Result of FASTA (omim) for
pF1KB8918
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8918, 262 aa
1>>>pF1KB8918 262 - 262 aa - 262 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1514+/-0.000681; mu= 1.8284+/- 0.042
mean_var=338.3826+/-70.030, 0's: 0 Z-trim(113.0): 1887 B-trim: 124 in 1/53
Lambda= 0.069722
statistics sampled from 19864 (22078) to 19864 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 6.270
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001258568 (OMIM: 604080) zinc finger protein 13 ( 319) 1854 200.7 2.7e-51
NP_001258567 (OMIM: 604080) zinc finger protein 13 ( 287) 1775 192.7 6.3e-49
NP_006515 (OMIM: 604080) zinc finger protein 138 i ( 293) 1775 192.7 6.4e-49
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 1355 150.8 4.7e-36
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1355 150.9 5e-36
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 1331 148.7 3.2e-35
NP_056936 (OMIM: 194624) zinc finger protein 117 [ ( 483) 1306 145.8 1.3e-34
XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1306 146.1 1.8e-34
NP_001013768 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 783) 1306 146.1 1.8e-34
XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1306 146.1 1.8e-34
NP_057304 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 i ( 783) 1306 146.1 1.8e-34
XP_016867774 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1306 146.1 1.8e-34
XP_016867772 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1306 146.1 1.8e-34
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 1300 145.3 2.1e-34
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 1301 145.5 2.1e-34
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 1300 145.3 2.2e-34
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1300 145.4 2.4e-34
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 1300 145.4 2.4e-34
XP_016881606 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 486) 1290 144.2 4.1e-34
XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1290 144.3 4.2e-34
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1290 144.3 4.4e-34
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1290 144.3 4.4e-34
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1290 144.3 4.4e-34
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1290 144.3 4.4e-34
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1290 144.3 4.4e-34
NP_001269289 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 820) 1293 144.9 4.5e-34
NP_009070 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 517) 1275 142.8 1.2e-33
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 1270 142.3 1.8e-33
NP_001274463 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 510) 1268 142.1 2e-33
NP_001274462 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 510) 1268 142.1 2e-33
NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 554) 1268 142.1 2.1e-33
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1259 141.3 4.1e-33
XP_016867185 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1243 139.5 1.1e-32
XP_016867182 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1243 139.5 1.1e-32
XP_016867183 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1243 139.5 1.1e-32
XP_016867178 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1243 139.5 1.1e-32
XP_016867186 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1243 139.5 1.1e-32
XP_016867181 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1243 139.5 1.1e-32
XP_016867179 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1243 139.5 1.1e-32
XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1243 139.5 1.1e-32
XP_016867184 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1243 139.5 1.1e-32
XP_016867180 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1243 139.5 1.1e-32
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 1243 139.6 1.2e-32
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 1243 139.6 1.2e-32
NP_001258578 (OMIM: 604080) zinc finger protein 13 ( 172) 1231 137.7 1.4e-32
NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 1226 137.9 3.8e-32
NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 1226 137.9 3.9e-32
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 1212 136.5 1e-31
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1212 136.5 1e-31
XP_011514048 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 537) 1206 135.9 1.5e-31
>>NP_001258568 (OMIM: 604080) zinc finger protein 138 is (319 aa)
initn: 1854 init1: 1854 opt: 1854 Z-score: 1041.9 bits: 200.7 E(85289): 2.7e-51
Smith-Waterman score: 1854; 100.0% identity (100.0% similar) in 262 aa overlap (1-262:58-319)
10 20 30
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKD
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYRHVMLENYRNLVFLDLITCLEQGKEPWNMKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKD
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKV
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWS
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260
pF1KB8 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
270 280 290 300 310
>>NP_001258567 (OMIM: 604080) zinc finger protein 138 is (287 aa)
initn: 1775 init1: 1775 opt: 1775 Z-score: 999.4 bits: 192.7 E(85289): 6.3e-49
Smith-Waterman score: 1775; 100.0% identity (100.0% similar) in 250 aa overlap (13-262:38-287)
10 20 30 40
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 YGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 RHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 EKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPY
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KB8 KCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
250 260 270 280
>>NP_006515 (OMIM: 604080) zinc finger protein 138 isofo (293 aa)
initn: 1775 init1: 1775 opt: 1775 Z-score: 999.3 bits: 192.7 E(85289): 6.4e-49
Smith-Waterman score: 1775; 100.0% identity (100.0% similar) in 250 aa overlap (13-262:44-293)
10 20 30 40
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGK
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 YGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKI
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 RHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTG
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 EKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPY
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260
pF1KB8 KCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
260 270 280 290
>>NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (531 aa)
initn: 6594 init1: 1355 opt: 1355 Z-score: 768.3 bits: 150.8 E(85289): 4.7e-36
Smith-Waterman score: 1355; 72.1% identity (88.2% similar) in 262 aa overlap (1-262:1-262)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDEC
:::::..::: ...::.:::::: :::::::::::::.:::: :.:: :::::.:.:::
NP_001 MKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDEC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
: :.:: ::::::: : ::::::.::::: :::::::::.::::..: :.: .: ::.
NP_001 KMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
:.: ::.:..:::: ::::::::::.::::..:.: :.::::::::::: :::::.:::
NP_001 MISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
: ::: :.:::::::: .:::.:.. : :: :::::: ::::::..:::.:..: ::: :
NP_001 LIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTH
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
. :.:::.:::::::::::. :
NP_001 RKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIH
250 260 270 280 290 300
>--
initn: 3869 init1: 770 opt: 796 Z-score: 464.5 bits: 94.6 E(85289): 3.9e-19
Smith-Waterman score: 796; 60.8% identity (83.3% similar) in 186 aa overlap (77-262:329-514)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE
: : ..:.. :.... :. ..::: ::
NP_001 IHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTG
300 310 320 330 340 350
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY
.: ..::::.:.. . :.::.:::::: :. :.::.:::.:: :.::.. :: :: ::::
NP_001 EKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPY
360 370 380 390 400 410
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ
::: :::.:. : :: ::::.:::::::: .:::::.:::.::.:: ::: :::: ::.
NP_001 KCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEE
420 430 440 450 460 470
230 240 250 260
pF1KB8 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::.:.:: .::::. :.:::.::::::: :::. :
NP_001 CGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
480 490 500 510 520 530
>--
initn: 329 init1: 329 opt: 329 Z-score: 210.6 bits: 47.6 E(85289): 5.4e-05
Smith-Waterman score: 329; 69.7% identity (86.4% similar) in 66 aa overlap (151-216:263-328)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.::. : ::::::::::. :::::.::.
NP_001 RSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAH
240 250 260 270 280 290
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
:: :..:.:::::::: .:::::.. :::: :::::
NP_001 LTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKH
300 310 320 330 340 350
250 260
pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
NP_001 KIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSH
360 370 380 390 400 410
>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa)
initn: 6594 init1: 1355 opt: 1355 Z-score: 767.8 bits: 150.9 E(85289): 5e-36
Smith-Waterman score: 1355; 72.1% identity (88.2% similar) in 262 aa overlap (1-262:65-326)
10 20 30
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKD
:::::..::: ...::.:::::: ::::::
NP_003 ENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKD
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKV
:::::::.:::: :.:: :::::.:.:::: :.:: ::::::: : ::::::.:::::
NP_003 SFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKV
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWS
:::::::::.::::..: :.: .: ::. :.: ::.:..:::: ::::::::::.::::
NP_003 AHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT
..:.: :.::::::::::: :::::.::: : ::: :.:::::::: .:::.:.. : ::
NP_003 STLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260
pF1KB8 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::: ::::::..:::.:..: ::: :. :.:::.:::::::::::. :
NP_003 THKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKI
280 290 300 310 320 330
NP_003 IHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTG
340 350 360 370 380 390
>--
initn: 3869 init1: 770 opt: 796 Z-score: 464.0 bits: 94.7 E(85289): 4.2e-19
Smith-Waterman score: 796; 60.8% identity (83.3% similar) in 186 aa overlap (77-262:393-578)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE
: : ..:.. :.... :. ..::: ::
NP_003 IHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTG
370 380 390 400 410 420
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY
.: ..::::.:.. . :.::.:::::: :. :.::.:::.:: :.::.. :: :: ::::
NP_003 EKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPY
430 440 450 460 470 480
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ
::: :::.:. : :: ::::.:::::::: .:::::.:::.::.:: ::: :::: ::.
NP_003 KCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEE
490 500 510 520 530 540
230 240 250 260
pF1KB8 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::.:.:: .::::. :.:::.::::::: :::. :
NP_003 CGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
550 560 570 580 590
>--
initn: 329 init1: 329 opt: 329 Z-score: 210.1 bits: 47.7 E(85289): 5.8e-05
Smith-Waterman score: 329; 69.7% identity (86.4% similar) in 66 aa overlap (151-216:327-392)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.::. : ::::::::::. :::::.::.
NP_003 RSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAH
300 310 320 330 340 350
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
:: :..:.:::::::: .:::::.. :::: :::::
NP_003 LTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKH
360 370 380 390 400 410
250 260
pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
NP_003 KIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSH
420 430 440 450 460 470
>>NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 is (852 aa)
initn: 4879 init1: 1307 opt: 1331 Z-score: 753.2 bits: 148.7 E(85289): 3.2e-35
Smith-Waterman score: 1331; 73.2% identity (87.0% similar) in 261 aa overlap (1-261:65-324)
10 20 30
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKD
.:::::: :: .. .:::::: ::::::
NP_001 ENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKKEPWNIKRHEMV-AKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKD
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKV
::::::: :::: ..::::::::: :::: ::.::.: .:::: : ::::::::::::
NP_001 SFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKV
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWS
. :::::::.: ::: ::::.::::.::.:.::.::::..:::: : ::::::::.:::
NP_001 FDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWF
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT
..:.: :.::::::::::: :::::.::: ::.::::.: ::: :: .:::::::.::::
NP_001 STLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260
pF1KB8 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::: ::::: :.:::::.:: :: ..:..:::. :::.::::::::
NP_001 IHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKR
280 290 300 310 320 330
NP_001 IHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILME
340 350 360 370 380 390
>--
initn: 3600 init1: 809 opt: 829 Z-score: 480.3 bits: 98.2 E(85289): 5.2e-20
Smith-Waterman score: 829; 55.1% identity (79.1% similar) in 225 aa overlap (45-262:357-577)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
NP_001 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL
330 340 350 360 370 380
80 90 100 110 120
pF1KB8 KITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQ
:.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::.
NP_001 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
390 400 410 420 430 440
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII
:::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: :
NP_001 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI
450 460 470 480 490 500
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGE
.:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.:::
NP_001 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
510 520 530 540 550 560
250 260
pF1KB8 EPYKCEECGKAFNLS
.:::::::::::: :
NP_001 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
570 580 590 600 610 620
>--
initn: 1618 init1: 745 opt: 754 Z-score: 439.5 bits: 90.7 E(85289): 9.6e-18
Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (40-262:602-829)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 KHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY
. . .:.... .. : : .:. : :
NP_001 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV
580 590 600 610 620
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
.:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :.
NP_001 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
630 640 650 660 670 680
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. ::
NP_001 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST
690 700 710 720 730 740
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
:: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. :
NP_001 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH
750 760 770 780 790 800
250 260
pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.::.:::.:::: . :.:::::
NP_001 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
810 820 830 840 850
>>NP_056936 (OMIM: 194624) zinc finger protein 117 [Homo (483 aa)
initn: 4025 init1: 1275 opt: 1306 Z-score: 742.1 bits: 145.8 E(85289): 1.3e-34
Smith-Waterman score: 1306; 70.6% identity (86.6% similar) in 262 aa overlap (1-262:1-261)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDEC
::::::: ::: .. ::: :: ::::.:::::::: :: : :..::::::::::: ::
NP_056 MKRHEMV-AKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVEC
10 20 30 40 50
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pF1KB8 KGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
: :.: :.::::::: : ::::::::::.:.::.:::::::.::::::::.:::: :..:
NP_056 KQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
:::.:::::.:.:: :::::: :..::::..:.: :.::::::::::. :::::.:.:
NP_056 MLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
: .:: :.: :::::: .:::::.::: :: :.:::: : :::::.: ..:.:. ::.:
NP_056 LIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEH
180 190 200 210 220 230
250 260
pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
..:.:::. :.::::::::: :
NP_056 KLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIH
240 250 260 270 280 290
>--
initn: 2326 init1: 714 opt: 716 Z-score: 421.4 bits: 86.5 E(85289): 9.9e-17
Smith-Waterman score: 730; 57.0% identity (80.1% similar) in 186 aa overlap (77-262:272-457)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE
: :...:.. :.... :. . :: :.
NP_056 IHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSG
250 260 270 280 290 300
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY
.: ..:.:: :.. ..: ::.:::::: :. ::::::::.:: .::.. : ::::::::
NP_056 EKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPY
310 320 330 340 350 360
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ
:: :::::.::: :. ::::.:::.:.:: . ::.:. ::.:. : ::: :: ::::.
NP_056 KCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEE
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260
pF1KB8 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::.:..: :: :. :.:::.:::::::::::: :
NP_056 CGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKA
430 440 450 460 470 480
NP_056 ST
>>XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger pro (783 aa)
initn: 4878 init1: 1306 opt: 1306 Z-score: 740.0 bits: 146.1 E(85289): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 1306; 72.9% identity (87.1% similar) in 255 aa overlap (7-261:1-255)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDEC
.::: .. .:::::: ::::::::::::: :::: ..::::::::: ::::
XP_016 MVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDEC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
::.::.: .:::: : ::::::::::::. :::::::.: ::: ::::.::::.::.:
XP_016 TGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.::.::::..:::: : ::::::::.::: ..:.: :.::::::::::: :::::.:::
XP_016 VLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
::.::::.: ::: :: .:::::::.:::: :::::: ::::: :.:::::.:: :: .
XP_016 LTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQ
180 190 200 210 220 230
250 260
pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.:..:::. :::.::::::::
XP_016 KILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIH
240 250 260 270 280 290
>--
initn: 3600 init1: 809 opt: 829 Z-score: 480.7 bits: 98.2 E(85289): 4.9e-20
Smith-Waterman score: 829; 55.1% identity (79.1% similar) in 225 aa overlap (45-262:288-508)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
XP_016 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL
260 270 280 290 300 310
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pF1KB8 KITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQ
:.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::.
XP_016 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
320 330 340 350 360 370
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pF1KB8 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII
:::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: :
XP_016 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI
380 390 400 410 420 430
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGE
.:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.:::
XP_016 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
440 450 460 470 480 490
250 260
pF1KB8 EPYKCEECGKAFNLS
.:::::::::::: :
XP_016 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
500 510 520 530 540 550
>--
initn: 1618 init1: 745 opt: 754 Z-score: 439.9 bits: 90.6 E(85289): 9.2e-18
Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (40-262:533-760)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 KHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY
. . .:.... .. : : .:. : :
XP_016 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV
510 520 530 540 550 560
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
.:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :.
XP_016 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
570 580 590 600 610
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. ::
XP_016 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST
620 630 640 650 660 670
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
:: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. :
XP_016 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH
680 690 700 710 720 730
250 260
pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.::.:::.:::: . :.:::::
XP_016 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
740 750 760 770 780
>>NP_001013768 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 is (783 aa)
initn: 4878 init1: 1306 opt: 1306 Z-score: 740.0 bits: 146.1 E(85289): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 1306; 72.9% identity (87.1% similar) in 255 aa overlap (7-261:1-255)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDEC
.::: .. .:::::: ::::::::::::: :::: ..::::::::: ::::
NP_001 MVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDEC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
::.::.: .:::: : ::::::::::::. :::::::.: ::: ::::.::::.::.:
NP_001 TGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.::.::::..:::: : ::::::::.::: ..:.: :.::::::::::: :::::.:::
NP_001 VLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
::.::::.: ::: :: .:::::::.:::: :::::: ::::: :.:::::.:: :: .
NP_001 LTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQ
180 190 200 210 220 230
250 260
pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.:..:::. :::.::::::::
NP_001 KILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIH
240 250 260 270 280 290
>--
initn: 3600 init1: 809 opt: 829 Z-score: 480.7 bits: 98.2 E(85289): 4.9e-20
Smith-Waterman score: 829; 55.1% identity (79.1% similar) in 225 aa overlap (45-262:288-508)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
NP_001 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL
260 270 280 290 300 310
80 90 100 110 120
pF1KB8 KITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQ
:.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::.
NP_001 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
320 330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII
:::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: :
NP_001 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI
380 390 400 410 420 430
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGE
.:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.:::
NP_001 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
440 450 460 470 480 490
250 260
pF1KB8 EPYKCEECGKAFNLS
.:::::::::::: :
NP_001 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
500 510 520 530 540 550
>--
initn: 1618 init1: 745 opt: 754 Z-score: 439.9 bits: 90.6 E(85289): 9.2e-18
Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (40-262:533-760)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 KHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY
. . .:.... .. : : .:. : :
NP_001 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV
510 520 530 540 550 560
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
.:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :.
NP_001 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
570 580 590 600 610
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. ::
NP_001 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST
620 630 640 650 660 670
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
:: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. :
NP_001 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH
680 690 700 710 720 730
250 260
pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.::.:::.:::: . :.:::::
NP_001 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
740 750 760 770 780
>>XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger pro (783 aa)
initn: 4878 init1: 1306 opt: 1306 Z-score: 740.0 bits: 146.1 E(85289): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 1306; 72.9% identity (87.1% similar) in 255 aa overlap (7-261:1-255)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDEC
.::: .. .:::::: ::::::::::::: :::: ..::::::::: ::::
XP_016 MVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDEC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
::.::.: .:::: : ::::::::::::. :::::::.: ::: ::::.::::.::.:
XP_016 TGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFC
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.::.::::..:::: : ::::::::.::: ..:.: :.::::::::::: :::::.:::
XP_016 VLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQ
120 130 140 150 160 170
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pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
::.::::.: ::: :: .:::::::.:::: :::::: ::::: :.:::::.:: :: .
XP_016 LTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQ
180 190 200 210 220 230
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pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.:..:::. :::.::::::::
XP_016 KILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIH
240 250 260 270 280 290
>--
initn: 3600 init1: 809 opt: 829 Z-score: 480.7 bits: 98.2 E(85289): 4.9e-20
Smith-Waterman score: 829; 55.1% identity (79.1% similar) in 225 aa overlap (45-262:288-508)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
XP_016 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL
260 270 280 290 300 310
80 90 100 110 120
pF1KB8 KITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQ
:.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::.
XP_016 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
320 330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII
:::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: :
XP_016 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI
380 390 400 410 420 430
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGE
.:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.:::
XP_016 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
440 450 460 470 480 490
250 260
pF1KB8 EPYKCEECGKAFNLS
.:::::::::::: :
XP_016 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
500 510 520 530 540 550
>--
initn: 1618 init1: 745 opt: 754 Z-score: 439.9 bits: 90.6 E(85289): 9.2e-18
Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (40-262:533-760)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 KHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY
. . .:.... .. : : .:. : :
XP_016 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV
510 520 530 540 550 560
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
.:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :.
XP_016 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
570 580 590 600 610
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. ::
XP_016 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST
620 630 640 650 660 670
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
:: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. :
XP_016 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH
680 690 700 710 720 730
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pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.::.:::.:::: . :.:::::
XP_016 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
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262 residues in 1 query sequences
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:45:58 2016 done: Sat Nov 5 01:45:59 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]