Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9407
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9407, 1258 aa
1>>>pF1KB9407 1258 - 1258 aa - 1258 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0042+/-0.00114; mu= 1.6749+/- 0.068
mean_var=282.5987+/-57.959, 0's: 0 Z-trim(112.0): 113 B-trim: 225 in 1/50
Lambda= 0.076294
statistics sampled from 12692 (12803) to 12692 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.393), width: 16
Scan time: 4.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2904.1 MAGI1 gene_id:9223|Hs108|chr3 (1256) 8399 939.2 0
CCDS33781.1 MAGI1 gene_id:9223|Hs108|chr3 (1287) 8265 924.5 0
CCDS33780.1 MAGI1 gene_id:9223|Hs108|chr3 (1462) 5412 610.5 1e-173
CCDS5594.1 MAGI2 gene_id:9863|Hs108|chr7 (1455) 1578 188.5 1.1e-46
CCDS75623.1 MAGI2 gene_id:9863|Hs108|chr7 (1441) 1320 160.1 3.9e-38
CCDS860.1 MAGI3 gene_id:260425|Hs108|chr1 (1125) 826 105.6 7.5e-22
CCDS44196.1 MAGI3 gene_id:260425|Hs108|chr1 (1481) 826 105.7 9.2e-22
>>CCDS2904.1 MAGI1 gene_id:9223|Hs108|chr3 (1256 aa)
initn: 5713 init1: 5713 opt: 8399 Z-score: 5010.0 bits: 939.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8399; 99.8% identity (99.8% similar) in 1258 aa overlap (1-1258:1-1256)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSKVIQKKNHWTSRVHECTVKRGPQGELGVTVLGGAEHGEFPYVGAVAAVEAAGLPGGGE
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CCDS29 MSKVIQKKNHWTSRVHECTVKRGPQGELGVTVLGGAEHGEFPYVGAVAAVEAAGLPGGGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GPRLGEGELLLEVQGVRVSGLPRYDVLGVIDSCKEAVTFKAVRQGGRLNKDLRHFLNQRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 GPRLGEGELLLEVQGVRVSGLPRYDVLGVIDSCKEAVTFKAVRQGGRLNKDLRHFLNQRF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 QKGSPDHELQQTIRDNLYRHAVPCTTRSPREGEVPGVDYNFLTVKEFLDLEQSGTLLEVG
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CCDS29 QKGSPDHELQQTIRDNLYRHAVPCTTRSPREGEVPGVDYNFLTVKEFLDLEQSGTLLEVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TYEGNYYGTPKPPSQPVSGKVITTDALHSLQSGSKQSTPKRTKSYNDMQNAGIVHAENEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TYEGNYYGTPKPPSQPVSGKVITTDALHSLQSGSKQSTPKRTKSYNDMQNAGIVHAENEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 EDDVPEMNSSFTAADSGEQEEHTLQETALPPVNSSIIAAPITDPSQKFPQYLPLSAEDNL
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CCDS29 EDDVPEMNSSFTA-DSGEQEEHTLQETALPPVNSSIIAAPITDPSQKFPQYLPLSAEDNL
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GPLPENWEMAYTENGEVYFIDHNTKTTSWLDPRCLNKQQKPLEECEDDEGVHTEELDSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 GPLPENWEMAYTENGEVYFIDHNTKTTSWLDPRCLNKQQKPLEECEDDEGVHTEELDSEL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 ELPAGWEKIEDPVYGIYYVDHINRKTQYENPVLEAKRKKQLEQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 ELPAGWEKIEDPVYGIYYVDHINRKTQYENPVLEAKRKKQLEQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 QQQTEEWTEDHSALVPPVIPNHPPSNPEPAREVPLQGKPFFTRNPSELKGKFIHTKLRKS
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QQ-TEEWTEDHSALVPPVIPNHPPSNPEPAREVPLQGKPFFTRNPSELKGKFIHTKLRKS
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 SRGFGFTVVGGDEPDEFLQIKSLVLDGPAALDGKMETGDVIVSVNDTCVLGHTHAQVVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SRGFGFTVVGGDEPDEFLQIKSLVLDGPAALDGKMETGDVIVSVNDTCVLGHTHAQVVKI
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 FQSIPIGASVDLELCRGYPLPFDPDDPNTSLVTSVAILDKEPIIVNGQETYDSPASHSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 FQSIPIGASVDLELCRGYPLPFDPDDPNTSLVTSVAILDKEPIIVNGQETYDSPASHSSK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 TGKVNGMKDARPSSPADVASNSSHGYPNDTVSLASSIATQPELITVHIVKGPMGFGFTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TGKVNGMKDARPSSPADVASNSSHGYPNDTVSLASSIATQPELITVHIVKGPMGFGFTIA
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 DSPGGGGQRVKQIVDSPRCRGLKEGDLIVEVNKKNVQALTHNQVVDMLVECPKGSEVTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 DSPGGGGQRVKQIVDSPRCRGLKEGDLIVEVNKKNVQALTHNQVVDMLVECPKGSEVTLL
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 VQRGGLPVPKKSPKSQPLERKDSQNSSQHSVSSHRSLHTASPSHSTQVLPEFPPAEAQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 VQRGGLPVPKKSPKSQPLERKDSQNSSQHSVSSHRSLHTASPSHSTQVLPEFPPAEAQAP
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 DQTDSSGQKKPDPFKIWAQSRSMYENRPMSPSPASGLSKGEREREINSTNFGECPIPDYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 DQTDSSGQKKPDPFKIWAQSRSMYENRPMSPSPASGLSKGEREREINSTNFGECPIPDYQ
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 EQDIFLWRKETGFGFRILGGNEPGEPIYIGHIVPLGAADTDGRLRSGDELICVDGTPVIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 EQDIFLWRKETGFGFRILGGNEPGEPIYIGHIVPLGAADTDGRLRSGDELICVDGTPVIG
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 KSHQLVVQLMQQAAKQGHVNLTVRRKVVFAVPKTENEVPSPASSHHSSNQPASLTEEKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 KSHQLVVQLMQQAAKQGHVNLTVRRKVVFAVPKTENEVPSPASSHHSSNQPASLTEEKRT
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 PQGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSTVVQPYDVEIRRGENEGFGFVIVSSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PQGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSTVVQPYDVEIRRGENEGFGFVIVSSVS
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 RPEAGTTFAGNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRILAVNGCSITNKSHSDIVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RPEAGTTFAGNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRILAVNGCSITNKSHSDIVNL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 IKEAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEKIATITTTHTPSQQGTQETRNTTKPKQESQFE
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CCDS29 IKEAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEKIATITTTHTPSQQGTQETRNTTKPKQESQFE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB9 FKAPQATQEQDFYTVELERGAKGFGFSLRGGREYNMDLYVLRLAEDGPAERCGKMRIGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 FKAPQATQEQDFYTVELERGAKGFGFSLRGGREYNMDLYVLRLAEDGPAERCGKMRIGDE
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB9 ILEINGETTKNMKHSRAIELIKNGGRRVRLFLKRGDGSVPEYGGSNYENIPSFPGMTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 ILEINGETTKNMKHSRAIELIKNGGRRVRLFLKRGDGSVPEYGGSNYENIPSFPGMTP
1200 1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS33781.1 MAGI1 gene_id:9223|Hs108|chr3 (1287 aa)
initn: 4349 init1: 4198 opt: 8265 Z-score: 4930.2 bits: 924.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8265; 99.8% identity (99.8% similar) in 1242 aa overlap (1-1242:1-1239)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSKVIQKKNHWTSRVHECTVKRGPQGELGVTVLGGAEHGEFPYVGAVAAVEAAGLPGGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSKVIQKKNHWTSRVHECTVKRGPQGELGVTVLGGAEHGEFPYVGAVAAVEAAGLPGGGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GPRLGEGELLLEVQGVRVSGLPRYDVLGVIDSCKEAVTFKAVRQGGRLNKDLRHFLNQRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GPRLGEGELLLEVQGVRVSGLPRYDVLGVIDSCKEAVTFKAVRQGGRLNKDLRHFLNQRF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 QKGSPDHELQQTIRDNLYRHAVPCTTRSPREGEVPGVDYNFLTVKEFLDLEQSGTLLEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QKGSPDHELQQTIRDNLYRHAVPCTTRSPREGEVPGVDYNFLTVKEFLDLEQSGTLLEVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TYEGNYYGTPKPPSQPVSGKVITTDALHSLQSGSKQSTPKRTKSYNDMQNAGIVHAENEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TYEGNYYGTPKPPSQPVSGKVITTDALHSLQSGSKQSTPKRTKSYNDMQNAGIVHAENEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 EDDVPEMNSSFTAADSGEQEEHTLQETALPPVNSSIIAAPITDPSQKFPQYLPLSAEDNL
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EDDVPEMNSSFTA-DSGEQEEHTLQETALPPVNSSIIAAPITDPSQKFPQYLPLSAEDNL
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GPLPENWEMAYTENGEVYFIDHNTKTTSWLDPRCLNKQQKPLEECEDDEGVHTEELDSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GPLPENWEMAYTENGEVYFIDHNTKTTSWLDPRCLNKQQKPLEECEDDEGVHTEELDSEL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 ELPAGWEKIEDPVYGIYYVDHINRKTQYENPVLEAKRKKQLEQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ELPAGWEKIEDPVYGIYYVDHINRKTQYENPVLEAKRKKQLEQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 QQQTEEWTEDHSALVPPVIPNHPPSNPEPAREVPLQGKPFFTRNPSELKGKFIHTKLRKS
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QQ-TEEWTEDHSALVPPVIPNHPPSNPEPAREVPLQGKPFFTRNPSELKGKFIHTKLRKS
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 SRGFGFTVVGGDEPDEFLQIKSLVLDGPAALDGKMETGDVIVSVNDTCVLGHTHAQVVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SRGFGFTVVGGDEPDEFLQIKSLVLDGPAALDGKMETGDVIVSVNDTCVLGHTHAQVVKI
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 FQSIPIGASVDLELCRGYPLPFDPDDPNTSLVTSVAILDKEPIIVNGQETYDSPASHSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FQSIPIGASVDLELCRGYPLPFDPDDPNTSLVTSVAILDKEPIIVNGQETYDSPASHSSK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 TGKVNGMKDARPSSPADVASNSSHGYPNDTVSLASSIATQPELITVHIVKGPMGFGFTIA
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CCDS33 TGKVNGMKDARPSSPADVASNSSHGYPNDTVSLASSIATQPELITVHIVKGPMGFGFTIA
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 DSPGGGGQRVKQIVDSPRCRGLKEGDLIVEVNKKNVQALTHNQVVDMLVECPKGSEVTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DSPGGGGQRVKQIVDSPRCRGLKEGDLIVEVNKKNVQALTHNQVVDMLVECPKGSEVTLL
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 VQRGGLPVPKKSPKSQPLERKDSQNSSQHSVSSHRSLHTASPSHSTQVLPEFPPAEAQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VQRGGLPVPKKSPKSQPLERKDSQNSSQHSVSSHRSLHTASPSHSTQVLPEFPPAEAQAP
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 DQTDSSGQKKPDPFKIWAQSRSMYENRPMSPSPASGLSKGEREREINSTNFGECPIPDYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DQTDSSGQKKPDPFKIWAQSRSMYENRPMSPSPASGLSKGEREREINSTNFGECPIPDYQ
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 EQDIFLWRKETGFGFRILGGNEPGEPIYIGHIVPLGAADTDGRLRSGDELICVDGTPVIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EQDIFLWRKETGFGFRILGGNEPGEPIYIGHIVPLGAADTDGRLRSGDELICVDGTPVIG
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 KSHQLVVQLMQQAAKQGHVNLTVRRKVVFAVPKTENEVPSPASSHHSSNQPASLTEEKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSHQLVVQLMQQAAKQGHVNLTVRRKVVFAVPKTENEVPSPASSHHSSNQPASLTEEKRT
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 PQGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSTVVQPYDVEIRRGENEGFGFVIVSSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PQGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSTVVQPYDVEIRRGENEGFGFVIVSSVS
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 RPEAGTTFAGNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRILAVNGCSITNKSHSDIVNL
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RPEAGTTF-GNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRILAVNGCSITNKSHSDIVNL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 IKEAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEKIATITTTHTPSQQGTQETRNTTKPKQESQFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IKEAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEKIATITTTHTPSQQGTQETRNTTKPKQESQFE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB9 FKAPQATQEQDFYTVELERGAKGFGFSLRGGREYNMDLYVLRLAEDGPAERCGKMRIGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FKAPQATQEQDFYTVELERGAKGFGFSLRGGREYNMDLYVLRLAEDGPAERCGKMRIGDE
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB9 ILEINGETTKNMKHSRAIELIKNGGRRVRLFLKRGDGSVPEYGGSNYENIPSFPGMTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ILEINGETTKNMKHSRAIELIKNGGRRVRLFLKRGDGSVPEYAMIPPNIAACMRNEKLGE
1200 1210 1220 1230 1240 1250
CCDS33 ACFYLMGHNQTTTPAATATAPPPVHKVFRK
1260 1270 1280
>>CCDS33780.1 MAGI1 gene_id:9223|Hs108|chr3 (1462 aa)
initn: 5519 init1: 2726 opt: 5412 Z-score: 3232.3 bits: 610.5 E(32554): 1e-173
Smith-Waterman score: 8010; 96.4% identity (96.9% similar) in 1259 aa overlap (1-1258:1-1228)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSKVIQKKNHWTSRVHECTVKRGPQGELGVTVLGGAEHGEFPYVGAVAAVEAAGLPGGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSKVIQKKNHWTSRVHECTVKRGPQGELGVTVLGGAEHGEFPYVGAVAAVEAAGLPGGGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GPRLGEGELLLEVQGVRVSGLPRYDVLGVIDSCKEAVTFKAVRQGGRLNKDLRHFLNQRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GPRLGEGELLLEVQGVRVSGLPRYDVLGVIDSCKEAVTFKAVRQGGRLNKDLRHFLNQRF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 QKGSPDHELQQTIRDNLYRHAVPCTTRSPREGEVPGVDYNFLTVKEFLDLEQSGTLLEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QKGSPDHELQQTIRDNLYRHAVPCTTRSPREGEVPGVDYNFLTVKEFLDLEQSGTLLEVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TYEGNYYGTPKPPSQPVSGKVITTDALHSLQSGSKQSTPKRTKSYNDMQNAGIVHAENEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TYEGNYYGTPKPPSQPVSGKVITTDALHSLQSGSKQSTPKRTKSYNDMQNAGIVHAENEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 EDDVPEMNSSFTAADSGEQEEHTLQETALPPVNSSIIAAPITDPSQKFPQYLPLSAEDNL
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EDDVPEMNSSFTA-DSGEQEEHTLQETALPPVNSSIIAAPITDPSQKFPQYLPLSAEDNL
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GPLPENWEMAYTENGEVYFIDHNTKTTSWLDPRCLNKQQKPLEECEDDEGVHTEELDSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GPLPENWEMAYTENGEVYFIDHNTKTTSWLDPRCLNKQQKPLEECEDDEGVHTEELDSEL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 ELPAGWEKIEDPVYGIYYVDHINRKTQYENPVLEAKRKKQLEQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ELPAGWEKIEDPVYGIYYVDHINRKTQYENPVLEAKRKKQLEQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 QQQTEEWTEDHSALVPPVIPNHPPSNPEPAREVPLQGKPFFTRNPSELKGKFIHTKLRKS
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QQ-TEEWTEDHSALVPPVIPNHPPSNPEPAREVPLQGKPFFTRNPSELKGKFIHTKLRKS
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 SRGFGFTVVGGDEPDEFLQIKSLVLDGPAALDGKMETGDVIVSVNDTCVLGHTHAQVVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SRGFGFTVVGGDEPDEFLQIKSLVLDGPAALDGKMETGDVIVSVNDTCVLGHTHAQVVKI
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 FQSIPIGASVDLELCRGYPLPFDPDDPNTSLVTSVAILDKEPIIVNGQETYDSPASHSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FQSIPIGASVDLELCRGYPLPFDPDDPNTSLVTSVAILDKEPIIVNGQETYDSPASHSSK
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pF1KB9 TGKVNGMKDARPSSPADVASNSSHGYPNDTVSLASSIATQPELITVHIVKGPMGFGFTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TGKVNGMKDARPSSPADVASNSSHGYPNDTVSLASSIATQPELITVHIVKGPMGFGFTIA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DSPGGGGQRVKQIVDSPRCRGLKEGDLIVEVNKKNVQALTHNQVVDMLVECPKGSEVTLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VQRGGLPVPKKSPKSQPLERKDSQNSSQHSVSSHRSLHTASPSHSTQVLPEFPPAEAQAP
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::::::::::::::::::::::::::: .::::
CCDS33 DQTDSSGQKKPDPFKIWAQSRSMYENR----------------------------LPDYQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EQDIFLWRKETGFGFRILGGNEPGEPIYIGHIVPLGAADTDGRLRSGDELICVDGTPVIG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSHQLVVQLMQQAAKQGHVNLTVRRKVVFAVPKTENEVPSPASSHHSSNQPASLTEEKRT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PQGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSTVVQPYDVEIRRGENEGFGFVIVSSVS
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CCDS33 RPEAGTTF-GNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRILAVNGCSITNKSHSDIVNL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IKEAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEKIATITTTHTPSQQGTQETRNTTKPKQESQFE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FKAPQATQEQDFYTVELERGAKGFGFSLRGGREYNMDLYVLRLAEDGPAERCGKMRIGDE
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. .. :. : .:
CCDS33 ILEINGETTKNMKHSRAIELIKNGGRRVRLFLKRGDGSVPEYDPSSDRHGPATGPQGVPE
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CCDS33 VRAGPDRRQHPSLESSYPPDLHKSSPHGEKRAHARDPKGSREYSRQPNEHHTWNGTSRKP
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CCDS55 TYEDNYYGTPKPPAEPAPLLLNVTDQILPGATPSAEGKRKRNKSVSNMEKASIEPPEEEE
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pF1KB9 ED-DVPEMNSSFTAADSGEQEEHTLQETALPPVNSSIIAAPITDPSQKFPQYL----PLS
:. : . :. .. .:.:.:... .. : :. ::. . ... . . : .
CCDS55 EERPVVNGNGVVVTPESSEHEDKSAGASGEMP--SQPYPAPVYSQPEELKEQMDDTKPTK
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CCDS55 PEDNEEPDPLPDNWEMAYTEKGEVYFIDHNTKTTSWLDPR-LAKKAKPPEECKENE----
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pF1KB9 EELDSELELPAGWEKIEDPVYGIYYVDHINRKTQYENPVLEAKRKKQLEQQQQQQQQQQQ
:: :::::.::.:: ::::::::.::.::::::::::
CCDS55 --------LPYGWEKIDDPIYGTYYVDHINRRTQFENPVLEAKRK---------------
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pF1KB9 QQQQQQQQQQTEEWTEDHSALVPPVIPNHPPSNPEPAREVPLQGKPFFTRNPSELKGKFI
::... .:: :. : . :. :: ::.:::. :.::: :.
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pF1KB9 HTKLRKSSRGFGFTVVGGDEPDEFLQIKSLVLDGPAALDGKMETGDVIVSVNDTCVLGHT
: :.::. :::::..::::::::::.::.. ::::: ::::::::::: .:..::::::
CCDS55 STTLKKSNMGFGFTIIGGDEPDEFLQVKSVIPDGPAAQDGKMETGDVIVYINEVCVLGHT
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pF1KB9 HAQVVKIFQSIPIGASVDLELCRGYPLPFDPDDPNTSLVTSVAILDKEP-IIVNGQETYD
::.:::.:::.::: ::.: :::::::::::.:: .:.: .::... : ..:::...:.
CCDS55 HADVVKLFQSVPIGQSVNLVLCRGYPLPFDPEDPANSMVPPLAIMERPPPVMVNGRHNYE
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pF1KB9 SPASHSSKTGK-VNGMKDARPSS----PADVASNSSHGYP--NDTVSLASSIATQPELIT
. . :.:.. : . : : : :.: .... : .:.::.::: ::: ::.:
CCDS55 TYLEYISRTSQSVPDITDRPPHSLHSMPTDGQLDGTYPPPVHDDNVSMASSGATQAELMT
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pF1KB9 VHIVKGPMGFGFTIADSPGGGGQRVKQIVDSPRCRGLKEGDLIVEVNKKNVQALTHNQVV
. :::: .:::::::::: : ::::::.: : :: :::::::.:..::: :.:..::
CCDS55 LTIVKGAQGFGFTIADSPTG--QRVKQILDIQGCPGLCEGDLIVEINQQNVQNLSHTEVV
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pF1KB9 DMLVECPKGSEVTLLVQRGGLPVPKKSPKSQPLERKDSQNSSQHSVSSHRSLHTASPSHS
:.: .:: :::..:...:::. : :.:: ..: ..:.: : :.:. : :
CCDS55 DILKDCPIGSETSLIIHRGGFFSPWKTPKPI-MDRWENQGSPQTSLSA-----PAIP---
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pF1KB9 TQVLPEFPPA--EAQAPDQTDSSGQKKPDPFKIWAQSRSMYENRPMSPSPASGLSKGERE
: :: :::: ... ::.:.. .::::.... .::..::.: . : : ...
CCDS55 -QNLP-FPPALHRSSFPDSTEAFDPRKPDPYELYEKSRAIYESRQQVP-PRTSF------
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pF1KB9 REINSTNFGECPIPDYQEQDIFLWRKETGFGFRILGGNEPGEPIYIGHIVPLGAADTDGR
...:.. :::.: :. : : :.:::::::::.:::.:: :: .. .:.:: :::
CCDS55 -RMDSSG------PDYKELDVHLRRMESGFGFRILGGDEPGQPILIGAVIAMGSADRDGR
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pF1KB9 LRSGDELICVDGTPVIGKSHQLVVQLMQQAAKQGHVNLTVRRKVVFA-VPKTEN-EVPSP
:. ::::. ::: :: ::.:. :..::..::..:.:::::::::. . : :: . :.
CCDS55 LHPGDELVYVDGIPVAGKTHRYVIDLMHHAARNGQVNLTVRRKVLCGGEPCPENGRSPGS
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pF1KB9 ASSHHSSNQPASLTEEKRTPQGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSTVVQPYDV
.:.:::: : :. .. .. : .. .:... : .: .: ::
CCDS55 VSTHHSS--P-------RSDYATYTNSNHAAPSSNASPP--------EGFASHSLQTSDV
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pF1KB9 EIRRGENEGFGFVIVSSVSRPEAGTTFAGNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRI
:.: :::::::::.::..:::.:.: ...::::::::.:::::::.::::::::
CCDS55 VIHRKENEGFGFVIISSLNRPESGST------ITVPHKIGRIIDGSPADRCAKLKVGDRI
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pF1KB9 LAVNGCSITNKSHSDIVNLIKEAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEK---------IAT
::::: :: : :.:::.:::.:: .::::::: .: .. : ..:: .:
CCDS55 LAVNGQSIINMPHADIVKLIKDAGLSVTLRIIPQEELNSPTSAPSSEKQSPMAQQSPLAQ
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pF1KB9 ITTTHTPSQ------------------QGTQET-RNTTKPKQESQFEFKAPQAT------
. :: :: ... :. .: .:. . ... : :
CCDS55 QSPLAQPSPATPNSPIAQPAPPQPLQLQGHENSYRSEVKARQDVKPDIRQPPFTDYRQPP
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pF1KB9 -------------------------------------------QEQDF--YTVELERGAK
: ::: .::..:.:::
CCDS55 LDYRQPPGGDYQQPPPLDYRQPPLLDYRQHSPDTRQYPLSDYRQPQDFDYFTVDMEKGAK
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pF1KB9 GFGFSLRGGREYNMDLYVLRLAEDGPAERCGKMRIGDEILEINGETTKNMKHSRAIELIK
:::::.::::::.:::::::::::::: : :.::.::.:.:::::.:..: :.:::::::
CCDS55 GFGFSIRGGREYKMDLYVLRLAEDGPAIRNGRMRVGDQIIEINGESTRDMTHARAIELIK
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pF1KB9 NGGRRVRLFLKRGDGSVPEYGGSNYENIPSF--PGMTP
.:::::::.:::: :.:::: . :. ::.
CCDS55 SGGRRVRLLLKRGTGQVPEYDEPAPWSSPAAAAPGLPEVGVSLDDGLAPFSPSHPAPPSD
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CCDS55 PSHQISPGPTWDIKREHDVRKPKELSACGQKKQRLGEQRERSASPQRAARPRLEEAPGGQ
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CCDS75 MSKSLKKKSHWTSKVHESVIGRNPEGQLGFELKGGAENGQFPYLGEVKPGKVAYESGS--
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pF1KB9 GPRLGEGELLLEVQGVRVSGLPRYDVLGVIDSCKEAVTFKAVRQGGRLNKDLRHFLNQRF
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CCDS75 --KLVSEELLLEVNETPVAGLTIRDVLAVIKHCKDPLRLKCVKQGGIVDKDLRHYLNLRF
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pF1KB9 QKGSPDHELQQTIRDNLYRHAVPCTTRSPREGEVPGVDYNFLTVKEFLDLEQSGTLLEVG
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CCDS75 QKGSVDHELQQIIRDNLYLRTVPCTTRPHKEGEVPGVDYIFITVEDFMELEKSGALLESG
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pF1KB9 TYEGNYYGTPKPPSQPVSGKVITTDALHSLQSGSKQSTPKRTKSYNDMQNAGIVHAENEE
::: :::::::::..:. . .:: . . : .. ::.:: ..:..:.: :.::
CCDS75 TYEDNYYGTPKPPAEPAPLLLNVTDQILPGATPSAEGKRKRNKSVSNMEKASIEPPEEEE
180 190 200 210 220 230
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pF1KB9 ED-DVPEMNSSFTAADSGEQEEHTLQETALPPVNSSIIAAPITDPSQKFPQYL----PLS
:. : . :. .. .:.:.:... .. : :. ::. . ... . . : .
CCDS75 EERPVVNGNGVVVTPESSEHEDKSAGASGEMP--SQPYPAPVYSQPEELKEQMDDTKPTK
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pF1KB9 AEDNL--GPLPENWEMAYTENGEVYFIDHNTKTTSWLDPRCLNKQQKPLEECEDDEGVHT
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CCDS75 PEDNEEPDPLPDNWEMAYTEKGEVYFIDHNTKTTSWLDPR-LAKKAKPPEECKENE----
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pF1KB9 EELDSELELPAGWEKIEDPVYGIYYVDHINRKTQYENPVLEAKRKKQLEQQQQQQQQQQQ
:: :::::.::.:: ::::::::.::.::::::::::
CCDS75 --------LPYGWEKIDDPIYGTYYVDHINRRTQFENPVLEAKRK---------------
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pF1KB9 QQQQQQQQQQTEEWTEDHSALVPPVIPNHPPSNPEPAREVPLQGKPFFTRNPSELKGKFI
::... .:: :. : . :. :: ::.:::. :.::: :.
CCDS75 --LQQHNMPHTELGTK----------PLQAPG----FRE-----KPLFTRDASQLKGTFL
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pF1KB9 HTKLRKSSRGFGFTVVGGDEPDEFLQIKSLVLDGPAALDGKMETGDVIVSVNDTCVLGHT
: :.::. :::::..::::::::::.::.. ::::: ::::::::::: .:..::::::
CCDS75 STTLKKSNMGFGFTIIGGDEPDEFLQVKSVIPDGPAAQDGKMETGDVIVYINEVCVLGHT
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pF1KB9 HAQVVKIFQSIPIGASVDLELCRGYPLPFDPDDPNTSLVTSVAILDKEP-IIVNGQETYD
::.:::.:::.::: ::.: :::::::::::.:: .:.: .::... : ..:::...:.
CCDS75 HADVVKLFQSVPIGQSVNLVLCRGYPLPFDPEDPANSMVPPLAIMERPPPVMVNGRHNYE
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pF1KB9 SPASHSSKTGK-VNGMKDARPSS----PADVASNSSHGYP--NDTVSLASSIATQPELIT
. . :.:.. : . : : : :.: .... : .:.::.::: ::: ::.:
CCDS75 TYLEYISRTSQSVPDITDRPPHSLHSMPTDGQLDGTYPPPVHDDNVSMASSGATQAELMT
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pF1KB9 VHIVKGPMGFGFTIADSPGGGGQRVKQIVDSPRCRGLKEGDLIVEVNKKNVQALTHNQVV
. :::: .:::::::::: : ::::::.: : :: :::::::.:..::: :.:..::
CCDS75 LTIVKGAQGFGFTIADSPTG--QRVKQILDIQGCPGLCEGDLIVEINQQNVQNLSHTEVV
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pF1KB9 DMLVECPKGSEVTLLVQRGGLPVPKKSPKSQPLERKDSQNSSQHSVSSHRSLHTASPSHS
:.: .:: :::..:...:::. : :.:: ..: ..:.: : :.:. : :
CCDS75 DILKDCPIGSETSLIIHRGGFFSPWKTPKPI-MDRWENQGSPQTSLSA-----PAIP---
670 680 690 700 710
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pF1KB9 TQVLPEFPPA--EAQAPDQTDSSGQKKPDPFKIWAQSRSMYENRPMSPSPASGLSKGERE
: :: :::: ... ::.:.. .::::.... .::..::.:
CCDS75 -QNLP-FPPALHRSSFPDSTEAFDPRKPDPYELYEKSRAIYESR----------------
720 730 740 750
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pF1KB9 REINSTNFGECPIPDYQEQDIFLWRKETGFGFRILGGNEPGEPIYIGHIVPLGAADTDGR
: :::.: :. : : :.:::::::::.:::.:: :: .. .:.:: :::
CCDS75 R------------PDYKELDVHLRRMESGFGFRILGGDEPGQPILIGAVIAMGSADRDGR
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pF1KB9 LRSGDELICVDGTPVIGKSHQLVVQLMQQAAKQGHVNLTVRRKVVFA-VPKTEN-EVPSP
:. ::::. ::: :: ::.:. :..::..::..:.:::::::::. . : :: . :.
CCDS75 LHPGDELVYVDGIPVAGKTHRYVIDLMHHAARNGQVNLTVRRKVLCGGEPCPENGRSPGS
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pF1KB9 ASSHHSSNQPASLTEEKRTPQGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSTVVQPYDV
.:.:::: : :. .. .. : .. .:... : .: .: ::
CCDS75 VSTHHSS--P-------RSDYATYTNSNHAAPSSNASPP--------EGFASHSLQTSDV
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pF1KB9 EIRRGENEGFGFVIVSSVSRPEAGTTFAGNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRI
:.: :::::::::.::..:::.:.: ...::::::::.:::::::.::::::::
CCDS75 VIHRKENEGFGFVIISSLNRPESGST------ITVPHKIGRIIDGSPADRCAKLKVGDRI
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pF1KB9 LAVNGCSITNKSHSDIVNLIKEAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEK---------IAT
::::: :: : :.:::.:::.:: .::::::: .: .. : ..:: .:
CCDS75 LAVNGQSIINMPHADIVKLIKDAGLSVTLRIIPQEELNSPTSAPSSEKQSPMAQQSPLAQ
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pF1KB9 ITTTHTPSQ------------------QGTQET-RNTTKPKQESQFEFKAPQAT------
. :: :: ... :. .: .:. . ... : :
CCDS75 QSPLAQPSPATPNSPIAQPAPPQPLQLQGHENSYRSEVKARQDVKPDIRQPPFTDYRQPP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1150 1160
pF1KB9 -------------------------------------------QEQDF--YTVELERGAK
: ::: .::..:.:::
CCDS75 LDYRQPPGGDYQQPPPLDYRQPPLLDYRQHSPDTRQYPLSDYRQPQDFDYFTVDMEKGAK
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CCDS75 GFGFSIRGGREYKMDLYVLRLAEDGPAIRNGRMRVGDQIIEINGESTRDMTHARAIELIK
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CCDS75 PSHQISPGPTWDIKREHDVRKPKELSACGQKKQRLGEQRERSASPQRAARPRLEEAPGGQ
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CCDS86 NKVLLLLRPGTGLIPDHGLAPSGLCSYVKPEQH
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CCDS44 TCCVVSGKAPSPGDVLLEVNGTPVSGLTNRDTLAVIRHFREPIRLKTVKPGKVINKDLRH
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pF1KB9 AQVVKIFQSIPIGASVDLELCRGYPLPFDPDDPNTSLVTSVAILDKEPIIVNGQETYDSP
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CCDS44 MCIDGIPVKGKSHKQVLDLMTTAARNGHVLLTVRRKIFYGEKQPEDD----------SSQ
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CCDS44 ELSHDNIVQLIKDAGVTVTLTVIAEEEHHGPPSGTNSARQSPALQHRPMGQSQANHIPGD
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CCDS44 RSALEGEIGKDVSTSYRHSWSDHKHLAQPDTAVISVVGSRHNQNLGCYPVELERGPRGFG
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CCDS44 FSLRGGKEYNMGLFILRLAEDGPAIKDGRIHVGDQIVEINGEPTQGITHTRAIELIQAGG
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CCDS44 NKVLLLLRPGTGLIPDHGDWDINN-PSSSNVIYDEQSPLPPSSHFASIFEESHVPVIEES
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1258 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]