Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9417
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9417, 885 aa
1>>>pF1KB9417 885 - 885 aa - 885 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6701+/-0.00112; mu= -3.7448+/- 0.065
mean_var=403.1192+/-91.967, 0's: 0 Z-trim(112.9): 383 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.063879
statistics sampled from 13130 (13559) to 13130 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.417), width: 16
Scan time: 4.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 885) 6126 579.9 6.9e-165
CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 626) 3114 302.2 2e-81
CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 894) 3114 302.3 2.5e-81
CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 845) 2244 222.1 3.3e-57
CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 890) 2244 222.2 3.4e-57
CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 ( 999) 2129 211.6 5.7e-54
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 794 88.7 7.7e-17
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 794 88.7 7.7e-17
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 793 88.6 8.3e-17
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 793 88.6 8.4e-17
CCDS482.1 TIE1 gene_id:7075|Hs108|chr1 (1138) 781 87.4 1.6e-16
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 773 87.0 4.3e-16
CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1081) 761 85.6 5.4e-16
CCDS6519.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1124) 761 85.6 5.6e-16
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 757 85.1 5.7e-16
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 764 86.0 5.9e-16
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 757 85.1 6e-16
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 751 84.8 1.2e-15
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 751 84.8 1.2e-15
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 749 84.5 1.3e-15
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1351) 749 84.6 1.4e-15
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1400) 749 84.6 1.4e-15
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 729 82.7 4.7e-15
CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 ( 976) 716 81.4 8.9e-15
CCDS77820.1 RYK gene_id:6259|Hs108|chr3 ( 607) 695 79.2 2.5e-14
CCDS75016.1 RYK gene_id:6259|Hs108|chr3 ( 610) 695 79.2 2.5e-14
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 687 78.6 5.1e-14
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 687 78.6 5.1e-14
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 679 78.0 1e-13
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 679 78.0 1e-13
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 ( 940) 673 77.4 1.4e-13
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 670 77.0 1.4e-13
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 670 77.0 1.4e-13
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1030) 673 77.4 1.4e-13
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 670 77.1 1.5e-13
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 670 77.1 1.5e-13
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 670 77.1 1.5e-13
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 670 77.1 1.5e-13
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 670 77.1 1.5e-13
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1014) 668 77.0 2e-13
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 661 76.2 2.4e-13
CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 734) 661 76.2 2.5e-13
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 661 76.2 2.6e-13
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 661 76.2 2.6e-13
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 655 75.5 3.1e-13
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 655 75.6 3.5e-13
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 655 75.6 3.5e-13
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 655 75.6 3.5e-13
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 655 75.6 3.6e-13
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 655 75.7 3.9e-13
>>CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 (885 aa)
initn: 6126 init1: 6126 opt: 6126 Z-score: 3073.8 bits: 579.9 E(32554): 6.9e-165
Smith-Waterman score: 6126; 100.0% identity (100.0% similar) in 885 aa overlap (1-885:1-885)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESPFVGNPGNITGARGLTGTLRCQLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESPFVGNPGNITGARGLTGTLRCQLQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 QGEPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRITSLQLSDTGQYQCLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QGEPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRITSLQLSDTGQYQCLVF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQGPPEPVDLLWLQDAVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQGPPEPVDLLWLQDAVPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATITVLPQQPRNLHLVSRQPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATITVLPQQPRNLHLVSRQPTE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQASVPPHQLRLGSLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQASVPPHQLRLGSLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 PHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGSQAFVHWQEPRAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGSQAFVHWQEPRAPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 QGTLLGYRLAYQGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSVSNLTVCVAAYTAAGDGPWSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QGTLLGYRLAYQGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSVSNLTVCVAAYTAAGDGPWSLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 VPLEAWRPVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILALFLVHRRKKETRYGEVFEPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VPLEAWRPVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILALFLVHRRKKETRYGEVFEPTV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 ERGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ERGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 VMEGQLNQDDSILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VMEGQLNQDDSILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQGSE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 RESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLSTKRFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLSTKRFI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 HRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 SDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYALMSRCWELN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYALMSRCWELN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 PQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAGGADPPTQPDPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAGGADPPTQPDPK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KB9 DSCSCLTAAEVHPAGRYVLCPSTTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DSCSCLTAAEVHPAGRYVLCPSTTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA
850 860 870 880
>>CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 (626 aa)
initn: 4233 init1: 3114 opt: 3114 Z-score: 1575.4 bits: 302.2 E(32554): 2e-81
Smith-Waterman score: 4219; 98.6% identity (98.6% similar) in 626 aa overlap (269-885:1-626)
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TELEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQASVPPHQLRLGS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MGIQAGEPDPPEEPLTSQASVPPHQLRLGS
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 LHPHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGSQAFVHWQEPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LHPHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGSQAFVHWQEPRA
40 50 60 70 80 90
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 PLQGTLLGYRLAYQGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSVSNLTVCVAAYTAAGDGPWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 PLQGTLLGYRLAYQGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSVSNLTVCVAAYTAAGDGPWS
100 110 120 130 140 150
420 430 440 450 460
pF1KB9 LPVPLEAWRP---------VKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILALFLVHRRKKE
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LPVPLEAWRPGQAQPVHQLVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILALFLVHRRKKE
160 170 180 190 200 210
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 TRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVAL
220 230 240 250 260 270
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 GKTLGEGEFGAVMEGQLNQDDSILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GKTLGEGEFGAVMEGQLNQDDSILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVM
280 290 300 310 320 330
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 RLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIAS
340 350 360 370 380 390
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 GMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAI
400 410 420 430 440 450
710 720 730 740 750 760
pF1KB9 ESLADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ESLADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGL
460 470 480 490 500 510
770 780 790 800 810 820
pF1KB9 YALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 YALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAG
520 530 540 550 560 570
830 840 850 860 870 880
pF1KB9 GADPPTQPDPKDSCSCLTAAEVHPAGRYVLCPSTTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GADPPTQPDPKDSCSCLTAAEVHPAGRYVLCPSTTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA
580 590 600 610 620
>>CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 (894 aa)
initn: 6112 init1: 3114 opt: 3114 Z-score: 1573.5 bits: 302.3 E(32554): 2.5e-81
Smith-Waterman score: 6098; 99.0% identity (99.0% similar) in 894 aa overlap (1-885:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESPFVGNPGNITGARGLTGTLRCQLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESPFVGNPGNITGARGLTGTLRCQLQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 QGEPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRITSLQLSDTGQYQCLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QGEPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRITSLQLSDTGQYQCLVF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQGPPEPVDLLWLQDAVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQGPPEPVDLLWLQDAVPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATITVLPQQPRNLHLVSRQPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATITVLPQQPRNLHLVSRQPTE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQASVPPHQLRLGSLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQASVPPHQLRLGSLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 PHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGSQAFVHWQEPRAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGSQAFVHWQEPRAPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 QGTLLGYRLAYQGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSVSNLTVCVAAYTAAGDGPWSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QGTLLGYRLAYQGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSVSNLTVCVAAYTAAGDGPWSLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB9 VPLEAWRP---------VKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILALFLVHRRKKETR
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VPLEAWRPGQAQPVHQLVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILALFLVHRRKKETR
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 YGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGK
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 TLGEGEFGAVMEGQLNQDDSILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TLGEGEFGAVMEGQLNQDDSILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRL
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600 610 620 630 640 650
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIASGM
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 EYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIES
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
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CCDS12 LADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYA
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAGGA
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880
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CCDS12 DPPTQPDPKDSCSCLTAAEVHPAGRYVLCPSTTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA
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..:..:: ... : : .:..:.. :: . : . :.. ::.:.: : : : .:
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.::: .. .::.:.: ::.: .: :.::.:::.: :::::: ..: . .. .. .:.
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.:. :.: :..... ::::::: ::...:::::. . :: : :. ... . .. ::
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: :: .: : ::.:.. . : : :. . ::: : .: : :
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: .:: :... ::: .. :.: .: .: . :.:. : :. : ...:.: :.:::.:
CCDS81 YSLRVRCANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVIPEAPLEG
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: :.:.. : . : . : : : ..: : ..: : : . .:.: :::: :.
CCDS81 PLGPYKLSWVQDNGTQDELTVEGTRANLT----GWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPL
310 320 330 340 350 360
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. . . . . : : :.::...: . . :::.:...:.::::.:..:. ..
CCDS81 VVSSHDRAGQQGPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMA
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::: .:..:. .:..:. : :::.:::::.::::::.::.. ... .::. ::.:::
CCDS81 RGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEF
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:.: :.::.:.: :..::::: .: : . :..:.:: ::.::::::::.: .:.:: ..
CCDS81 GSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLR
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pF1KB9 GSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLSTK
. . .: :.::::::::::::.::: ::.:..: :: : :..::.::: ::::::..
CCDS81 SRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSR
550 560 570 580 590 600
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pF1KB9 RFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVY
::::::::::::: :.:.:::::::::.:::.::::::: .:.::::.:.::::: .:
CCDS81 NFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLY
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pF1KB9 TSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYALMSRCW
: .::::.:::::::: ::::::: :.::.:::.:: ::::::: .:.. .: :: .::
CCDS81 TVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCW
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pF1KB9 ELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAGGADPPTQP
.:..::::: :: .::: : : . .. ::.:.... : : :.:. . : .
CCDS81 SADPKQRPSFTCLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINIERA----EEPTAGGSLELPGRD
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.: .. : . :. :. ::.: :. . .:.: . : .: .:
CCDS81 QPYSGAGDGSGMGAVGGTPSDCRYILTPGGLAEQPGQAEHQ--PESPLNETQRLLLLQQG
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CCDS81 LLPHSSC
840
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..: : :. :.: : :...:..:: ... : : .:..:.. :: . : .
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:.. ::.:.: : : : .: .::: .. .::.:.: ::.: .: :.::.:::.: :
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110 120 130 140 150 160
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::::: ..: . .. .. .:. .:. :.: :..... ::::::: ::...:::::. .
CCDS10 PPEPVTIVWWRGTTKIG-GPAPSPS-VLNVTGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQ
170 180 190 200 210 220
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pF1KB9 -LPQQPRNLHLVSRQPTELEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEP
:: : :. ... . .. ::: :: .: : ::.:.. . : :
CCDS10 ALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGW-----------EV
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:. . ::: : .: : : : .:: :... ::: .. :.: .: .: . :.:. :
CCDS10 LAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRCANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHA
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:. : ...:.: :.:::.: : :.:.. : . : . : : : ..: :
CCDS10 IRTDSGLILEWEEVIPEAPLEGPLGPYKLSWVQDNGTQDELTVEGTRANLT----GWDPQ
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..: : : . .:.: :::: :. . . . . . : : :.::...: . . ::
CCDS10 KDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQGPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALA
390 400 410 420 430 440
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pF1KB9 LFLVHRRKKETRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTE---ATLNSLGISEELKEK
:.:...:.::::.:..:. .. ::: .:..:. .:..:. : :::.:::::.:::::
CCDS10 LILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEK
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pF1KB9 LRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGAVMEGQLNQDD-SILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLS
:.::.. ... .::. ::.::::.: :.::.:.: :..::::: .: : . :..:.::
CCDS10 LEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLR
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pF1KB9 EAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYL
::.::::::::.: .:.:: ... . .: :.::::::::::::.::: ::.:..: :
CCDS10 EAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNL
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pF1KB9 PTQMLVKFMADIASGMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYR
: : :..::.::: ::::::.. ::::::::::::: :.:.:::::::::.:::.:::::
CCDS10 PLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYR
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pF1KB9 QGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQ
:: .:.::::.:.::::: .:: .::::.:::::::: ::::::: :.::.:::.::
CCDS10 QGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIG
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pF1KB9 GNRLKQPADCLDGLYALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNM
::::::: .:.. .: :: .:: .:..::::: :: .::: : : . .. ::.:.
CCDS10 GNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFTCLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINI
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pF1KB9 DEGGGYPEPPGAAGGADPPTQPDPKDSC---SCLTAAEVHPAG-RYVLCPS-TTPSPAQP
... : : :.:. . : . .: .. : . :. :. ::.: :. . .:.:
CCDS10 ERA----EEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAVGGTPSDCRYILTPGGLAEQPGQA
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880
pF1KB9 ADRGSPAAPGQEDGA
. : .: .:
CCDS10 EHQ--PESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
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CCDS20 LSLPHASGYQPALMFSPTQPGRPHTGNVAIPQVTSVESKPLPPLAFKHTVGHIILSEHKG
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60 70 80 90 100
pF1KB9 GTLRCQLQVQG--EPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRITSLQL
. :...: . . . : .::. : : . :: .:: ..... :::.:
CCDS20 VKFNCSISVPNIYQDTTISWWKDGKELLGAHHAITQF-YPDDEVT--AIIASFSITSVQR
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110 120 130 140 150 160
pF1KB9 SDTGQYQCLVFLGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQGPPEPV
::.:.: : . .... .::.: :. ..:::.: ..::. .:. :: :::.::: ::::::
CCDS20 SDNGSYICKMKINNEEIVSDPIYIEVQGLPHFTKQPESMNVTRNTAFNLTCQAVGPPEPV
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 DLLWLQDAVPLATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATITV--LPQQ
...:.:.. . : ..:. : ::::.. . ::::::: ::.:.:. . :.. .:.
CCDS20 NIFWVQNSSRVNEQPEKSPS-VLTVPGLTEMAVFSCEAHNDKGLTVSKGVQINIKAIPSP
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230 240 250 260 270 280
pF1KB9 PRNLHLVSRQPTELEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQA
: .. . . . ..:.::..: :. .:..: .. ..: . ..
CCDS20 PTEVSIRNSTAHSILISWVPGFDGYSPFRNCSIQ---------VKEADPLSNGSVMIFNT
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290 300 310 320 330 340
pF1KB9 SVPPHQLRLGSLHPHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGS
:. :: .. .:. . : : :.: . : :. . :. . : ::.: : :... : :
CCDS20 SALPHLYQIKQLQALANYSIGVSCMNEIGWSAVSPWILASTTEGAPSVAPLNVTVFLNES
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350 360 370 380 390
pF1KB9 QAFV--HWQEPRAPLQ-GTLLGYRLAYQGQD---TPEVLMDIGL---RQEVTLELQGDGS
. : .:..: . : : :.:::... :. . :.: ..: : ........
CCDS20 SDNVDIRWMKPPTKQQDGELVGYRISHVWQSAGISKELLEEVGQNGSRARISVQVHN---
400 410 420 430 440 450
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pF1KB9 VSNLTVCVAAYTAAGDGPWSLPV----PLEAWRPVKEPSTPAF-SWPWWYVLLGAVVAAA
.. :: .:: : .: ::.: :: : ..: :::: . ...: .
CCDS20 -ATCTVRIAAVTRGGVGPFSDPVKIFIPAHGWVDYAPSSTPAPGNADPVLIIFGCFCGFI
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 CV-LILALFL-VHRRKKETRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISE
. ::: . : ...: .::..:..: : : .:::: : ..::. ::. : ::.:::.::
CCDS20 LIGLILYISLAIRKRVQETKFGNAF--TEEDSELVVNYIAKKSFCRRAIELTLHSLGVSE
520 530 540 550 560 570
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pF1KB9 ELKEKLRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGAVMEGQLNQDDSI-LKVAVKTMKIAICTRSEL
::..::.::..::. . ::: :::::::.::::.:.:.:. :::::::::. .. :.
CCDS20 ELQNKLEDVVIDRNLLILGKILGEGEFGSVMEGNLKQEDGTSLKVAVKTMKLDNSSQREI
580 590 600 610 620 630
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pF1KB9 EDFLSEAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGD
:.:::::.:::.:.::::.::.:::.. : ...: :.:::::::.::::..::::::
CCDS20 EEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEMSS-QGIPKPMVILPFMKYGDLHTYLLYSRLET
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 QPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYN
: ..: : :.:::.::: ::::::.. :.::::::::::: ..:.:::::::::::::.
CCDS20 GPKHIPLQTLLKFMVDIALGMEYLSNRNFLHRDLAARNCMLRDDMTVCVADFGLSKKIYS
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pF1KB9 GDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::.: :.:
CCDS20 GDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWAFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMY
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760 770 780 790 800 810
pF1KB9 DYLRQGNRLKQPADCLDGLYALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEI
::: .:.::::: :::: :: .: ::. .: :::.:. :: .::. :..:: ... ..
CCDS20 DYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCWRTDPLDRPTFSVLRLQLEKLLESLPDVRNQADV
820 830 840 850 860 870
820 830 840 850
pF1KB9 LYVN---MDEGGGYPEPPGAAGGADPPTQPD-------PKDSCSCLTAAEVHPA----GR
.::: .. . : . : : .:: :. . : .:: ::: . ::
CCDS20 IYVNTQLLESSEGLAQGSTLAP-LDLNIDPDSIIASCTPRAAISVVTA-EVHDSKPHEGR
880 890 900 910 920
860 870 880
pF1KB9 YVLCP--------STTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA
:.: ...:: : :...: . ::.
CCDS20 YILNGGSEEWEDLTSAPSAAVTAEKNS-VLPGERLVRNGVSWSHSSMLPLGSSLPDELLF
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CCDS20 ADDSSEGSEVLM
990
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pF1KB9 QPTELEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQASVPPHQLRL
: ..: : : :. . .. .
CCDS73 FVPRPERKRRDVMQVANTTMSSRSRNTTAADTYNITDPEELETEYPFFESRVDNKERTVI
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CCDS10 SNLRPFTLYRIDIHSCNHEAEKLGCSASNFVFARTMPAEGADDIP-GPVTW--EPRPENS
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CCDS10 IFLKWPEPENP-NGLILMYEIKYGSQVEDQRECVSRQEYRKYGGAKLN-RLNPGNYTARI
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CCDS10 HMNGGRKNERALPLPQSSTC
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CCDS47 LTDMSPILTSGDSDISSPLLQNTVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRG
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CCDS47 HFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLN-RITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGIC
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CCDS47 LR-----SEGSPLVVLPYMKHGDLRNFI------RNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYL
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CCDS47 ASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESL
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CCDS47 QTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEV
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CCDS47 MLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKCVAPYPSLLSSEDNA
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: .. :
CCDS47 DDEVDTRPASFWETS
1400
885 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 23:14:54 2016 done: Thu Nov 3 23:14:55 2016
Total Scan time: 4.900 Total Display time: 0.290
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]