FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8978, 374 aa
1>>>pF1KB8978 374 - 374 aa - 374 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4611+/-0.000945; mu= 15.8682+/- 0.056
mean_var=105.2257+/-28.633, 0's: 0 Z-trim(106.1): 270 B-trim: 1130 in 2/45
Lambda= 0.125030
statistics sampled from 8402 (8800) to 8402 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 2513 464.4 7.2e-131
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 2098 389.5 2.4e-108
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 1569 294.1 1.3e-79
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 1253 237.1 1.8e-62
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 1152 218.9 5.5e-57
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 1152 218.9 5.8e-57
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 1099 209.3 4.2e-54
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 958 183.9 1.9e-46
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 917 176.5 3.2e-44
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 917 176.5 3.4e-44
CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 344) 831 161.0 1.5e-39
CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 356) 831 161.0 1.5e-39
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 782 152.2 7.2e-37
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 779 151.6 1e-36
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 779 151.6 1e-36
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 755 147.3 2e-35
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 755 147.3 2.1e-35
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 735 143.7 2.5e-34
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 710 139.2 5.5e-33
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 710 139.2 5.6e-33
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 709 139.0 6.3e-33
CCDS2736.1 XCR1 gene_id:2829|Hs108|chr3 ( 333) 699 137.1 2.1e-32
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 695 136.4 3.6e-32
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 694 136.3 4.2e-32
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 694 136.3 4.6e-32
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 682 134.1 1.8e-31
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 646 127.6 1.6e-29
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 623 123.5 3e-28
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 548 109.9 3.5e-24
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 536 107.8 1.6e-23
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 495 100.4 2.7e-21
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 486 98.8 8.6e-21
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 468 95.5 7.7e-20
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 468 95.6 8.1e-20
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 468 95.6 8.2e-20
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 457 93.5 3.1e-19
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 456 93.4 3.5e-19
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 453 92.8 5.1e-19
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 452 92.7 5.9e-19
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 447 91.8 1.1e-18
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 444 91.2 1.5e-18
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 439 90.3 3e-18
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 439 90.3 3e-18
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 436 89.7 4.2e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 435 89.6 5.3e-18
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 432 89.0 7e-18
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 430 88.7 9e-18
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 430 88.7 9.4e-18
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 430 88.7 9.5e-18
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 430 88.7 9.6e-18
>>CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 (374 aa)
initn: 2513 init1: 2513 opt: 2513 Z-score: 2463.0 bits: 464.4 E(32554): 7.2e-131
Smith-Waterman score: 2513; 100.0% identity (100.0% similar) in 374 aa overlap (1-374:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 CQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 AVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTHCCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTHCCI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 NPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRGKGKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRGKGKSI
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB8 GRAPEASLQDKEGA
::::::::::::::
CCDS43 GRAPEASLQDKEGA
370
>>CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 2098 init1: 2098 opt: 2098 Z-score: 2058.6 bits: 389.5 E(32554): 2.4e-108
Smith-Waterman score: 2098; 98.4% identity (99.1% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 CQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 AVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTHCCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTHCCI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 NPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRGKGKSI
::::::::::::: . .
CCDS46 NPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTSTNTPSTGEQEVSAGL
310 320 330 340 350 360
>>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 (352 aa)
initn: 1571 init1: 890 opt: 1569 Z-score: 1543.1 bits: 294.1 E(32554): 1.3e-79
Smith-Waterman score: 1569; 75.2% identity (90.4% similar) in 311 aa overlap (21-325:7-317)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDY--GAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFV
. ..: .: . ::.:..::::.:.:::::::::::::::
CCDS27 MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTG
:::::.:::::::.:: .:::::::::::::.::.:.:.::: :: .: :::.::.:.::
CCDS27 GNMLVILILINCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGNTMCQLLTG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIF
:: ::.:.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::.:::::
CCDS27 LYFIGFFSGIFFIILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGIIF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TKCQKEDSVYVCGPYFPRG----WNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRN
:. ::: :.:. .:: . :.::.:. :::::::::.:::::::::::::::::
CCDS27 TRSQKEGLHYTCSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 EKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLG
:::::::::.::::::::::::.:::::.:::::::::::.:: :...:::: :::::::
CCDS27 EKKRHRAVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQEFFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 MTHCCINPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGR
:::::::::::::::::::. . . . .::
CCDS27 MTHCCINPIIYAFVGEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQ
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KB8 GKGKSIGRAPEASLQDKEGA
CCDS27 EISVGL
350
>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 1100 init1: 412 opt: 1253 Z-score: 1235.0 bits: 237.1 E(32554): 1.8e-62
Smith-Waterman score: 1253; 57.7% identity (85.0% similar) in 319 aa overlap (12-325:5-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
::.:. ..:: ::: ..::.: . . .:::::::::::::..:.:::
CCDS27 METPNTTED-YDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWA-HSAANEWVFGNAMCKLFTGL
.::::.:.. :.:: .:.::::::::::::::.:::.: .. ..::::.::::...:.
CCDS27 ILVVLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
:. : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::.: : .:..::.::. :.
CCDS27 YYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KCQKEDSVYVCGPYFP----RGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
: : : . ..:. .:: : :. :... :..:::::::.:.:::.::.: ::: ::
CCDS27 KTQWEFTHHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGM
:: .:::.::.:::..::::::::..::...::.:. .::.. .:: :.::::....
CCDS27 KKS-KAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 THCCINPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRG
::::.::.:::::::.::. .. . :.:
CCDS27 THCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEHEL
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 994 init1: 379 opt: 1152 Z-score: 1136.5 bits: 218.9 E(32554): 5.5e-57
Smith-Waterman score: 1152; 54.2% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (21-317:14-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
:...: : : :.: :.. . ::..:::::::: :..::
CCDS27 MTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSA-ANEWVFGNAMCKLFTGL
..::.:::. ..:. .:.::::::::::::::.:::.: : . ...::::..::::..:.
CCDS27 VVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
:: : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::..:: .::.:..: .::
CCDS27 YHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KCQKEDSVYVCGPYFPR----GWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
. .. .:. .:. .: .:::. .:. ::::::.:.:::.::.:::::: .
CCDS27 ETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPS-
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGM
::...:.:.::.:: :.:.::::::..:::...: .. ..:: ...:: . :::....
CCDS27 KKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 THCCINPIIYAFVGEKFRS----LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLL
.:::.::.:::::::.::. .::
CCDS27 SHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPEL
300 310 320 330 340 350
>>CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 (376 aa)
initn: 994 init1: 379 opt: 1152 Z-score: 1136.2 bits: 218.9 E(32554): 5.8e-57
Smith-Waterman score: 1152; 54.2% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (21-317:35-338)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYS
:...: : : :.: :.. . ::..:::::
CCDS54 IRMLLRAHKPGSSRRSEMTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB8 LVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSA-ANEWVFG
::: :..::..::.:::. ..:. .:.::::::::::::::.:::.: : . ...::::
CCDS54 LVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 NAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAV
..::::..:.:: : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::..:: .::
CCDS54 HGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 FASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGPYFPR----GWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGI
.:..: .:: . .. .:. .:. .: .:::. .:. ::::::.:.:::.::
CCDS54 LAALPEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQ
.:::::: . ::...:.:.::.:: :.:.::::::..:::...: .. ..:: ...::
CCDS54 IKTLLRCPS-KKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 ATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRS----LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGK
. :::.....:::.::.:::::::.::. .::
CCDS54 VMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSS
310 320 330 340 350 360
350 360 370
pF1KB8 NVKVTTQGLLDGRGKGKSIGRAPEASLQDKEGA
CCDS54 VSPSTAEPELSIVF
370
>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 959 init1: 676 opt: 1099 Z-score: 1084.8 bits: 209.3 E(32554): 4.2e-54
Smith-Waterman score: 1099; 50.8% identity (80.1% similar) in 307 aa overlap (31-333:28-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
:: : .: .: .:::::::::.::..::
CCDS26 MNPTDIADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFGLLGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY
.:::.:.. :.:. .::.::::::::::::...::.:.. ::..:::: ..::... .:
CCDS26 SVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAADQWVFGLGLCKMISWMY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK
.:...::::..:..::::::::::::.:.:::.:.::.::. :: ::::::.::..:.
CCDS26 LVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFST
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB8 CQKEDSVYVCGPYFPRG---WNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKK
: : . : . . :. . .. ::::::.:: ::..::: :..:: .:.::::
CCDS26 CYTERNHTYCKTKYSLNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEKK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 RHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTH
..::..::....... ::::::::..:.:. :. :..: :: : :.::::...:
CCDS26 -NKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCTFERYLDYAIQATETLAFVH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 CCINPIIYAFVGEKFRS-LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRGK
::.::::: :.:::::. .... :: . ::
CCDS26 CCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDL
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB8 GKSIGRAPEASLQDKEGA
CCDS26 HDAL
360
>>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 899 init1: 571 opt: 958 Z-score: 947.4 bits: 183.9 E(32554): 1.9e-46
Smith-Waterman score: 958; 43.5% identity (78.4% similar) in 301 aa overlap (20-313:9-308)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDY----GAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFG
::: :: : ..:: .. : :: .: :.:.:.
CCDS26 MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQTNGKLLLAVFYCLLFVFS
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 FVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLF
..:: ::.:.:. ::::. .::.::::::.:::::....:. .. ..::::..:::.
CCDS26 LLGNSLVILVLVVCKKLRSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQTYYLLDQWVFGTVMCKVV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 TGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGI
.:.:.::.....::: :...:::::.::::.:::.::. .:.. . .::.:..:..: .
CCDS26 SGFYYIGFYSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIMATIPLL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 IFTKCQKEDSVYVCGPYFPRG---WNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCR
.: . .::.: : .. . :. : .. :::::..:. :...:: ::. : ::.
CCDS26 VFYQVASEDGVLQCYSFYNQQTLKWKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKILHQLKRCQ
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 NEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETL
:..: .:.:... ..:. .:::.:.:.:..:.... . :..: ..:: ::.::: .
CCDS26 NHNKT-KAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYATHVTEII
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 GMTHCCINPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDG
..::::.::.:::::::::.
CCDS26 SFTHCCVNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPRESCEKSSSCQQHSSRS
290 300 310 320 330 340
>>CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 862 init1: 597 opt: 917 Z-score: 907.4 bits: 176.5 E(32554): 3.2e-44
Smith-Waterman score: 917; 46.6% identity (75.2% similar) in 311 aa overlap (18-322:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAP-CHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVG
: :: :.:: : :. :. .:. .: .::..: .:.::
CCDS43 MDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFAIGLVG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 NMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGL
:.:::. : : :: : .:::::::::.:::::. :::.:.: :: . :::::. :..
CCDS43 NLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLHNAMCKFTTAF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
. ::.::.:::: ...:::::::: :. ... ::: ::. :. .: .:.....: ..::
CCDS43 FFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KCQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNI----LGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
: :::. : .:. ... ..::. ::..:::::: :: :..::. :.:.
CCDS43 K-QKENE---CLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTLFSCKNH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGM
:: .:...:. ..::.::::::::..:.:.:.. . . .:. ..: : .::::...
CCDS43 KKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVTETVAF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 THCCINPIIYAFVGEKFRS-LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGR
.:::.::.::::.::::: :.:. :
CCDS43 SHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVLSSNFT
290 300 310 320 330 340
>>CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 (387 aa)
initn: 862 init1: 597 opt: 917 Z-score: 906.9 bits: 176.5 E(32554): 3.4e-44
Smith-Waterman score: 917; 46.6% identity (75.2% similar) in 311 aa overlap (18-322:38-343)
10 20 30 40
pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAP-CHKFDVKQIGAQLLP
: :: :.:: : :. :. .:. .:
CCDS54 FKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 PLYSLVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEW
.::..: .:.:::.:::. : : :: : .:::::::::.:::::. :::.:.: ::
CCDS54 IFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 VFGNAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWL
. :::::. :... ::.::.:::: ...:::::::: :. ... ::: ::. :. .:
CCDS54 GLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VAVFASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNI----LGLVLPLLIMVICY
.:.....: ..::: :::. : .:. ... ..::. ::..:::::: ::
CCDS54 AAILVAAPQFMFTK-QKENE---CLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCY
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 SGILKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQ
:..::. :.:.:: .:...:. ..::.::::::::..:.:.:.. . . .:. ..
CCDS54 FRIIQTLFSCKNHKKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 LDQATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRS-LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGK
: : .::::....:::.::.::::.::::: :.:. :
CCDS54 LRLALSVTETVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370
pF1KB8 NVKVTTQGLLDGRGKGKSIGRAPEASLQDKEGA
CCDS54 RSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
370 380
374 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 16:47:48 2016 done: Fri Nov 4 16:47:49 2016
Total Scan time: 2.420 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]