Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9469
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9469, 802 aa
1>>>pF1KB9469 802 - 802 aa - 802 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3367+/-0.00102; mu= 3.5081+/- 0.062
mean_var=240.3626+/-48.542, 0's: 0 Z-trim(112.6): 123 B-trim: 7 in 1/51
Lambda= 0.082726
statistics sampled from 13247 (13370) to 13247 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.411), width: 16
Scan time: 3.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14388.1 OPHN1 gene_id:4983|Hs108|chrX ( 802) 5367 654.1 2.6e-187
CCDS47297.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 ( 759) 2182 273.9 6.8e-73
CCDS4277.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 ( 814) 2172 272.8 1.6e-72
CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs108|chr4 ( 786) 1332 172.5 2.4e-42
>>CCDS14388.1 OPHN1 gene_id:4983|Hs108|chrX (802 aa)
initn: 5367 init1: 5367 opt: 5367 Z-score: 3476.2 bits: 654.1 E(32554): 2.6e-187
Smith-Waterman score: 5367; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (1-802:1-802)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGHPPLEFSDCYLDSPDFRERLKCYEQELERTNKFIKDVIKDGNALISAMRNYSSAVQKF
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CCDS14 MGHPPLEFSDCYLDSPDFRERLKCYEQELERTNKFIKDVIKDGNALISAMRNYSSAVQKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SQTLQSFQFDFIGDTLTDDEINIAESFKEFAELLNEVENERMMMVHNASDLLIKPLENFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SQTLQSFQFDFIGDTLTDDEINIAESFKEFAELLNEVENERMMMVHNASDLLIKPLENFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KEQIGFTKERKKKFEKDGERFYSLLDRHLHLSSKKKESQLQEADLQVDKERHNFFESSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KEQIGFTKERKKKFEKDGERFYSLLDRHLHLSSKKKESQLQEADLQVDKERHNFFESSLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 YVYQIQEVQESKKFNIVEPVLAFLHSLFISNSLTVELTQDFLPYKQQLQLSLQNTRNHFS
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CCDS14 YVYQIQEVQESKKFNIVEPVLAFLHSLFISNSLTVELTQDFLPYKQQLQLSLQNTRNHFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 STREEMEELKKRMKEAPQTCKLPGQPTIEGYLYTQEKWALGISWVKYYCQYEKETKTLTM
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CCDS14 STREEMEELKKRMKEAPQTCKLPGQPTIEGYLYTQEKWALGISWVKYYCQYEKETKTLTM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 TPMEQKPGAKQGPLDLTLKYCVRRKTESIDKRFCFDIETNERPGTITLQALSEANRRLWM
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CCDS14 TPMEQKPGAKQGPLDLTLKYCVRRKTESIDKRFCFDIETNERPGTITLQALSEANRRLWM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 EAMDGKEPIYHSPITKQQEMELNEVGFKFVRKCINIIETKGIKTEGLYRTVGSNIQVQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EAMDGKEPIYHSPITKQQEMELNEVGFKFVRKCINIIETKGIKTEGLYRTVGSNIQVQKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LNAFFDPKCPGDVDFHNSDWDIKTITSSLKFYLRNLSEPVMTYRLHKELVSAAKSDNLDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LNAFFDPKCPGDVDFHNSDWDIKTITSSLKFYLRNLSEPVMTYRLHKELVSAAKSDNLDY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 RLGAIHSLVYKLPEKNREMLELLIRHLVNVCEHSKENLMTPSNMGVIFGPTLMRAQEDTV
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CCDS14 RLGAIHSLVYKLPEKNREMLELLIRHLVNVCEHSKENLMTPSNMGVIFGPTLMRAQEDTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 AAMMNIKFQNIVVEILIEHFGKIYLGPPEESAAPPVPPPRVTARRHKPITISKRLLRERT
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CCDS14 AAMMNIKFQNIVVEILIEHFGKIYLGPPEESAAPPVPPPRVTARRHKPITISKRLLRERT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 VFYTSSLDESEDEIQHQTPNGTITSSIEPPKPPQHPKLPIQRSGETDPGRKSPSRPILDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VFYTSSLDESEDEIQHQTPNGTITSSIEPPKPPQHPKLPIQRSGETDPGRKSPSRPILDG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 KLEPCPEVDVGKLVSRLQDGGTKITPKATNGPMPGSGPTKTPSFHIKRPAPRPLAHHKEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KLEPCPEVDVGKLVSRLQDGGTKITPKATNGPMPGSGPTKTPSFHIKRPAPRPLAHHKEG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 DADSFSKVRPPGEKPTIIRPPVRPPDPPCRAATPQKPEPKPDIVAGNAGEITSSVVASRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DADSFSKVRPPGEKPTIIRPPVRPPDPPCRAATPQKPEPKPDIVAGNAGEITSSVVASRT
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB9 RFFETASRKTGSSQGRLPGDES
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CCDS14 RFFETASRKTGSSQGRLPGDES
790 800
>>CCDS47297.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 (759 aa)
initn: 2157 init1: 1170 opt: 2182 Z-score: 1422.1 bits: 273.9 E(32554): 6.8e-73
Smith-Waterman score: 2182; 48.8% identity (75.0% similar) in 735 aa overlap (1-726:1-723)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGHPPLEFSDCYLDSPDFRERLKCYEQELERTNKFIKDVIKDGNALISAMRNYSSAVQKF
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CCDS47 MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SQTLQSFQFDFIGDTLTDDEINIAESFKEFAELLNEVENERMMMVHNASDLLIKPLENFR
...:. :.:. :::. ::::. ::.:..::: .: ..:.::. :..:::..:: :::.::
CCDS47 ADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KEQIGFTKERKKKFEKDGERFYSLLDRHLHLSSKKKESQLQEADLQVDKERHNFFESSLD
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CCDS47 KEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 YVYQIQEVQESKKFNIVEPVLAFLHSLFISNSLTVELTQDFLPYKQQLQLSLQNTRNHFS
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CCDS47 YVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 STREEMEELKKRMKEAPQTCKLPGQPTIEGYLYTQEKWALGISWVKYYCQYEKETKTLTM
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CCDS47 GTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB9 TPMEQKPGAKQGPLD-LTLKYCVRRKTESIDKRFCFDIETNERPGTITLQALSEANRRLW
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CCDS47 VPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLW
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 MEAMDGKEPIYHSPITKQQE--MELNEVGFKFVRKCINIIETKGIKTEGLYRTVGSNIQV
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CCDS47 MEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 QKLLNAFFDPKCPGDVDFH-NSDWDIKTITSSLKFYLRNLSEPVMTYRLHKELVSAAKSD
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CCDS47 QKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 NLDYRLGAIHSLVYKLPEKNREMLELLIRHLVNVCEHSKENLMTPSNMGVIFGPTLMRAQ
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CCDS47 NQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQ
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 EDTVAAMMNIKFQNIVVEILIEHFGKIYLGPPEES-AAPPVPPPRVTARRHKPITISKRL
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CCDS47 EETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERP
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 LRERTVFYTSSLDESEDEIQHQTPNGTITSSIEPPKPPQHPKLPIQ---RSGETDPGRKS
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CCDS47 L---TLFHTVQSTEKQEQ-RNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVK
610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 PSRPILDGKLEPCPEVDVGKLVSRLQDGGTKITPKATNGPMPGSGPTKTPSFHIKRPAPR
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CCDS47 PTRP---NSLPPNPS-PTSPLSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSDSSPVSTP-F---RKAKA
660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB9 PLAHHKEGDAD-SFSKVRPPGEKPTIIRPPVRPPDPPCRAATPQKPEPKPDIVAGNAGEI
: . : :.. ::.
CCDS47 LYACKAEHDSELSFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPENYVEFL
710 720 730 740 750
>>CCDS4277.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 (814 aa)
initn: 2164 init1: 1170 opt: 2172 Z-score: 1415.3 bits: 272.8 E(32554): 1.6e-72
Smith-Waterman score: 2172; 49.5% identity (75.9% similar) in 711 aa overlap (1-703:1-697)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGHPPLEFSDCYLDSPDFRERLKCYEQELERTNKFIKDVIKDGNALISAMRNYSSAVQKF
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CCDS42 MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SQTLQSFQFDFIGDTLTDDEINIAESFKEFAELLNEVENERMMMVHNASDLLIKPLENFR
...:. :.:. :::. ::::. ::.:..::: .: ..:.::. :..:::..:: :::.::
CCDS42 ADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KEQIGFTKERKKKFEKDGERFYSLLDRHLHLSSKKKESQLQEADLQVDKERHNFFESSLD
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CCDS42 KEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 YVYQIQEVQESKKFNIVEPVLAFLHSLFISNSLTVELTQDFLPYKQQLQLSLQNTRNHFS
::...::::: : :..:::.::::..:: ::..:: .: :: .:.:::::.:
CCDS42 YVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 STREEMEELKKRMKEAPQTCKLPGQPTIEGYLYTQEKWALGISWVKYYCQYEKETKTLTM
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CCDS42 GTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB9 TPMEQKPGAKQGPLD-LTLKYCVRRKTESIDKRFCFDIETNERPGTITLQALSEANRRLW
.:..:: :.: : . . :: :.::::.::.::::::.:. .:::.::.::::: .::::
CCDS42 VPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLW
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 MEAMDGKEPIYHSPITKQQE--MELNEVGFKFVRKCINIIETKGIKTEGLYRTVGSNIQV
::::::.::.:.: .:.: .:. .::...::::. .::.::. .:::: :: : .:
CCDS42 MEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 QKLLNAFFDPKCPGDVDFH-NSDWDIKTITSSLKFYLRNLSEPVMTYRLHKELVSAAKSD
::::....::: .... ..:.::::::.:: ::: : :.: :.... ...::: .
CCDS42 QKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 NLDYRLGAIHSLVYKLPEKNREMLELLIRHLVNVCEHSKENLMTPSNMGVIFGPTLMRAQ
: . :.. :::::..::::::.::.::. ::.:: .. :.:::: .:.::.:::::.: :
CCDS42 NQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQ
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 EDTVAAMMNIKFQNIVVEILIEHFGKIYLGPPEES-AAPPVPPPRVTARRHKPITISKRL
:.::::.:.:::::::.:::::. ::. :. . . : . :: . :.:
CCDS42 EETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERP
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 LRERTVFYTSSLDESEDEIQHQTPNGTITSSIEPPKPPQHPKLPIQ---RSGETDPGRKS
: :.:.: . :.... ... :... : :. . . .: :.. : . .
CCDS42 L---TLFHTVQSTEKQEQ-RNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVK
610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 PSRPILDGKLEPCPEVDVGKLVSRLQDGGTKITPKATNGPMPGSGPTKTPSFHIKRPAPR
:.:: ..: : : .: :. . .. : ..::: :. .. :
CCDS42 PTRP---NSLPPNPSP-----TSPLSPSWPMFS--APSSPMPTSSTSSDSSPVRSVAGFV
660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB9 PLAHHKEGDADSFSKVRPPGEKPTIIRPPVRPPDPPCRAATPQKPEPKPDIVAGNAGEIT
CCDS42 WFSVAAVVLSLARSSLHAVFSLLVNFVPCHPNLHLLFDRPEEAVHEDSSTPFRKAKALYA
710 720 730 740 750 760
>>CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs108|chr4 (786 aa)
initn: 1934 init1: 1005 opt: 1332 Z-score: 873.7 bits: 172.5 E(32554): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 2128; 44.5% identity (70.9% similar) in 821 aa overlap (1-799:1-773)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGHPPLEFSDCYLDSPDFRERLKCYEQELERTNKFIKDVIKDGNALISAMRNYSSAVQKF
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CCDS34 MGLQPLEFSDCYLDSPWFRERIRAHEAELERTNKFIKELIKDGKNLIAATKSLSVAQRKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SQTLQSFQFDFIGDTLTDDEINIAESFKEFAELLNEVENERMMMVHNASDLLIKPLENFR
...:..:.:.::::..:::: : :..::...:...:..: .:. .... ::::::.::
CCDS34 AHSLRDFKFEFIGDAVTDDERCIDASLREFSNFLKNLEEQREIMALSVTETLIKPLEKFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KEQIGFTKERKKKFEKDGERFYSLLDRHLHLSSKKKESQLQEADLQVDKERHNFFESSLD
:::.: .::.::::.:. :. :::.:.::.::.:::.:.:::::.::...:..:.: ::.
CCDS34 KEQLGAVKEEKKKFDKETEKNYSLIDKHLNLSAKKKDSHLQEADIQVEQNRQHFYELSLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 YVYQIQEVQESKKFNIVEPVLAFLHSLFISNSLTVELTQDFLPYKQQLQLSLQNTRNHFS
:: ..::.:: :::..:::.:.:....: ::..:: ::..::...:::::.:
CCDS34 YVCKLQEIQERKKFEFVEPMLSFFQGMFTFYHQGHELAKDFNHYKMELQINIQNTRNRFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB9 STREEMEELKKRMKEAPQTCKLPGQPTIEGYLYTQEKWA--LGISWVKYYCQYEKETKTL
.:: :.::: ..... :. : .: : :::::.::: .: ::::.::.:.: .: .
CCDS34 GTRSEVEELMNKIRQNPKDHKRASQFTAEGYLYVQEKRPAPFGSSWVKHYCMYRKAAKKF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TMTPMEQKPGAKQGPLDLT-LKYCVRRKTESIDKRFCFDIETNERPG-TITLQALSEANR
.: :.:.. :.: : .. :: :..:.:.:::.:::::::. .::: ..:.::.:: .:
CCDS34 NMIPFEHRSGGKLGDGEVFFLKECTKRHTDSIDRRFCFDIEAADRPGVSLTMQAFSEEER
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 RLWMEAMDGKEPIYHS---PITKQQE--MELNEVGFKFVRKCINIIETKGIKTEGLYRTV
. :.::. ::: . :: : . : .:...:: ..::::. .::.::. .::::.:
CCDS34 KQWLEALGGKEALSHSFNTAIIPRPEGNAQLDKMGFTIIRKCISAVETRGINDQGLYRVV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 GSNIQVQKLLNAFFDPKCPGDVDFHNS-DWDIKTITSSLKFYLRNLSEPVMTYRLHKELV
: . .::.::. ..: : ..::..:: ::..:::::.:: :::.: ::.:::.:: ...
CCDS34 GVSSKVQRLLSMLMDVKTCNEVDLENSADWEVKTITSALKQYLRSLPEPLMTYELHGDFI
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 SAAKSDNLDYRLGAIHSLVYKLPEKNREMLELLIRHLVNVCEHSKENLMTPSNMGVIFGP
::: . . :..::: ::.::::::.:::..:..::.:: .:::.:::: .:.::.:::
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