Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8832
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8832, 452 aa
1>>>pF1KB8832 452 - 452 aa - 452 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8717+/-0.00113; mu= 11.9434+/- 0.067
mean_var=216.1185+/-43.718, 0's: 0 Z-trim(111.1): 938 B-trim: 18 in 1/50
Lambda= 0.087243
statistics sampled from 11074 (12092) to 11074 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.371), width: 16
Scan time: 3.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1638.1 ZNF672 gene_id:79894|Hs108|chr1 ( 452) 3277 425.6 5.2e-119
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1186 163.0 1.6e-39
CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 734) 1135 156.2 1e-37
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 1100 151.7 1.9e-36
CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 686) 1100 151.8 2e-36
CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 697) 1100 151.8 2e-36
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 1082 149.6 1e-35
CCDS55406.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 575) 1062 146.9 5e-35
CCDS48099.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 581) 1062 146.9 5.1e-35
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1045 144.5 1.7e-34
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1045 144.7 2e-34
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1045 144.7 2e-34
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1033 143.2 5.7e-34
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1019 141.4 1.9e-33
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1020 141.7 2e-33
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1020 141.7 2.1e-33
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1020 141.7 2.1e-33
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1020 141.7 2.2e-33
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 1019 141.6 2.3e-33
CCDS12944.1 ZNF667 gene_id:63934|Hs108|chr19 ( 610) 1013 140.8 3.7e-33
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CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1010 140.3 4.2e-33
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1008 140.2 5.8e-33
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 997 138.7 1.5e-32
CCDS35074.1 ZNF510 gene_id:22869|Hs108|chr9 ( 683) 998 139.0 1.5e-32
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 997 138.8 1.6e-32
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 ( 437) 993 138.1 1.8e-32
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 994 138.5 2.1e-32
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 992 138.2 2.5e-32
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 990 137.9 2.9e-32
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 990 137.9 2.9e-32
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 990 138.0 3e-32
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 990 138.0 3.1e-32
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 989 137.8 3.3e-32
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 989 137.9 3.3e-32
CCDS33003.1 ZNF260 gene_id:339324|Hs108|chr19 ( 412) 985 137.0 3.4e-32
CCDS44202.1 ZNF697 gene_id:90874|Hs108|chr1 ( 545) 986 137.3 3.7e-32
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 988 137.8 3.8e-32
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 986 137.4 3.8e-32
CCDS12638.1 ZNF285 gene_id:26974|Hs108|chr19 ( 590) 986 137.4 3.9e-32
CCDS74389.1 ZNF285 gene_id:26974|Hs108|chr19 ( 597) 986 137.4 3.9e-32
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 986 137.4 4.1e-32
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 986 137.4 4.2e-32
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 985 137.3 4.7e-32
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 979 136.2 5.3e-32
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 980 136.5 5.8e-32
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 979 136.4 6.5e-32
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 982 137.1 6.8e-32
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 868) 982 137.1 6.9e-32
CCDS46990.1 ZNF732 gene_id:654254|Hs108|chr4 ( 585) 979 136.5 7.1e-32
>>CCDS1638.1 ZNF672 gene_id:79894|Hs108|chr1 (452 aa)
initn: 3277 init1: 3277 opt: 3277 Z-score: 2250.1 bits: 425.6 E(32554): 5.2e-119
Smith-Waterman score: 3277; 100.0% identity (100.0% similar) in 452 aa overlap (1-452:1-452)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MFATSGAVAAGKPYSCSECGKSFCYSSVLLRHERAHGGDGRFRCLECGERCARAADLRAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MFATSGAVAAGKPYSCSECGKSFCYSSVLLRHERAHGGDGRFRCLECGERCARAADLRAH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RRTHAGQTLYICSECGQSFRHSGRLDLHLGAHRQRCRTCPCRTCGRRFPHLPALLLHRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RRTHAGQTLYICSECGQSFRHSGRLDLHLGAHRQRCRTCPCRTCGRRFPHLPALLLHRRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QHLPERPRRCPLCARTFRQSALLFHQARAHPLGTTSDPAAPPHRCAQCPRAFRSGAGLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 QHLPERPRRCPLCARTFRQSALLFHQARAHPLGTTSDPAAPPHRCAQCPRAFRSGAGLRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 HARIHVSRSPTRPRVSDAHQCGVCGKCFGKSSTLTRHLQTHSGEKPFKCPECGKGFLESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 HARIHVSRSPTRPRVSDAHQCGVCGKCFGKSSTLTRHLQTHSGEKPFKCPECGKGFLESA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TLVRHQRTHTGEKPYACGDCGRCFSESSTLLRHRRSHQGERPHACATCGKGFGQRSDLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 TLVRHQRTHTGEKPYACGDCGRCFSESSTLLRHRRSHQGERPHACATCGKGFGQRSDLVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 HQRIHTGEKPFACPECGRRFSDRSDLTKHRRTHTGEKPYRCELCGKRFTCVSNLNVHRRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 HQRIHTGEKPFACPECGRRFSDRSDLTKHRRTHTGEKPYRCELCGKRFTCVSNLNVHRRN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 HAGHKPHKCPECSKAFSVASKLALHRKTHLGERPAECAECGKCFSHSRSLSQHQRAHTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 HAGHKPHKCPECSKAFSVASKLALHRKTHLGERPAECAECGKCFSHSRSLSQHQRAHTRA
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB8 RTAAAVAIQSAVGTALVFEGPAEQEKPGFSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RTAAAVAIQSAVGTALVFEGPAEQEKPGFSVS
430 440 450
>>CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280 aa)
initn: 1696 init1: 876 opt: 1186 Z-score: 822.9 bits: 163.0 E(32554): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 1233; 40.3% identity (63.7% similar) in 422 aa overlap (12-418:395-800)
10 20 30 40
pF1KB8 MFATSGAVAAGKPYSCSECGKSFCYSSVLLRHERAHGGDGR
:::.: ::::.: . :.: .:: : :.
CCDS54 GEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKP
370 380 390 400 410 420
50 60 70 80 90
pF1KB8 FRCLECGERCARAADLRAHRRTHAGQTLYICSECGQSFRHSGRLD----LHLGAHRQRCR
..: :::. ...: :.. :.:.: : : :::..: . : .: : . .:.
CCDS54 YKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECGKGFSMFSILTKHKVIHNGEKPYKCE
430 440 450 460 470 480
100 110 120 130 140
pF1KB8 TC---------P--CRTCGRRFPHLPALLLHRRRQHLPERPRRCPLCARTFRQSALLFHQ
: : :. ::. : :. :.: : :.: .: :...: ..: ..
CCDS54 ECDKATHAGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKR-IHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKH
490 500 510 520 530 540
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 ARAHPLGTTSDPAAPPHRCAQCPRAFRSGAGLRSHARIHVSRSPTRPRVSDAHQCGVCGK
: . :..: .: .:.. .. : : .::. ..: ..: :::
CCDS54 KVIHT-------GEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKP--------YKCEECGK
550 560 570 580
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 CFGKSSTLTRHLQTHSGEKPFKCPECGKGFLESATLVRHQRTHTGEKPYACGDCGRCFSE
:..:. : .: . :.::::.:: :::: : . .::. :. :.::::: : .::. : .
CCDS54 AFNQSAILIKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKTFIK
590 600 610 620 630 640
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SSTLLRHRRSHQGERPHACATCGKGFGQRSDLVVHQRIHTGEKPFACPECGRRFSDRSDL
::: :. : ::.:. : :::.:.. : :. :. :::::::. : :::. :. :.:
CCDS54 VSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNL
650 660 670 680 690 700
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 TKHRRTHTGEKPYRCELCGKRFTCVSNLNVHRRNHAGHKPHKCPECSKAFSVASKLALHR
.:.: :::::::.:: ::: :. : :. :. :.:.::.:: ::.::.. .: :. :.
CCDS54 MEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSVLTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHK
710 720 730 740 750 760
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 KTHLGERPAECAECGKCFSHSRSLSQHQRAHTRARTAAAVAIQSAVGTALVFEGPAEQEK
: : :.: .: :::: :..: : .:.: ::
CCDS54 KIHTVEKPYKCEECGKAFNRSAILIKHKRIHTDEKPYKCEECGKTFSKVSTLTTHKAIHA
770 780 790 800 810 820
450
pF1KB8 PGFSVS
CCDS54 GEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKP
830 840 850 860 870 880
>--
initn: 834 init1: 834 opt: 977 Z-score: 680.7 bits: 136.7 E(32554): 1.3e-31
Smith-Waterman score: 1165; 39.0% identity (63.6% similar) in 418 aa overlap (2-418:820-1220)
10 20 30
pF1KB8 MFATSGAVAAG-KPYSCSECGKSFCYSSVLL
..: :. :: :::.:.::::.: :.:
CCDS54 AILIKHKRIHTDEKPYKCEECGKTFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILT
790 800 810 820 830 840
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 RHERAHGGDGRFRCLECGERCARAADLRAHRRTHAGQTLYICSECGQSFRHSGRLDLHLG
.:. : :. ..: :::. . : :.. :.:. : : :::..: . : :
CCDS54 KHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEV
850 860 870 880 890 900
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 AHRQRCRTCPCRTCGRRFPHLPALLLHRRRQHLPERPRRCPLCARTFRQSALLFHQARAH
: . . :. ::. : : .. :.. : :. .: :......:. : .. . :
CCDS54 IHTGE-KPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKT-HAGEKFYKCEACGKAYKSSSTLSYHKKIH
910 920 930 940 950 960
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 PLGTTSDPAAPPHRCAQCPRAFRSGAGLRSHARIHVSRSPTRPRVSDAHQCGVCGKCFGK
:.. .: ..: . . : .: ::....: ..: ::: :.
CCDS54 -------TEEKPYKYEECGKGFSTFSILTKHKVIHTGEKP--------YKCEECGKAFNW
970 980 990 1000 1010
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 SSTLTRHLQTHSGEKPFKCPECGKGFLESATLVRHQRTHTGEKPYACGDCGRCFSESSTL
::.: .: . :.:: :.:: :: :.: ..:..:. ::.::::: : .::. :: : :
CCDS54 SSNLMEHKKIHTGETPYKCEECDKAFSWPSSLTEHKATHAGEKPYKCEECGKAFSWPSRL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LRHRRSHQGERPHACATCGKGFGQRSDLVVHQRIHTGEKPFACPECGRRFSDRSDLTKHR
.:. .: ::.:. : :::.:. :.:. :.::::::::. : :::. :: : ::::.
CCDS54 TEHKATHAGEEPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHK
1080 1090 1100 1110 1120 1130
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 RTHTGEKPYRCELCGKRFTCVSNLNVHRRNHAGHKPHKCPECSKAFSVASKLALHRKTHL
:::::::.:: ::: . :.:. :.. :. .::.:: ::.:.: . : :: :. :
CCDS54 VIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKGFVMFSILAKHKVIHT
1140 1150 1160 1170 1180 1190
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 GERPAECAECGKCFSHSRSLSQHQRAHTRARTAAAVAIQSAVGTALVFEGPAEQEKPGFS
::. .: :::: .. .: :.. ::
CCDS54 GEKLYKCEECGKAYKWPSTLRYHKKIHTGEKPYKCEECGKAFSTFSILTKHKVIHTGEKP
1200 1210 1220 1230 1240 1250
>--
initn: 751 init1: 751 opt: 751 Z-score: 527.0 bits: 108.2 E(32554): 4.9e-23
Smith-Waterman score: 751; 47.5% identity (68.9% similar) in 219 aa overlap (200-418:174-392)
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 RAFRSGAGLRSHARIHVSRSPTRPRVSDAHQCGVCGKCFGKSSTLTRHLQTHSGEKPFKC
:: . : : :..: . .. :. .::
CCDS54 VFQRGKYANVFHKCSNSNRHKIRHTGKKHLQCKEYVRSFCMLSHLSQHKRIYTRENSYKC
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 PECGKGFLESATLVRHQRTHTGEKPYACGDCGRCFSESSTLLRHRRSHQGERPHACATCG
: ::.: :.::. .. .::::::: : .::. ::. : : .:. : ::. . : ::
CCDS54 EEGGKAFNWSSTLTYYKSAHTGEKPYRCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKSYKCEECG
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 KGFGQRSDLVVHQRIHTGEKPFACPECGRRFSDRSDLTKHRRTHTGEKPYRCELCGKRFT
:.:.: . :. :. ::::::: : :::. :: : :: :. :.:::::.:. ::: :.
CCDS54 KAFNQSAILTKHKIIHTGEKPNKCEECGKAFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFS
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 CVSNLNVHRRNHAGHKPHKCPECSKAFSVASKLALHRKTHLGERPAECAECGKCFSHSRS
::.: .:. :::.::.:: ::.:::: : :. :. : ::.: .: :::: .. .
CCDS54 KVSTLITHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPST
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450
pF1KB8 LSQHQRAHTRARTAAAVAIQSAVGTALVFEGPAEQEKPGFSVS
:: :.. ::
CCDS54 LSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEH
390 400 410 420 430 440
>>CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 (734 aa)
initn: 3544 init1: 899 opt: 1135 Z-score: 790.8 bits: 156.2 E(32554): 1e-37
Smith-Waterman score: 1147; 39.9% identity (61.3% similar) in 426 aa overlap (3-418:347-732)
10 20 30
pF1KB8 MFATSGAVAAGKPYSCSECGKSFCYSSVLLRH
.:.:.:. : :. ::: : : ::::
CCDS12 PTDEDPCRGVGPALITTRWRSPRGRSRGRPSTGGGVVRGG--RCDVCGKVFSQRSNLLRH
320 330 340 350 360 370
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ERAHGGDGRFRCLECGERCARAADLRAHRRTHAGQTLYICSECGQSFRHSGRLDLHLGAH
.. : :. : : :::. .:.. : :. ::. . ..:..:::.: .:.::. :
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:: : :.: :: :...::: . :... : :
CCDS12 --------------------------RRVHTGEQPFRCAECGQSFRQRSNLLQHQRIHGD
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: : . : ::: :..: ..: : : : .:.. . . :
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::. ::. :.: .: ..::::.:: : :::..: . ..:..:.: ::::.:.::..::.
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: . :: .: : : ::.: :: ::. :.:: :. ::: ::::::. : ::: :..
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: ::.:.: ::::.:. : ::. : .::. ::: :.:..:. ::::.::: :
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. : .:: :.: : .::. : .: .: ::::.:.
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CCDS35 SSSLIQHQRIHTGEKPYTCSNCGKSFSHSSSLSKHQRIHTGEKPYKCGECGKAFRQNSCL
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CCDS35 TRHQRIHTGEKPYLCNDCGMTFSHFTSVIYHQRLHSGEKPYKCNQCEKAFPTHSLLSRHQ
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CCDS35 RIHTGVKPYKCKECGKSFSQSSSLNEHHRIHTGEKPYECNYCGATFSRSSILVEHLKIHT
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CCDS55 ------YKGIKC-----TTSSL-IYQRIHTSEKP---------QCSEHGKASDEKPSPTK
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CCDS55 HWRTHTKENIYECSKCGKSFRGKSHLSVHQRIHTGEKPYECSICGKTFSGKSHLSVHHRT
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CCDS55 HTGEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFSEKSPLIKHQRIHTGE
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CCDS55 RPYECTDCKKAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKSTLIVHHRTHTGEKPYE
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pF1KB8 CAECGKCFSHSRSLSQHQRAHTRARTAAAVAIQSAVGTALVFEGPAEQEKPGFSVS
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CCDS55 CRDCGKAFSGKSTLIKHQRSHTGDKNL
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CCDS48 FLGQNRSYVRKKDDGCKAYWKVCLHYNLHKAQPAERFFDPNQRGKALHQKQALRKSQRSQ
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CCDS48 TGEKLYKCTECGKVFIQKANLVVHQRTHTGEKPYECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTGE-
220 230 240 250 260 270
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CCDS48 KPYECSECGKTFIQKSTLIKHQRT-HTGEKPFVCDKCPKAFKSSYHLIRHEKTHIRQAF-
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