Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8976
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8976, 372 aa
1>>>pF1KB8976 372 - 372 aa - 372 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5159+/-0.00104; mu= 14.9029+/- 0.061
mean_var=127.7603+/-38.811, 0's: 0 Z-trim(105.2): 270 B-trim: 1086 in 2/48
Lambda= 0.113469
statistics sampled from 7795 (8310) to 7795 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 2496 420.7 1e-117
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 845 150.4 2.3e-36
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 845 150.5 2.5e-36
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 804 143.7 2.4e-34
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 788 141.1 1.5e-33
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 788 141.1 1.5e-33
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 754 135.5 6.9e-32
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 712 128.6 8.1e-30
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 712 128.6 8.2e-30
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 687 124.5 1.4e-28
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 687 124.6 1.4e-28
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 666 121.1 1.6e-27
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 655 119.3 5.3e-27
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 644 117.5 1.8e-26
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 628 114.9 1.1e-25
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 624 114.2 1.8e-25
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 623 114.1 2.1e-25
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 621 113.7 2.5e-25
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 619 113.4 3.3e-25
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 613 112.4 6.2e-25
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 607 111.4 1.2e-24
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 607 111.5 1.3e-24
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 555 102.9 4.5e-22
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 555 103.0 4.7e-22
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 555 103.0 4.8e-22
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 539 100.3 2.8e-21
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 527 98.4 1.1e-20
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 512 95.9 6.2e-20
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 507 95.2 1.1e-19
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 495 93.1 4.1e-19
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 493 92.8 5.4e-19
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 493 92.8 5.4e-19
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 493 92.8 5.4e-19
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 493 92.8 5.5e-19
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 493 92.8 5.5e-19
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 493 92.8 5.5e-19
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 493 92.9 5.6e-19
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 493 92.9 5.6e-19
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 492 92.6 5.8e-19
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 493 92.9 5.8e-19
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 493 93.0 6.2e-19
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 490 92.3 7.1e-19
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 486 91.6 1.1e-18
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 484 91.3 1.4e-18
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 484 91.4 1.5e-18
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 482 91.0 1.8e-18
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 479 90.5 2.5e-18
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 477 90.2 3.1e-18
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 469 88.8 7.5e-18
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 467 88.5 9.6e-18
>>CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 (372 aa)
initn: 2496 init1: 2496 opt: 2496 Z-score: 2226.8 bits: 420.7 E(32554): 1e-117
Smith-Waterman score: 2496; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (1-372:1-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MNYPLTLEMDLENLEDLFWELDRLDNYNDTSLVENHLCPATEGPLMASFKAVFVPVAYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MNYPLTLEMDLENLEDLFWELDRLDNYNDTSLVENHLCPATEGPLMASFKAVFVPVAYSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSVGWVLGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 IFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSVGWVLGTF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHRRLLSIHITCGTIWLVGFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHRRLLSIHITCGTIWLVGFLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFSQENQAETHAWFTSRFLYHVAGFLLPMLVMGWCYVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFSQENQAETHAWFTSRFLYHVAGFLLPMLVMGWCYVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVDNTCKLNGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVDNTCKLNGSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 PVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQLFPSWRRSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQLFPSWRRSSL
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB8 SESENATSLTTF
::::::::::::
CCDS84 SESENATSLTTF
370
>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa)
initn: 788 init1: 444 opt: 845 Z-score: 766.2 bits: 150.4 E(32554): 2.3e-36
Smith-Waterman score: 845; 40.9% identity (68.3% similar) in 357 aa overlap (14-367:20-364)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MNYPLTLEMDLENLEDLFWELDRLDNYNDTSLVENHLCPATEGPLMASFKAVFV
::.. : .: .: : . :: . .: .:.
CCDS14 MVLEVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESD-SCCTSPPCPQ---DFSLNFDRAFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 PVAYSLIFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSVG
:. :::.::::..:: : ..: .: . :::.:::.:::::: :::. ::. .....:
CCDS14 PALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 WVLGTFLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHRRLLSIHITCGTIW
::.:. :::.. :: ..::: ..::::::. :::: ::::.. ::. . .:: ..:
CCDS14 WVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LVGFLLALPEILFAKVSQGHHNNSL--PRCTFSQENQAETHAWFTSRFLYHVAGFLLPML
. .:.:::...: .. ::.. : .: .. . ..: . : : :::::::.:
CCDS14 GLCLLFALPDFIFLSA---HHDERLNATHCQYNFPQVGRT----ALRVLQLVAGFLLPLL
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VMGWCYVGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVDN
::..::. .. : ..: .: .:.:....:. : :::.:::.:...: : : :.
CCDS14 VMAYCYAHILAVL-LVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALAR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TCKLNGSLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQLF
.: .. . :: .. :: ::::::.::.:.::::: . :: .::: . .: .
CCDS14 NCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQP
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KB8 PSWRR-SSLSESENATSLTTF
: :: :: ::. .:.
CCDS14 SSSRRDSSWSETSEASYSGL
350 360
>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa)
initn: 788 init1: 444 opt: 845 Z-score: 765.6 bits: 150.5 E(32554): 2.5e-36
Smith-Waterman score: 845; 40.9% identity (68.3% similar) in 357 aa overlap (14-367:67-411)
10 20 30 40
pF1KB8 MNYPLTLEMDLENLEDLFWELDRLDNYNDTSLVENHLCPATEG
::.. : .: .: : . ::
CCDS48 PGLYTAPSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESD-SCCTSPPCPQ---
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 PLMASFKAVFVPVAYSLIFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFI
. .: .:.:. :::.::::..:: : ..: .: . :::.:::.:::::: :::.
CCDS48 DFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLT
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LPFAVAEGSVGWVLGTFLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHRRL
::. .....: ::.:. :::.. :: ..::: ..::::::. :::: ::::.. ::.
CCDS48 LPLWAVDAAVQWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPP
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 LSIHITCGTIWLVGFLLALPEILFAKVSQGHHNNSL--PRCTFSQENQAETHAWFTSRFL
. .:: ..: . .:.:::...: .. ::.. : .: .. . ..: . : :
CCDS48 ARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSA---HHDERLNATHCQYNFPQVGRT----ALRVL
220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 YHVAGFLLPMLVMGWCYVGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFL
:::::::.:::..::. .. : ..: .: .:.:....:. : :::.:::.:...
CCDS48 QLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVL-LVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLV
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 DTLARLKAVDNTCKLNGSLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLG
: : : :. .: .. . :: .. :: ::::::.::.:.::::: . :: .::
CCDS48 DILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLG
330 340 350 360 370 380
350 360 370
pF1KB8 CTGPASLCQLFPSWRR-SSLSESENATSLTTF
: . .: . : :: :: ::. .:.
CCDS48 CPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL
390 400 410
>>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 (360 aa)
initn: 777 init1: 372 opt: 804 Z-score: 730.0 bits: 143.7 E(32554): 2.4e-34
Smith-Waterman score: 810; 38.3% identity (68.5% similar) in 368 aa overlap (7-372:4-360)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MNYPLTLEMDLENLEDLFWELDRLDNYNDTSLVENHLCPATEG-PLMASFKAVFVPVAYS
..:. ...:: ::. . :.::. .: . : :. : .. :: . :.
CCDS24 MEDFNMESDSFED-FWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFVVIIYA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LIFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSVGWVLGT
:.:::...:: ::.... : :: :...:..::.::::... ::. .: ::..::
CCDS24 LVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 FLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHRRLLSIHITCGTIWLVGFL
::::.: :..:::: . ::::::.::::::::::... ..: : ... : .:: ...:
CCDS24 FLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYL-VKFICLSIWGLSLL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFSQENQAETHAW-FTSRFLYHVAGFLLPMLVMGWCY
:::: .:: .. . .: : : .. :. : : . :.: . ::..:.:.: .::
CCDS24 LALPVLLFRRTV--YSSNVSPACYEDMGNN--TANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVDNTCKLNG
... : .:. :...:.:: . :. ::.::: ::..:.. ::: : .....::. .
CCDS24 GFTLRTLFKAHM-GQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 SLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQLFPSWRRS
. :. :.::. : ::::..:.: : ::: : ..:. : . :: :. :
CCDS24 HIDRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSL----PKDSRP
300 310 320 330 340
360 370
pF1KB8 SLSESENATSLTTF
:. : .. . ::.
CCDS24 SFVGSSSGHTSTTL
350 360
>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (372 aa)
initn: 746 init1: 359 opt: 788 Z-score: 715.7 bits: 141.1 E(32554): 1.5e-33
Smith-Waterman score: 788; 37.2% identity (73.0% similar) in 352 aa overlap (25-370:29-371)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MNYPLTLEMDLENLEDLFWELDRLDNYN-DTSLVENHLCPATEGPLMASFKAVFVP
:: . : .: :. :: . . .::: :.:
CCDS77 MKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFES-LCSKKD---VRNFKAWFLP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VAYSLIFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSVGW
. ::.: ..:..:: ::.. .. .. :.:.:..:::::.:... ::: . .. .:
CCDS77 IMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAKSW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VLGTFLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHR-RLLSI-HITCGTI
:.:. .:: ..:..:..:. . ::: ::..:::.:::.:: :.::: :.: : ...: :
CCDS77 VFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 WLVGFLLALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFSQENQAETHAWFTSRFLYHVAGFLLPMLV
:... .:..::.:.. .... .... ::.. :. ..:..: . : :::.:.:.
CCDS77 WILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAM-RCSLITEH---VEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 MGWCYVGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVDNT
:..::. ... : :: : .:.::..: : :. .:.. ::. :.. .:.: .. ...:
CCDS77 MSFCYLVIIRTLLQA-RNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSST
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 CKLNGSLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQLFP
:.:. .: .: . :. ..::.::.::.: :::::.:: .:. ::: . .: :
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360 370
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CCDS77 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
360 370
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CCDS11 LAMSFCYLVIIRTLLQA-RNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITS
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CCDS11 STCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQW
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pF1KB8 FPSW--RRSSLS-ESENATSLTTF
::::.: :.:..:...
CCDS11 SSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
360 370
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CCDS24 ALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFG
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pF1KB8 TFLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHRRLLSIHITCGTIWLVGF
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CCDS24 TFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHL-VKFVCLGCWGLSM
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pF1KB8 LLALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFSQENQAETHAW-FTSRFLYHVAGFLLPMLVMGWC
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CCDS24 NLSLPFFLFRQAY--HPNNSSPVCYEVLGN--DTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFC
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pF1KB8 YVGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVDNTCKLN
: ... : .:. :...:.:: . :. ::.::: ::..:.. ::: : ......:.
CCDS24 YGFTLRTLFKAHM-GQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERR
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pF1KB8 GSLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQL-FPSWR
... :. :.::. : ::::..:.: : .:: . ..:. : .. : . :.
CCDS24 NNIGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYT
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pF1KB8 RSSLSESENATSLTTF
::.. : :
CCDS24 SSSVNVSSNL
350
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CCDS46 GYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVANWYFGNFLCKAVHVIYTVNLYSS
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CCDS46 CLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVS-RG-SSLKILSKGKRGGHSSVSTESESSSFHSS
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CCDS33 LQIYTSDNYTEEMGSGDYDSMKEPCFREENANFNKIFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVM
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CCDS33 GYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVANWYFGNFLCKAVHVIYTVNLYSS
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CCDS33 DDRYICDRFYPNDL----WVVVFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGH-QKR
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::....... :: :: ::.: : .:.. :. . . :...... :.. : :.. ::
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CCDS33 CLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVS-RG-SSLKILSKGKRGGHSSVSTESESSSFHSS
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CCDS27 CTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVL
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CCDS27 ALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQVTQTIAFFHSC
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]