCQVCNYRSSSFSDVETHFRTSHENTKNLLCPFCLKVIKIATPYM
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 CHYRGHWGKSAHQCSKCRLQFLTFKEKMEHKTQCHQMFKKPKQLEGLPPETKVTIQVSLE
:: : :. :.:.:::::::: ::::.:::: :. : :::::::::: :::::..:.
CCDS32 HHYMKHQKKGIHRCTKCRLQFLTCKEKMDHKTQHHRTFIKPKQLEGLPPGTKVTIRASVG
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540
pF1KB9 PLQPGSVDVASITVSTSDSEPSLPRSKSKISKKSH
::: :. . ::..:.: . : ::.:. .:
CCDS32 PLQSGASPTPSISASASTLQLSPPRTKNITAKNPAKSNTSKPNTVKSNASKPNTSKPNGS
530 540 550 560 570 580
CCDS32 KSKYKPKISNMQKKQSTLASSNKKSKVNTALRNLRYRRGIHKCIECCSEIKDFANHFPTY
590 600 610 620 630 640
>>CCDS14622.1 ZNF280C gene_id:55609|Hs108|chrX (737 aa)
initn: 1082 init1: 949 opt: 1320 Z-score: 712.5 bits: 142.0 E(32554): 2.3e-33
Smith-Waterman score: 1499; 46.8% identity (67.8% similar) in 566 aa overlap (5-540:22-564)
10 20 30 40
pF1KB9 MEQSCEEEKEPEP-QKNIQETKQVDDEDAELIFVGVEHVNEDA
:::: : :: ::...::. ::: :
CCDS14 MDDDKPFQPKNISKMAELFMECEEE-ELEPWQKKVEETQ---DED-------------DD
10 20 30 40
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 ELIFVGVTSNSKPVVSNILNRVTPGSWSRRKKYDHLRKDTARKLQPKSHETVT--SEAVT
:::::: :.:::..:::::: .: :. : . . .. :.. :. :.
CCDS14 ELIFVGEISSSKPAISNILNRGHSSSSSKGIKSEPHSPGIPEIFRTASQRCRDPPSNPVA
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KB9 VLPASQLESRSTDSPIIIEPLSKPDYRNSSPQVVPNNSSEL--PSPLITFTDSLHHPVST
. : .: :.:..: . .: ::::. ..: :: .::: : : .. : :
CCDS14 ASPRFHLVSKSSQSSVTVENASKPDFTKNS-QVGSDNSSILLFDSTQESLPPSQDIP---
110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 ALSVGGINESPRVSKQLSTFEVNSINPKRAKLRDGIIEGNSSASFPSDTFHTMNTQQSTP
:. :.... : :. :: .:::..::. : . . . : :.:.: ....:
CCDS14 AIFREGMKNTSYVLKHPSTSKVNSVTPKKPKTSEDVPQINPSTSLPLIGSPPVTSSQVML
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 SNNVHTSLSHVQNGAPFPAAFPKDNIHFK---PINTNLDRANELAKTDILS-LTSQNKTF
:....:: : . :: . : :: :..:. :.. .. . : .:. ......
CCDS14 SKGTNTS-SPYDAGADYLRACPKCNVQFNLLDPLKYHMKHCCPDMITKFLGVIVKSERPC
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320
pF1KB9 DPKKENP-----IVLLSDFYYGQHKGEGQPEQKTHTTFKCLSCVKVLKN-VKFMNHVKHH
: : . :.:...::::.:.: . : ::.:::::.:: ::::: ..::::.:::
CCDS14 DEDKTDSETGKLIMLVNEFYYGRHEGVTEKEPKTYTTFKCFSCSKVLKNNIRFMNHMKHH
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 LEFEKQRNDSWENHTTCQHCHRQFPTPFQLQCHIENVHTAQEPSTVCKICELSFETDQVL
::.::: :.:::::::::::.::.:::::::::::..:: .: ::.::::::::::...:
CCDS14 LELEKQNNESWENHTTCQHCYRQYPTPFQLQCHIESTHTPHEFSTICKICELSFETEHIL
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
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CCDS99 PSFPSPPAVSIASFVTVKRPGVTGENSNEVAKLVNTLNTIPSLGQSPGPVVVSNNSSAHG
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CCDS99 VYHCNKCRLQFLFAKDKIEHKLQHHKTFRKPKQLEGLKPGTKVTIRASRG--QPRTVPVS
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CCDS53 EPSVPSAAKPPSPEKTAPVASTPSSTPIPALSPPTKVPEPNENVGDAVQTKLIMLVDDFY
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CCDS53 QVCQYRSSLYSEVDVHFRMIHEDTRHLLCPYCLKVFKNGNAFQQHYMRHQKRNVYHCNKC
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CCDS53 ALQEAAPLTSSMDPLPVFLYPPVQRSIQKRAVRKMSVMGRQTCLECSFEIPDFPNHFPTY
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CCDS99 TVIPATLTIRSTVPQ-SQSQQTKSTPSTSTTPTATQPTSLGQLAVQSPGQSNQTTNPKLA
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pF1KB9 EPLSKPDYRN-------SSPQVVPNNSSE---LPSPLITFTDSLHHPVSTALSVGG-INE
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CCDS99 PSFPSPPAVSIASFVTVKRPGVTGENSNEVAKLVNTLNTIPSLGQSPGPVVVSNNSSAHG
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CCDS99 SQRTSGPESSMKVTSSIPVF-DLQDGGRKICPRCNAQFRVTEALRGHMCYCCPEMVEYQK
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CCDS99 KGKSLDSEPSVPSAAKPPSPEKTAPVASTPSSTPIPALSPPTKVPEPNENVGDAVQTKLI
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CCDS99 MLVDDFYYGRDGGKVAQLTNFPKVATSFRCPHCTKRLKNNIRFMNHMKHHVELDQQ-NGE
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CCDS99 GEMPYVCQVCQYRSSLYSEVDVHFRMIHEDTRHLLCPYCLKVFKNGNAFQQHYMRHQKRN
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