Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9517
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9517, 565 aa
1>>>pF1KB9517 565 - 565 aa - 565 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2621+/-0.000833; mu= 8.1971+/- 0.051
mean_var=203.1151+/-39.725, 0's: 0 Z-trim(115.2): 101 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.089992
statistics sampled from 15666 (15767) to 15666 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.484), width: 16
Scan time: 4.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7845.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11 ( 565) 3918 521.0 1.5e-147
CCDS60746.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11 ( 541) 3758 500.2 2.7e-141
CCDS41626.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11 ( 533) 3015 403.7 2.9e-112
CCDS44945.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 ( 412) 1362 189.0 9.6e-48
CCDS55847.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 ( 451) 1362 189.0 1e-47
CCDS55848.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 ( 545) 1362 189.1 1.2e-47
CCDS8998.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 ( 657) 1362 189.2 1.4e-47
CCDS1422.1 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1 ( 399) 1137 159.8 5.8e-39
CCDS1423.2 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1 ( 465) 1134 159.5 8.5e-39
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 648 96.8 1.9e-19
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 648 96.8 1.9e-19
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 645 96.4 2.6e-19
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 645 96.4 2.6e-19
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 629 94.3 1.1e-18
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 626 93.9 1.4e-18
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 621 93.3 2.2e-18
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 621 93.3 2.2e-18
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 602 90.8 1.3e-17
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 602 90.8 1.3e-17
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 602 90.8 1.3e-17
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 602 90.8 1.3e-17
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 602 90.8 1.3e-17
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 602 90.9 1.5e-17
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 599 90.4 1.7e-17
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 599 90.4 1.7e-17
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 599 90.5 2e-17
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 599 90.5 2e-17
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 377) 578 87.2 3.9e-17
CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 405) 578 87.2 4.1e-17
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 588 89.1 5.3e-17
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 588 89.1 5.3e-17
CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1188) 578 87.6 9.2e-17
CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1216) 578 87.6 9.4e-17
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 573 86.8 1.1e-16
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 573 86.8 1.1e-16
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 563 85.7 3.5e-16
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 563 85.7 3.8e-16
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 558 85.1 6.1e-16
CCDS335.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1436) 557 85.0 7e-16
CCDS334.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1446) 557 85.0 7e-16
CCDS53290.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1433) 555 84.7 8.4e-16
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 780) 549 83.7 9.1e-16
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 642) 547 83.4 9.5e-16
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 700) 547 83.4 1e-15
CCDS73501.1 PTPRQ gene_id:374462|Hs108|chr12 (2299) 554 84.7 1.3e-15
CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1 ( 807) 543 82.9 1.6e-15
CCDS44098.2 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1440) 537 82.4 4.2e-15
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 538 82.6 4.8e-15
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 538 82.6 4.8e-15
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1997) 538 82.6 5e-15
>>CCDS7845.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11 (565 aa)
initn: 3918 init1: 3918 opt: 3918 Z-score: 2762.3 bits: 521.0 E(32554): 1.5e-147
Smith-Waterman score: 3918; 100.0% identity (100.0% similar) in 565 aa overlap (1-565:1-565)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KB9 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
:::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
550 560
>>CCDS60746.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11 (541 aa)
initn: 3758 init1: 3758 opt: 3758 Z-score: 2650.3 bits: 500.2 E(32554): 2.7e-141
Smith-Waterman score: 3758; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (25-565:1-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
460 470 480 490 500 510
550 560
pF1KB9 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
:::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
520 530 540
>>CCDS41626.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11 (533 aa)
initn: 3015 init1: 3015 opt: 3015 Z-score: 2129.0 bits: 403.7 E(32554): 2.9e-112
Smith-Waterman score: 3627; 94.3% identity (94.3% similar) in 565 aa overlap (1-565:1-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLL----------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ----------EPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
450 460 470 480 490 500
550 560
pF1KB9 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
:::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
510 520 530
>>CCDS44945.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 (412 aa)
initn: 1316 init1: 870 opt: 1362 Z-score: 970.7 bits: 189.0 E(32554): 9.6e-48
Smith-Waterman score: 1362; 60.1% identity (80.2% similar) in 338 aa overlap (229-563:78-410)
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 EKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQERRGSNVSLTLDMCTPGC
:. . .: .:::::::::::::::: . :
CCDS44 EQAPKVLNVVVDPQGRGAPEIKATTATSVCPSPFKMKPIGLQERRGSNVSLTLDMSSLG-
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 NEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLLQAEFFEIPMNFVDPKEYD
: : : . .:::. : ::: ::::.: .:.. . . :::.::.::::::::::: :
CCDS44 NIEPFVSIPTPREKVAMEYLQSASRILTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNFVDPKEID
110 120 130 140 150 160
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 IPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIRGYGGEEKVYIATQGPIVS
:: ::::::::::: ::::: . : ::.::::::::::.:.::..::::::...
CCDS44 IPRHGTKNRYKTILPNPLSRVCLRPKNVTDSLSTYINANYIRGYSGKEKAFIATQGPMIN
170 180 190 200 210 220
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 TVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIHTEDYRLR
:: :::.::::: .:.:::::...: ::::. ::::.. : ::. : .: . ..: .:
CCDS44 TVDDFWQMVWQEDSPVIVMITKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVISVNECDNYTIR
230 240 250 260 270 280
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 LISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE---AAQQEGPHCAPIIVH
. ::.:.. . .::::.:::::.:::: : :::.:. .::: :.: .:: ..::
CCDS44 NLVLKQGSHTQHVKHYWYTSWPDHKTPDSAQPLLQLMLDVEEDRLASQGRGP----VVVH
290 300 310 320 330 340
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 CSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSLY
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CCDS44 ESRLSAETVQ
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CCDS55 TSIGCQQLKEEGVVDALSIVCQLRMDRGGMVQTSEQYEFVHHALCLYESRLSAETVQ
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CCDS89 LYRLKERFQLSLRQDKEKNQEIHLSPITLQPALSEAKTVHSMVQPEQAPK--VLNVVVDP
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CCDS89 QGRGAPEIKATTATSVCPSPFKMKPIGLQERRGSNVSLTLDMSSLG-NIEPFVSIPTPRE
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pF1KB9 KHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE---AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIA
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CCDS89 TSIGCQQLKEEGVVDALSIVCQLRMDRGGMVQTSEQYEFVHHALCLYESRLSAETVQ
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CCDS14 DVRSLGAVEP-ICSVNTPREVTLH-FLRTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNF
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CCDS14 TQGPMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKE
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pF1KB9 TEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEEAAQQEGPHCAP
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CCDS14 CPEYTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPET-AAHPGP
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CCDS14 IVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLKARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHT
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pF1KB9 MSLYEKQLSHQ-SPE
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CCDS14 LALYAGQLPEEPSP
390
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CCDS14 PHLSMVQAHGGRSRAQPLTLSLGAAMTQPPPEKTPAK---KHVRLQERRGSNVALMLDVR
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CCDS14 SLGAVEP-ICSVNTPREVTLH-FLRTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSP
160 170 180 190 200 210
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CCDS14 EDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQSQED-GDYINANYIRGYDGKEKVYIATQG
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pF1KB9 PIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIHTED
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CCDS14 PMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPE
280 290 300 310 320 330
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pF1KB9 YRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEEAAQQEGPHCAPIIV
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CCDS14 YTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAA-HPGPIVV
340 350 360 370 380 390
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pF1KB9 HCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSL
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CCDS14 HCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLKARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLAL
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560
pF1KB9 YEKQLSHQ-SPE
: :: .. ::
CCDS14 YAGQLPEEPSP
460
>>CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439 aa)
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pF1KB9 GLQERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDP
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CCDS75 NFSPRYENHSATAESSRLLDVPRYLCEGTESPYQTGQLHPAIRVADLLQHINLM-KTSDS
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pF1KB9 FLLQAE---FFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYI
. .. : ::: : . : :::: .:. :::: : .: ::: :.::
CCDS75 YGFKEEYESFFEGQSASWDVAKKDQNRA--KNRYGNIIAYDHSRVIL-QPVEDDPSSDYI
890 900 910 920 930 940
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pF1KB9 NANYIRGYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNE-KCTEYWP
::::: :: . . :::::::. :: :::::.:::.. :::.::. :... :: .:::
CCDS75 NANYIDGYQ-RPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQEQSACIVMVTNLVEVGRVKCYKYWP
950 960 970 980 990 1000
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pF1KB9 EEQVAYDGVEITVQKVIHTEDYRLRLISL-KSGTEE-RGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPL
.. .: ..: .. .: .: ..: . : .: : .:.. ::.:::. .: .: :
CCDS75 DDTEVYGDFKVTCVEMEPLAEYVVRTFTLERRGYNEIREVKQFHFTGWPDHGVPYHATGL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KB9 LHLVREVEEAAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQL
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CCDS75 LSFIRRVKLS---NPPSAGPIVVHCSAGAGRTGCYIVIDIMLDMAEREGVVDIYNCVKAL
1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KB9 RQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
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CCDS75 RSRRINMVQTEEQYIFIHDAILEACLCGETAIPVCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEF
1120 1130 1140 1150 1160 1170
565 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:10:19 2016 done: Fri Nov 4 00:10:20 2016
Total Scan time: 4.100 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]