Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9340
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9340, 766 aa
1>>>pF1KB9340 766 - 766 aa - 766 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4766+/-0.00102; mu= 10.0227+/- 0.061
mean_var=125.9664+/-25.668, 0's: 0 Z-trim(107.2): 149 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.114274
statistics sampled from 9257 (9411) to 9257 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8727.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 766) 5085 850.3 0
CCDS76544.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 851) 5085 850.3 0
CCDS76545.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 878) 5085 850.3 0
CCDS81679.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 673) 4478 750.2 2.5e-216
CCDS4829.1 FGD2 gene_id:221472|Hs108|chr6 ( 655) 2026 345.9 1.2e-94
CCDS14359.1 FGD1 gene_id:2245|Hs108|chrX ( 961) 1809 310.2 9.8e-84
CCDS69619.1 FGD3 gene_id:89846|Hs108|chr9 ( 724) 1354 235.2 2.9e-61
CCDS43849.1 FGD3 gene_id:89846|Hs108|chr9 ( 725) 1354 235.2 2.9e-61
CCDS31878.1 FGD6 gene_id:55785|Hs108|chr12 (1430) 975 172.8 3.4e-42
CCDS46767.1 FGD5 gene_id:152273|Hs108|chr3 (1462) 628 115.6 5.7e-25
CCDS33424.1 FARP2 gene_id:9855|Hs108|chr2 (1054) 553 103.2 2.3e-21
CCDS9487.1 FARP1 gene_id:10160|Hs108|chr13 (1045) 480 91.1 9.5e-18
CCDS3220.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 883) 364 72.0 4.7e-12
CCDS58860.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 914) 364 72.0 4.8e-12
CCDS13410.1 PREX1 gene_id:57580|Hs108|chr20 (1659) 367 72.6 5.7e-12
CCDS6201.1 PREX2 gene_id:80243|Hs108|chr8 (1606) 360 71.5 1.2e-11
CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 670) 344 68.6 3.7e-11
CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 690) 344 68.6 3.7e-11
>>CCDS8727.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 (766 aa)
initn: 5085 init1: 5085 opt: 5085 Z-score: 4537.2 bits: 850.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5085; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEEIKPASASCVSKEKPSKVSDLISRFEGGSSLSNYSDLKKESAVNLNAPRTPGRHGLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MEEIKPASASCVSKEKPSKVSDLISRFEGGSSLSNYSDLKKESAVNLNAPRTPGRHGLTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TPQQKLLSQHLPQRQGNDTDKTQGAQTCVANGVMAAQNQMECEEEKAATLSSDTSIQASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TPQQKLLSQHLPQRQGNDTDKTQGAQTCVANGVMAAQNQMECEEEKAATLSSDTSIQASE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 PLLDTHIVNGERDETATAPASPTTDSCDGNASDSSYRTPGIGPVLPLEERGAETETKVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 PLLDTHIVNGERDETATAPASPTTDSCDGNASDSSYRTPGIGPVLPLEERGAETETKVQE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RENGESPLELEQLDQHHEMKETNEQKLHKIANELLLTERAYVNRLDLLDQVFYCKLLEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 RENGESPLELEQLDQHHEMKETNEQKLHKIANELLLTERAYVNRLDLLDQVFYCKLLEEA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 NRGSFPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLPELEKRMQEWETTPRIGDILQKLAPFLKMYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NRGSFPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLPELEKRMQEWETTPRIGDILQKLAPFLKMYG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 EYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEIQKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPRYEMLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 EYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEIQKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPRYEMLLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 DYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHSNSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEEDIVNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 DYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHSNSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEEDIVNPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNMLLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGIDGMKIVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNMLLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGIDGMKIVE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 TQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKEEWIKALQETIDAFHQRHETFRNAIAKDNDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKEEWIKALQETIDAFHQRHETFRNAIAKDNDI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 HSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKEPFNALTRRRHHCRACGYVVCWKCSDYKAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 HSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKEPFNALTRRRHHCRACGYVVCWKCSDYKAQL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 EYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEEKKRKGILEIESAEVSGNSVVCSFLQYMEKSKPWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 EYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEEKKRKGILEIESAEVSGNSVVCSFLQYMEKSKPWQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 KAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIPLLGYVVDEMPRSADLPHSFKLTQSKSVHSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 KAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIPLLGYVVDEMPRSADLPHSFKLTQSKSVHSF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB9 AADSEELKQKWLKVILLAVTGETPGGPNEHPATLDDHPEPKKKSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 AADSEELKQKWLKVILLAVTGETPGGPNEHPATLDDHPEPKKKSEC
730 740 750 760
>>CCDS76544.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 (851 aa)
initn: 5085 init1: 5085 opt: 5085 Z-score: 4536.5 bits: 850.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5085; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:86-851)
10 20 30
pF1KB9 MEEIKPASASCVSKEKPSKVSDLISRFEGG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PPKPLHLQNSPSSNIHQTPRHKALPSAKPRMEEIKPASASCVSKEKPSKVSDLISRFEGG
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 SSLSNYSDLKKESAVNLNAPRTPGRHGLTTTPQQKLLSQHLPQRQGNDTDKTQGAQTCVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSLSNYSDLKKESAVNLNAPRTPGRHGLTTTPQQKLLSQHLPQRQGNDTDKTQGAQTCVA
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 NGVMAAQNQMECEEEKAATLSSDTSIQASEPLLDTHIVNGERDETATAPASPTTDSCDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NGVMAAQNQMECEEEKAATLSSDTSIQASEPLLDTHIVNGERDETATAPASPTTDSCDGN
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 ASDSSYRTPGIGPVLPLEERGAETETKVQERENGESPLELEQLDQHHEMKETNEQKLHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ASDSSYRTPGIGPVLPLEERGAETETKVQERENGESPLELEQLDQHHEMKETNEQKLHKI
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 ANELLLTERAYVNRLDLLDQVFYCKLLEEANRGSFPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ANELLLTERAYVNRLDLLDQVFYCKLLEEANRGSFPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLP
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 ELEKRMQEWETTPRIGDILQKLAPFLKMYGEYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ELEKRMQEWETTPRIGDILQKLAPFLKMYGEYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEI
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 QKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPRYEMLLKDYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPRYEMLLKDYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHS
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 NSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEEDIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEEDIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNM
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 LLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGIDGMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGIDGMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKE
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 EWIKALQETIDAFHQRHETFRNAIAKDNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EWIKALQETIDAFHQRHETFRNAIAKDNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKE
600 610 620 630 640 650
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 PFNALTRRRHHCRACGYVVCWKCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEEKKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PFNALTRRRHHCRACGYVVCWKCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEEKKRK
660 670 680 690 700 710
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 GILEIESAEVSGNSVVCSFLQYMEKSKPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GILEIESAEVSGNSVVCSFLQYMEKSKPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIP
720 730 740 750 760 770
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 LLGYVVDEMPRSADLPHSFKLTQSKSVHSFAADSEELKQKWLKVILLAVTGETPGGPNEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LLGYVVDEMPRSADLPHSFKLTQSKSVHSFAADSEELKQKWLKVILLAVTGETPGGPNEH
780 790 800 810 820 830
760
pF1KB9 PATLDDHPEPKKKSEC
::::::::::::::::
CCDS76 PATLDDHPEPKKKSEC
840 850
>>CCDS76545.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 (878 aa)
initn: 5085 init1: 5085 opt: 5085 Z-score: 4536.3 bits: 850.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5085; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:113-878)
10 20 30
pF1KB9 MEEIKPASASCVSKEKPSKVSDLISRFEGG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PPKPLHLQNSPSSNIHQTPRHKALPSAKPRMEEIKPASASCVSKEKPSKVSDLISRFEGG
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 SSLSNYSDLKKESAVNLNAPRTPGRHGLTTTPQQKLLSQHLPQRQGNDTDKTQGAQTCVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSLSNYSDLKKESAVNLNAPRTPGRHGLTTTPQQKLLSQHLPQRQGNDTDKTQGAQTCVA
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 NGVMAAQNQMECEEEKAATLSSDTSIQASEPLLDTHIVNGERDETATAPASPTTDSCDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NGVMAAQNQMECEEEKAATLSSDTSIQASEPLLDTHIVNGERDETATAPASPTTDSCDGN
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 ASDSSYRTPGIGPVLPLEERGAETETKVQERENGESPLELEQLDQHHEMKETNEQKLHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ASDSSYRTPGIGPVLPLEERGAETETKVQERENGESPLELEQLDQHHEMKETNEQKLHKI
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 ANELLLTERAYVNRLDLLDQVFYCKLLEEANRGSFPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ANELLLTERAYVNRLDLLDQVFYCKLLEEANRGSFPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLP
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 ELEKRMQEWETTPRIGDILQKLAPFLKMYGEYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ELEKRMQEWETTPRIGDILQKLAPFLKMYGEYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEI
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 QKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPRYEMLLKDYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPRYEMLLKDYLRKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHS
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 NSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEEDIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEEDIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNM
510 520 530 540 550 560
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 LLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGIDGMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGIDGMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKE
570 580 590 600 610 620
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 EWIKALQETIDAFHQRHETFRNAIAKDNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EWIKALQETIDAFHQRHETFRNAIAKDNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKE
630 640 650 660 670 680
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 PFNALTRRRHHCRACGYVVCWKCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEEKKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PFNALTRRRHHCRACGYVVCWKCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEEKKRK
690 700 710 720 730 740
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 GILEIESAEVSGNSVVCSFLQYMEKSKPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GILEIESAEVSGNSVVCSFLQYMEKSKPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIP
750 760 770 780 790 800
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 LLGYVVDEMPRSADLPHSFKLTQSKSVHSFAADSEELKQKWLKVILLAVTGETPGGPNEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LLGYVVDEMPRSADLPHSFKLTQSKSVHSFAADSEELKQKWLKVILLAVTGETPGGPNEH
810 820 830 840 850 860
760
pF1KB9 PATLDDHPEPKKKSEC
::::::::::::::::
CCDS76 PATLDDHPEPKKKSEC
870
>>CCDS81679.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 (673 aa)
initn: 4478 init1: 4478 opt: 4478 Z-score: 3997.2 bits: 750.2 E(32554): 2.5e-216
Smith-Waterman score: 4478; 100.0% identity (100.0% similar) in 673 aa overlap (94-766:1-673)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 QKLLSQHLPQRQGNDTDKTQGAQTCVANGVMAAQNQMECEEEKAATLSSDTSIQASEPLL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MAAQNQMECEEEKAATLSSDTSIQASEPLL
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 DTHIVNGERDETATAPASPTTDSCDGNASDSSYRTPGIGPVLPLEERGAETETKVQEREN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DTHIVNGERDETATAPASPTTDSCDGNASDSSYRTPGIGPVLPLEERGAETETKVQEREN
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GESPLELEQLDQHHEMKETNEQKLHKIANELLLTERAYVNRLDLLDQVFYCKLLEEANRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GESPLELEQLDQHHEMKETNEQKLHKIANELLLTERAYVNRLDLLDQVFYCKLLEEANRG
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SFPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLPELEKRMQEWETTPRIGDILQKLAPFLKMYGEYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SFPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLPELEKRMQEWETTPRIGDILQKLAPFLKMYGEYV
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEIQKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPRYEMLLKDYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEIQKQKICGSLTLQHHMLEPVQRIPRYEMLLKDYL
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 RKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHSNSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEEDIVNPSNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RKLPPDSLDWNDAKKSLEIISTAASHSNSAIRKMENLKKLLEIYEMLGEEEDIVNPSNEL
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 IKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNMLLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGIDGMKIVETQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IKEGQILKLAARNTSAQERYLFLFNNMLLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGIDGMKIVETQN
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 EEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKEEWIKALQETIDAFHQRHETFRNAIAKDNDIHSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQDKEEWIKALQETIDAFHQRHETFRNAIAKDNDIHSE
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CCDS43 AVGLVSTWTQRSPLFKDVVHSIQKQEVCGNLTLQHHMLEPVQRVPRYELLLKDYLKRLPQ
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CCDS43 IQKLSAKNGTPQDRHLFLFNSMILYCVPKLRLMGQKFSVREKMDISGLQVQDIVKPNTAH
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CCDS43 MPITSTSPVEPVVTTEGSSGAAGLE-PRKLSSKTRRDKEKQSCKSCGETFNSITKRRHHC
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CCDS43 KLCGAVICGKCSEFKAE----NSRQSRVCRDCFLTQPVAPESTEKT-------PTAD-PQ
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CCDS43 PSLLCGPLRLSESGETWSEVWAAIPMSDPQVLHLQGGSQDGRLPRTIPLPSCKLSVPDPE
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CCDS43 ERLDSGHVWKLQWAKQSWYLSASSAELQQQWLETLSTAAHGDTAQDSPGALQLQVPMGAA
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CCDS43 AP
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>>CCDS46767.1 FGD5 gene_id:152273|Hs108|chr3 (1462 aa)
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CCDS46 LSSEKAYVEMLQHLNLDFHGAVMRALDDMDHEGRDTLAREELRQGLSELPAIHDLHQG-I
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CCDS46 EFEQSVQGGSQTAKHRLLRVVQRLFQYQVLLTDYLNNLCPDSAEYDNTQGALSLISKVTD
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CCDS46 GPIFHLYHKKTLFYSFKAEDTNSAQRWIEAMEDASVL
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pF1KB9 EC
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 23:10:21 2016 done: Thu Nov 3 23:10:21 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]