Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8974
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8974, 369 aa
1>>>pF1KB8974 369 - 369 aa - 369 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7389+/-0.00131; mu= 13.7160+/- 0.077
mean_var=119.9054+/-38.373, 0's: 0 Z-trim(100.7): 292 B-trim: 855 in 2/47
Lambda= 0.117126
statistics sampled from 5727 (6235) to 5727 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 2.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 2441 424.7 6.3e-119
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 2356 410.3 1.3e-114
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 1007 182.4 5.6e-46
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 1007 182.4 5.6e-46
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 837 153.6 2.4e-37
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 837 153.7 2.5e-37
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 791 145.9 5.2e-35
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 773 142.8 4.3e-34
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 773 142.8 4.4e-34
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 764 141.3 1.3e-33
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 757 140.1 2.9e-33
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 755 139.8 3.7e-33
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 748 138.6 8.1e-33
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 746 138.3 1e-32
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 740 137.2 2.1e-32
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 737 136.7 2.9e-32
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 737 136.7 2.9e-32
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 722 134.2 1.8e-31
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 697 130.0 3.2e-30
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 689 128.6 8.2e-30
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 689 128.7 8.6e-30
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 689 128.7 8.7e-30
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 687 128.3 1.1e-29
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 677 126.6 3.4e-29
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 677 126.7 3.7e-29
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 664 124.4 1.5e-28
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 661 123.9 2.2e-28
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 637 119.8 3.6e-27
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 637 119.9 3.8e-27
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 556 106.2 4.8e-23
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 533 102.3 7.4e-22
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 526 101.1 1.5e-21
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 520 100.1 3.2e-21
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 515 99.2 5.9e-21
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 503 97.2 2.5e-20
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 500 96.7 3.3e-20
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 496 96.0 5.4e-20
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 496 96.0 5.5e-20
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 494 95.7 6.6e-20
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 489 94.9 1.3e-19
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 483 93.8 2.5e-19
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 483 93.8 2.5e-19
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 482 93.7 2.8e-19
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 482 93.7 2.8e-19
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 481 93.6 3.4e-19
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 478 93.0 4.7e-19
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 475 92.5 6.5e-19
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 468 91.3 1.4e-18
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 466 90.9 1.8e-18
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 460 89.9 3.6e-18
>>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (369 aa)
initn: 2441 init1: 2441 opt: 2441 Z-score: 2248.6 bits: 424.7 E(32554): 6.3e-119
Smith-Waterman score: 2441; 100.0% identity (100.0% similar) in 369 aa overlap (1-369:1-369)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLL
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ETTSGALSL
:::::::::
CCDS27 ETTSGALSL
>>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (357 aa)
initn: 2356 init1: 2356 opt: 2356 Z-score: 2171.1 bits: 410.3 E(32554): 1.3e-114
Smith-Waterman score: 2356; 100.0% identity (100.0% similar) in 357 aa overlap (13-369:1-357)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCK
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHT
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQ
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLL
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 ETTSGALSL
:::::::::
CCDS27 ETTSGALSL
350
>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (372 aa)
initn: 1007 init1: 603 opt: 1007 Z-score: 939.0 bits: 182.4 E(32554): 5.6e-46
Smith-Waterman score: 1007; 41.9% identity (74.6% similar) in 358 aa overlap (13-364:22-371)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFL
..::: ...:. :.... . : :..::.: . ::
CCDS77 MKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT-----VDYTLFESLCSKKDVRNFKAWFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 PPLYWLVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQ
: .: .. .:: :::.::.:.: : :.::::: .:::::.::.:::.:::::: .:: .
CCDS77 PIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAKS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 WKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFT
: : . .::.. ..:::.:.: .::..:::.:::.::.::. :: : . :: ::. :
CCDS77 WVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 IWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAI--CTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVV
::.::..: :::.:::.... :. :... : .. .. . ....::..:...
CCDS77 IWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLI---TEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 MACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNC
:. :: .::.::.::.. ..::.:: :.:..::.. :.::: ..:.::. . . :.:
CCDS77 MSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 AVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQ---WVSF
.: ...: ..:: ..: . :.:: ::.:.: .:: :: : .:.:::.:: : : :
CCDS77 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSC
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KB8 TR-REGSLKLSSMLLETTSGALSL
. :..:... . : :
CCDS77 RHIRRSSMSVEAETTTTFSP
360 370
>>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (378 aa)
initn: 1007 init1: 603 opt: 1007 Z-score: 938.9 bits: 182.4 E(32554): 5.6e-46
Smith-Waterman score: 1007; 41.9% identity (74.6% similar) in 358 aa overlap (13-364:28-377)
10 20 30 40
pF1KB8 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQ
..::: ...:. :.... . : :..::.
CCDS11 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT-----VDYTLFESLCSKKDVRN
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 FASHFLPPLYWLVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWA
: . ::: .: .. .:: :::.::.:.: : :.::::: .:::::.::.:::.::::::
CCDS11 FKAWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 IAAADQWKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYS
.:: .: : . .::.. ..:::.:.: .::..:::.:::.::.::. :: : . :: :
CCDS11 YSAAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLIS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 KMVCFTIWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAI--CTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGF
:. : ::.::..: :::.:::.... :. :... : .. .. . ....::
CCDS11 KLSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLI---TEHVEAFITIQVAQMVIGF
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 FLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYA
..:...:. :: .::.::.::.. ..::.:: :.:..::.. :.::: ..:.::. .
CCDS11 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 MFISNCAVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQ-
. :.: .: ...: ..:: ..: . :.:: ::.:.: .:: :: : .:.:::.:: :
CCDS11 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KB8 --WVSFTR-REGSLKLSSMLLETTSGALSL
: : . :..:... . : :
CCDS11 RQWSSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
360 370
>>CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 (350 aa)
initn: 808 init1: 380 opt: 837 Z-score: 784.0 bits: 153.6 E(32554): 2.4e-37
Smith-Waterman score: 837; 36.9% identity (69.8% similar) in 325 aa overlap (12-336:6-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFI
:.. :: : . :. ... .. : :..::.::. ::: . .::.
CCDS30 MALEQNQSTDYYYEE-NEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCK
.: :::.:. .: : . .: ::...::::.::::.: ::::::. :. : . .:::
CCDS30 IGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC
.....: .:: : . .. :::.:::.:... . ... : ..:: .:. : :
CCDS30 ITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTK-VPSQSGVGKPCW---IICFCVWMAAILLS
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHT
::.... .... : : ..: .:..:. . :.. .:: .::..:. :: : .:
CCDS30 IPQLVFYTVNDN---ARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITART
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQ
:.. . . . ::: .::. ::...:.::: . . ..:: .:..: .: .:: .:
CCDS30 LMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQ
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLL
::..::.:::::::.::::.: :. ..:. :. :
CCDS30 VTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTS
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 ETTSGALSL
CCDS30 TFSI
350
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10 20 30 40 50
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CCDS52 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVN-TSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
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: : :. . : ::: ::.... . ....:::..:::.::::.::..::::::.. :.
CCDS52 PIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
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CCDS52 AWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
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CCDS52 VVWGLSVIISSSTFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMF
170 180 190 200 210 220
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: :::.:..::.::..:..:::..: :.:. ::. :.:.: .::: . . : .:
CCDS52 MIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTAANLGKM-NRSC
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 AVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRR
: ::...::.: :::::::.:.:..:: ..: ::.: :.
CCDS52 QSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSC
290 300 310 320 330 340
350 360
pF1KB8 EGSLKLSSMLLETTSGALSL
CCDS52 AGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM
350 360 370
>>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 (352 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS27 MDY--QVSSPIYD-INY-YTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFI
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CCDS27 FGFVGNMLVILILINCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGNTMCQ
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pF1KB8 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC
.....: ..:.: ...:. ...:::.:...:. : . . . .. .. ::.:.
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190 200 210 220 230
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CCDS27 LPGIIFTRSQKEGLHYTCSSHFPYSQYQFWKN-FQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILK
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pF1KB8 TLIQAKKSSK-HKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDIC
::.. .. .: :.:... .:.. :. : ::: .::..:.. . . ..::. :. .:
CCDS27 TLLRCRNEKKRHRAVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQEF-FGLNNCSSSNRLDQA
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300 310 320 330 340 350
pF1KB8 FQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSM
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CCDS27 MQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSV
280 290 300 310 320 330
360
pF1KB8 LLETTSGALSL
..:
CCDS27 YTRSTGEQEISVGL
340 350
>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 (355 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDY---VNFNFTDFY-CEKNNVRQFASHFLPPLYW
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CCDS27 METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYS
10 20 30 40
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pF1KB8 LVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWA-IAAADQWKFQ
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CCDS27 LVFVIGLVGNILVVLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFG
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pF1KB8 TFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVL
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CCDS27 DAMCKILSGFYYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFA--LRARTVTFGVITSIIIWAL
110 120 130 140 150 160
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pF1KB8 AAALCIPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKV-ILGFFLPFVVMACCY
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CCDS27 AILASMPGLYFSKTQWEFTHHTCSLHFPH-ESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICY
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pF1KB8 TIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTN
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CCDS27 TGIIKILLRRPNEKKSKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDF-LFTHECEQSRH
220 230 240 250 260 270
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pF1KB8 IDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLK
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CCDS27 LDLAVQVTEVIAYTHCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLER
280 290 300 310 320 330
360
pF1KB8 LSSMLLETTSGALSL
.::
CCDS27 VSSTSPSTGEHELSAGF
340 350
>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 679 init1: 431 opt: 773 Z-score: 725.4 bits: 142.8 E(32554): 4.4e-34
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pF1KB8 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFI
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CCDS26 MNPTD-------IADTTLDESIYS--NYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFV
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CCDS26 FGLLGNSVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAADQWVFGLGLCK
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pF1KB8 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC
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CCDS26 MISWMYLVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAV--FSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFAS
120 130 140 150 160
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pF1KB8 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKV-ILGFFLPFVVMACCYTIIIH
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CCDS26 LPGFLFSTCYTERNHTYCKTKY-SLNSTTWK-VLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIR
170 180 190 200 210 220
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pF1KB8 TLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICF
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CCDS26 TLQHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEV-LQDCTFERYLDYAI
230 240 250 260 270 280
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pF1KB8 QVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSML
:.:.:.:: : ::::..: :.::.::. ... .:
CCDS26 QATETLAFVHCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSS
290 300 310 320 330 340
360
pF1KB8 LETTSGALSL
CCDS26 YTQSTMDHDLHDAL
350 360
>>CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 595 init1: 377 opt: 764 Z-score: 717.2 bits: 141.3 E(32554): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 764; 34.7% identity (73.0% similar) in 311 aa overlap (19-328:14-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFI
.:: . . .... :.: .:.:.....::::: ::::
CCDS46 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDY-GAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFI
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CCDS46 FGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCK
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CCDS46 LFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFA--LKARTVTFGVVTSVITWLVAVFAS
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pF1KB8 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHT
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CCDS46 VPGIIFTKCQKEDSVYVCGPYFPRGWN----NFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKT
180 190 200 210 220
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pF1KB8 LIQAKKSSK-HKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICF
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CCDS46 LLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEF-FGLSNCESTSQLDQAT
230 240 250 260 270 280
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pF1KB8 QVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSML
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CCDS46 QVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTSTN
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]