Result of FASTA (omim) for
pF1KB9127
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9127, 819 aa
1>>>pF1KB9127 819 - 819 aa - 819 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4919+/-0.00107; mu= 17.4823+/- 0.065
mean_var=345.8052+/-72.447, 0's: 0 Z-trim(105.8): 2123 B-trim: 73 in 1/52
Lambda= 0.068970
statistics sampled from 11698 (14001) to 11698 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.424), E-opt: 0.2 (0.164), width: 16
Scan time: 7.780
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 5706 584.7 7.3e-166
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 5706 584.7 7.3e-166
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 5706 584.7 7.3e-166
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 5706 584.7 7.3e-166
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 5706 584.7 7.3e-166
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2676 283.2 4.2e-75
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2676 283.2 4.2e-75
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2676 283.2 4.3e-75
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2676 283.3 4.3e-75
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2676 283.3 4.3e-75
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2676 283.3 4.3e-75
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2676 283.3 4.4e-75
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2548 270.2 2.5e-71
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2548 270.2 2.5e-71
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2548 270.2 2.5e-71
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2548 270.3 2.5e-71
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 2548 270.3 2.6e-71
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2516 267.4 2.8e-70
XP_016865199 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2502 265.7 6.2e-70
XP_016865202 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2502 265.7 6.2e-70
XP_016865200 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2502 265.7 6.2e-70
NP_689496 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ho ( 867) 2502 265.7 6.2e-70
XP_016865204 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2502 265.7 6.2e-70
XP_016865201 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2502 265.7 6.2e-70
XP_016865203 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2502 265.7 6.2e-70
NP_001166109 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ( 900) 2502 265.8 6.3e-70
XP_016865206 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 900) 2502 265.8 6.3e-70
XP_016865207 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 806) 2474 262.9 4.1e-69
XP_016865205 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 821) 2474 262.9 4.2e-69
XP_016865210 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 753) 2471 262.5 4.9e-69
XP_016865209 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 786) 2471 262.6 5e-69
XP_016865208 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2471 262.6 5.1e-69
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2450 260.8 2.6e-68
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 2397 255.3 8.6e-67
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 2397 255.3 9e-67
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 2397 255.3 9e-67
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2369 252.5 6e-66
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2363 251.8 8.4e-66
>>XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger pro (1059 aa)
initn: 4862 init1: 4862 opt: 5706 Z-score: 3098.8 bits: 584.7 E(85289): 7.3e-166
Smith-Waterman score: 5706; 98.2% identity (99.0% similar) in 816 aa overlap (4-819:248-1059)
10 20 30
pF1KB9 MMNLEKNFDKTTLFNHMRTDKRGKCSDLNEYGT
..::::: ::::::::: ::::::::::::
XP_016 DGSGQGLYDKTICITPQSFLTGEKSCKDDEFRKNFDKITLFNHMRTDTRGKCSDLNEYGT
220 230 240 250 260 270
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 SCDKTTAVEYNKVHMAMTHYECNERGINFSRKSPLTQSQRTITGWSAFESNKCEENFSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SCDKTTAVEYNKVHMAMTHYECNERGINFSRKSPLTQSQRTITGWSAFESNKCEENFSQS
280 290 300 310 320 330
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SAHIVHQKTQAGDKFGEHNECTDALYQKLDFTAHQRIHTDFTAHQKFYLSDEHGKCRKSF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:::::::::::::::
XP_016 SAHIVHQKTQAGDKFGEHNECTDALYQKLDFTAHQRIHTE----DKFYLSDEHGKCRKSF
340 350 360 370 380 390
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 YWKAHLIQHERPHSGEKTYQYEECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNS
: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YRKAHLIQHQRPHSGEKTYQYEECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNS
400 410 420 430 440 450
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 NLSKHLRIHTKEKPCDNNGCGRSYKSPLIGHQKTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLSKHLRIHTKEKPCDNNGCGRSYKSPLIGHQKTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILM
460 470 480 490 500 510
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GEKPYECIECGKTFSKTSHLRAHQRIHTGEKPYECVECEKTFSHKTHLSVHQRVHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GEKPYECIECGKTFSKTSHLRAHQRIHTGEKPYECVECEKTFSHKTHLSVHQRVHTGEKP
520 530 540 550 560 570
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 YECNDCGKSFTYNSALRAHQRIHTGEKPYECSDCEKTFAHNSALRAHHRIHTGEKPYECN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YECNDCGKSFTYNSALRAHQRIHTGEKPYECSDCEKTFAHNSALRAHHRIHTGEKPYECN
580 590 600 610 620 630
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 ECGRSFAHISVLKAHQRIHTREKPYECNECGRSFTYNSALRAHQRIHTGRKPYECSDCEK
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ECGRSFAHISVLKAHQRIHTGEKPYECNECGRSFTYNSALRAHQRIHTGRKPYECSDCEK
640 650 660 670 680 690
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 TFAHNSALKIHQRIHTGEKPYKCNECEKTFAHNSALRAHQNIHTGEKLYECSECGKTFFQ
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFAHNSALKIHQRIHTGEKPYECNECEKTFAHNSALRAHQNIHTGEKLYECSECGKTFFQ
700 710 720 730 740 750
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 KTRLSTHRRIHTGEKPYECSKCGKTFSQKSYLSGHERIHTGEKPYECNVCGKTFVYKAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTRLSTHRRIHTGEKPYECSKCGKTFSQKSYLSGHERIHTGEKPYECNVCGKTFVYKAAL
760 770 780 790 800 810
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 IVHQRIHTGEKPYECNECGKTFSQRTHLCAHQRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRAHH
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IVHQRIHTGEKPYECNQCGKTFSQRTHLCAHQRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRAHH
820 830 840 850 860 870
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 RIHTGEKPYECNDCGKTFSKTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RIHTGEKPYECNDCGKTFSKTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRVHT
880 890 900 910 920 930
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 GEKPYECNVCGKPFAHNSTLRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GEKPYECNVCGKPFAHNSTLRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGEKP
940 950 960 970 980 990
760 770 780 790 800 810
pF1KB9 YECNECGKAFAQNSTLRVHQRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YECNECGKAFAQNSTLRVHQRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLAC
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB9 NGFGKS
::::::
XP_016 NGFGKS
>>XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger pro (1059 aa)
initn: 4862 init1: 4862 opt: 5706 Z-score: 3098.8 bits: 584.7 E(85289): 7.3e-166
Smith-Waterman score: 5706; 98.2% identity (99.0% similar) in 816 aa overlap (4-819:248-1059)
10 20 30
pF1KB9 MMNLEKNFDKTTLFNHMRTDKRGKCSDLNEYGT
..::::: ::::::::: ::::::::::::
XP_005 DGSGQGLYDKTICITPQSFLTGEKSCKDDEFRKNFDKITLFNHMRTDTRGKCSDLNEYGT
220 230 240 250 260 270
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 SCDKTTAVEYNKVHMAMTHYECNERGINFSRKSPLTQSQRTITGWSAFESNKCEENFSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SCDKTTAVEYNKVHMAMTHYECNERGINFSRKSPLTQSQRTITGWSAFESNKCEENFSQS
280 290 300 310 320 330
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SAHIVHQKTQAGDKFGEHNECTDALYQKLDFTAHQRIHTDFTAHQKFYLSDEHGKCRKSF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:::::::::::::::
XP_005 SAHIVHQKTQAGDKFGEHNECTDALYQKLDFTAHQRIHTE----DKFYLSDEHGKCRKSF
340 350 360 370 380 390
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 YWKAHLIQHERPHSGEKTYQYEECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNS
: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YRKAHLIQHQRPHSGEKTYQYEECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNS
400 410 420 430 440 450
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 NLSKHLRIHTKEKPCDNNGCGRSYKSPLIGHQKTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NLSKHLRIHTKEKPCDNNGCGRSYKSPLIGHQKTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILM
460 470 480 490 500 510
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GEKPYECIECGKTFSKTSHLRAHQRIHTGEKPYECVECEKTFSHKTHLSVHQRVHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GEKPYECIECGKTFSKTSHLRAHQRIHTGEKPYECVECEKTFSHKTHLSVHQRVHTGEKP
520 530 540 550 560 570
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 YECNDCGKSFTYNSALRAHQRIHTGEKPYECSDCEKTFAHNSALRAHHRIHTGEKPYECN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YECNDCGKSFTYNSALRAHQRIHTGEKPYECSDCEKTFAHNSALRAHHRIHTGEKPYECN
580 590 600 610 620 630
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 ECGRSFAHISVLKAHQRIHTREKPYECNECGRSFTYNSALRAHQRIHTGRKPYECSDCEK
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ECGRSFAHISVLKAHQRIHTGEKPYECNECGRSFTYNSALRAHQRIHTGRKPYECSDCEK
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460 470 480 490 500 510
pF1KB9 TFAHNSALKIHQRIHTGEKPYKCNECEKTFAHNSALRAHQNIHTGEKLYECSECGKTFFQ
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TFAHNSALKIHQRIHTGEKPYECNECEKTFAHNSALRAHQNIHTGEKLYECSECGKTFFQ
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pF1KB9 KTRLSTHRRIHTGEKPYECSKCGKTFSQKSYLSGHERIHTGEKPYECNVCGKTFVYKAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KTRLSTHRRIHTGEKPYECSKCGKTFSQKSYLSGHERIHTGEKPYECNVCGKTFVYKAAL
760 770 780 790 800 810
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 IVHQRIHTGEKPYECNECGKTFSQRTHLCAHQRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRAHH
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IVHQRIHTGEKPYECNQCGKTFSQRTHLCAHQRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRAHH
820 830 840 850 860 870
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 RIHTGEKPYECNDCGKTFSKTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RIHTGEKPYECNDCGKTFSKTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRVHT
880 890 900 910 920 930
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 GEKPYECNVCGKPFAHNSTLRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GEKPYECNVCGKPFAHNSTLRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGEKP
940 950 960 970 980 990
760 770 780 790 800 810
pF1KB9 YECNECGKAFAQNSTLRVHQRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YECNECGKAFAQNSTLRVHQRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLAC
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB9 NGFGKS
::::::
XP_005 NGFGKS
>>NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [H (1059 aa)
initn: 4862 init1: 4862 opt: 5706 Z-score: 3098.8 bits: 584.7 E(85289): 7.3e-166
Smith-Waterman score: 5706; 98.2% identity (99.0% similar) in 816 aa overlap (4-819:248-1059)
10 20 30
pF1KB9 MMNLEKNFDKTTLFNHMRTDKRGKCSDLNEYGT
..::::: ::::::::: ::::::::::::
NP_001 DGSGQGLYDKTICITPQSFLTGEKSCKDDEFRKNFDKITLFNHMRTDTRGKCSDLNEYGT
220 230 240 250 260 270
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 SCDKTTAVEYNKVHMAMTHYECNERGINFSRKSPLTQSQRTITGWSAFESNKCEENFSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCDKTTAVEYNKVHMAMTHYECNERGINFSRKSPLTQSQRTITGWSAFESNKCEENFSQS
280 290 300 310 320 330
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SAHIVHQKTQAGDKFGEHNECTDALYQKLDFTAHQRIHTDFTAHQKFYLSDEHGKCRKSF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:::::::::::::::
NP_001 SAHIVHQKTQAGDKFGEHNECTDALYQKLDFTAHQRIHTE----DKFYLSDEHGKCRKSF
340 350 360 370 380 390
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 YWKAHLIQHERPHSGEKTYQYEECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNS
: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YRKAHLIQHQRPHSGEKTYQYEECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNS
400 410 420 430 440 450
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 NLSKHLRIHTKEKPCDNNGCGRSYKSPLIGHQKTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLSKHLRIHTKEKPCDNNGCGRSYKSPLIGHQKTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILM
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XP_011 YECNECGKAFAQNSTLRVHQRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLAC
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pF1KB9 NGFGKS
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XP_011 NGFGKS
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: .:. ..:.: . .:: :. . ..: :.:.:: ..: . : : :.:
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pF1KB9 YWKAHLIQHERPHSGEKTYQYEECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNS
:.. : .:.: :.::: :. :::.:.: .:: .: ..: : :. .:::::: :.
XP_006 IWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSL
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.:.:: ::..::: . ::...: : : :. : .: : :. ....: :.
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:. : ::: :.: ::::.: .: :: :.:::::::::.: :: :.:::.. :. :.:.
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:::::::.:..:::.:. .:.: :. :: ::::.:..:.::: . :.: :. ::.::
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pF1KB9 KPYECNECGRSFAHISVLKAHQRIHTREKPYECNECGRSFTYNSALRAHQRIHTGRKPYE
: :.:.:::..: . : : :. ::: ::::.:.:::..:...:.: :.:::: .::..
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:..: :.: .:.: :.:::::::::::.:: :.:...:.: :..:::::: :.:.::
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::.: ... :. :. ::.::: :.: .:::.:.:.: :. :. ::: ::: . . : :.:
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.....: :.:::: :: :.:.::::.::: .:: .:.:.:::::::.:.::::.:...:
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pF1KB9 ALRAHHRIHTGEKPYECNDCGKTFSKTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSA
.: .:. ::::::::.:..:::.: :.: : : ..:::::.: ::::.::..: ..
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: :.:::::::.:. ::: : ..: : .:. :::::: :.:..:::.: ..: :..:.::
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:: ::::.:.::::::.:.::: :.:.:::::::.: ::::.: ...:: ..: .::
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pF1KB9 EKTLACNGFGKS
:: :. ::.
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>--
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::. . . . :: : .. . .
XP_006 MEDSFQKVLLRKYEKCGHENLQLRKGCKSVDEC--KVHKEGYNKLN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]