Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8833
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8833, 453 aa
1>>>pF1KB8833 453 - 453 aa - 453 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2064+/-0.000992; mu= 15.1684+/- 0.060
mean_var=116.9890+/-23.187, 0's: 0 Z-trim(108.1): 30 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.118577
statistics sampled from 9974 (9993) to 9974 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 3.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14487.1 ARMCX1 gene_id:51309|Hs108|chrX ( 453) 2955 516.6 2e-146
CCDS14489.1 ARMCX3 gene_id:51566|Hs108|chrX ( 379) 997 181.6 1.2e-45
CCDS14490.1 ARMCX2 gene_id:9823|Hs108|chrX ( 632) 955 174.6 2.6e-43
CCDS5728.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 343) 884 162.2 7.5e-40
CCDS55146.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 308) 840 154.6 1.3e-37
CCDS59170.1 ARMCX4 gene_id:100131755|Hs108|chrX (2290) 723 135.4 5.9e-31
CCDS55147.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 284) 549 104.8 1.2e-22
CCDS14500.1 ARMCX5 gene_id:64860|Hs108|chrX ( 558) 509 98.2 2.2e-20
CCDS35352.1 GPRASP1 gene_id:9737|Hs108|chrX (1395) 437 86.3 2.2e-16
CCDS14501.1 GPRASP2 gene_id:114928|Hs108|chrX ( 838) 424 83.9 7e-16
CCDS14502.1 BHLHB9 gene_id:80823|Hs108|chrX ( 547) 399 79.4 9.9e-15
CCDS55145.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 284) 386 77.0 2.9e-14
CCDS55149.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 225) 349 70.5 1.9e-12
CCDS55148.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 249) 342 69.4 4.8e-12
>>CCDS14487.1 ARMCX1 gene_id:51309|Hs108|chrX (453 aa)
initn: 2955 init1: 2955 opt: 2955 Z-score: 2742.1 bits: 516.6 E(32554): 2e-146
Smith-Waterman score: 2955; 100.0% identity (100.0% similar) in 453 aa overlap (1-453:1-453)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGRTREAGCVAAGVVIGAGACYCVYRLAWGRDENEKIWDEDEESTDTSEIGVETVKGAKT
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CCDS14 MGRTREAGCVAAGVVIGAGACYCVYRLAWGRDENEKIWDEDEESTDTSEIGVETVKGAKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NAGAGSGAKLQGDSEVKPEVSLGLEDCPGVKEKAHSGSHSGGGLEAKAKALFNTLKEQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NAGAGSGAKLQGDSEVKPEVSLGLEDCPGVKEKAHSGSHSGGGLEAKAKALFNTLKEQAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AKAGKGARVGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AKAGKGARVGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PATTWPVRRGKFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYSFNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PATTWPVRRGKFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYSFNQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMVCRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMVCRL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTENPAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTENPAM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 TRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSLFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSLFFL
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB8 FKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
430 440 450
>>CCDS14489.1 ARMCX3 gene_id:51566|Hs108|chrX (379 aa)
initn: 1109 init1: 963 opt: 997 Z-score: 932.9 bits: 181.6 E(32554): 1.2e-45
Smith-Waterman score: 1021; 42.1% identity (66.9% similar) in 456 aa overlap (1-453:1-369)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGRTREAGCVAAGVVIGAGACYCVYRLAWGRDEN-EKIWDEDEESTDTSEIGVETVKGAK
:: .:..: :.::.:::::::::.:::. :: .: ::. .: : .:
CCDS14 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKM----------AEGG----SGDV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 TNAGAGSGAKLQGDSEVKPEVSLGLEDCPGVKEKAHSGSHSGGGLEAKAKALFNTLKEQA
.:: :: :.. . : . . .. :.:. . .
CCDS14 DDAG----------------------DCSGARYNDWSDDDDDSN-ESKSIVWYPPW----
50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SAKAGKGARVGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTR
::.:: .:.: ....::...::
CCDS14 -------ARIGTEAGTR--------------------------------ARARARARATR
80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 APATTWPVRRG--KFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYS
: ::. : : . : .:: .::::: ..: .. :.: :.::..:::::::.
CCDS14 A-------RRAVQKRASPNSDDTVLSPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYA
110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 FNQNAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMV
::.. ::.:::.::.::...:.:::..::. .::::::::::: ..:.:..::::::..
CCDS14 FNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTIT
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 CRLDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTEN
::.:.::.:::::::::::::.:::.:. :. ::: :. ::. ::.:..::..:..::
CCDS14 SRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAEN
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 PAMTRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSL
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CCDS14 PAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSL
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450
pF1KB8 FFLFKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
::..:: ::. :. .. .:.:..::::: : ..::
CCDS14 FFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
340 350 360 370
>>CCDS14490.1 ARMCX2 gene_id:9823|Hs108|chrX (632 aa)
initn: 1120 init1: 756 opt: 955 Z-score: 891.1 bits: 174.6 E(32554): 2.6e-43
Smith-Waterman score: 958; 42.0% identity (68.9% similar) in 421 aa overlap (45-453:215-632)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 VIGAGACYCVYRLAWGRDENEKIWDEDEESTDTSEIGVE-TVKGAKTNAGAGSGAKLQGD
:...: : : :: . .::. . .:.
CCDS14 TEAAAPTEVTEGPGVAAPTKVAEAPGVASPTEAAEAPVPATPTGAAAPTGAAESPGTSGS
190 200 210 220 230 240
80 90 100 110 120
pF1KB8 --SEVKPEVSLGLEDCPGVKEKAHSGSHSGGGLEAKAKALFNTLKEQASAKAGKGARV--
. : : .: . . ::.. : . :. : :. . : ..... :: ..:
CCDS14 PRTAVVPGTSAAKKATPGAHTGAIPKATSATGAVPKGGGKGVTRSRNGGKGKGKKSKVEV
250 260 270 280 290 300
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 -----GTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAG--GRASGKSKGKARSKSTRAPA
: :. . : . .: : . :. : : .. .: . .. .. :
CCDS14 DELGMGFRPGDGAAAAAAASANG-GQAFLAEVPDSEEGESGWTDTESDSDSEPETQRRGR
310 320 330 340 350 360
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TTWPVRRGKFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYSFNQNA
:: : :::.::.::.. ::.::: .:....:::::.:::.::.::: :: ::..
CCDS14 GRRPVAMQKRPFPYEIDEILGVRDLRKVLALLQKSDDPFIQQVALLTLSNNANYSCNQET
370 380 390 400 410 420
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMVCRLDS
::.:::.::::..:. :: :.::. :.:::: : ::::....:...: :: :. :.:
CCDS14 IRKLGGLPIIANMINKTDPHIKEKALMAMNNLSENYENQGRLQVYMNKVMDDIMASNLNS
430 440 450 460 470 480
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTENPAMTR
:::..::..:::::.:: ::::: :. .:: :: :. :..:.:.. ::.::: : .
CCDS14 AVQVVGLKFLTNMTITNDYQHLLVNSIANFFRLLSQGGGKIKVEILKILSNFAENPDMLK
490 500 510 520 530 540
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSLFFLFK
.:.: .::. . ::.:. . :::.: ::::: : ::.. : . . .::...:::.:
CCDS14 KLLSTQVPASFSSLYNSYVESEILINALTLFEIIYDNLRAEVF--NYREFNKGSLFYLCT
550 560 570 580 590 600
430 440 450
pF1KB8 ESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
::::::::.:::::.::.:::::.:...:.
CCDS14 TSGVCVKKIRALANHHDLLVKVKVIKLVNKF
610 620 630
>>CCDS5728.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 (343 aa)
initn: 962 init1: 769 opt: 884 Z-score: 829.0 bits: 162.2 E(32554): 7.5e-40
Smith-Waterman score: 884; 48.6% identity (74.1% similar) in 313 aa overlap (148-453:33-343)
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 QASAKAGKGARVGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKS
:: ::.. ::. : :.:. ..:
CCDS57 GPRGAGWVAAGLLLGAGACYCIYRLTRGRRRGDRELGIRSSKSAGALEEGTSEGQLCGRS
10 20 30 40 50 60
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TRAPAT--TWPVRRGKFNFPYKI-----DDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTL
.: : : :: . .: . : . ::.:.: .:::.: .:: :.:: : : ::.::
CCDS57 AR-PQTGGTWESQWSKTSQPEDLTDGSYDDVLNAEQLQKLLYLLESTEDPVIIERALITL
70 80 90 100 110 120
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GNNAAYSFNQNAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQ
:::::.: :: ::::::.::.:. :. .. :.::. :::::::::.::: ::: ::::
CCDS57 GNNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKINHSNQSIKEKALNALNNLSVNVENQIKIKIYISQ
130 140 150 160 170 180
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VCDDTMVCRLDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKL
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CCDS57 VCEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMTVTNDHQHMLHSYITDLFQVLLTGNGNTKVQVLKL
190 200 210 220 230 240
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 IINFTENPAMTRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRK
..:..::::::. :. .: : ..::.... .:::: .::::.::.. .: :: . .
CCDS57 LLNLSENPAMTEGLLRAQVDSSFLSLYDSHVAKEILLRVLTLFQNIKNCLKIEGHLAVQP
250 260 270 280 290 300
420 430 440 450
pF1KB8 EFSRSSLFFLFKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
:...:::::.. . :..::.::..:.: :: ::. .. :.
CCDS57 TFTEGSLFFLLH-GEECAQKIRALVDHHDAEVKEKVVTIIPKI
310 320 330 340
>>CCDS55146.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 (308 aa)
initn: 962 init1: 769 opt: 840 Z-score: 788.9 bits: 154.6 E(32554): 1.3e-37
Smith-Waterman score: 840; 48.8% identity (75.6% similar) in 287 aa overlap (167-453:30-308)
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 TLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTRAPATTWPVRRGKFNFPY
:. .: : . :. .. . :..
CCDS55 MGGPRGAGWVAAGLLLGAGACYCIYRLTRGRRRGD-RELGIRSSKSAEDLTDGSY----
10 20 30 40 50
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 KIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYSFNQNAIRELGGVPIIAKLI
::.:.: .:::.: .:: :.:: : : ::.:::::::.: :: ::::::.::.:. :
CCDS55 --DDVLNAEQLQKLLYLLESTEDPVIIERALITLGNNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKI
60 70 80 90 100 110
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 KTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMVCRLDSAVQMAGLRLLTNMT
. .. :.::. :::::::::.::: ::: ::::::.:.. :.::::.::: ::::::
CCDS55 NHSNQSIKEKALNALNNLSVNVENQIKIKIYISQVCEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMT
120 130 140 150 160 170
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 VTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTENPAMTRELVSCKVPSELISL
::: .::.: . :.: .:. :: ::.:..::..:..::::::. :. .: : ..::
CCDS55 VTNDHQHMLHSYITDLFQVLLTGNGNTKVQVLKLLLNLSENPAMTEGLLRAQVDSSFLSL
180 190 200 210 220 230
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 FNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSLFFLFKESGVCVKKIKALAN
.... .:::: .::::.::.. .: :: . . :...:::::.. . :..::.::..
CCDS55 YDSHVAKEILLRVLTLFQNIKNCLKIEGHLAVQPTFTEGSLFFLLH-GEECAQKIRALVD
240 250 260 270 280 290
440 450
pF1KB8 HNDLVVKVKVLKVLTKL
:.: :: ::. .. :.
CCDS55 HHDAEVKEKVVTIIPKI
300
>>CCDS59170.1 ARMCX4 gene_id:100131755|Hs108|chrX (2290 aa)
initn: 931 init1: 687 opt: 723 Z-score: 669.2 bits: 135.4 E(32554): 5.9e-31
Smith-Waterman score: 749; 33.4% identity (64.7% similar) in 485 aa overlap (2-453:1818-2290)
10 20
pF1KB8 MGRTREAGCVA---AGVVIGAGACYCVYRLA
: ::: : ::. :::: .
CCDS59 KASSGSWIRSEEVAYMGSCVGAEAGAGAEAGAGAEAGAGAGAEAGAEAGAGAGA-----G
1790 1800 1810 1820 1830 1840
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 WGRDENEKIWDEDEESTDTSEIGVETVKGAKTNAGAGSG--AKLQGDSEVKPEVSLGLED
: . . ::. : ..: ::. :: .::. : :. :..:.. : : .:.
CCDS59 PGTESGAGIWSWDGDATT-----VESRLGAGEEAGVESWTLARNVGEDELSRESSPDIEE
1850 1860 1870 1880 1890
90 100 110 120 130
pF1KB8 CPGVK----EKAHSG---SHSGGGLEAKAKALFNT-LKEQASAKAGKGARVGT--ISGNR
. :. .:. :.:: .. : :: .:.. : :: :. .:. .::.
CCDS59 ISLRSLFWAESENSNTFRSKSGKDASFESGAGDNTSIKDKFEA-AG-GVDIGSWFCAGNE
1900 1910 1920 1930 1940 1950
140 150 160 170 180
pF1KB8 TLAPSLPCPGGRGGGCHPTRS--GSRAGGRASGKSKGK---ARSKSTRAPATTWPV----
. . . : ... .:. . : . :. : ...: .. ...::
CCDS59 NTSEDKSAPKAKAKKSSESRGIYPYMVPGAGMGSWDGAMIWSETKFAHQSEASFPVEDES
1960 1970 1980 1990 2000 2010
190 200 210 220 230
pF1KB8 ----RRGKFNFPY----KIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYSFN
: :. . :. : . .. ::.:.. ..: :.:: ..:.: .: :.: ::..
CCDS59 RKQTRTGEKTRPWSCRCKHEANMDPRDLEKLICMIEMTEDPSVHEIANNALYNSADYSYS
2020 2030 2040 2050 2060 2070
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 QNAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMVCR
....:..::. .: .:... : .:.:. :::::.:: :::. :.:::..:::.::..
CCDS59 HEVVRNVGGISVIESLLNNPYPSVRQKALNALNNISVAAENHRKVKTYLNQVCEDTVTYP
2080 2090 2100 2110 2120 2130
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 LDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTENPA
:.: ::.:::::. ..:.:..:::... . .:. :: .:. :: ... ...::..::.
CCDS59 LNSNVQLAGLRLIRHLTITSEYQHMVTNYISEFLRLLTVGSGETKDHVLGMLLNFSKNPS
2140 2150 2160 2170 2180 2190
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 MTRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSLFF
::..:. ..:. ::..:.:. .: .:: :.:::::: ..: .. : .. .::..::.:
CCDS59 MTKDLLIANAPTSLINIFSKKETKENILNALSLFENINYHFKRRAKAFTQDKFSKNSLYF
2200 2210 2220 2230 2240 2250
420 430 440 450
pF1KB8 LFKESGVCVKKIKALANH-NDLVVKVKVLKVLTKL
::.. .:.::..::: . :: :: .: ...::
CCDS59 LFQRPKACAKKLRALAAECNDPEVKERVELLISKL
2260 2270 2280 2290
>>CCDS55147.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 (284 aa)
initn: 872 init1: 547 opt: 549 Z-score: 520.3 bits: 104.8 E(32554): 1.2e-22
Smith-Waterman score: 696; 44.6% identity (68.6% similar) in 287 aa overlap (167-453:30-284)
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 TLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTRAPATTWPVRRGKFNFPY
:. .: : . :. .. . :..
CCDS55 MGGPRGAGWVAAGLLLGAGACYCIYRLTRGRRRGD-RELGIRSSKSAEDLTDGSY----
10 20 30 40 50
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 KIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYSFNQNAIRELGGVPIIAKLI
::.:.: .:::.: .:: :.:: : : ::.:::::::.: :: ::::::.::.:. :
CCDS55 --DDVLNAEQLQKLLYLLESTEDPVIIERALITLGNNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKI
60 70 80 90 100 110
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 KTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMVCRLDSAVQMAGLRLLTNMT
. .. :.::. :::::::::.::: ::: ::::::.:.. :.::::.::: ::::::
CCDS55 NHSNQSIKEKALNALNNLSVNVENQIKIKIYISQVCEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMT
120 130 140 150 160 170
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 VTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTENPAMTRELVSCKVPSELISL
::: .::.: . :.: .:. :: ::.. : ..::
CCDS55 VTNDHQHMLHSYITDLFQVLLTGNGNTKVD------------------------SSFLSL
180 190 200
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 FNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSLFFLFKESGVCVKKIKALAN
.... .:::: .::::.::.. .: :: . . :...:::::.. . :..::.::..
CCDS55 YDSHVAKEILLRVLTLFQNIKNCLKIEGHLAVQPTFTEGSLFFLLH-GEECAQKIRALVD
210 220 230 240 250 260
440 450
pF1KB8 HNDLVVKVKVLKVLTKL
:.: :: ::. .. :.
CCDS55 HHDAEVKEKVVTIIPKI
270 280
>>CCDS14500.1 ARMCX5 gene_id:64860|Hs108|chrX (558 aa)
initn: 503 init1: 503 opt: 509 Z-score: 479.5 bits: 98.2 E(32554): 2.2e-20
Smith-Waterman score: 515; 31.8% identity (64.5% similar) in 324 aa overlap (134-453:246-558)
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LEAKAKALFNTLKEQASAKAGKGARVGTISGNRTLAPSL-PCPGG-RGGGCHPTRSGSRA
:: ::. .: : : : : :
CCDS14 TIKQKVIAWSRARYIVLVPVEGGEQSLPPEGNWTLVETLIETPLGIRPLTKIPPYHGPYY
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 GGRASGKSKGKARSKSTRAPATTWPVRRGKFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPF
: :.. . : : : . :: :.. : ...:.. .:. :.:::
CCDS14 QTLAEIKKQIRQREKYGPNPKACHCKSRG-FSLEPK--------EFDKLVALLKLTKDPF
280 290 300 310 320
230 240 250 260 270
pF1KB8 IQEVALVTLGNNAAYSFNQNAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREK--TYNALNNLSVNAE
:.:.: . .: . :: :.:. :...: . .: .:. ..: ..:. . . ... : ..:
CCDS14 IHEIATMIMGISPAYPFTQDIIHDVGITVMIENLV--NNPNVKEHPGALSMVDDSSESSE
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 NQGKIKTYISQVCDDTMVCRLDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLG
. . ..:: ::: . : :.: ::.:::.:: .... . ..... .:::..:: :
CCDS14 EPKSGESYIHQVCKGIISCPLNSPVQLAGLKLLGHLSIKFEDHYVITSYIPDFLTLLNKG
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 NHFTKIQIMKLIINFTENPAMTRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDN
. ::. ..:.. ...: : ::::.: :: : :.. :::. .. .:::. .::::: .
CCDS14 SVKTKFYVLKVFSCLSKNHANTRELISAKVLSSLVAPFNKNESKANILNIIEIFENINFQ
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 IKNEGLASSRKEFSRSSLFFLFKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
.:... ....:..: :. .:.:. .:.. ::.:.: :. ::.... ::
CCDS14 FKTKAKLFTKEKFTKSELISIFQEAKQFGQKLQDLAEHSDPEVRDKVIRLILKL
510 520 530 540 550
>>CCDS35352.1 GPRASP1 gene_id:9737|Hs108|chrX (1395 aa)
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Smith-Waterman score: 437; 30.5% identity (70.3% similar) in 239 aa overlap (202-439:1151-1388)
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KARSKSTRAPATTWPVRRGKFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLG
... .....: ..:. ::::.:.. ...:
CCDS35 SVQEIREHLRAKESTEPESSSCNCIQCELKIGSEEFEELLLLMEKIRDPFIHEISKIAMG
1130 1140 1150 1160 1170 1180
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 NNAAYSFNQNAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQV
.: .:... ::. : : .: :.. . .: . . . .. : . :.::: .:
CCDS35 MRSASQFTRDFIRDSGVVSLIETLLNYPSSRVRTSFLENMIRMAPPYPNLNIIQTYICKV
1190 1200 1210 1220 1230 1240
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 CDDTMVCRLDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLI
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CCDS35 CEETLAYSVDSPEQLSGIRMIRHLTTTTDYHTLVANYMSGFLSLLATGNAKTRFHVLKML
1250 1260 1270 1280 1290 1300
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 INFTENPAMTRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKE
.:..:: ::.::.: .. ::.:.:::.: . . .:..::::..:::.: . :. .
CCDS35 LNLSENLFMTKELLSAEAVSEFIGLFNREETNDNIQIVLAIFENIGNNIKKETVFSD-DD
1310 1320 1330 1340 1350
420 430 440 450
pF1KB8 FSRSSLFFLFKESGVCVKKIKALA-NHNDLVVKVKVLKVLTKL
:. :. :.. .:.... . :.::
CCDS35 FNIEPLISAFHKVEKFAKELQGKTDNQNDPEGDQEN
1360 1370 1380 1390
>>CCDS14501.1 GPRASP2 gene_id:114928|Hs108|chrX (838 aa)
initn: 456 init1: 395 opt: 424 Z-score: 398.6 bits: 83.9 E(32554): 7e-16
Smith-Waterman score: 424; 28.9% identity (67.8% similar) in 239 aa overlap (202-439:593-831)
180 190 200 210 220 230
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... .... : .... ::::.:.. ...:
CCDS14 SVREIREHLRARESAESESWSCSCIQCELKIGSEEFEEFLLLMDKIRDPFIHEISKIAMG
570 580 590 600 610 620
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 NNAAYSFNQNAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQV
.: .:... ::. : : .: :.. . .: . . . ... : . :.:.: ::
CCDS14 MRSASQFTRDFIRDSGVVSLIETLLNYPSSRVRTSFLENMIHMAPPYPNLNMIETFICQV
630 640 650 660 670 680
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 CDDTMVCRLDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLI
:..:.. .:: :..:.:.: ..:.: :. :.. . :..:: .: ::....:..
CCDS14 CEETLAHSVDSLEQLTGIRMLRHLTMTIDYHTLIANYMSGFLSLLTTANARTKFHVLKML
690 700 710 720 730 740
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CCDS14 LNLSENPAVAKKLFSAKALSIFVGLFNIEETNDNIQIVIKMFQNISNIIKSGKMSLIDDD
750 760 770 780 790 800
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:: :. :.: .:...: . :.::
CCDS14 FSLEPLISAFREFEELAKQLQAQIDNQNDPEVGQQS
810 820 830
453 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]