Result of FASTA (omim) for
pF1KB9495
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9495, 836 aa
1>>>pF1KB9495 836 - 836 aa - 836 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4279+/-0.000372; mu= 2.4380+/- 0.023
mean_var=236.6390+/-48.350, 0's: 0 Z-trim(121.1): 29 B-trim: 1273 in 1/56
Lambda= 0.083374
statistics sampled from 37116 (37151) to 37116 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.436), width: 16
Scan time: 16.110
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057735 (OMIM: 607861) dapper homolog 1 isoform ( 836) 5565 682.9 1.6e-195
NP_001072988 (OMIM: 607861) dapper homolog 1 isofo ( 799) 3951 488.7 4.2e-137
XP_006720230 (OMIM: 607861) PREDICTED: dapper homo ( 555) 3710 459.6 1.7e-128
XP_016881823 (OMIM: 611112) PREDICTED: dapper homo ( 561) 486 71.9 9.4e-12
NP_659493 (OMIM: 611112) dapper homolog 3 isoform ( 629) 486 71.9 1e-11
XP_011524801 (OMIM: 611112) PREDICTED: dapper homo ( 404) 445 66.8 2.2e-10
NP_001287975 (OMIM: 611112) dapper homolog 3 isofo ( 404) 445 66.8 2.2e-10
XP_011524802 (OMIM: 611112) PREDICTED: dapper homo ( 404) 445 66.8 2.2e-10
NP_001273280 (OMIM: 608966) dapper homolog 2 isofo ( 280) 352 55.5 3.9e-07
NP_999627 (OMIM: 608966) dapper homolog 2 isoform ( 774) 355 56.2 6.7e-07
>>NP_057735 (OMIM: 607861) dapper homolog 1 isoform 1 [H (836 aa)
initn: 5565 init1: 5565 opt: 5565 Z-score: 3631.3 bits: 682.9 E(85289): 1.6e-195
Smith-Waterman score: 5565; 100.0% identity (100.0% similar) in 836 aa overlap (1-836:1-836)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKPSPAGTAKELEPPAPARGEQRTAEPEGRWREKGEADTERQRTRERQEATLAGLAELEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MKPSPAGTAKELEPPAPARGEQRTAEPEGRWREKGEADTERQRTRERQEATLAGLAELEY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LRQRQELLVRGALRGAGGAGAAAPRAGELLGEAAQRSRLEEKFLEENILLLRKQLNCLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LRQRQELLVRGALRGAGGAGAAAPRAGELLGEAAQRSRLEEKFLEENILLLRKQLNCLRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RDAGLLNQLQELDKQISDLRLDVEKTSEEHLETDSRPSSGFYELSDGASGSLSNSSNSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RDAGLLNQLQELDKQISDLRLDVEKTSEEHLETDSRPSSGFYELSDGASGSLSNSSNSVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SECLSSCHSSTCFCSPLEATLSLSDGCPKSADLIGLLEYKEGHCEDQASGAVCRSLSTPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SECLSSCHSSTCFCSPLEATLSLSDGCPKSADLIGLLEYKEGHCEDQASGAVCRSLSTPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FNSLDVIADVNPKYQCDLVSKNGNDVYRYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 FNSLDVIADVNPKYQCDLVSKNGNDVYRYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 HASDICGGSELDAVKTDSSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 HASDICGGSELDAVKTDSSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SVNADPTKGLLRNGSVCVRAPGGVSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SVNADPTKGLLRNGSVCVRAPGGVSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KESKAEQAESKRVPLPEGCPSGAASDLQSKHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 KESKAEQAESKRVPLPEGCPSGAASDLQSKHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 LSGASPKESPSRGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFPVEERPALDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LSGASPKESPSRGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFPVEERPALDF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 KSEGSSQSLEEAHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 KSEGSSQSLEEAHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 VREKTRAGSKKCRFPDDLDTNKKLKKASSKGRKSGGGPEAGVPGRPAGGGHRAGSRAHGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 VREKTRAGSKKCRFPDDLDTNKKLKKASSKGRKSGGGPEAGVPGRPAGGGHRAGSRAHGH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 GREAVVAKPKHKRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASPYAYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GREAVVAKPKHKRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASPYAYV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 ASDSEYSAECESLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ASDSEYSAECESLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB9 GLIWSQFVQTLPIQTVTAPDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GLIWSQFVQTLPIQTVTAPDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
790 800 810 820 830
>>NP_001072988 (OMIM: 607861) dapper homolog 1 isoform 2 (799 aa)
initn: 3948 init1: 3948 opt: 3951 Z-score: 2582.3 bits: 488.7 E(85289): 4.2e-137
Smith-Waterman score: 5234; 95.6% identity (95.6% similar) in 836 aa overlap (1-836:1-799)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKPSPAGTAKELEPPAPARGEQRTAEPEGRWREKGEADTERQRTRERQEATLAGLAELEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKPSPAGTAKELEPPAPARGEQRTAEPEGRWREKGEADTERQRTRERQEATLAGLAELEY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LRQRQELLVRGALRGAGGAGAAAPRAGELLGEAAQRSRLEEKFLEENILLLRKQLNCLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRQRQELLVRGALRGAGGAGAAAPRAGELLGEAAQRSRLEEKFLEENILLLRKQLNCLRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RDAGLLNQLQELDKQISDLRLDVEKTSEEHLETDSRPSSGFYELSDGASGSLSNSSNSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDAGLLNQLQELDKQISDLRLDVEKTSEEHLETDSRPSSGFYELSDGASGSLSNSSNSVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SECLSSCHSSTCFCSPLEATLSLSDGCPKSADLIGLLEYKEGHCEDQASGAVCRSLSTPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SECLSSCHSSTCFCSPLEATLSLSDGCPKSAD----------------------------
190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FNSLDVIADVNPKYQCDLVSKNGNDVYRYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ---------VNPKYQCDLVSKNGNDVYRYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGN
220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 HASDICGGSELDAVKTDSSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HASDICGGSELDAVKTDSSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRT
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SVNADPTKGLLRNGSVCVRAPGGVSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVNADPTKGLLRNGSVCVRAPGGVSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWS
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KESKAEQAESKRVPLPEGCPSGAASDLQSKHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KESKAEQAESKRVPLPEGCPSGAASDLQSKHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQ
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 LSGASPKESPSRGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFPVEERPALDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSGASPKESPSRGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFPVEERPALDF
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 KSEGSSQSLEEAHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSEGSSQSLEEAHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPT
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 VREKTRAGSKKCRFPDDLDTNKKLKKASSKGRKSGGGPEAGVPGRPAGGGHRAGSRAHGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VREKTRAGSKKCRFPDDLDTNKKLKKASSKGRKSGGGPEAGVPGRPAGGGHRAGSRAHGH
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 GREAVVAKPKHKRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASPYAYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GREAVVAKPKHKRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASPYAYV
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 ASDSEYSAECESLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASDSEYSAECESLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESG
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830
pF1KB9 GLIWSQFVQTLPIQTVTAPDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLIWSQFVQTLPIQTVTAPDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
750 760 770 780 790
>>XP_006720230 (OMIM: 607861) PREDICTED: dapper homolog (555 aa)
initn: 3710 init1: 3710 opt: 3710 Z-score: 2427.9 bits: 459.6 E(85289): 1.7e-128
Smith-Waterman score: 3710; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (282-836:1-555)
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 PKYQCDLVSKNGNDVYRYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGNHASDICGGSEL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MFLLCLTGNPLREEDRLGNHASDICGGSEL
10 20 30
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 DAVKTDSSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRTSVNADPTKGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DAVKTDSSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRTSVNADPTKGLL
40 50 60 70 80 90
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 RNGSVCVRAPGGVSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWSKESKAEQAESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RNGSVCVRAPGGVSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWSKESKAEQAESK
100 110 120 130 140 150
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 RVPLPEGCPSGAASDLQSKHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQLSGASPKESPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RVPLPEGCPSGAASDLQSKHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQLSGASPKESPS
160 170 180 190 200 210
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 RGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFPVEERPALDFKSEGSSQSLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFPVEERPALDFKSEGSSQSLEE
220 230 240 250 260 270
560 570 580 590 600 610
pF1KB9 AHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPTVREKTRAGSKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPTVREKTRAGSKK
280 290 300 310 320 330
620 630 640 650 660 670
pF1KB9 CRFPDDLDTNKKLKKASSKGRKSGGGPEAGVPGRPAGGGHRAGSRAHGHGREAVVAKPKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CRFPDDLDTNKKLKKASSKGRKSGGGPEAGVPGRPAGGGHRAGSRAHGHGREAVVAKPKH
340 350 360 370 380 390
680 690 700 710 720 730
pF1KB9 KRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASPYAYVASDSEYSAECE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASPYAYVASDSEYSAECE
400 410 420 430 440 450
740 750 760 770 780 790
pF1KB9 SLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESGGLIWSQFVQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESGGLIWSQFVQTL
460 470 480 490 500 510
800 810 820 830
pF1KB9 PIQTVTAPDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PIQTVTAPDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
520 530 540 550
>>XP_016881823 (OMIM: 611112) PREDICTED: dapper homolog (561 aa)
initn: 466 init1: 177 opt: 486 Z-score: 332.0 bits: 71.9 E(85289): 9.4e-12
Smith-Waterman score: 487; 29.1% identity (52.2% similar) in 581 aa overlap (298-836:25-561)
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 RYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGNHASDIC---GGSELDAVKTDSSLPSPS
::.. .:. :: : .. .... .::
XP_016 MGTGYQRGAREGRNKEALPGLVWDLGQQLGDLSLESGGLEQESGRSSGFYEDPS
10 20 30 40 50
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 SLWSASHPSSSKKMD-GYILSLVQKKTHPVRTNKPRTSVNADPTKGLLRNGSVCVRAPGG
: . . : :. : :. : . : ..:: .. :.: :.. ::
XP_016 STGGPDSPPSTFCGDSGFSGSSSYGRLGP---SEPRGIYASERPKSL---GDASPSAPEV
60 70 80 90 100
390 400 410 420 430
pF1KB9 VSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWSKESKAE----------QAESKRV
: : . . : .: :..: :. .: : : .:. .: . :
XP_016 V--GARAAVPRSFSAPYPTAG------GSAGPEACSSAERRARAGPFLTPSPLHAVAMRS
110 120 130 140 150 160
440 450 460 470 480
pF1KB9 PLPEGCP-------SGAASDLQS--KHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQLSGA
: : : : .::. :.. . : . . . . : : :. .:... ..
XP_016 PRPCGRPPTDSPDAGGAGRPLDGYISALLRRRRRRGAGQPRTSPGGADGGPRRQNSVRQR
170 180 190 200 210 220
490 500 510 520 530
pF1KB9 SPKESPSRGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFP------VEERPAL
: ::: : : : .. .. . : :..: :: :. . .::
XP_016 PPDASPSPGSARPAREPSLERV----------GGHPTSPAALSRAWASSWESEAAPEPAA
230 240 250 260 270
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 DFKSEGSSQSLEEAHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQG--LEN
. . .: :..:::::.::: : ..: :. .. .. : .: .:.
XP_016 PPAAPSPPDSPAEGRLVKAQYIPGAQAATR--------GLPGRAARRKPPPLTRGRSVEQ
280 290 300 310 320
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 GLPTVREKTRAGSKKCRFPDDLDT--NKKLKKAS-SKGRKSGGGPEAGVPGRPAG--GGH
. : ::. ::.... :. . . . .::: :... : : ..::. : ..
XP_016 SPP--RERPRAAGRRGRMAEASGRRGSPRARKASRSQSETSLLGRASAVPSGPPKYPTAE
330 340 350 360 370 380
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 RAGSRAHGHGREAVVAKPKHKRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPL
: : : . . . . :::.:.:::. .. ::.: : .. :.: :
XP_016 REEPRPPRPRRGPAPTLAAQAAGSCRRWRSTAEIDAADG-RRVRP--RAPAARVPGPGPS
390 400 410 420 430
720 730 740 750 760
pF1KB9 PYASP----YAYVASDSEYSAECESLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFV
: : :. ..:::: :: . . .. .. . . .:.::::.::::
XP_016 PSAPQRRLLYGCAGSDSECSA-------GRLGPLGRRGPAGGVGGGYGESESSASEGESP
440 450 460 470 480 490
770 780 790 800 810 820
pF1KB9 GESTTTSDSEESGGLIW-SQFVQTLPIQTVTA-PDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRF
. :...:::. ::::.: .:.: . . : :::.:::::::: ::::::::
XP_016 AFSSASSDSDGSGGLVWPQQLVAATAASGGGAGAGAPAGPAKVFVKIKASHALKKKILRF
500 510 520 530 540 550
830
pF1KB9 RSGSLKLMTTV
::::::.::::
XP_016 RSGSLKVMTTV
560
>>NP_659493 (OMIM: 611112) dapper homolog 3 isoform 1 [H (629 aa)
initn: 534 init1: 177 opt: 486 Z-score: 331.3 bits: 71.9 E(85289): 1e-11
Smith-Waterman score: 487; 29.1% identity (52.2% similar) in 581 aa overlap (298-836:93-629)
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 RYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGNHASDIC---GGSELDAVKTDSSLPSPS
::.. .:. :: : .. .... .::
NP_659 ADEDEDAAAARRAAAALEEQLEALPGLVWDLGQQLGDLSLESGGLEQESGRSSGFYEDPS
70 80 90 100 110 120
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: . . : :. : :. : . : ..:: .. :.: :.. ::
NP_659 STGGPDSPPSTFCGDSGFSGSSSYGRLGP---SEPRGIYASERPKSL---GDASPSAPEV
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: : . . : .: :..: :. .: : : .:. .: . :
NP_659 V--GARAAVPRSFSAPYPTAG------GSAGPEACSSAERRARAGPFLTPSPLHAVAMRS
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: : : : .::. :.. . : . . . . : : :. .:... ..
NP_659 PRPCGRPPTDSPDAGGAGRPLDGYISALLRRRRRRGAGQPRTSPGGADGGPRRQNSVRQR
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: ::: : : : .. .. . : :..: :: :. . .::
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. . .: :..:::::.::: : ..: :. .. .. : .: .:.
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. : ::. ::.... :. . . . .::: :... : : ..::. : ..
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: : : . . . . :::.:.:::. .. ::.: : .. :.: :
NP_659 REEPRPPRPRRGPAPTLAAQAAGSCRRWRSTAEIDAADG-RRVRP--RAPAARVPGPGPS
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: : :. ..:::: :: . . .. .. . . .:.::::.::::
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. :...:::. ::::.: .:.: . . : :::.:::::::: ::::::::
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::::::.::::
NP_659 RSGSLKVMTTV
620
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. .::: :... : : ..::. : ..: : : . . . . :::
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. . .. .. . . .:.::::.:::: . :...:::. ::::.: .:.: . .
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XP_011 GGGAGAGAPAGPAKVFVKIKASHALKKKILRFRSGSLKVMTTV
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NP_001 GGGAGAGAPAGPAKVFVKIKASHALKKKILRFRSGSLKVMTTV
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pF1KB9 SGGIPSLNNGTFSPPKQWSKESKAEQAESKRVPLPEGCP-------SGAASDLQS--KHL
: : : : : .::. :.. . :
XP_011 MRSPRPCGRPPTDSPDAGGAGRPLDGYISAL
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XP_011 LRRRRRRGAGQPRTSPGGADGGPRRQNSVRQRPPDASPSPGSARPAREPSLERV------
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XP_011 ----GGHPTSPAALSRAWASSWESEAAPEPAAPPAAPSPPDSPAEGRLVKAQYIPGAQAA
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XP_011 TR--------GLPGRAARRKPPPLTRGRSVEQSPP--RERPRAAGRRGRMAEASGRRGSP
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pF1KB9 KLKKAS-SKGRKSGGGPEAGVPGRPAG--GGHRAGSRAHGHGREAVVAKPKHKRTDYRRW
. .::: :... : : ..::. : ..: : : . . . . :::
XP_011 RARKASRSQSETSLLGRASAVPSGPPKYPTAEREEPRPPRPRRGPAPTLAAQAAGSCRRW
200 210 220 230 240 250
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pF1KB9 KSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASP----YAYVASDSEYSAECESLFH
.:.:::. .. ::.: : .. :.: : : : :. ..:::: ::
XP_011 RSTAEIDAADG-RRVRP--RAPAARVPGPGPSPSAPQRRLLYGCAGSDSECSA-------
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pF1KB9 STVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESGGLIW-SQFVQTLPIQ
. . .. .. . . .:.::::.:::: . :...:::. ::::.: .:.: . .
XP_011 GRLGPLGRRGPAGGVGGGYGESESSASEGESPAFSSASSDSDGSGGLVWPQQLVAATAAS
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pF1KB9 TVTA-PDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
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XP_011 GGGAGAGAPAGPAKVFVKIKASHALKKKILRFRSGSLKVMTTV
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:. ::::: . ::: . . : :. :: . :..::. ::..: :
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pF1KB9 LLNQLQELDKQISDLRLDVEKTSEEHLETDSRPSSGFYELSDGASGSLSNSSNSVFSECL
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NP_001 LKTHLDQLDLQISKLQLDVGTASGEALDSDSRPSSGFYEMSDGGSCSLSTSCASVCSDHI
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pF1KB9 S-SCHSSTCFCSPLEATLSLSDGCPKSADLIGLLEYKEGHCEDQASGAVCRSLSTPQFNS
: : : . .: :..: :.:.:
NP_001 SPSLGSLLPVAQAHKARPSMGDWRPRSVDETTVPAWRPQATEEGARPPGSVEDAGQPWGT
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pF1KB9 PAGTAKELEPPAPARGEQRTAEPEGRWREKGEADTERQRTRERQEATLAGLAELEYLRQR
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NP_999 MWTPGGPPGSAGWDRRRLGARLRAAFAGLQELQGLRAT
10 20 30
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NP_999 QQERVRGALALQPPPAPAAPCGPHGLHGPEQQ-------LEAALAALQEQLSRLRQQDIG
40 50 60 70 80 90
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pF1KB9 LLNQLQELDKQISDLRLDVEKTSEEHLETDSRPSSGFYELSDGASGSLSNSSNSVFSECL
: ..:..:: ::: :.::: .: : :..::::::::::.:::.: :::.: :: :. .
NP_999 LKTHLDQLDLQISKLQLDVGTASGEALDSDSRPSSGFYEMSDGGSCSLSTSCASVCSDHI
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pF1KB9 S-SCHSSTCFCSPLEATLSLSDGCPKSADLIGLLEYKE----------GHCEDQ------
: : : . .: :..: :.:.: . .. : ::
NP_999 SPSLGSLLPVAQAHKARPSMGDWRPRSVDETTVPAWRPQATEEGARPPGSVEDAGQPWGT
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pF1KB9 ------ASGAVCRSLSTP---QFNSLDVI--------ADV-----NPKYQCDLVSKNGND
..: . :.: . : : :. .:. .:::. ::::..: .
NP_999 FWPRPVSTGDLDRALPADTGLQKASADAELLGLLCQGVDIPLHVPDPKYRQDLVSQGGRE
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:: :::::::::.:::.:.: :.: :: : . : : :.: ...
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pF1KB9 SSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRTSVNADPTKGLLRNGSVC
. . ::. : .: .: : . . . .:. . . . : : .
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: ::: ..:. .. ... .:. .: : :. ..:.. :.. :: :..
NP_999 VFAPGREDEGGPAQSRGAGRGGPQQQGYMPLEG-PQ-QSGSL--PEEGSKPSNSCVL---
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: . .. ::. :.. :..:...: . :. .. : . :: : :.
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440 450 460 470 480
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NP_999 AASLKMGPPKSK--AEKIKRSPMDKVLRF---ARQPLL-----LLDRP------EG----
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pF1KB9 LEEAHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPTVREKTRAG
:: . : :::.. .: : ..:..: ::: : :.
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NP_999 SESTLYPMPVLV-----------------PLAVAPQE----SHRTSAQAL-FPFEASLLT
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.: .:::.:..::: : : . :.: : :: :: . :
NP_999 SVARRK-HRRWQSTVEIS---ARARLASCPESNLG-PPRPVARRAGGPLARGRPSLVRQD
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pF1KB9 AYVASDSE---YSAECESLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTS
::. :::: .::::. : :.. .::: :.:..::: ::: ::: :. : : ..
NP_999 AYTRSDSEPSKHSAECDPRFPSVIPETSEGESSDHTTNRFGDRESSSSD-EEGGAQSRDC
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: . ..: ..: :... .: : :. . .::::. ::::: ::. .::
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720 730 740 750 760
pF1KB9 LMTTV
.:: :
NP_999 VMTMV
770
836 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]