Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8926
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8926, 273 aa
1>>>pF1KB8926 273 - 273 aa - 273 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0656+/-0.00133; mu= 7.8081+/- 0.078
mean_var=214.1124+/-45.111, 0's: 0 Z-trim(107.5): 933 B-trim: 128 in 2/46
Lambda= 0.087650
statistics sampled from 8605 (9629) to 8605 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16
Scan time: 2.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7206.1 ZNF32 gene_id:7580|Hs108|chr10 ( 273) 1940 258.1 4.9e-69
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 891 125.9 6.8e-29
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 891 125.9 7.3e-29
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 891 126.0 7.5e-29
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 884 125.0 1.3e-28
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 884 125.0 1.3e-28
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 882 124.7 1.5e-28
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 882 124.7 1.5e-28
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 882 124.8 1.5e-28
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 865 122.4 5.7e-28
CCDS12962.2 ZNF776 gene_id:284309|Hs108|chr19 ( 518) 862 122.1 7.9e-28
CCDS82408.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 432) 860 121.8 8.4e-28
CCDS82407.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 474) 860 121.8 8.9e-28
CCDS33135.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 487) 860 121.8 9.1e-28
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 862 122.3 9.8e-28
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 533) 859 121.8 1e-27
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 860 122.0 1.1e-27
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 860 122.0 1.1e-27
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 860 122.1 1.2e-27
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 657) 859 121.9 1.2e-27
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 858 121.8 1.4e-27
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 858 121.8 1.4e-27
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 858 121.9 1.5e-27
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 855 121.3 1.6e-27
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 856 121.6 1.7e-27
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 853 121.0 1.7e-27
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 853 121.0 1.8e-27
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 853 121.0 1.8e-27
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 853 121.1 1.9e-27
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 854 121.3 1.9e-27
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 854 121.3 1.9e-27
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 854 121.3 1.9e-27
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 853 121.1 1.9e-27
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 853 121.1 2e-27
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 855 121.5 2e-27
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 852 121.0 2.1e-27
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 852 121.0 2.1e-27
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 852 121.0 2.2e-27
CCDS55406.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 575) 849 120.5 2.6e-27
CCDS48099.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 581) 849 120.5 2.7e-27
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 847 120.3 3e-27
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 846 120.1 3.1e-27
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 847 120.3 3.2e-27
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 846 120.1 3.2e-27
CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10 ( 458) 845 119.9 3.3e-27
CCDS35074.1 ZNF510 gene_id:22869|Hs108|chr9 ( 683) 847 120.4 3.5e-27
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 846 120.3 3.8e-27
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 847 120.5 3.9e-27
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 847 120.5 4e-27
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 847 120.5 4e-27
>>CCDS7206.1 ZNF32 gene_id:7580|Hs108|chr10 (273 aa)
initn: 1940 init1: 1940 opt: 1940 Z-score: 1352.9 bits: 258.1 E(32554): 4.9e-69
Smith-Waterman score: 1940; 100.0% identity (100.0% similar) in 273 aa overlap (1-273:1-273)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MFGFPTATLLDCHGRYAQNVAFFNVMTEAHHKYDHSEATGSSSWDIQNSFRREKLEQKSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MFGFPTATLLDCHGRYAQNVAFFNVMTEAHHKYDHSEATGSSSWDIQNSFRREKLEQKSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DSKTLQEDSPGVRQRVYECQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQKPFECTHCGKSFRAKGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DSKTLQEDSPGVRQRVYECQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQKPFECTHCGKSFRAKGNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VTHQRIHTGEKPYQCKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYECAICQRSFRNQSNLAVHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VTHQRIHTGEKPYQCKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYECAICQRSFRNQSNLAVHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACTQCRKSFHTRGNCILHGKIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACTQCRKSFHTRGNCILHGKIHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KB8 GETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL
250 260 270
>>CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (591 aa)
initn: 1695 init1: 891 opt: 891 Z-score: 632.3 bits: 125.9 E(32554): 6.8e-29
Smith-Waterman score: 891; 58.5% identity (79.3% similar) in 193 aa overlap (74-266:170-362)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 WDIQNSFRREKLEQKSPDSKTLQEDSPGVRQRVYECQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQK
.: ::: :::::: .::::. :.:.:::..
CCDS82 PSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKR
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 PFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYQCKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYEC
:.:: .::::: ::.:: :::.::::.::.: :::::::: :.: :.:.:::..::::
CCDS82 PYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYEC
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 AICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACTQCR
: . : ...:: :.: :..:.::.:..::: :::::.: : :::: .:: : .:
CCDS82 EECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECG
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270
pF1KB8 KSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL
::: .:. : . :::: :: ::.:::::...:.: ::::
CCDS82 KSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFR
320 330 340 350 360 370
CCDS82 GKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCS
380 390 400 410 420 430
>--
initn: 569 init1: 569 opt: 685 Z-score: 491.5 bits: 99.8 E(32554): 4.7e-21
Smith-Waterman score: 754; 51.0% identity (78.1% similar) in 192 aa overlap (74-265:366-554)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 WDIQNSFRREKLEQKSPDSKTLQEDSPGVRQRVYECQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQK
.: :::.:: : :: :. : :.:.:::..
CCDS82 TGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGER
340 350 360 370 380 390
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 PFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYQCKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYEC
:.::..:::::. .... .:::.::::::..:.:::::: : :: :.:.:::..::::
CCDS82 PYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYEC
400 410 420 430 440 450
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 AICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACTQCR
. : .::...:.: :...:..:.::.: .::: :: ::. : ::::: .:: : .:
CCDS82 GECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFS---SLLEHRRVHTGERPYECRECG
460 470 480 490 500 510
230 240 250 260 270
pF1KB8 KSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL
:.: :. . : ..:: :: :..:::::.. ::. :.:
CCDS82 KTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKSFH
520 530 540 550 560 570
CCDS82 RSSSLLRHQRVHTERSPYK
580 590
>>CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (676 aa)
initn: 1695 init1: 891 opt: 891 Z-score: 631.6 bits: 125.9 E(32554): 7.3e-29
Smith-Waterman score: 891; 58.5% identity (79.3% similar) in 193 aa overlap (74-266:255-447)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 WDIQNSFRREKLEQKSPDSKTLQEDSPGVRQRVYECQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQK
.: ::: :::::: .::::. :.:.:::..
CCDS42 PSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKR
230 240 250 260 270 280
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 PFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYQCKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYEC
:.:: .::::: ::.:: :::.::::.::.: :::::::: :.: :.:.:::..::::
CCDS42 PYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYEC
290 300 310 320 330 340
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 AICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACTQCR
: . : ...:: :.: :..:.::.:..::: :::::.: : :::: .:: : .:
CCDS42 EECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECG
350 360 370 380 390 400
230 240 250 260 270
pF1KB8 KSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL
::: .:. : . :::: :: ::.:::::...:.: ::::
CCDS42 KSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFR
410 420 430 440 450 460
CCDS42 GKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCS
470 480 490 500 510 520
>--
initn: 569 init1: 569 opt: 685 Z-score: 490.8 bits: 99.9 E(32554): 5.1e-21
Smith-Waterman score: 754; 51.0% identity (78.1% similar) in 192 aa overlap (74-265:451-639)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 WDIQNSFRREKLEQKSPDSKTLQEDSPGVRQRVYECQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQK
.: :::.:: : :: :. : :.:.:::..
CCDS42 TGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGER
430 440 450 460 470 480
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 PFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYQCKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYEC
:.::..:::::. .... .:::.::::::..:.:::::: : :: :.:.:::..::::
CCDS42 PYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYEC
490 500 510 520 530 540
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 AICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACTQCR
. : .::...:.: :...:..:.::.: .::: :: ::. : ::::: .:: : .:
CCDS42 GECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFS---SLLEHRRVHTGERPYECRECG
550 560 570 580 590
230 240 250 260 270
pF1KB8 KSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL
:.: :. . : ..:: :: :..:::::.. ::. :.:
CCDS42 KTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKSFH
600 610 620 630 640 650
CCDS42 RSSSLLRHQRVHTERSPYK
660 670
>>CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (697 aa)
initn: 1695 init1: 891 opt: 891 Z-score: 631.5 bits: 126.0 E(32554): 7.5e-29
Smith-Waterman score: 891; 58.5% identity (79.3% similar) in 193 aa overlap (74-266:276-468)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 WDIQNSFRREKLEQKSPDSKTLQEDSPGVRQRVYECQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQK
.: ::: :::::: .::::. :.:.:::..
CCDS82 PSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKR
250 260 270 280 290 300
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 PFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYQCKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYEC
:.:: .::::: ::.:: :::.::::.::.: :::::::: :.: :.:.:::..::::
CCDS82 PYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYEC
310 320 330 340 350 360
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 AICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACTQCR
: . : ...:: :.: :..:.::.:..::: :::::.: : :::: .:: : .:
CCDS82 EECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECG
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270
pF1KB8 KSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL
::: .:. : . :::: :: ::.:::::...:.: ::::
CCDS82 KSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFR
430 440 450 460 470 480
CCDS82 GKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCS
490 500 510 520 530 540
>--
initn: 569 init1: 569 opt: 685 Z-score: 490.7 bits: 99.9 E(32554): 5.2e-21
Smith-Waterman score: 754; 51.0% identity (78.1% similar) in 192 aa overlap (74-265:472-660)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 WDIQNSFRREKLEQKSPDSKTLQEDSPGVRQRVYECQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQK
.: :::.:: : :: :. : :.:.:::..
CCDS82 TGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGER
450 460 470 480 490 500
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 PFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYQCKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYEC
:.::..:::::. .... .:::.::::::..:.:::::: : :: :.:.:::..::::
CCDS82 PYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYEC
510 520 530 540 550 560
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 AICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACTQCR
. : .::...:.: :...:..:.::.: .::: :: ::. : ::::: .:: : .:
CCDS82 GECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFS---SLLEHRRVHTGERPYECRECG
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230 240 250 260 270
pF1KB8 KSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL
:.: :. . : ..:: :: :..:::::.. ::. :.:
CCDS82 KTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKSFH
620 630 640 650 660 670
CCDS82 RSSSLLRHQRVHTERSPYK
680 690
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CCDS12 RTHTGEKSYECPHCGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHT
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CCDS12 GEKPYVCNECGKSFRQKATLTVHQKIHTGQKSYECPQCGKAFSRKSYLIHHQRTHTGEKP
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:. :. . . .:.:: .
CCDS74 IDHQRTHTGEKPFVCNECGKSFRLKTALTDHQRTHTGEKSYECLQCRNAFRLK-------
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CCDS74 -SHLIRHQRTHTGEKPYECNDCGKSFRQKTTLSLHQRIHTGEKPYICKECGKSFHQKANL
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pF1KB8 VTHQRIHTGEKPYQCKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYECAICQRSFRNQSNLAVHR
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CCDS74 TVHQRTHTGEKPYICNECGKSFSQKTTLALHEKTHNEEKPYICSECGKSFRQKTTLVAHQ
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CCDS74 RTHTGEKSYECPHCGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHT
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:: ::.:..::::: :...:.:::.
CCDS74 GEKPYVCNECGKSFRQKATLTVHQKIHTGQKSYECPQCGKAFSRKSYLIHHQRTHTGEKP
530 540 550 560 570 580
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pF1KB8 PFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYQCKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYEC
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CCDS54 PYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYEC
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CCDS54 TECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECG
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pF1KB8 KSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL
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CCDS54 KTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFS
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CCDS43 PYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYEC
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CCDS43 TECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECG
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CCDS43 KTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFS
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CCDS54 PYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYEC
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pF1KB8 AICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACTQCR
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CCDS54 TECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECG
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pF1KB8 KSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL
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CCDS54 KTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFS
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CCDS44 RVCGGNEFERCSSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKKIYE
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CCDS44 CNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKCNEC
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CCDS44 GKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECGKAF
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pF1KB8 RNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACTQCRKSFHTRG
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CCDS44 TQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSS
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CCDS44 TLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQ
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CCDS44 HRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRI
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>--
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pF1KB8 SSSWDIQNSFRREKLEQKSPDSKTLQEDSPGVRQRVYECQECGKSFRQKGSLTLHERIHT
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CCDS44 HTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKP--FECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHT
300 310 320 330 340
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CCDS44 GEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKP
350 360 370 380 390 400
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pF1KB8 YECAICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACT
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CCDS44 YECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTHT
410 420 430 440 450 460
230 240 250 260 270
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]