Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9100
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9100, 1108 aa
1>>>pF1KB9100 1108 - 1108 aa - 1108 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1748+/-0.00131; mu= 5.7153+/- 0.078
mean_var=286.1790+/-60.623, 0's: 0 Z-trim(107.9): 144 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.075815
statistics sampled from 9764 (9897) to 9764 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 5.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 7406 825.2 0
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098) 5365 601.9 2.5e-171
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs108|chr12 (1022) 1957 229.1 3.9e-59
CCDS53685.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (1178) 1627 193.1 3.2e-48
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2175) 1627 193.4 4.8e-48
CCDS53683.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2215) 1627 193.4 4.9e-48
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078) 1478 176.8 2.4e-43
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107) 1478 176.8 2.4e-43
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136) 1478 176.8 2.5e-43
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 1442 172.8 3.6e-42
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 1442 172.8 3.6e-42
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 1437 172.3 5.2e-42
CCDS54834.1 MYO10 gene_id:4651|Hs108|chr5 (2058) 1438 172.7 7.8e-42
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 1362 164.1 1.5e-39
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 1353 163.3 4.5e-39
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 1340 161.6 7.7e-39
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 1340 161.6 8e-39
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 1345 162.4 8e-39
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 1317 159.4 6.9e-38
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 1317 159.4 7e-38
CCDS42271.1 MYO15A gene_id:51168|Hs108|chr17 (3530) 1314 159.3 1.4e-37
CCDS46405.1 MYO7B gene_id:4648|Hs108|chr2 (2116) 1294 156.9 4.4e-37
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 1287 156.1 7e-37
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976) 1274 154.7 1.9e-36
CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938) 1273 154.6 2e-36
CCDS10565.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1972) 1273 154.6 2e-36
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs108|chr14 (1935) 1230 149.9 5.2e-35
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 1177 143.4 1e-33
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022) 1182 144.7 2.1e-33
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937) 1174 143.8 3.7e-33
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940) 1171 143.4 4.6e-33
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 1168 143.1 5.9e-33
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs108|chr3 (1946) 1151 141.3 2.1e-32
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 970) 1111 136.6 2.7e-31
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 982 122.7 6.8e-27
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 960 120.2 3.1e-26
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 960 120.2 3.2e-26
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 923 116.3 6.7e-25
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983) 909 114.8 2e-24
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs108|chr17 (1941) 867 110.2 4.7e-23
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 861 109.5 7.4e-23
CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs108|chr7 (1018) 847 107.7 1.4e-22
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs108|chr17 (1938) 847 108.0 2.1e-22
CCDS32008.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1858) 843 107.6 2.8e-22
CCDS73598.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1880) 843 107.6 2.8e-22
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 843 107.6 2.9e-22
CCDS45654.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 770) 692 90.6 1.4e-17
CCDS75481.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1262) 688 90.4 2.7e-17
CCDS34487.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1285) 688 90.4 2.8e-17
CCDS10239.1 MYO9A gene_id:4649|Hs108|chr15 (2548) 635 84.9 2.5e-15
>>CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108 aa)
initn: 7406 init1: 7406 opt: 7406 Z-score: 4395.8 bits: 825.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7406; 100.0% identity (100.0% similar) in 1108 aa overlap (1-1108:1-1108)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGSKGVYQYHWQSHNVKHSGVDDMVLLSKITENSIVENLKKRYMDDYIFTYIGSVLISVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGSKGVYQYHWQSHNVKHSGVDDMVLLSKITENSIVENLKKRYMDDYIFTYIGSVLISVN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PFKQMPYFGEKEIEMYQGAAQYENPPHIYALADNMYRNMIIDRENQCVIISGESGAGKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PFKQMPYFGEKEIEMYQGAAQYENPPHIYALADNMYRNMIIDRENQCVIISGESGAGKTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 AAKYIMSYISRVSGGGTKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AAKYIMSYISRVSGGGTKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GGEPDGGKISNFLLEKSRVVMRNPGERSFHIFYQLIEGASAEQKHSLGITSMDYYYYLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGEPDGGKISNFLLEKSRVVMRNPGERSFHIFYQLIEGASAEQKHSLGITSMDYYYYLSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SGSYKVDDIDDRREFQETLHAMNVIGIFAEEQTLVLQIVAGILHLGNISFKEVGNYAAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGSYKVDDIDDRREFQETLHAMNVIGIFAEEQTLVLQIVAGILHLGNISFKEVGNYAAVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SEEFLAFPAYLLGINQDRLKEKLTSRQMDSKWGGKSESIHVTLNVEQACYTRDALAKALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEEFLAFPAYLLGINQDRLKEKLTSRQMDSKWGGKSESIHVTLNVEQACYTRDALAKALH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 ARVFDFLVDSINKAMEKDHEEYNIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ARVFDFLVDSINKAMEKDHEEYNIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LKAEQEEYVQEGIRWTPIEYFNNKIVCDLIENKVNPPGIMSILDDVCATMHAVGEGADQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LKAEQEEYVQEGIRWTPIEYFNNKIVCDLIENKVNPPGIMSILDDVCATMHAVGEGADQT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 LLQKLQMQIGSHEHFNSWNQGFIIHHYAGKVSYDMDGFCERNRDVLFMDLIELMQSSELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLQKLQMQIGSHEHFNSWNQGFIIHHYAGKVSYDMDGFCERNRDVLFMDLIELMQSSELP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 FIKSLFPENLQADKKGRPTTAGSKIKKQANDLVSTLMKCTPHYIRCIKPNETKKPRDWEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKSLFPENLQADKKGRPTTAGSKIKKQANDLVSTLMKCTPHYIRCIKPNETKKPRDWEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 SRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGYAYRRIFQKFLQRYAILTKATWPSWQGEEKQGVLHLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGYAYRRIFQKFLQRYAILTKATWPSWQGEEKQGVLHLLQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 SVNMDSDQFQLGRSKVFIKAPESLFLLEEMRERKYDGYARVIQKSWRKFVARKKYVQMRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SVNMDSDQFQLGRSKVFIKAPESLFLLEEMRERKYDGYARVIQKSWRKFVARKKYVQMRE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 EASDLLLNKKERRRNSINRNFIGDYIGMEEHPELQQFVGKREKIDFADTVTKYDRRFKGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EASDLLLNKKERRRNSINRNFIGDYIGMEEHPELQQFVGKREKIDFADTVTKYDRRFKGV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 KRDLLLTPKCLYLIGREKVKQGPDKGLVKEVLKRKIEIERILSVSLSTMQDDIFILHEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KRDLLLTPKCLYLIGREKVKQGPDKGLVKEVLKRKIEIERILSVSLSTMQDDIFILHEQE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 YDSLLESVFKTEFLSLLAKRYEEKTQKQLPLKFSNTLELKLKKENWGPWSAGGSRQVQFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YDSLLESVFKTEFLSLLAKRYEEKTQKQLPLKFSNTLELKLKKENWGPWSAGGSRQVQFH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 QGFGDLAVLKPSNKVLQVSIGPGLPKNSRPTRRNTTQNTGYSSGTQNANYPVRAAPPPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QGFGDLAVLKPSNKVLQVSIGPGLPKNSRPTRRNTTQNTGYSSGTQNANYPVRAAPPPPG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 YHQNGVIRNQYVPYPHAPGSQRSNQKSLYTSMARPPLPRQQSTSSDRVSQTPESLDFLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YHQNGVIRNQYVPYPHAPGSQRSNQKSLYTSMARPPLPRQQSTSSDRVSQTPESLDFLKV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 PDQGAAGVRRQTTSRPPPAGGRPKPQPKPKPQVPQCKALYAYDAQDTDELSFNANDIIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PDQGAAGVRRQTTSRPPPAGGRPKPQPKPKPQVPQCKALYAYDAQDTDELSFNANDIIDI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KB9 IKEDPSGWWTGRLRGKQGLFPNNYVTKI
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IKEDPSGWWTGRLRGKQGLFPNNYVTKI
1090 1100
>>CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098 aa)
initn: 5339 init1: 4738 opt: 5365 Z-score: 3189.3 bits: 601.9 E(32554): 2.5e-171
Smith-Waterman score: 5369; 71.7% identity (87.7% similar) in 1116 aa overlap (1-1108:1-1098)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGSKGVYQYHWQSHNVKHSGVDDMVLLSKITENSIVENLKKRYMDDYIFTYIGSVLISVN
:::: ..::::::::.::::::::: .:::..:. ::.::.:::::::::::::::::
CCDS42 MGSK--ERFHWQSHNVKQSGVDDMVLLPQITEDAIAANLRKRFMDDYIFTYIGSVLISVN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PFKQMPYFGEKEIEMYQGAAQYENPPHIYALADNMYRNMIIDRENQCVIISGESGAGKTV
:::::::: ..::..::::::::::::::::.:::::::.:: :::::::::::::::::
CCDS42 PFKQMPYFTDREIDLYQGAAQYENPPHIYALTDNMYRNMLIDCENQCVIISGESGAGKTV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 AAKYIMSYISRVSGGGTKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSP
::::::.:::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AAKYIMGYISKVSGGGEKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GGEPDGGKISNFLLEKSRVVMRNPGERSFHIFYQLIEGASAEQKHSLGITSMDYYYYLSL
:::::::::::::::::::::.: .::.:::.:::.:::: ::...::. . ::::::.
CCDS42 GGEPDGGKISNFLLEKSRVVMQNENERNFHIYYQLLEGASQEQRQNLGLMTPDYYYYLNQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SGSYKVDDIDDRREFQETLHAMNVIGIFAEEQTLVLQIVAGILHLGNISFKEVGNYAAVE
: .:.:: ::: .: ::: ::.:::: : ::::.:::::::::::: : :::: ::
CCDS42 SDTYQVDGTDDRSDFGETLSAMQVIGIPPSIQQLVLQLVAGILHLGNISFCEDGNYARVE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SEEFLAFPAYLLGINQDRLKEKLTSRQMDSKWGGKSESIHVTLNVEQACYTRDALAKALH
: ..::::::::::.. ::.::::::.:::.:::.::::.:::::::: ::::::::.:.
CCDS42 SVDLLAFPAYLLGIDSGRLQEKLTSRKMDSRWGGRSESINVTLNVEQAAYTRDALAKGLY
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 ARVFDFLVDSINKAMEKDHEEYNIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELT
::.:::::..::.::.: .:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ARLFDFLVEAINRAMQKPQEEYSIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LKAEQEEYVQEGIRWTPIEYFNNKIVCDLIENKVNPPGIMSILDDVCATMHAVGEGADQT
::::::::::::::::::.:::::.::::::::..::::::.::::::::::.: :::::
CCDS42 LKAEQEEYVQEGIRWTPIQYFNNKVVCDLIENKLSPPGIMSVLDDVCATMHATGGGADQT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 LLQKLQMQIGSHEHFNSWNQGFIIHHYAGKVSYDMDGFCERNRDVLFMDLIELMQSSELP
:::::: .:.:::::::. ::.:::::::::::..::::::::::: :::::::.::
CCDS42 LLQKLQAAVGTHEHFNSWSAGFVIHHYAGKVSYDVSGFCERNRDVLFSDLIELMQTSEQA
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 FIKSLFPENLQADKKGRPTTAGSKIKKQANDLVSTLMKCTPHYIRCIKPNETKKPRDWEE
:.. ::::.:..::::::.::::::::::::::.:::.:::::::::::::::.::::::
CCDS42 FLRMLFPEKLDGDKKGRPSTAGSKIKKQANDLVATLMRCTPHYIRCIKPNETKRPRDWEE
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 SRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGYAYRRIFQKFLQRYAILTKATWPSWQGEEKQGVLHLLQ
.:::::::::::::::::::::.:::: : :::::::::: ::: :.:.:.::: :::.
CCDS42 NRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGFAYRRQFAKFLQRYAILTPETWPRWRGDERQGVQHLLR
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 SVNMDSDQFQLGRSKVFIKAPESLFLLEEMRERKYDGYARVIQKSWRKFVARKKYVQMRE
.:::. ::.:.: .:::.: :::::::::.::::.::.::.:::.::. :: .:: .:::
CCDS42 AVNMEPDQYQMGSTKVFVKNPESLFLLEEVRERKFDGFARTIQKAWRRHVAVRKYEEMRE
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 EASDLLLNKKERRRNSINRNFIGDYIGMEEHPELQQFVGKREKIDFADTVTKYDRRFKGV
:::..::::::::::::::::.:::.:.::.:::.::.::::..::::.::::::::: .
CCDS42 EASNILLNKKERRRNSINRNFVGDYLGLEERPELRQFLGKRERVDFADSVTKYDRRFKPI
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 KRDLLLTPKCLYLIGREKVKQGPDKGLVKEVLKRKIEIERILSVSLSTMQDDIFILHEQE
::::.:::::.:.:::::::.::.:: : ::::.:..:. . .::::: :::.:::.:.
CCDS42 KRDLILTPKCVYVIGREKVKKGPEKGQVCEVLKKKVDIQALRGVSLSTRQDDFFILQEDA
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 YDSLLESVFKTEFLSLLAKRYEEKTQKQLPLKFSNTLELKLKKENWGPWSAGGSRQVQFH
::.:::::::::.::: ::.:: :.. ::: ::.::....:::.:: .::.:.: :
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CCDS46 KARKILRELKHQKRCKEAVTTIAAYWHGTQARRELRRLKEEARNKHAIAVIWAYWLGSKA
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