Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9478
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9478, 1211 aa
1>>>pF1KB9478 1211 - 1211 aa - 1211 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.5522+/-0.00109; mu= -24.5254+/- 0.066
mean_var=521.2152+/-107.159, 0's: 0 Z-trim(116.2): 60 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.056178
statistics sampled from 16754 (16809) to 16754 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.516), width: 16
Scan time: 6.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210) 8039 666.9 8.6e-191
CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218) 8030 666.1 1.4e-190
CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163) 1581 143.4 3e-33
CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251) 1318 122.1 8.4e-27
CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226) 1313 121.7 1.1e-26
CCDS14684.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1311) 780 78.5 1.2e-13
CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 772 77.9 1.8e-13
CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX ( 952) 761 76.9 2.6e-13
CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 751 76.2 5.9e-13
>>CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210 aa)
initn: 7624 init1: 7338 opt: 8039 Z-score: 3538.8 bits: 666.9 E(32554): 8.6e-191
Smith-Waterman score: 8039; 99.9% identity (99.9% similar) in 1211 aa overlap (1-1211:1-1210)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 ADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 CPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 CPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEVHCVEEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 DQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEVHCVEEIL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 KEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 SMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 SDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 HPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 HPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 GTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRAAASNEPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 GTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRAAASNEPK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 PAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEHFALVPLTESQGPPHSGSGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 PAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEHFALVPLTESQGPPHSGSGSR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 TSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 SRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEIKSQSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEIKSQSSSS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 SSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 SSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 KQQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KQQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 ETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 ETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 FESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQ
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 FESSSKVAQAPSPCIA-STGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQ
1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB9 NMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 NMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQG
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210
pF1KB9 FQQLQELTKTP
:::::::::::
CCDS36 FQQLQELTKTP
1200 1210
>>CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218 aa)
initn: 8030 init1: 8030 opt: 8030 Z-score: 3534.8 bits: 666.1 E(32554): 1.4e-190
Smith-Waterman score: 8030; 99.9% identity (100.0% similar) in 1207 aa overlap (5-1211:12-1218)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDEL
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDEL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 QSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 HKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 SNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 VRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEV
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 HCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 NSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESES
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 TSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPR
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 STEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 PPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRA
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 AASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEHFALVPLTESQGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEHFALVPLTESQGPP
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB9 HSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB9 PQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEI
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB9 KSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCG
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KB9 QDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPG
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB9 KPQVKFDKQQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KPQVKFDKQQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSK
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB9 SAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKY
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB9 SRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB9 STPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210
pF1KB9 VHYTRQGFQQLQELTKTP
::::::::::::::::::
CCDS54 VHYTRQGFQQLQELTKTP
1210
>>CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163 aa)
initn: 1393 init1: 451 opt: 1581 Z-score: 710.3 bits: 143.4 E(32554): 3e-33
Smith-Waterman score: 2476; 39.7% identity (68.6% similar) in 1228 aa overlap (10-1209:4-1160)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDELSSRIQN
.:::.::..:.:::::: .: ..::: . :::.:::: :.: :.::::::.
CCDS41 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 MLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPS--SSFHTSVHHQSIH
:::::.:.:.:.. .: .: : . :: : :. :. :. . : . :..:
CCDS41 MLGNYDEMKDFIGDRS-IPKLVA----IPKPTVPPSADEKSN-PNFFEQRHGGSHQSSKW
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 TPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLH------AKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGS
::. :: . . ...: :. . : : : : . .:. .:: . .. ::
CCDS41 TPV-GP------APSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRESYNNSGS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 SHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVH
: .:::.. :.. .. .:.: . :. : :. :: . :
CCDS41 SSRKKGQH---GSEHSKSRSSSPGK--------PQAVSSLNSSHS------------RSH
170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 GSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPT
:....:: . .:::.: . . ..:. . .: .:.::: :: ::: .: ::::
CCDS41 GNDHHSKEHQRSKSPRDPDA---NWDSPSRVPFSSGQHSTQSFPP-SLMSKSNSMLQKPT
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340
pF1KB9 AYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEK--TDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTY
:::::::::. : :.:. : : .:. . :.:: .::.:::::.::: .. .
CCDS41 AYVRPMDGQE---SMEPKLS--SEHYSSQSHGNSMTELKPSSKAHLTKLKIPSQPLDASA
260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 SNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSS
:..: ::.:::::::::::::::::::: .::::::::::.::. . : .::.:. :
CCDS41 SGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQKRYNPS-
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 KTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQT-----PEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASA
:: ::..: ..:::.:::.::.:::::.:: :.. :.:.. :: .: : . ..
CCDS41 KT-SNGHQ-SKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNS--EGADNS
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 HSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQ
...:. :.: :.:.:.::::::::::::: ::: .. .:::::: ::::::::::.::.
CCDS41 RDDSS-SHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNP
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 PAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGK--
. : . ... : . .: . ...:.. ..... : ..:: .: .. . :.
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.. :. ::: . ..: : . :..::::.::. . .:. : :. . . :
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CCDS41 ESLPPSSQTPKYPES---NRTP-VKPSSVEEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRY
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CCDS33 HWLRNSAHLS
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pF1KB9 SSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAM
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CCDS42 MAAKHSSS----GHC-----------------------------VQNFPP-SLASKPSLV
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CCDS42 QQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE-PARAKAKLSKFSI
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CCDS42 PKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGH
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CCDS42 NNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPN
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pF1KB9 APQSLPEPVASAHSSSA-ESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPT
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CCDS42 CRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPAS
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CCDS42 SNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPSLREK
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pF1KB9 E-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPEA--------PHPGKRSCQKSPAQQEP-PQ
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CCDS42 EIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPC--APAENAPAPA
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CCDS42 RRSAG----KKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRA
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pF1KB9 AASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDRTPEHFAL-----
. .: . .: ... . : . :: . :. ..:. . :.. :
CCDS42 SHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQT
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pF1KB9 VPLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLS
: . :.: ..::: :. : .: ...: .. .:. ..:::
CCDS42 VAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLS
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pF1KB9 PLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIP----QPPGKGSRQ-RKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSD
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CCDS42 PLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPS---HTSDTPAEK
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CCDS42 ALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKN
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pF1KB9 SKKEMLPPPPVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRV
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CCDS42 EKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPN---GNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGD
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pF1KB9 EGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDK--QQADLHMREAKKMKQ
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CCDS42 LTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKH
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CCDS42 KADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHS
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pF1KB9 DATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIA
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CCDS42 GPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGA
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KB9 --RSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVL
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CCDS42 SGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSIL
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1160 1170 1180 1190 1200 1210
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..: ::.:. :...:.::: :. . ..:.::. ::.:..::.. :.
CCDS42 HSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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::: ..: ::: ::::::.: . . : . :. . :... . .. . .
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:... :. . .:: :::. . : . :: ... . : .. :.:
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CCDS14 LFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVN
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: : ..... .:.. :: ..:: .:.::::.:.::. . .
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CCDS14 KFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDG
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CCDS14 SPVSLNNVSPINAMGNCNNG----------PVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWD
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CCDS78 LMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNG----------PVT
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CCDS78 IPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLV
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CCDS78 RYVRQGLCWLRIDAHLL
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CCDS55 MKFKRRHQAFPSFFKMKVSLPSDPSCVEEILRESQH
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CCDS55 LTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVS-FKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQA
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pF1KB9 PEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAE-SESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLE
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CCDS55 VEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPR
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CCDS55 VATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETI-SLPPPIIQPMEVQMKVK
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CCDS55 TNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQR-TIGKKQPK
220 230 240 250 260 270
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CCDS55 KVEKNTS-----TDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPN
280 290 300 310 320
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CCDS55 IPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSK
330 340 350 360 370 380
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CCDS55 EICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNE-EPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKID
390 400 410 420 430 440
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