FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9419, 543 aa
1>>>pF1KB9419 543 - 543 aa - 543 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.2528+/-0.000808; mu= -18.7035+/- 0.048
mean_var=914.1116+/-202.954, 0's: 0 Z-trim(116.0): 1163 B-trim: 1501 in 1/53
Lambda= 0.042420
statistics sampled from 25450 (26797) to 25450 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16
Scan time: 10.330
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005424 (OMIM: 164880) tyrosine-protein kinase Y ( 543) 3672 241.4 5.3e-63
XP_016881449 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-pr ( 543) 3672 241.4 5.3e-63
XP_005258196 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-pr ( 499) 2875 192.6 2.4e-48
XP_011527315 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 536) 2725 183.5 1.5e-45
NP_938033 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 2725 183.5 1.5e-45
NP_005408 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 2725 183.5 1.5e-45
XP_016883515 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 2703 182.1 3.7e-45
XP_016883516 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 2703 182.1 3.7e-45
XP_016883514 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 2703 182.1 3.7e-45
XP_016883513 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 2703 182.1 3.7e-45
XP_005266947 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 534) 2675 180.4 1.2e-44
NP_694592 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 534) 2675 180.4 1.2e-44
NP_002028 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
XP_016866139 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
XP_016866140 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
XP_016866141 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
XP_016866143 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
XP_016866142 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 2640 178.3 5.4e-44
NP_005239 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinase F ( 529) 2465 167.6 8.9e-41
XP_006710515 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 2465 167.6 8.9e-41
NP_001036212 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 2465 167.6 8.9e-41
XP_011539312 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 2465 167.6 8.9e-41
NP_001036194 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 2465 167.6 8.9e-41
NP_001165604 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 2055 142.4 3.1e-33
NP_001165600 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 2055 142.4 3.1e-33
NP_001165603 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 506) 2055 142.4 3.1e-33
NP_002101 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinase H ( 526) 2055 142.5 3.2e-33
NP_001165602 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 504) 2044 141.8 5e-33
NP_001165601 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 525) 2044 141.8 5.1e-33
XP_016868905 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 491) 1945 135.7 3.3e-31
NP_001104567 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinas ( 491) 1945 135.7 3.3e-31
NP_002341 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinase L ( 512) 1945 135.7 3.3e-31
NP_001036236 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protei ( 509) 1942 135.5 3.8e-31
NP_005347 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protein k ( 509) 1942 135.5 3.8e-31
XP_011515831 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 682) 1945 135.9 3.9e-31
XP_011539313 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 460) 1909 133.4 1.4e-30
NP_001706 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protein k ( 505) 1879 131.7 5.4e-30
NP_001317394 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protei ( 434) 1839 129.1 2.7e-29
XP_016856162 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 325) 1731 122.3 2.3e-27
XP_016856163 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 325) 1731 122.3 2.3e-27
XP_011539316 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 325) 1731 122.3 2.3e-27
XP_011539314 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 410) 1540 110.8 8.5e-24
XP_005266949 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 482) 1523 109.8 1.9e-23
NP_694593 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 482) 1523 109.8 1.9e-23
XP_011533956 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
XP_005266937 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
NP_002022 (OMIM: 606573) tyrosine-protein kinase F ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
XP_005266939 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
XP_016866134 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
XP_005266938 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1438 104.7 7.3e-22
>>NP_005424 (OMIM: 164880) tyrosine-protein kinase Yes [ (543 aa)
initn: 3672 init1: 3672 opt: 3672 Z-score: 1252.1 bits: 241.4 E(85289): 5.3e-63
Smith-Waterman score: 3672; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 IEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 ENL
:::
NP_005 ENL
>>XP_016881449 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-protei (543 aa)
initn: 3672 init1: 3672 opt: 3672 Z-score: 1252.1 bits: 241.4 E(85289): 5.3e-63
Smith-Waterman score: 3672; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
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310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 IEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNRE
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pF1KB9 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 ENL
:::
XP_016 ENL
>>XP_005258196 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-protei (499 aa)
initn: 2875 init1: 2875 opt: 2875 Z-score: 988.9 bits: 192.6 E(85289): 2.4e-48
Smith-Waterman score: 3272; 91.9% identity (91.9% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAKGTAVNFSSLSMT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 INNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KVAIKTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYIVTEFMSKGSLLDFL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLARL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 IEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNRE
::::::::::: :::::
XP_005 IEDNEYTARQG--------------------------------------------MVNRE
430
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPG
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 ENL
:::
XP_005 ENL
>>XP_011527315 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTED: p (536 aa)
initn: 2696 init1: 2696 opt: 2725 Z-score: 939.0 bits: 183.5 E(85289): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 2725; 74.5% identity (86.8% similar) in 546 aa overlap (1-543:1-536)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSA---KGTAVNFSSL
:: ::: :. . . : . : : . . :: :.. .: .:: .: .. :.
XP_011 MGSNKSKP-KDASQRRRSLEPAENVHGAGG--GAFPASQTPSKPASADGHRGPSAAFAPA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SMTPFGGSSGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGER
. : ::: .:: .:. . . :.:::: ::::::::.:: :::::::::
XP_011 AAEP-------KLFGGFNSSDTVTSPQRAGPLAGGVTTFVALYDYESRTETDLSFKKGER
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 FQIINNTEGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGN
.::.:::::::: :.:..::..::::::::::.::::::::::::. :...:::::: :
XP_011 LQIVNNTEGDWWLAHSLSTGQTGYIPSNYVAPSDSIQAEEWYFGKITRRESERLLLNAEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 QRGIFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLV
:: ::::::::::::: ::. :.:. .: :::::::::::.::.:::.:.::..::.::
XP_011 PRGTFLVRESETTKGAYCLSVSDFDNAKGLNVKHYKIRKLDSGGFYITSRTQFNSLQQLV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 KHYTEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWN
.:..:::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB9 KHYTEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWN
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pF1KB9 ATEPQYQPGENL
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pF1KB9 MGCIKSKENKSPAIKYRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSA---KGTAVNFSSL
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. : ::: .:: .:. . . :.:::: ::::::::.:: :::::::::
XP_016 AAEP-------KLFGGFNSSDTVTSPQRAGPLAGGVTTFVALYDYESRTETDLSFKKGER
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pF1KB9 FQIINNT------EGDWWEARSIATGKNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERL
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pF1KB9 LLNPGNQRGIFLVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFD
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XP_016 VADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRV
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pF1KB9 ATEPQYQPGENL
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