Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8951
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8951, 326 aa
1>>>pF1KB8951 326 - 326 aa - 326 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9736+/-0.000935; mu= 17.3795+/- 0.056
mean_var=155.7593+/-74.871, 0's: 0 Z-trim(105.8): 278 B-trim: 1082 in 2/46
Lambda= 0.102765
statistics sampled from 8046 (8601) to 8046 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1 ( 326) 2171 334.5 7.1e-92
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 1015 163.3 3.1e-40
CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17 ( 332) 903 146.5 2.8e-35
CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 ( 318) 859 139.9 2.5e-33
CCDS838.1 TMIGD3 gene_id:57413|Hs108|chr1 ( 347) 395 71.2 1.3e-12
CCDS81358.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 ( 123) 377 67.8 5e-12
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 355 65.5 9.7e-11
>>CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1 (326 aa)
initn: 2171 init1: 2171 opt: 2171 Z-score: 1762.9 bits: 334.5 E(32554): 7.1e-92
Smith-Waterman score: 2171; 100.0% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPPSISAFQAAYIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVAVGA
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CCDS14 MPPSISAFQAAYIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVAVGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKMVVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKMVVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKVISMEYM
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CCDS14 PRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKVISMEYM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VYFNFFVWVLPPLLLMVLIYLEVFYLIRKQLNKKVSASSGDPQKYYGKELKIAKSLALIL
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CCDS14 VYFNFFVWVLPPLLLMVLIYLEVFYLIRKQLNKKVSASSGDPQKYYGKELKIAKSLALIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 FLFALSWLPLHILNCITLFCPSCHKPSILTYIAIFLTHGNSAMNPIVYAFRIQKFRVTFL
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CCDS14 FLFALSWLPLHILNCITLFCPSCHKPSILTYIAIFLTHGNSAMNPIVYAFRIQKFRVTFL
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB8 KIWNDHFRCQPAPPIDEDLPEERPDD
::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KIWNDHFRCQPAPPIDEDLPEERPDD
310 320
>>CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 (412 aa)
initn: 1007 init1: 700 opt: 1015 Z-score: 835.7 bits: 163.3 E(32554): 3.1e-40
Smith-Waterman score: 1015; 51.8% identity (75.9% similar) in 307 aa overlap (10-313:7-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPPSISAFQAAYIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVAVGA
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CCDS13 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKMVVT
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CCDS13 LAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKVISMEYM
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CCDS13 GTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB8 VYFNFFVWVLPPLLLMVLIYLEVFYLIRKQLNKKVSAS-SGD-PQKYYGKELKIAKSLAL
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CCDS13 VYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKSLAI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ILFLFALSWLPLHILNCITLFCPSC-HKPSILTYIAIFLTHGNSAMNPIVYAFRIQKFRV
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CCDS13 IVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB8 TFLKIWNDHFRCQPAPPIDEDLPEERPDD
:: :: .: : :
CCDS13 TFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERR
300 310 320 330 340 350
>>CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17 (332 aa)
initn: 740 init1: 472 opt: 903 Z-score: 746.9 bits: 146.5 E(32554): 2.8e-35
Smith-Waterman score: 903; 48.2% identity (74.1% similar) in 309 aa overlap (10-310:8-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPPSISAFQAAYIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVAVGA
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CCDS11 MLLETQDALYVALELVIAALSVAGNVLVCAAVGTANTLQTPTNYFLVSLAAADVAVGL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKMVVT
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CCDS11 FAIPFAITISLGFCTDFYGCLFLACFVLVLTQSSIFSLLAVAVDRYLAICVPLRYKSLVT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 PRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVE----RAWAANGSMGEP--VIKCEFEKV
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CCDS11 GTRARGVIAVLWVLAFGIGLTPFLGWNSKDSATNNCTEPW--DGTTNESCCLVKCLFENV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ISMEYMVYFNFFVWVLPPLLLMVLIYLEVFYLIRKQLNKKVSASSGDPQKYYGKELKIAK
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CCDS11 VPMSYMVYFNFFGCVLPPLLIMLVIYIKIFLVACRQLQR--TELMDHSRTTLQREIHAAK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SLALILFLFALSWLPLHILNCITLFCPSC--HKPSILTYIAIFLTHGNSAMNPIVYAFRI
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CCDS11 SLAMIVGIFALCWLPVHAVNCVTLFQPAQGKNKPKWAMNMAILLSHANSVVNPIVYAYRN
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB8 QKFRVTFLKIWNDHFRCQPAPPIDEDLPEERPDD
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CCDS11 RDFRYTFHKIISRYLLCQADVKSGNGQAGVQPALGVGL
300 310 320 330
>>CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 (318 aa)
initn: 954 init1: 533 opt: 859 Z-score: 711.8 bits: 139.9 E(32554): 2.5e-33
Smith-Waterman score: 1010; 48.8% identity (78.9% similar) in 322 aa overlap (1-319:1-313)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MPPSISAFQAA---YIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVA
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CCDS83 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VGALVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKM
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CCDS83 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VVTPRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKVISM
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CCDS83 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSE--YHRNVTF----LSCQFVSVMRM
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EYMVYFNFFVWVLPPLLLMVLIYLEVFYLIRKQLNKKVSASSGDPQKYYGKELKIAKSLA
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CCDS83 DYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSNSK-ETGAFYGREFKTAKSLF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LILFLFALSWLPLHILNCITLFCPSCHKPSILTYIAIFLTHGNSAMNPIVYAFRIQKFRV
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CCDS83 LVLFLFALSWLPLSIINCIIYF--NGEVPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKKFKE
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB8 TFLKIWNDHFRCQPAPPIDEDLPEERPDD
:.: : . :.:. .: ..
CCDS83 TYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE
300 310
>>CCDS838.1 TMIGD3 gene_id:57413|Hs108|chr1 (347 aa)
initn: 385 init1: 385 opt: 395 Z-score: 339.6 bits: 71.2 E(32554): 1.3e-12
Smith-Waterman score: 401; 49.6% identity (78.4% similar) in 139 aa overlap (1-136:1-130)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MPPSISAFQAA---YIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVA
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CCDS83 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VGALVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKM
::.::.::::....: .:..::...: .::.:..::..:::::::::::::. .:...
CCDS83 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRFRI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VVTPRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKVISM
: :: ::::
CCDS83 PGLP--------GC-ILSFQLKVCFLPVMWLFILLSLALISDAMVMDEKVKRSFVLDTAS
130 140 150 160 170
>>CCDS81358.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 (123 aa)
initn: 369 init1: 369 opt: 377 Z-score: 329.3 bits: 67.8 E(32554): 5e-12
Smith-Waterman score: 377; 53.5% identity (85.1% similar) in 114 aa overlap (1-111:1-114)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MPPSISAFQAA---YIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVA
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CCDS81 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VGALVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKM
::.::.::::....: .:..::...: .::.:..::..:::::::::::::.
CCDS81 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVSSIS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VVTPRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKVISM
CCDS81 PTL
>>CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 (478 aa)
initn: 319 init1: 159 opt: 355 Z-score: 306.3 bits: 65.5 E(32554): 9.7e-11
Smith-Waterman score: 357; 27.3% identity (58.0% similar) in 326 aa overlap (3-309:61-367)
10 20
pF1KB8 MPPSISAFQAAY--IG-IEVLIALVSVPGNVL
:.... . :. .: . .:..:... ::.
CCDS73 SSQSSISSLGRLPSISPTAPGTWAAAWVPLPTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLT
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 VIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVAVGALVIPLAILINIGPQTYFHT--CLMVA-CP
::.. ...:: . ::..:::.: .. :. . .. : : : . : :
CCDS73 VIYTFCRSRSLRTPANMFIINLAVSDFLMSFTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCG
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 VLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKMVVTPRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGW
.: . ::...: :::.:::: . :: :.. :::: .. : :. ... .: :.:::
CCDS73 AL-FGISSMITLTAIALDRYLVITRPLATFGVASKRRAAFVLLGVWLYALAWSLPPFFGW
160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 NNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKV----ISMEYMVYFNFFVWVLPPLLLMVLIYLE
. :.. .: . .: .. . : . . ::. :: ::... :.
CCDS73 S-------AYVPEGLL----TSCSWDYMSFTPAVRAYTMLLCCFVFFLP-LLIIIYCYIF
210 220 230 240 250
210 220 230 240 250
pF1KB8 VFYLIRK--QLNKKVSASSGDPQKYYGK-----ELKIAKSLALILFLFALSWLPLHILNC
.: ::. . . .: .:. .. . . : :.:: . :...::.::: : .
CCDS73 IFRAIRETGRALQTFGACKGNGESLWQRQRLQSECKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVAL
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 ITLFCPSCH--KPSILTYIAIFLTHGNSAMNPIVYAFRIQKFRVTFLKIWNDHFRCQPAP
.. : : : . . :. ...... :::.::. :.::.. . :. :
CCDS73 VA-FAGYAHVLTPYMSSVPAV-IAKASAIHNPIIYAITHPKYRVAIAQ----HLPCLGVL
320 330 340 350 360 370
320
pF1KB8 PIDEDLPEERPDD
CCDS73 LGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTSHTSNLSWISIRRRQESLGSESEVGWTHMEAAAVWGA
380 390 400 410 420 430
326 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 16:38:34 2016 done: Fri Nov 4 16:38:34 2016
Total Scan time: 2.350 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]