Result of FASTA (omim) for
pF1KB8833
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8833, 453 aa
1>>>pF1KB8833 453 - 453 aa - 453 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3762+/-0.000417; mu= 14.0039+/- 0.026
mean_var=126.1579+/-25.735, 0's: 0 Z-trim(115.1): 63 B-trim: 561 in 1/52
Lambda= 0.114187
statistics sampled from 25203 (25268) to 25203 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16
Scan time: 8.490
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057692 (OMIM: 300362) armadillo repeat-containi ( 453) 2955 498.3 1.7e-140
NP_808816 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containi ( 379) 997 175.7 1.9e-43
NP_808817 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containi ( 379) 997 175.7 1.9e-43
XP_005262198 (OMIM: 300364) PREDICTED: armadillo r ( 379) 997 175.7 1.9e-43
NP_057691 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containi ( 379) 997 175.7 1.9e-43
XP_005278174 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_005278168 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885481 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_005278171 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885478 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
NP_808818 (OMIM: 300363) armadillo repeat-containi ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_011529373 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_005278167 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_005278173 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_011529374 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885480 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885485 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885484 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885483 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885482 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_005278172 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885486 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885476 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_005278166 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885479 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
NP_055597 (OMIM: 300363) armadillo repeat-containi ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_016885477 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
XP_005278170 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 955 169.0 3.4e-41
NP_001269160 (OMIM: 300363) armadillo repeat-conta ( 632) 955 169.0 3.4e-41
NP_114111 (OMIM: 611864) armadillo repeat-containi ( 343) 884 157.0 7.1e-38
XP_011514903 (OMIM: 611864) PREDICTED: armadillo r ( 316) 850 151.4 3.3e-36
XP_016868173 (OMIM: 611864) PREDICTED: armadillo r ( 352) 846 150.8 5.6e-36
NP_001154481 (OMIM: 611864) armadillo repeat-conta ( 308) 840 149.7 1e-35
XP_016868176 (OMIM: 611864) PREDICTED: armadillo r ( 273) 838 149.4 1.2e-35
XP_011514904 (OMIM: 611864) PREDICTED: armadillo r ( 280) 838 149.4 1.2e-35
XP_016868174 (OMIM: 611864) PREDICTED: armadillo r ( 328) 555 102.8 1.4e-21
NP_001154483 (OMIM: 611864) armadillo repeat-conta ( 284) 549 101.8 2.6e-21
NP_001092881 (OMIM: 300417) G-protein coupled rece (1395) 437 83.9 2.9e-15
NP_001092880 (OMIM: 300417) G-protein coupled rece (1395) 437 83.9 2.9e-15
NP_001171656 (OMIM: 300417) G-protein coupled rece (1395) 437 83.9 2.9e-15
XP_016885470 (OMIM: 300417) PREDICTED: G-protein c (1395) 437 83.9 2.9e-15
NP_055525 (OMIM: 300417) G-protein coupled recepto (1395) 437 83.9 2.9e-15
XP_016885471 (OMIM: 300417) PREDICTED: G-protein c (1395) 437 83.9 2.9e-15
NP_001004051 (OMIM: 300969) G-protein coupled rece ( 838) 424 81.6 8.9e-15
NP_001171805 (OMIM: 300969) G-protein coupled rece ( 838) 424 81.6 8.9e-15
NP_001171804 (OMIM: 300969) G-protein coupled rece ( 838) 424 81.6 8.9e-15
NP_001171803 (OMIM: 300969) G-protein coupled rece ( 838) 424 81.6 8.9e-15
NP_612446 (OMIM: 300969) G-protein coupled recepto ( 838) 424 81.6 8.9e-15
NP_001135999 (OMIM: 300921) protein BHLHb9 [Homo s ( 547) 399 77.3 1.1e-13
NP_001136001 (OMIM: 300921) protein BHLHb9 [Homo s ( 547) 399 77.3 1.1e-13
>>NP_057692 (OMIM: 300362) armadillo repeat-containing X (453 aa)
initn: 2955 init1: 2955 opt: 2955 Z-score: 2643.2 bits: 498.3 E(85289): 1.7e-140
Smith-Waterman score: 2955; 100.0% identity (100.0% similar) in 453 aa overlap (1-453:1-453)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGRTREAGCVAAGVVIGAGACYCVYRLAWGRDENEKIWDEDEESTDTSEIGVETVKGAKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MGRTREAGCVAAGVVIGAGACYCVYRLAWGRDENEKIWDEDEESTDTSEIGVETVKGAKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NAGAGSGAKLQGDSEVKPEVSLGLEDCPGVKEKAHSGSHSGGGLEAKAKALFNTLKEQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 NAGAGSGAKLQGDSEVKPEVSLGLEDCPGVKEKAHSGSHSGGGLEAKAKALFNTLKEQAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AKAGKGARVGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 AKAGKGARVGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PATTWPVRRGKFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYSFNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 PATTWPVRRGKFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYSFNQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMVCRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 NAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMVCRL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTENPAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 DSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTENPAM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 TRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSLFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 TRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSLFFL
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB8 FKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 FKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
430 440 450
>>NP_808816 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containing X (379 aa)
initn: 1109 init1: 963 opt: 997 Z-score: 901.0 bits: 175.7 E(85289): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 1021; 42.1% identity (66.9% similar) in 456 aa overlap (1-453:1-369)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGRTREAGCVAAGVVIGAGACYCVYRLAWGRDEN-EKIWDEDEESTDTSEIGVETVKGAK
:: .:..: :.::.:::::::::.:::. :: .: ::. .: : .:
NP_808 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKM----------AEGG----SGDV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 TNAGAGSGAKLQGDSEVKPEVSLGLEDCPGVKEKAHSGSHSGGGLEAKAKALFNTLKEQA
.:: :: :.. . : . . .. :.:. . .
NP_808 DDAG----------------------DCSGARYNDWSDDDDDSN-ESKSIVWYPPW----
50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SAKAGKGARVGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTR
::.:: .:.: ....::...::
NP_808 -------ARIGTEAGTR--------------------------------ARARARARATR
80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 APATTWPVRRG--KFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYS
: ::. : : . : .:: .::::: ..: .. :.: :.::..:::::::.
NP_808 A-------RRAVQKRASPNSDDTVLSPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYA
110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 FNQNAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMV
::.. ::.:::.::.::...:.:::..::. .::::::::::: ..:.:..::::::..
NP_808 FNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTIT
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 CRLDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTEN
::.:.::.:::::::::::::.:::.:. :. ::: :. ::. ::.:..::..:..::
NP_808 SRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAEN
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 PAMTRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSL
:::::::. .::: : :::::. ..:..:..:..:::::::.: : ....:...::
NP_808 PAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSL
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450
pF1KB8 FFLFKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
::..:: ::. :. .. .:.:..::::: : ..::
NP_808 FFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
340 350 360 370
>>NP_808817 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containing X (379 aa)
initn: 1109 init1: 963 opt: 997 Z-score: 901.0 bits: 175.7 E(85289): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 1021; 42.1% identity (66.9% similar) in 456 aa overlap (1-453:1-369)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGRTREAGCVAAGVVIGAGACYCVYRLAWGRDEN-EKIWDEDEESTDTSEIGVETVKGAK
:: .:..: :.::.:::::::::.:::. :: .: ::. .: : .:
NP_808 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKM----------AEGG----SGDV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 TNAGAGSGAKLQGDSEVKPEVSLGLEDCPGVKEKAHSGSHSGGGLEAKAKALFNTLKEQA
.:: :: :.. . : . . .. :.:. . .
NP_808 DDAG----------------------DCSGARYNDWSDDDDDSN-ESKSIVWYPPW----
50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SAKAGKGARVGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTR
::.:: .:.: ....::...::
NP_808 -------ARIGTEAGTR--------------------------------ARARARARATR
80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 APATTWPVRRG--KFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYS
: ::. : : . : .:: .::::: ..: .. :.: :.::..:::::::.
NP_808 A-------RRAVQKRASPNSDDTVLSPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYA
110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 FNQNAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMV
::.. ::.:::.::.::...:.:::..::. .::::::::::: ..:.:..::::::..
NP_808 FNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTIT
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 CRLDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTEN
::.:.::.:::::::::::::.:::.:. :. ::: :. ::. ::.:..::..:..::
NP_808 SRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAEN
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 PAMTRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSL
:::::::. .::: : :::::. ..:..:..:..:::::::.: : ....:...::
NP_808 PAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSL
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450
pF1KB8 FFLFKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
::..:: ::. :. .. .:.:..::::: : ..::
NP_808 FFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
340 350 360 370
>>XP_005262198 (OMIM: 300364) PREDICTED: armadillo repea (379 aa)
initn: 1109 init1: 963 opt: 997 Z-score: 901.0 bits: 175.7 E(85289): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 1021; 42.1% identity (66.9% similar) in 456 aa overlap (1-453:1-369)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGRTREAGCVAAGVVIGAGACYCVYRLAWGRDEN-EKIWDEDEESTDTSEIGVETVKGAK
:: .:..: :.::.:::::::::.:::. :: .: ::. .: : .:
XP_005 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKM----------AEGG----SGDV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 TNAGAGSGAKLQGDSEVKPEVSLGLEDCPGVKEKAHSGSHSGGGLEAKAKALFNTLKEQA
.:: :: :.. . : . . .. :.:. . .
XP_005 DDAG----------------------DCSGARYNDWSDDDDDSN-ESKSIVWYPPW----
50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SAKAGKGARVGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTR
::.:: .:.: ....::...::
XP_005 -------ARIGTEAGTR--------------------------------ARARARARATR
80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 APATTWPVRRG--KFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYS
: ::. : : . : .:: .::::: ..: .. :.: :.::..:::::::.
XP_005 A-------RRAVQKRASPNSDDTVLSPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYA
110 120 130 140 150
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pF1KB8 FNQNAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMV
::.. ::.:::.::.::...:.:::..::. .::::::::::: ..:.:..::::::..
XP_005 FNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTIT
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pF1KB8 CRLDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTEN
::.:.::.:::::::::::::.:::.:. :. ::: :. ::. ::.:..::..:..::
XP_005 SRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAEN
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pF1KB8 PAMTRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSL
:::::::. .::: : :::::. ..:..:..:..:::::::.: : ....:...::
XP_005 PAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSL
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pF1KB8 FFLFKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
::..:: ::. :. .. .:.:..::::: : ..::
XP_005 FFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
340 350 360 370
>>NP_057691 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containing X (379 aa)
initn: 1109 init1: 963 opt: 997 Z-score: 901.0 bits: 175.7 E(85289): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 1021; 42.1% identity (66.9% similar) in 456 aa overlap (1-453:1-369)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGRTREAGCVAAGVVIGAGACYCVYRLAWGRDEN-EKIWDEDEESTDTSEIGVETVKGAK
:: .:..: :.::.:::::::::.:::. :: .: ::. .: : .:
NP_057 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKM----------AEGG----SGDV
10 20 30 40
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pF1KB8 ESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
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XP_016 DELGMGFRPGDGAAAAAAASANG-GQAFLAEVPDSEEGESGWTDTESDSDSEPETQRRGR
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XP_016 AVQVVGLKFLTNMTITNDYQHLLVNSIANFFRLLSQGGGKIKVEILKILSNFAENPDMLK
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XP_016 KLLSTQVPASFSSLYNSYVESEILINALTLFEIIYDNLRAEVF--NYREFNKGSLFYLCT
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pF1KB8 ESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
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XP_016 TSGVCVKKIRALANHHDLLVKVKVIKLVNKF
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453 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:57:40 2016 done: Fri Nov 4 15:57:42 2016
Total Scan time: 8.490 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]