FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9486, 1221 aa
1>>>pF1KB9486 1221 - 1221 aa - 1221 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7549+/-0.00105; mu= 21.3645+/- 0.064
mean_var=111.4896+/-21.732, 0's: 0 Z-trim(107.4): 115 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.121467
statistics sampled from 9458 (9580) to 9458 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 3.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10926.1 ADAMTS18 gene_id:170692|Hs108|chr16 (1221) 8724 1541.0 0
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CCDS34140.1 ADAMTS12 gene_id:81792|Hs108|chr5 (1594) 2275 411.0 1.2e-113
CCDS32303.1 ADAMTS7 gene_id:11173|Hs108|chr15 (1686) 2233 403.6 2.1e-111
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CCDS7306.1 ADAMTS14 gene_id:140766|Hs108|chr10 (1223) 1300 240.0 2.7e-62
CCDS13579.1 ADAMTS5 gene_id:11096|Hs108|chr21 ( 930) 1297 239.4 3.3e-62
CCDS8488.1 ADAMTS15 gene_id:170689|Hs108|chr11 ( 950) 1272 235.0 6.9e-61
CCDS33524.1 ADAMTS1 gene_id:9510|Hs108|chr21 ( 967) 1161 215.5 5e-55
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CCDS955.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 (1074) 1012 189.5 3.9e-47
CCDS30852.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 ( 877) 984 184.5 1e-45
CCDS41732.1 ADAMTS8 gene_id:11095|Hs108|chr11 ( 889) 954 179.2 3.9e-44
CCDS72908.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 (1097) 864 163.6 2.5e-39
CCDS6972.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1371) 817 155.4 9e-37
CCDS6970.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1427) 817 155.4 9.2e-37
CCDS6485.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 ( 525) 803 152.5 2.5e-36
CCDS1223.1 ADAMTS4 gene_id:9507|Hs108|chr1 ( 837) 793 151.0 1.2e-35
CCDS10238.2 THSD4 gene_id:79875|Hs108|chr15 (1018) 786 149.9 3.1e-35
CCDS32114.1 PAPLN gene_id:89932|Hs108|chr14 (1251) 715 137.5 2e-31
CCDS12071.1 ADAMTSL5 gene_id:339366|Hs108|chr19 ( 471) 705 135.3 3.4e-31
CCDS34311.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 ( 566) 676 130.3 1.3e-29
CCDS6976.1 ADAMTSL2 gene_id:9719|Hs108|chr9 ( 951) 675 130.4 2.1e-29
CCDS6971.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1340) 531 105.3 1.1e-21
CCDS4146.1 ADAMTS19 gene_id:171019|Hs108|chr5 (1207) 506 100.9 2.1e-20
CCDS66817.1 THSD4 gene_id:79875|Hs108|chr15 ( 658) 499 99.4 3.2e-20
CCDS10383.1 ADAMTS17 gene_id:170691|Hs108|chr15 (1095) 499 99.6 4.6e-20
CCDS47954.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 (1762) 413 84.7 2.2e-15
CCDS73773.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1682) 412 84.5 2.4e-15
CCDS10326.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1691) 412 84.5 2.4e-15
>>CCDS10926.1 ADAMTS18 gene_id:170692|Hs108|chr16 (1221 aa)
initn: 8724 init1: 8724 opt: 8724 Z-score: 8262.8 bits: 1541.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8724; 99.8% identity (99.8% similar) in 1221 aa overlap (1-1221:1-1221)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MECALLLACAFRAAGSGPPRGLAGLGRVAKALQLCCLCCASVAAALASDSSSGASGLNDD
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MECALLLACAFPAAGSGPPRGLAGLGRVAKALQLCCLCCASVAAALASDSSSGASGLNDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 YVFVTPVEVDSAGSYISHDILHNGRKKRSAQNARSSLHYRFSAFGQELHLELKPSAILSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YVFVTPVEVDSAGSYISHDILHNGRKKRSAQNARSSLHYRFSAFGQELHLELKPSAILSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HFIVQVLGKDGASETQKPEVQQCFYQGFIRNDSSSSVAVSTCAGLSGLIRTRKNEFLISP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HFIVQVLGKDGASETQKPEVQQCFYQGFIRNDSSSSVAVSTCAGLSGLIRTRKNEFLISP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LPQLLAQEHNYSSPAGHHPHVLYKRTAEEKIQRYRGYPGSGRNYPGYSPSHIPHASQSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPQLLAQEHNYSSPAGHHPHVLYKRTAEEKIQRYRGYPGSGRNYPGYSPSHIPHASQSRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 TEYHHRRLQKQHFCGRRKKYAPKPPTEDTYLRFDEYGSSGRPRRSAGKSQKGLNVETLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TEYHHRRLQKQHFCGRRKKYAPKPPTEDTYLRFDEYGSSGRPRRSAGKSQKGLNVETLVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 ADKKMVEKHGKGNVTTYILTVMNMVSGLFKDGTIGSDINVVVVSLILLEQEPGGLLINHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ADKKMVEKHGKGNVTTYILTVMNMVSGLFKDGTIGSDINVVVVSLILLEQEPGGLLINHH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 ADQSLNSFCQWQSALIGKNGKRHDHAILLTGFDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ADQSLNSFCQWQSALIGKNGKRHDHAILLTGFDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TINEDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNPCRKAEGNIMSPTLTGNNGVFSWSSCSRQ
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CCDS10 CSRTCGGGVKFQERHCNNPKPQYGGLFCPGSSRIYQLCNINPCNENSLDFRAQQCAEYNS
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CCDS10 ELVGCDHELGSKAVSDACGVCKGDNSTCKFYKGLYLNQHKANEYYPVVLIPAGARSIEIQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ELQVSSSYLAVRSLSQKYYLTGGWSIDWPGEFPFAGTTFEYQRSFNRPERLYAPGPTNET
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LVFEILMQGKNPGIAWKYALPKVMNGTPPATKRPAYTWSIVQSECSVSCGGGYINVKAIC
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CCDS10 LRDQNTQVNSSFCSAKTKPVTEPKICNAFSCPAYWMPGEWSTCSKACAGGQQSRKIQCVQ
910 920 930 940 950 960
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pF1KB9 KKPFQKEEAVLHSLCPVSTPTQVQACNSHACPPQWSLGPWSQCSKTCGRGVRKRELLCKG
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CCDS10 KKPFQKEEAVLHSLCPVSTPTQVQACNSHACPPQWSLGPWSQCSKTCGRGVRKRELLCKG
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pF1KB9 SAAETLPESQCTSLPRPELQEGCVLGRCPKNSRLQWVASSWSECSATCGLGVRKREMKCR
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CCDS10 SAAETLPESQCTSLPRPELQEGCVLGRCPKNSRLQWVASSWSECSATCGLGVRKREMKCS
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pF1KB9 EKGFQGKLITFPERRCRNIKKPNLDLEETCNRRACPAHPVYNMVAGWYSLPWQQCTVTCG
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CCDS10 EKGFQGKLITFPERRCRNIKKPNLDLEETCNRRACPAHPVYNMVAGWYSLPWQQCTVTCG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KB9 GGVQTRSVHCVQQGRPSSSCLLHQKPPVLRACNTNFCPAPEKREDPSCVDFFNWCHLVPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGVQTRSVHCVQQGRPSSSCLLHQKPPVLRACNTNFCPAPEKREDPSCVDFFNWCHLVPQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220
pF1KB9 HGVCNHKFYGKQCCKSCTRKI
:::::::::::::::::::::
CCDS10 HGVCNHKFYGKQCCKSCTRKI
1210 1220
>>CCDS43299.1 ADAMTS16 gene_id:170690|Hs108|chr5 (1224 aa)
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Smith-Waterman score: 5032; 56.2% identity (79.6% similar) in 1226 aa overlap (20-1219:9-1221)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MECALLLACAFRAAGSGPPRGLAGL----GRVAKALQLCCLCCASVAAALAS----DSSS
::::.: ..::. : . :..: . : .
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10 20 30 40
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pF1KB9 GASGLND--DYVFVTPVEVDSAGSYISHDILHNGRKKRSAQNAR-SSLHYRFSAFGQELH
: . .: .:. ::: :.:.::.:.:. :..:.. .. ::: :... ...:
CCDS43 ERPGWMEKGEYDLVSAYEVDHRGDYVSHEIMHHQRRRRAVPVSEVESLHLRLKGSRHDFH
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pF1KB9 LELKPSA-ILSSHFIVQVLGKDGASETQK-PEVQQCFYQGFIRNDSSSSVAVSTCAGLSG
..:. :. ... ::::.::: :.. .: : . ::::: .:. .::::.::: ::::
CCDS43 MDLRTSSSLVAPGFIVQTLGKTGTKSVQTLPPEDFCFYQGSLRSHRNSSVALSTCQGLSG
110 120 130 140 150 160
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pF1KB9 LIRTRKNEFLISPLPQLLAQEHNYSSPAGHHPHVLYKRTAEEKIQRYRGYPGSGRNYPGY
.:::.. .... :::. :. . . .. .. ::::::..: . ..:..
CCDS43 MIRTEEADYFLRPLPSHLSWKLGRAAQGSSPSHVLYKRSTEPHAPGASEVLVTSRTWE--
170 180 190 200 210 220
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pF1KB9 SPSHIP-HASQSRETEYHHRRLQKQHFCGRRKKYAPKPPTEDTYLRFDEYGSSGRPRRSA
.: : :.:. : :::::::::::: :.:: :: .. ::: : : .::
CCDS43 -LAHQPLHSSDLRLGLP-----QKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSL
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pF1KB9 GKSQKG--LNVETLVVADKKMVEKHGKGNVTTYILTVMNMVSGLFKDGTIGSDINVVVVS
.:... ::::::::.::::...::. :.:::.::..::::.::::::::..::...:.
CCDS43 LRSHRNEELNVETLVVVDKKMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVG
290 300 310 320 330 340
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pF1KB9 LILLEQEPGGLLINHHADQSLNSFCQWQSALIGKNGKRHDHAILLTGFDICSWKNEPCDT
:::::.: ::.:.::::..:.:::::::.:.::.: ::::::::::.::::::::::::
CCDS43 LILLEDEQPGLVISHHADHTLSSFCQWQSGLMGKDGTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCDT
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pF1KB9 LGFAPISGMCSKYRSCTINEDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNPCRKAEGNIMSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:.::::::::
CCDS43 LGFAPISGMCSKYRSCTINEDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCKKSEGNIMSPT
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pF1KB9 LTGNNGVFSWSSCSRQYLKKFLSTPQAGCLVDEPKQAGQYKYPDKLPGQIYDADTQCKWQ
:.: ::::::: ::::::.::::: :: ::.:.:: . .::::.::::..:::.::::::
CCDS43 LAGRNGVFSWSPCSRQYLHKFLSTAQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQ
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pF1KB9 FGAKAKLCSLGFVKDICKSLWCHRVGHRCETKFMPAAEGTVCGLSMWCRQGQCVKFGELG
:: ::::: : : :::::.:::::.:..::::::::::::.:: .:::: :::::.:. :
CCDS43 FGEKAKLCMLDFKKDICKALWCHRIGRKCETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEG
530 540 550 560 570 580
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pF1KB9 PRPIHGQWSAWSKWSECSRTCGGGVKFQERHCNNPKPQYGGLFCPGSSRIYQLCNINPCN
:.: ::.:: ::.:: :::::::::. . : :.::::..:: :: ::.: .::: . :
CCDS43 PKPTHGHWSDWSSWSPCSRTCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCP
590 600 610 620 630 640
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pF1KB9 ENSLDFRAQQCAEYNSKPFRGWFYQWKPYTKVEEEDRCKLYCKAENFEFFFAMSGKVKDG
..:.:::: ::::.::. ::: :.:::::.::..: ::::: ::.:.:::..:.:::::
CCDS43 RDSVDFRAAQCAEHNSRRFRGRHYKWKPYTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDG
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pF1KB9 TPCSPNKNDVCIDGVCELVGCDHELGSKAVSDACGVCKGDNSTCKFYKGLYLNQHKANEY
:::: .. .:::::.:: ::::. ::: :: :.::::.:.::.: ...::: ..:..:.:
CCDS43 TPCSEDSRNVCIDGICERVGCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHTNQY
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pF1KB9 YPVVLIPAGARSIEIQELQVSSSYLAVRSLSQKYYLTGGWSIDWPGEFPFAGTTFEYQRS
: .: ::.:::::.: :..::.::..::. ..:::.: :..::::.. :.::::.:.::
CCDS43 YHMVTIPSGARSIRIYEMNVSTSYISVRNALRRYYLNGHWTVDWPGRYKFSGTTFDYRRS
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pF1KB9 FNRPERLYAPGPTNETLVFEILMQGKNPGIAWKYALPKV-MNGTPPATKRPAYTWSIVQS
.:.:: : : :::::::. :.:.::.:::.::.:..:.. . ::: .:.:::.::.:
CCDS43 YNEPENLIATGPTNETLIVELLFQGRNPGVAWEYSMPRLGTEKQPPA--QPSYTWAIVRS
830 840 850 860 870
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::::::::: ..:. : :: . ::: :::. ::.::: :.. .:: : :.::.:
CCDS43 ECSVSCGGGQMTVREGCYRDLKFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSAC
880 890 900 910 920 930
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pF1KB9 SKACAGGQQSRKIQCVQKKPFQKEEAVLHSLCPVSTPTQVQACNSHACPPQWSLGPWSQC
:..:.:: ::: .::... ...: : :::: .:.. :::::..::: :: :::..:
CCDS43 SRTCGGGAQSRPVQCTRRVHYDSEP-VPASLCPQPAPSSRQACNSQSCPPAWSAGPWAEC
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pF1KB9 SKTCGRGVRKRELLCKGSA----AETLPESQCTSLPRPELQEGCVLGRCPKNSRLQWVAS
:.:::.: ::: . ::.. :. ::.. ::: :.:...:.:.: :: : ..:::..:
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CCDS43 HFCPIAEKK-DAFCKDYFHWCYLVPQHGMCSHKFYGKQCCKTCSKSNL
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CCDS39 KIGPSEEETLDYSGCLTHRPVEKEPCNNQSCPPQWVALDWSECTPKCGPGFKHRIVLCKS
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CCDS39 FR--QMCCKTCQGH
1110
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CCDS34 SQKQELWREKWERHNLPSRSLSRRSISKERW---VETLVVADTKMIEYHGSENVESYILT
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CCDS34 IMNMVTGLFHNPSIGNAIHIVVVRLILLEEEEQGLKIVHHAEKTLSSFCKWQKSINPKSD
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CCDS34 CNNPEPKFGGKYCTGERKRYRLCNVHPCRSEAPTFRQMQCSEFDTVPYKNELYHWFPI--
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CCDS34 TEDRCGVCLGDGSSCQTVRKMF-KQKEGSGYVDIGLIPKGARDIRVMEIEGAGNFLAIRS
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CCDS34 FCDPETQPNGRQKKCHEKACPPRWWAGEWEACSATCGPHGEKKRTVLCIQTM-VSDEQAL
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CCDS34 PPTDCQHLLKPKTLLSCNRDILCPSDWTVGNWSECSVSCGGGVRIRSVTCAKNHDE--P-
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CCDS34 --CDVTRKPNSRALCGLQQCPSSRRVLKPNKGTISNGKNPPTLKPVPPPTSRPRMLTTPT
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CCDS32 ---IVHPVRVDAGGSFLSYELWPRALRKRDVSVRRDAPAFYELQYRGRELRFNLTANQHL
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CCDS32 LAPGFVSETRRRGGLGRAHIRAHTPACHLLGEVQDPELEGGLAAISACDGLKGVFQLSNE
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pF1KB9 EFLISPLPQLLAQEHNYSSPA--GH-HPHVLYKRTAEEKIQRYRGYPGSGRNYPGYSPSH
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CCDS32 DYFIEPLD---------SAPARPGHAQPHVVYKRQAPERLAQ-RGDSSA----PSTCGVQ
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pF1KB9 IPHASQSRETEYHHRRLQKQHFCGRRKKYAPKPPTEDTYLRFDEYGSSGRPRRSAGKSQK
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CCDS32 VYPELESRRERWE----QRQQW--RR----PR-------LRRLH-------QRSVSKEKW
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pF1KB9 GLNVETLVVADKKMVEKHGKGNVTTYILTVMNMVSGLFKDGTIGSDINVVVVSLILLEQE
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CCDS32 ---VETLVVADAKMVEYHGQPQVESYVLTIMNMVAGLFHDPSIGNPIHITIVRLVLLEDE
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CCDS32 EEDLKITHHADNTLKSFCKWQKSINMKGDAHPLHHDTAILLTRKDLCAAMNRPCETLGLS
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CCDS32 HVAGMCQPHRSCSINEDTGLPLAFTVAHELGHSFGIQHDGSGNDCEPV-GKRPFIMSPQL
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CCDS32 GAYSAFCED--MDNVCHTLWCS-VGTTCHSKLDAAVDGTRCGENKWCLSGECVPVG-FRP
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CCDS32 R
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CCDS12 VAKLFQDSSLGSTVNILVTRLILLTEDQPTLEITHHAGKSLDSFCKWQKSIVNHSGHGNA
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CCDS12 GLCLNNRPPRQ-DFVYPTVAPGQAYDADEQCRFQHGVKSRQCKYG---EVCSELWCLSKS
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