Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9392
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9392, 802 aa
1>>>pF1KB9392 802 - 802 aa - 802 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0719+/-0.00103; mu= 19.3660+/- 0.062
mean_var=150.8044+/-31.724, 0's: 0 Z-trim(109.3): 117 B-trim: 55 in 1/49
Lambda= 0.104440
statistics sampled from 10646 (10771) to 10646 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16
Scan time: 3.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6469.1 UHRF2 gene_id:115426|Hs108|chr9 ( 802) 5586 854.4 0
CCDS74263.1 UHRF1 gene_id:29128|Hs108|chr19 ( 793) 2118 331.8 2.7e-90
CCDS74262.1 UHRF1 gene_id:29128|Hs108|chr19 ( 806) 2118 331.8 2.7e-90
>>CCDS6469.1 UHRF2 gene_id:115426|Hs108|chr9 (802 aa)
initn: 5586 init1: 5586 opt: 5586 Z-score: 4558.6 bits: 854.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5586; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (1-802:1-802)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MWIQVRTIDGSKTCTIEDVSRKATIEELRERVWALFDVRPECQRLFYRGKQLENGYTLFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MWIQVRTIDGSKTCTIEDVSRKATIEELRERVWALFDVRPECQRLFYRGKQLENGYTLFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 YDVGLNDIIQLLVRPDPDHLPGTSTQIEAKPCSNSPPKVKKAPRVGPSNQPSTSARARLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YDVGLNDIIQLLVRPDPDHLPGTSTQIEAKPCSNSPPKVKKAPRVGPSNQPSTSARARLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 DPGFGIYKVNELVDARDVGLGAWFEAHIHSVTRASDGQSRGKTPLKNGSSCKRTNGNIKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DPGFGIYKVNELVDARDVGLGAWFEAHIHSVTRASDGQSRGKTPLKNGSSCKRTNGNIKH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KSKENTNKLDSVPSTSNSDCVAADEDVIYHIQYDEYPESGTLEMNVKDLRPRARTILKWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KSKENTNKLDSVPSTSNSDCVAADEDVIYHIQYDEYPESGTLEMNVKDLRPRARTILKWN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ELNVGDVVMVNYNVESPGQRGFWFDAEITTLKTISRTKKELRVKIFLGGSEGTLNDCKII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ELNVGDVVMVNYNVESPGQRGFWFDAEITTLKTISRTKKELRVKIFLGGSEGTLNDCKII
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SVDEIFKIERPGAHPLSFADGKFLRRNDPECDLCGGDPEKKCHSCSCRVCGGKHEPNMQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SVDEIFKIERPGAHPLSFADGKFLRRNDPECDLCGGDPEKKCHSCSCRVCGGKHEPNMQL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LCDECNVAYHIYCLNPPLDKVPEEEYWYCPSCKTDSSEVVKAGERLKMSKKKAKMPSAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LCDECNVAYHIYCLNPPLDKVPEEEYWYCPSCKTDSSEVVKAGERLKMSKKKAKMPSAST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 ESRRDWGRGMACVGRTRECTIVPSNHYGPIPGIPVGSTWRFRVQVSEAGVHRPHVGGIHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ESRRDWGRGMACVGRTRECTIVPSNHYGPIPGIPVGSTWRFRVQVSEAGVHRPHVGGIHG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 RSNDGAYSLVLAGGFADEVDRGDEFTYTGSGGKNLAGNKRIGAPSADQTLTNMNRALALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RSNDGAYSLVLAGGFADEVDRGDEFTYTGSGGKNLAGNKRIGAPSADQTLTNMNRALALN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 CDAPLDDKIGAESRNWRAGKPVRVIRSFKGRKISKYAPEEGNRYDGIYKVVKYWPEISSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CDAPLDDKIGAESRNWRAGKPVRVIRSFKGRKISKYAPEEGNRYDGIYKVVKYWPEISSS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 HGFLVWRYLLRRDDVEPAPWTSEGIERSRRLCLRLQYPAGYPSDKEGKKPKGQSKKQPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HGFLVWRYLLRRDDVEPAPWTSEGIERSRRLCLRLQYPAGYPSDKEGKKPKGQSKKQPSG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 TTKRPISDDDCPSASKVYKASDSAEAIEAFQLTPQQQHLIREDCQNQKLWDEVLSHLVEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TTKRPISDDDCPSASKVYKASDSAEAIEAFQLTPQQQHLIREDCQNQKLWDEVLSHLVEG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 PNFLKKLEQSFMCVCCQELVYQPVTTECFHNVCKDCLQRSFKAQVFSCPACRHDLGQNYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PNFLKKLEQSFMCVCCQELVYQPVTTECFHNVCKDCLQRSFKAQVFSCPACRHDLGQNYI
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB9 MIPNEILQTLLDLFFPGYSKGR
::::::::::::::::::::::
CCDS64 MIPNEILQTLLDLFFPGYSKGR
790 800
>>CCDS74263.1 UHRF1 gene_id:29128|Hs108|chr19 (793 aa)
initn: 2841 init1: 1470 opt: 2118 Z-score: 1734.6 bits: 331.8 E(32554): 2.7e-90
Smith-Waterman score: 2977; 53.8% identity (74.4% similar) in 833 aa overlap (1-802:1-793)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MWIQVRTIDGSKTCTIEDVSRKATIEELRERVWALFDVRPECQRLFYRGKQLENGYTLFD
:::::::.:: .: :....:: . .::::... :: :.: :::::::::.:.:.::::
CCDS74 MWIQVRTMDGRQTHTVDSLSRLTKVEELRRKIQELFHVEPGLQRLFYRGKQMEDGHTLFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB9 YDVGLNDIIQLLVRPDPDHLPGTSTQIEAK------PCSNSPPKVKKAPRVGPSNQPSTS
:.: ::: :::::: . :: .. . ... : . . :. : . . :
CCDS74 YEVRLNDTIQLLVRQSLV-LPHSTKERDSELSDTDSGCCLGQSESDKSSTHGEAAAETDS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 --ARARLIDPG-FGIYKVNELVDARDVGLGAWFEAHIHSVTRASDGQSRGKTPLKNGSSC
: . : .:.::::: :::::...::::::.. ::: :.: .. :
CCDS74 RPADEDMWDETELGLYKVNEYVDARDTNMGAWFEAQVVRVTR--------KAPSRD-EPC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KRTNGNIKHKSKENTNKLDSVPSTSNSDCVAADEDVIYHIQYDEYPESGTLEMNVKDLRP
. : : : : .::::::..::.:::.:...:: .:.:
CCDS74 SST----------------SRP--------ALEEDVIYHVKYDDYPENGVVQMNSRDVRA
180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 RARTILKWNELNVGDVVMVNYNVESPGQRGFWFDAEITTLKTISRTKKELRVKIFLGGSE
:::::.::..:.::.:::.::: ..: .::::.::::. : .:: .:: ... :: .
CCDS74 RARTIIKWQDLEVGQVVMLNYNPDNPKERGFWYDAEISR-KRETRTARELYANVVLG--D
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 GTLNDCKIISVDEIFKIERPG-AHPLSFADGKFLRRNDPECDLCGGDPEKKCHSCSCRVC
.::::.:: :::.::::::: . :. .:. . :.. : : : : .. :. :.:..:
CCDS74 DSLNDCRIIFVDEVFKIERPGEGSPM--VDNPMRRKSGPSCKHCKDDVNRLCRVCACHLC
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 GGKHEPNMQLLCDECNVAYHIYCLNPPLDKVPEEEYWYCPSCKTDSSEVVKAGERLKMSK
::...:. ::.::::..:.:::::.:::..:: :. :::: :..:.:::: :::::. ::
CCDS74 GGRQDPDKQLMCDECDMAFHIYCLDPPLSSVPSEDEWYCPECRNDASEVVLAGERLRESK
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 KKAKMPSASTESRRDWGRGMACVGRTRECTIVPSNHYGPIPGIPVGSTWRFRVQVSEAGV
::::: ::.. :.::::.::::::::.:::::::::::::::::::. :::::::::.::
CCDS74 KKAKMASATSSSQRDWGKGMACVGRTKECTIVPSNHYGPIPGIPVGTMWRFRVQVSESGV
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 HRPHVGGIHGRSNDGAYSLVLAGGFADEVDRGDEFTYTGSGGKNLAGNKRIGAPSADQTL
:::::.::::::::::::::::::. :.::.:. ::::::::..:.:::: . : :: :
CCDS74 HRPHVAGIHGRSNDGAYSLVLAGGYEDDVDHGNFFTYTGSGGRDLSGNKRTAEQSCDQKL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 TNMNRALALNCDAPLDDKIGAESRNWRAGKPVRVIRSFKGRKISKYAPEEGNRYDGIYKV
:: :::::::: ::..:. :::...::.::::::.:. :: : ::::: :::::::::::
CCDS74 TNTNRALALNCFAPINDQEGAEAKDWRSGKPVRVVRNVKGGKNSKYAPAEGNRYDGIYKV
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640
pF1KB9 VKYWPEISSSHGFLVWRYLLRRDDVEPAPWTSEGIERSRRLCLRLQYPAGY-----PSDK
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CCDS74 VKYWPEKGKS-GFLVWRYLLRRDDDEPGPWTKEGKDRIKKLGLTMQYPEGYLEALANRER
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690
pF1KB9 EGKKPKGQSKKQPSGTTKRP---------ISDDDCPSASKVYKASDSAEAIEAFQLTPQQ
: .. : . ..: : : : :: . . ... .: ..:: ::
CCDS74 EKENSKREEEEQQEGGFASPRTGKGKWKRKSAGGGPSRAGSPRRTSKKTKVEPYSLTAQQ
630 640 650 660 670 680
700 710 720 730 740
pF1KB9 QHLIREDCQNQKLWDEVLSHLVEGPN-------FLKKLEQSFMCVCCQELVYQPVTTECF
. ::::: .: :::.:::. : . : ::.:.:..:.:.::::::..:.:: :
CCDS74 SSLIREDKSNAKLWNEVLASLKDRPASGSPFQLFLSKVEETFQCICCQELVFRPITTVCQ
690 700 710 720 730 740
750 760 770 780 790 800
pF1KB9 HNVCKDCLQRSFKAQVFSCPACRHDLGQNYIMIPNEILQTLLDLFFPGYSKGR
::::::::.:::.::::::::::.:::..: : :. :::.:. .::::..::
CCDS74 HNVCKDCLDRSFRAQVFSCPACRYDLGRSYAMQVNQPLQTVLNQLFPGYGNGR
750 760 770 780 790
>>CCDS74262.1 UHRF1 gene_id:29128|Hs108|chr19 (806 aa)
initn: 2841 init1: 1470 opt: 2118 Z-score: 1734.5 bits: 331.8 E(32554): 2.7e-90
Smith-Waterman score: 2977; 53.8% identity (74.4% similar) in 833 aa overlap (1-802:14-806)
10 20 30 40
pF1KB9 MWIQVRTIDGSKTCTIEDVSRKATIEELRERVWALFDVRPECQRLFY
:::::::.:: .: :....:: . .::::... :: :.: :::::
CCDS74 MGVFAVPPLSADTMWIQVRTMDGRQTHTVDSLSRLTKVEELRRKIQELFHVEPGLQRLFY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 RGKQLENGYTLFDYDVGLNDIIQLLVRPDPDHLPGTSTQIEAK------PCSNSPPKVKK
::::.:.:.:::::.: ::: :::::: . :: .. . ... : . . :
CCDS74 RGKQMEDGHTLFDYEVRLNDTIQLLVRQSLV-LPHSTKERDSELSDTDSGCCLGQSESDK
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB9 APRVGPSNQPSTS--ARARLIDPG-FGIYKVNELVDARDVGLGAWFEAHIHSVTRASDGQ
. : . . : : . : .:.::::: :::::...::::::.. :::
CCDS74 SSTHGEAAAETDSRPADEDMWDETELGLYKVNEYVDARDTNMGAWFEAQVVRVTR-----
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 SRGKTPLKNGSSCKRTNGNIKHKSKENTNKLDSVPSTSNSDCVAADEDVIYHIQYDEYPE
:.: .. :. : : : : .::::::..::.:::
CCDS74 ---KAPSRD-EPCSST----------------SRP--------ALEEDVIYHVKYDDYPE
180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 SGTLEMNVKDLRPRARTILKWNELNVGDVVMVNYNVESPGQRGFWFDAEITTLKTISRTK
.:...:: .:.: :::::.::..:.::.:::.::: ..: .::::.::::. : .::
CCDS74 NGVVQMNSRDVRARARTIIKWQDLEVGQVVMLNYNPDNPKERGFWYDAEISR-KRETRTA
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 KELRVKIFLGGSEGTLNDCKIISVDEIFKIERPG-AHPLSFADGKFLRRNDPECDLCGGD
.:: ... :: . .::::.:: :::.::::::: . :. .:. . :.. : : : :
CCDS74 RELYANVVLG--DDSLNDCRIIFVDEVFKIERPGEGSPM--VDNPMRRKSGPSCKHCKDD
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 PEKKCHSCSCRVCGGKHEPNMQLLCDECNVAYHIYCLNPPLDKVPEEEYWYCPSCKTDSS
.. :. :.:..:::...:. ::.::::..:.:::::.:::..:: :. :::: :..:.:
CCDS74 VNRLCRVCACHLCGGRQDPDKQLMCDECDMAFHIYCLDPPLSSVPSEDEWYCPECRNDAS
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 EVVKAGERLKMSKKKAKMPSASTESRRDWGRGMACVGRTRECTIVPSNHYGPIPGIPVGS
::: :::::. ::::::: ::.. :.::::.::::::::.:::::::::::::::::::.
CCDS74 EVVLAGERLRESKKKAKMASATSSSQRDWGKGMACVGRTKECTIVPSNHYGPIPGIPVGT
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 TWRFRVQVSEAGVHRPHVGGIHGRSNDGAYSLVLAGGFADEVDRGDEFTYTGSGGKNLAG
:::::::::.:::::::.::::::::::::::::::. :.::.:. ::::::::..:.:
CCDS74 MWRFRVQVSESGVHRPHVAGIHGRSNDGAYSLVLAGGYEDDVDHGNFFTYTGSGGRDLSG
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 NKRIGAPSADQTLTNMNRALALNCDAPLDDKIGAESRNWRAGKPVRVIRSFKGRKISKYA
::: . : :: ::: :::::::: ::..:. :::...::.::::::.:. :: : ::::
CCDS74 NKRTAEQSCDQKLTNTNRALALNCFAPINDQEGAEAKDWRSGKPVRVVRNVKGGKNSKYA
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 PEEGNRYDGIYKVVKYWPEISSSHGFLVWRYLLRRDDVEPAPWTSEGIERSRRLCLRLQY
: ::::::::::::::::: ..: ::::::::::::: ::.:::.:: .: ..: : .::
CCDS74 PAEGNRYDGIYKVVKYWPEKGKS-GFLVWRYLLRRDDDEPGPWTKEGKDRIKKLGLTMQY
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KB9 PAGY-----PSDKEGKKPKGQSKKQPSGTTKRP---------ISDDDCPSASKVYKASDS
: :: ..: .. : . ..: : : : :: . . ...
CCDS74 PEGYLEALANREREKENSKREEEEQQEGGFASPRTGKGKWKRKSAGGGPSRAGSPRRTSK
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730
pF1KB9 AEAIEAFQLTPQQQHLIREDCQNQKLWDEVLSHLVEGPN-------FLKKLEQSFMCVCC
.: ..:: ::. ::::: .: :::.:::. : . : ::.:.:..:.:.::
CCDS74 KTKVEPYSLTAQQSSLIREDKSNAKLWNEVLASLKDRPASGSPFQLFLSKVEETFQCICC
690 700 710 720 730 740
740 750 760 770 780 790
pF1KB9 QELVYQPVTTECFHNVCKDCLQRSFKAQVFSCPACRHDLGQNYIMIPNEILQTLLDLFFP
::::..:.:: : ::::::::.:::.::::::::::.:::..: : :. :::.:. .::
CCDS74 QELVFRPITTVCQHNVCKDCLDRSFRAQVFSCPACRYDLGRSYAMQVNQPLQTVLNQLFP
750 760 770 780 790 800
800
pF1KB9 GYSKGR
::..::
CCDS74 GYGNGR
802 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 23:12:47 2016 done: Thu Nov 3 23:12:47 2016
Total Scan time: 3.730 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]