Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8831
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8831, 445 aa
1>>>pF1KB8831 445 - 445 aa - 445 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0198+/-0.000997; mu= 13.9016+/- 0.059
mean_var=117.5911+/-35.116, 0's: 0 Z-trim(105.5): 271 B-trim: 1033 in 2/48
Lambda= 0.118273
statistics sampled from 8036 (8486) to 8036 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 2.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 ( 445) 2967 518.0 7.5e-147
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 481 93.7 3.4e-19
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 ( 375) 448 88.1 1.6e-17
CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 ( 375) 448 88.1 1.6e-17
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 426 84.4 2.2e-16
CCDS7761.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 ( 447) 398 79.6 6.8e-15
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 395 79.1 9.7e-15
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 384 77.2 3.4e-14
CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 ( 430) 379 76.4 6.3e-14
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 371 75.0 1.6e-13
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 371 75.0 1.6e-13
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 371 75.1 1.9e-13
CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4 ( 428) 368 74.5 2.3e-13
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 366 74.2 2.9e-13
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 344 70.4 3.7e-12
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 342 70.0 4.7e-12
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 339 69.6 7.2e-12
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 330 68.0 1.9e-11
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 321 66.4 5.2e-11
>>CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 (445 aa)
initn: 2967 init1: 2967 opt: 2967 Z-score: 2749.9 bits: 518.0 E(32554): 7.5e-147
Smith-Waterman score: 2967; 100.0% identity (100.0% similar) in 445 aa overlap (1-445:1-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDLELDEYYNKTLATENNTAATRNSDFPVWDDYKSSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNL
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CCDS38 MDLELDEYYNKTLATENNTAATRNSDFPVWDDYKSSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LILMALMKKRNQKTTVNFLIGNLAFSDILVVLFCSPFTLTSVLLDQWMFGKVMCHIMPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 LILMALMKKRNQKTTVNFLIGNLAFSDILVVLFCSPFTLTSVLLDQWMFGKVMCHIMPFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QCVSVLVSTLILISIAIVRYHMIKHPISNNLTANHGYFLIATVWTLGFAICSPLPVFHSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 QCVSVLVSTLILISIAIVRYHMIKHPISNNLTANHGYFLIATVWTLGFAICSPLPVFHSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VELQETFGSALLSSRYLCVESWPSDSYRIAFTISLLLVQYILPLVCLTVSHTSVCRSISC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 VELQETFGSALLSSRYLCVESWPSDSYRIAFTISLLLVQYILPLVCLTVSHTSVCRSISC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 GLSNKENRLEENEMINLTLHPSKKSGPQVKLSGSHKWSYSFIKKHRRRYSKKTACVLPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GLSNKENRLEENEMINLTLHPSKKSGPQVKLSGSHKWSYSFIKKHRRRYSKKTACVLPAP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ERPSQENHSRILPENFGSVRSQLSSSSKFIPGVPTCFEIKPEENSDVHELRVKRSVTRIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 ERPSQENHSRILPENFGSVRSQLSSSSKFIPGVPTCFEIKPEENSDVHELRVKRSVTRIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 KRSRSVFYRLTILILVFAVSWMPLHLFHVVTDFNDNLISNRHFKLVYCICHLLGMMSCCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KRSRSVFYRLTILILVFAVSWMPLHLFHVVTDFNDNLISNRHFKLVYCICHLLGMMSCCL
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB8 NPILYGFLNNGIKADLVSLIHCLHM
:::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NPILYGFLNNGIKADLVSLIHCLHM
430 440
>>CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 (384 aa)
initn: 653 init1: 369 opt: 481 Z-score: 458.2 bits: 93.7 E(32554): 3.4e-19
Smith-Waterman score: 504; 28.1% identity (54.8% similar) in 398 aa overlap (43-436:41-331)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 LATENNTAATRNSDFPVWDDYKSSVDDLQYFLIGL-YTFVSLLGFMGNLLILMALMKKRN
: ..: : : .:: ::: ... ..:...
CCDS34 NHSVHSNFSEKNAQLLAFENDDCHLPLAMIFTLALAYGAVIILGVSGNLALIIIILKQKE
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 QKTTVNFLIGNLAFSDILVVLFCSPFTLTSVLLDQWMFGKVMCHIMPFLQCVSVLVSTLI
.....:.:: ::.:::.::...: :::.. .:.:.:.::..::.. ::.::::. :: .
CCDS34 MRNVTNILIVNLSFSDLLVAIMCLPFTFVYTLMDHWVFGEAMCKLNPFVQCVSITVSIFS
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 LISIAIVRYHMIKHPISNNLTANHGYFLIATVWTLGFAICSPLPVFHSLVELQETFGSAL
:. ::. :...: .: . . :.: ::..:.: :. : :: . : .: : ..
CCDS34 LVLIAVERHQLIINPRGWRPNNRHAYVGIAVIWVL--AVASSLPFLIYQVMTDEPFQNVT
140 150 160 170 180
200 210 220 230 240
pF1KB8 LSS---RYLCVESWPSDSYRIAFTISLLLVQYILPLVCLTVSHTSVCRSISCGLSNKENR
:.. .:.: ...::::.:...: ::..::. :: :. .:
CCDS34 LDAYKDKYVCFDQFPSDSHRLSYTTLLLVLQYFGPL-CFIF----ICY------------
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LEENEMINLTLHPSKKSGPQVKLSGSHKWSYSFIKKHRRRYSKKTACVLPAPERPSQENH
:. .:. .::
CCDS34 --------------------FKI---------YIRLKRR---------------------
240
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SRILPENFGSVRSQLSSSSKFIPGVPTCFEIKPEENSDVHELRVKRSVTRIKKRSRSVFY
:. . ..: .. . :: .
CCDS34 -----------------------------------NNMMDKMRDNKYRSSETKR---INI
250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RLTILILVFAVSWMPLHLFHVVTDFNDNLISNRHFKLVYCICHLLGMMSCCLNPILYGFL
: ....::: :.:: .:..: :.: ..:.. . .:.. .::: .:.: :.:::.::::
CCDS34 MLLSIVVAFAVCWLPLTIFNTVFDWNHQIIATCNHNLLFLLCHLTAMISTCVNPIFYGFL
270 280 290 300 310 320
430 440
pF1KB8 NNGIKADLVSLIHCLHM
:.... ::
CCDS34 NKNFQRDLQFFFNFCDFRSRDDDYETIAMSTMHTDVSKTSLKQASPVAFKKINNNDDNEK
330 340 350 360 370 380
>>CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 (375 aa)
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Smith-Waterman score: 484; 25.1% identity (55.4% similar) in 406 aa overlap (39-440:39-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 YNKTLATENNTAATRNSDFPVWDDYKSSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMALMK
:.. :.. :.. ...: .::: .. . ..
CCDS73 LLLPKSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIETVVGVLGNLCLMCVTVR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KRNQKTTVNFLIGNLAFSDILVVLFCSPFTLTSVLLDQWMFGKVMCHIMPFLQCVSVLVS
.... ...:.::.::::::.:. :.:.:.: . ...: :.::...:.. :.::.:: ::
CCDS73 QKEKANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDYWIFGETLCKMSAFIQCMSVTVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TLILISIAIVRYHMIKHPISNNLTANHGYFLIATVWTLGFAICSPLPVFHSLVE--LQET
: :. .:. :...: .: . . . ...:. :. .:... .. :. . .:..: ....
CCDS73 ILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLSLPF-LANSILENVFHKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FGSAL--LSSRYLCVESWPSDSYRIAFTISLLLVQYILPLVCLTVSHTSVCRSISCGLSN
..:: :... .:.:::: .: .: ::: :: ::: . : .. . : ..
CCDS73 HSKALEFLADKVVCTESWPLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCYARIYRCLQ-----
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KENRLEENEMINLTLHPSKKSGPQVKLSGSHKWSYSFIKKHRRRYSKKTACVLPAPERPS
...:. :: .::. : . :.. ::
CCDS73 RQGRVF------------------------HKGTYSL----RAGHMKQVNVVL-------
250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 QENHSRILPENFGSVRSQLSSSSKFIPGVPTCFEIKPEENSDVHELRVKRSVTRIKKRSR
CCDS73 ------------------------------------------------------------
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SVFYRLTILILVFAVSWMPLHLFHVVTDFNDNLISNRHFKLVYCICHLLGMMSCCLNPIL
......::: :.:::.:. . :.. . : : .:.. .::::.: : :.::..
CCDS73 ------VVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDWHHEAIPICHGNLIFLVCHLLAMASTCVNPFI
270 280 290 300 310 320
430 440
pF1KB8 YGFLNNGIKADLVSLIHCLHM
:::::...: .. .:.
CCDS73 YGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAPLEESEHLPLSTVHTEVSKGSLRLSGRSNPI
330 340 350 360 370
>>CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 (375 aa)
initn: 629 init1: 326 opt: 448 Z-score: 427.9 bits: 88.1 E(32554): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 484; 25.1% identity (55.4% similar) in 406 aa overlap (39-440:39-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 YNKTLATENNTAATRNSDFPVWDDYKSSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMALMK
:.. :.. :.. ...: .::: .. . ..
CCDS81 LLLPKSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIETVVGVLGNLCLMCVTVR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KRNQKTTVNFLIGNLAFSDILVVLFCSPFTLTSVLLDQWMFGKVMCHIMPFLQCVSVLVS
.... ...:.::.::::::.:. :.:.:.: . ...: :.::...:.. :.::.:: ::
CCDS81 QKEKANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDYWIFGETLCKMSAFIQCMSVTVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TLILISIAIVRYHMIKHPISNNLTANHGYFLIATVWTLGFAICSPLPVFHSLVE--LQET
: :. .:. :...: .: . . . ...:. :. .:... .. :. . .:..: ....
CCDS81 ILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLSLPF-LANSILENVFHKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FGSAL--LSSRYLCVESWPSDSYRIAFTISLLLVQYILPLVCLTVSHTSVCRSISCGLSN
..:: :... .:.:::: .: .: ::: :: ::: . : .. . : ..
CCDS81 HSKALEFLADKVVCTESWPLAHHRTIYTTFLLLFQYCLPLGFILVCYARIYRRLQ-----
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KENRLEENEMINLTLHPSKKSGPQVKLSGSHKWSYSFIKKHRRRYSKKTACVLPAPERPS
...:. :: .::. : . :.. ::
CCDS81 RQGRVF------------------------HKGTYSL----RAGHMKQVNVVL-------
250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 QENHSRILPENFGSVRSQLSSSSKFIPGVPTCFEIKPEENSDVHELRVKRSVTRIKKRSR
CCDS81 ------------------------------------------------------------
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SVFYRLTILILVFAVSWMPLHLFHVVTDFNDNLISNRHFKLVYCICHLLGMMSCCLNPIL
......::: :.:::.:. . :.. . : : .:.. .::::.: : :.::..
CCDS81 ------VVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDWHHEAIPICHGNLIFLVCHLLAMASTCVNPFI
270 280 290 300 310 320
430 440
pF1KB8 YGFLNNGIKADLVSLIHCLHM
:::::...: .. .:.
CCDS81 YGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAPLEESEHLPLSTVHTEVSKGSLRLSGRSNPI
330 340 350 360 370
>>CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 (381 aa)
initn: 576 init1: 343 opt: 426 Z-score: 407.5 bits: 84.4 E(32554): 2.2e-16
Smith-Waterman score: 446; 25.4% identity (53.1% similar) in 409 aa overlap (39-442:48-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 YNKTLATENNTAATRNSDFPVWDDYKSSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMALMK
..: :: : . ::: .:: :.. ...:
CCDS37 KVEQYGPQTTPRGELVPDPEPELIDSTKLIEVQVVLILAYCSIILLGVIGNSLVIHVVIK
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KRNQKTTVNFLIGNLAFSDILVVLFCSPFTLTSVLLDQWMFGKVMCHIMPFLQCVSVLVS
....:..::.:.::: .:.:: .: ::::: .:. .: .: :.::..:. : ..: ::
CCDS37 FKSMRTVTNFFIANLAVADLLVNTLCLPFTLTYTLMGEWKMGPVLCHLVPYAQGLAVQVS
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TLILISIAIVRYHMIKHPISNNLTANHGYFLIATVWTLGFAICSPLPVF--HSLVELQET
:. : ::. :.. : . . .... ....:. .: .. . ::: .: .::.:.
CCDS37 TITLTVIALDRHRCIVYHLESKISKRISFLIIGLAWGISALLASPLAIFREYSLIEIIPD
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FGSALLSSRYLCVESWPSDS---YRIAFTISLLLVQYILPLVCLTVSHTSVCRSISCGLS
: ... :.:.::.. : ....: ::. :.::: .. :.: .
CCDS37 F--EIVA----CTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLILYVLPLGIISFSYTRI---------
200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NKENRLEENEMINLTLHPSKKSGPQVKLSGSHKWSYSFIKKHRRRYSKKTACVLPAPERP
::
CCDS37 ---------------------------------WS-------------------------
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SQENHSRILPENFGSVRSQLSSSSKFIPGVPTCFEIKPEENSDVHELRVKRSVTRIKKRS
. .:: ::. :. :. : : .:..
CCDS37 KLKNHVS--------------------PGAA---------NDHYHQRRQK--TTKM----
250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RSVFYRLTILILVFAVSWMPLHLFHVVTDFNDNLISNRHFKLVYCICHLLGMMSCCLNPI
:. ...::::::.::: :....:....... ...::.. . :...: : ::.
CCDS37 ------LVCVVVVFAVSWLPLHAFQLAVDIDSQVLDLKEYKLIFTVFHIIAMCSTFANPL
270 280 290 300 310 320
430 440
pF1KB8 LYGFLNNGIKADLVSLIHCLHM
:::..:.. . ..: ..:
CCDS37 LYGWMNSNYRKAFLSAFRCEQRLDAIHSEVSVTFKAKKNLEVRKNSGPNDSFTEATNV
330 340 350 360 370 380
>>CCDS7761.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 (447 aa)
initn: 430 init1: 252 opt: 398 Z-score: 380.8 bits: 79.6 E(32554): 6.8e-15
Smith-Waterman score: 407; 25.6% identity (55.6% similar) in 410 aa overlap (45-442:58-408)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 TENNTAATRNSDFPVWDDYKSSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMALMKKRNQKT
: ::. . :.. ::.::...: .: .:
CCDS77 LLNSSSVGNLSCEPPRIRGAGTRELELAIRITLYAVIFLMSVGGNMLIIVVLGLSRRLRT
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 TVNFLIGNLAFSDILVVLFCSPFTLTSVLLDQWMFGKVMCHIMPFLQCVSVLVSTLILIS
..: .. .:: ::.:... : :::: :. ..:: :.:. . .:. ::: :::: :..
CCDS77 VTNAFLLSLAVSDLLLAVACMPFTLLPNLMGTFIFGTVICKAVSYLMGVSVSVSTLSLVA
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 IAIVRYHMIKHPISNNL--TANHGYFLIATVWTLGFAICSPLPVFHSLVELQETFGSALL
::. :: : .:.. . : .:. .:...: :. . : ::. ..:. : .:
CCDS77 IALERYSAICRPLQARVWQTRSHAARVIVATWLLSGLLMVPYPVY-TVVQ---PVGPRVL
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240
pF1KB8 SSRYLCVESWPSDSYRIAFTISLLLVQYILPLVCLTVSHTSVCRSISCGL-------SNK
. ::. ::: : .... :::. ...: : ..:.. . : . :: :..
CCDS77 Q----CVHRWPSARVRQTWSVLLLLLLFFIPGVVMAVAYGLISRELYLGLRFDGDSDSDS
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ENRLEENEMINLTLHPSKKSGPQVKLSGSHKWSYSFIKKHRRRYSKKTACVLPAPE-RPS
..:.... . ..: . . :.. : . .: . :. ::.
CCDS77 QSRVRNQGGLPGAVHQNGRCRPETGAVGEDS----------------DGCYVQLPRSRPA
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 QENHSRILPENFGSVRSQLSSSSKFIPGVPTCFEIKPEENSDVHELRVKRSVTRIKKRSR
: :.. . :: . .: . .: .:. :.:.
CCDS77 LE----------------LTALTAPGPGSGS----RPTQA----KLLAKKRVVRM-----
310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SVFYRLTILILVFAVSWMPLHLFHVVTDFNDNLISNRHFKLV-YCICHLLGMMSCCLNPI
: .....: . :.:.. .. : :. ..: .. . . :::.. : :.::.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]