Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9522
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9522, 687 aa
1>>>pF1KB9522 687 - 687 aa - 687 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4826+/-0.000947; mu= 19.4784+/- 0.057
mean_var=83.7446+/-17.078, 0's: 0 Z-trim(106.4): 89 B-trim: 18 in 1/48
Lambda= 0.140151
statistics sampled from 8870 (8966) to 8870 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 3.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32461.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 687) 4557 931.8 0
CCDS73893.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 692) 4537 927.7 0
CCDS32460.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 693) 4535 927.3 0
CCDS10785.1 ADGRG5 gene_id:221188|Hs108|chr16 ( 528) 941 200.5 5.1e-51
CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 966) 802 172.6 2.3e-42
CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 987) 801 172.4 2.7e-42
CCDS55376.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 993) 801 172.4 2.7e-42
CCDS43921.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 995) 801 172.4 2.7e-42
CCDS55378.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1001) 801 172.4 2.7e-42
CCDS43922.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1003) 801 172.4 2.8e-42
CCDS14191.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1014) 801 172.4 2.8e-42
CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017) 801 172.5 2.8e-42
CCDS76879.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 429) 783 168.5 1.8e-41
CCDS10786.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 549) 783 168.6 2.2e-41
CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193) 718 155.7 3.5e-37
CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 718 155.7 3.6e-37
CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 718 155.7 3.6e-37
CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 718 155.7 3.7e-37
CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 666 145.5 1.1e-33
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 502 112.1 5.1e-24
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 502 112.1 5.8e-24
CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 709) 431 97.5 7e-20
CCDS58646.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 745) 431 97.5 7.3e-20
CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 431 97.6 8.3e-20
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 416 94.7 1e-18
CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1474) 416 94.7 1e-18
CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1123) 411 93.6 1.6e-18
CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177) 411 93.6 1.7e-18
CCDS32935.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 823) 409 93.1 1.7e-18
CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403) 411 93.7 1.9e-18
CCDS81345.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1416) 411 93.7 2e-18
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 377 86.7 1.6e-16
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 377 86.7 1.6e-16
CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 ( 690) 355 82.1 2.9e-15
CCDS58645.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 867) 351 81.4 6e-15
CCDS796.1 CELSR2 gene_id:1952|Hs108|chr1 (2923) 355 82.6 8.8e-15
CCDS32931.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 742) 328 76.7 1.3e-13
CCDS32930.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 786) 328 76.7 1.4e-13
CCDS32929.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 835) 328 76.7 1.5e-13
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 313 73.9 2e-12
CCDS14076.1 CELSR1 gene_id:9620|Hs108|chr22 (3014) 314 74.3 2.8e-12
CCDS2775.1 CELSR3 gene_id:1951|Hs108|chr3 (3312) 303 72.2 1.4e-11
>>CCDS32461.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 (687 aa)
initn: 4557 init1: 4557 opt: 4557 Z-score: 4979.3 bits: 931.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4557; 99.7% identity (99.7% similar) in 687 aa overlap (1-687:1-687)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MTPQSLLQTTLFLLSLLFLVQGAHGRGHREDFRFCSQRNQTHRSSLHYKPTPDLRISIEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTPQSLLQTTLFLLSLLFLVQGAHGRGHREDFRFCSQRNQTHRSSLHYKPTPDLRISIEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SEEALTVHAPFPAAHPASRSFPDPRGLYHFCLYWNRHAGRLHLLYGKRDFLLSDKASSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEEALTVHAPFPAAHPASRSFPDPRGLYHFCLYWNRHAGRLHLLYGKRDFLLSDKASSLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 CFQHQEESLAQGPPLLATSVTSWWSPQNISLPSAASFTFSFHSPPHTAAHNASVDMCELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CFQHQEESLAQGPPLLATSVTSWWSPQNISLPSAASFTFSFHSPPHTAAHNASVDMCELK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RDLQLLSQFLKHPQKASRRPSAAPASQQLQSLESKLTSVRFMGDMVSFEEDRINATVWKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RDLQLLSQFLKHPQKASRRPSAAPASQQLQSLESKLTSVRFMGDMVSFEEDRINATVWKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QPTAGLQDLHIHSRQEEEQSEIMEYSVLLPRTLFQRTKGRRGEAEKRLLLVDFSSQALFQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS32 QPTAGLQDLHIHSRQEEEQSEIMEYSVLLPRTLFQRTKGRSGEAEKRLLLVDFSSQALFQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DKNSSQVLGEKVLGIVVQNTKVANLTEPVVLTFQHQLQPKNVTLQCVFWVEDPTLSSPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DKNSSQVLGEKVLGIVVQNTKVANLTEPVVLTFQHQLQPKNVTLQCVFWVEDPTLSSPGH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 WSSAGCETVRRETQTSCFCNHLTYFAVLMVSSVEVDAVHKHYLSLLSYVGCVVSALACLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WSSAGCETVRRETQTSCFCNHLTYFAVLMVSSVEVDAVHKHYLSLLSYVGCVVSALACLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 TIAAYLCSRRKPRDYTIKVHMNLLLAVFLLDTSFLLSEPVALTGSEAGCRASAIFLHFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TIAAYLCSRRKPRDYTIKVHMNLLLAVFLLDTSFLLSEPVALTGSEAGCRASAIFLHFSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 LTCLSWTGLEGYNLYRLVVEVFGTYVPGYLLKLSAMGWGFPIFLVTLVALVDVDNYGPII
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTCLSWMGLEGYNLYRLVVEVFGTYVPGYLLKLSAMGWGFPIFLVTLVALVDVDNYGPII
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 LAVHRTPEGVIYPSMCWIRDSLVSYITNLGLFSLVFLFNMAMLATMVVQILRLRPHTQKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAVHRTPEGVIYPSMCWIRDSLVSYITNLGLFSLVFLFNMAMLATMVVQILRLRPHTQKW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 SHVLTLLGLSLVLGLPWALIFFSFASGTFQLVVLYLFSIITSFQGFLIFIWYWSMRLQAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SHVLTLLGLSLVLGLPWALIFFSFASGTFQLVVLYLFSIITSFQGFLIFIWYWSMRLQAR
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB9 GGPSPLKSNSDSARLPISSGSTSSSRI
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGPSPLKSNSDSARLPISSGSTSSSRI
670 680
>>CCDS73893.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 (692 aa)
initn: 4433 init1: 4433 opt: 4537 Z-score: 4957.4 bits: 927.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4537; 99.0% identity (99.0% similar) in 692 aa overlap (1-687:1-692)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MTPQSLLQTTLFLLSLLFLVQ-----GAHGRGHREDFRFCSQRNQTHRSSLHYKPTPDLR
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MTPQSLLQTTLFLLSLLFLVQASASSGAHGRGHREDFRFCSQRNQTHRSSLHYKPTPDLR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 ISIENSEEALTVHAPFPAAHPASRSFPDPRGLYHFCLYWNRHAGRLHLLYGKRDFLLSDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ISIENSEEALTVHAPFPAAHPASRSFPDPRGLYHFCLYWNRHAGRLHLLYGKRDFLLSDK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 ASSLLCFQHQEESLAQGPPLLATSVTSWWSPQNISLPSAASFTFSFHSPPHTAAHNASVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ASSLLCFQHQEESLAQGPPLLATSVTSWWSPQNISLPSAASFTFSFHSPPHTAAHNASVD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 MCELKRDLQLLSQFLKHPQKASRRPSAAPASQQLQSLESKLTSVRFMGDMVSFEEDRINA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MCELKRDLQLLSQFLKHPQKASRRPSAAPASQQLQSLESKLTSVRFMGDMVSFEEDRINA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TVWKLQPTAGLQDLHIHSRQEEEQSEIMEYSVLLPRTLFQRTKGRRGEAEKRLLLVDFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS73 TVWKLQPTAGLQDLHIHSRQEEEQSEIMEYSVLLPRTLFQRTKGRSGEAEKRLLLVDFSS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 QALFQDKNSSQVLGEKVLGIVVQNTKVANLTEPVVLTFQHQLQPKNVTLQCVFWVEDPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QALFQDKNSSQVLGEKVLGIVVQNTKVANLTEPVVLTFQHQLQPKNVTLQCVFWVEDPTL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 SSPGHWSSAGCETVRRETQTSCFCNHLTYFAVLMVSSVEVDAVHKHYLSLLSYVGCVVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SSPGHWSSAGCETVRRETQTSCFCNHLTYFAVLMVSSVEVDAVHKHYLSLLSYVGCVVSA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 LACLVTIAAYLCSRRKPRDYTIKVHMNLLLAVFLLDTSFLLSEPVALTGSEAGCRASAIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LACLVTIAAYLCSRRKPRDYTIKVHMNLLLAVFLLDTSFLLSEPVALTGSEAGCRASAIF
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 LHFSLLTCLSWTGLEGYNLYRLVVEVFGTYVPGYLLKLSAMGWGFPIFLVTLVALVDVDN
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LHFSLLTCLSWMGLEGYNLYRLVVEVFGTYVPGYLLKLSAMGWGFPIFLVTLVALVDVDN
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 YGPIILAVHRTPEGVIYPSMCWIRDSLVSYITNLGLFSLVFLFNMAMLATMVVQILRLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YGPIILAVHRTPEGVIYPSMCWIRDSLVSYITNLGLFSLVFLFNMAMLATMVVQILRLRP
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 HTQKWSHVLTLLGLSLVLGLPWALIFFSFASGTFQLVVLYLFSIITSFQGFLIFIWYWSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HTQKWSHVLTLLGLSLVLGLPWALIFFSFASGTFQLVVLYLFSIITSFQGFLIFIWYWSM
610 620 630 640 650 660
660 670 680
pF1KB9 RLQARGGPSPLKSNSDSARLPISSGSTSSSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RLQARGGPSPLKSNSDSARLPISSGSTSSSRI
670 680 690
>>CCDS32460.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 (693 aa)
initn: 2868 init1: 2868 opt: 4535 Z-score: 4955.2 bits: 927.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4535; 98.8% identity (98.8% similar) in 693 aa overlap (1-687:1-693)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MTPQSLLQTTLFLLSLLFLVQGAHGRGHREDFRFCSQRNQTHRSSLHYKPTPDLRISIEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTPQSLLQTTLFLLSLLFLVQGAHGRGHREDFRFCSQRNQTHRSSLHYKPTPDLRISIEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SEEALTVHAPFPAAHPASRSFPDPRGLYHFCLYWNRHAGRLHLLYGKRDFLLSDKASSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEEALTVHAPFPAAHPASRSFPDPRGLYHFCLYWNRHAGRLHLLYGKRDFLLSDKASSLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 CFQHQEESLAQGPPLLATSVTSWWSPQNISLPSAASFTFSFHSPPHTAAHNASVDMCELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CFQHQEESLAQGPPLLATSVTSWWSPQNISLPSAASFTFSFHSPPHTAAHNASVDMCELK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RDLQLLSQFLKHPQKASRRPSAAPASQQLQSLESKLTSVRFMGDMVSFEEDRINATVWKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RDLQLLSQFLKHPQKASRRPSAAPASQQLQSLESKLTSVRFMGDMVSFEEDRINATVWKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QPTAGLQDLHIHSRQEEEQSEIMEYSVLLPRTLFQRTKGRRGEAEKRLLLVDFSSQALFQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS32 QPTAGLQDLHIHSRQEEEQSEIMEYSVLLPRTLFQRTKGRSGEAEKRLLLVDFSSQALFQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DKNSSQVLGEKVLGIVVQNTKVANLTEPVVLTFQHQLQPKNVTLQCVFWVEDPTLSSPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DKNSSQVLGEKVLGIVVQNTKVANLTEPVVLTFQHQLQPKNVTLQCVFWVEDPTLSSPGH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 WSSAGCETVRRETQTSCFCNHLTYFAVLMVSSVEVDAVHKHYLSLLSYVGCVVSALACLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WSSAGCETVRRETQTSCFCNHLTYFAVLMVSSVEVDAVHKHYLSLLSYVGCVVSALACLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB9 TIAAYLCSR------RKPRDYTIKVHMNLLLAVFLLDTSFLLSEPVALTGSEAGCRASAI
::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TIAAYLCSRVPLPCRRKPRDYTIKVHMNLLLAVFLLDTSFLLSEPVALTGSEAGCRASAI
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 FLHFSLLTCLSWTGLEGYNLYRLVVEVFGTYVPGYLLKLSAMGWGFPIFLVTLVALVDVD
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLHFSLLTCLSWMGLEGYNLYRLVVEVFGTYVPGYLLKLSAMGWGFPIFLVTLVALVDVD
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 NYGPIILAVHRTPEGVIYPSMCWIRDSLVSYITNLGLFSLVFLFNMAMLATMVVQILRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NYGPIILAVHRTPEGVIYPSMCWIRDSLVSYITNLGLFSLVFLFNMAMLATMVVQILRLR
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 PHTQKWSHVLTLLGLSLVLGLPWALIFFSFASGTFQLVVLYLFSIITSFQGFLIFIWYWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PHTQKWSHVLTLLGLSLVLGLPWALIFFSFASGTFQLVVLYLFSIITSFQGFLIFIWYWS
610 620 630 640 650 660
660 670 680
pF1KB9 MRLQARGGPSPLKSNSDSARLPISSGSTSSSRI
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRLQARGGPSPLKSNSDSARLPISSGSTSSSRI
670 680 690
>>CCDS10785.1 ADGRG5 gene_id:221188|Hs108|chr16 (528 aa)
initn: 701 init1: 233 opt: 941 Z-score: 1029.5 bits: 200.5 E(32554): 5.1e-51
Smith-Waterman score: 941; 36.0% identity (64.0% similar) in 492 aa overlap (184-656:26-507)
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 AASFTFSFHSPPHTAAHNASVDMCELKRDLQLLSQFLKHPQKASRRPSAAPASQQLQSLE
.::: .... : .:: :.. .:.::..::
CCDS10 MDHCGALFLCLCLLTLQNATTETWEELLS-YMENMQ-VSRGRSSVFSSRQLHQLE
10 20 30 40 50
220 230 240 250 260
pF1KB9 SKLTSVRFMGDMVSFEEDRINATVWKLQ--------PTAGLQDLHIHSRQEEEQSEIMEY
. : .. : : .... :.. ..::. .: :. . . :. . .. :..
CCDS10 QMLLNTSFPGYNLTLQTPTIQSLAFKLSCDFSGLSLTSATLKRVPQAGGQHARGQHAMQF
60 70 80 90 100 110
270 280 290 300 310 320
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CCDS55 SYGKFPNGS--PDDFCWINNNAVFYITVVGYFCVIFLLNVSMFIVVLVQLCRIKKKKQLG
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