Result of FASTA (omim) for
pF1KB8829
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8829, 437 aa
1>>>pF1KB8829 437 - 437 aa - 437 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9428+/-0.000814; mu= 11.4413+/- 0.050
mean_var=344.1565+/-74.912, 0's: 0 Z-trim(112.1): 1954 B-trim: 64 in 1/48
Lambda= 0.069135
statistics sampled from 18578 (20843) to 18578 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 6.810
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2041 218.8 2.8e-56
NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 ( 529) 1962 210.9 6.5e-54
NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 is ( 532) 1962 210.9 6.5e-54
XP_016882732 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1843 198.9 2.3e-50
XP_011526571 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger ( 508) 1843 199.0 2.4e-50
NP_003428 (OMIM: 604078) zinc finger protein 136 [ ( 540) 1843 199.0 2.4e-50
XP_011526368 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 571) 1824 197.2 9.3e-50
XP_016882359 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 583) 1824 197.2 9.4e-50
NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 is ( 615) 1824 197.2 9.7e-50
XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1824 197.2 9.7e-50
XP_011526364 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1824 197.3 9.9e-50
NP_001157748 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 ( 663) 1824 197.3 1e-49
NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [ ( 671) 1800 194.9 5.3e-49
XP_011525924 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 639) 1790 193.9 1e-48
XP_016881629 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 673) 1790 193.9 1.1e-48
XP_016881628 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 685) 1790 193.9 1.1e-48
XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 718) 1790 194.0 1.1e-48
NP_001277012 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 429) 1775 192.1 2.4e-48
XP_011526082 (OMIM: 612248) PREDICTED: zinc finger ( 429) 1775 192.1 2.4e-48
NP_660338 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 i ( 461) 1775 192.1 2.5e-48
NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1710 185.9 2.6e-46
XP_005259991 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 503) 1695 184.2 6.6e-46
XP_016882360 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 503) 1695 184.2 6.6e-46
NP_001277013 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1593 173.8 6.4e-43
NP_001277014 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1593 173.8 6.4e-43
NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [H ( 545) 1575 172.3 2.7e-42
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1536 168.5 4.4e-41
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1512 166.1 2.3e-40
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1512 166.1 2.3e-40
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1512 166.1 2.3e-40
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1512 166.2 2.3e-40
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1512 166.2 2.3e-40
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1512 166.2 2.3e-40
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1512 166.2 2.3e-40
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1512 166.2 2.3e-40
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1512 166.2 2.3e-40
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1512 166.2 2.4e-40
XP_016882570 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1485 163.0 1.1e-39
XP_016882571 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1485 163.0 1.1e-39
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1487 163.6 1.2e-39
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1487 163.6 1.2e-39
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1487 163.7 1.3e-39
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1487 163.7 1.3e-39
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1433 158.3 5.5e-38
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1433 158.3 5.5e-38
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1433 158.4 5.8e-38
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1433 158.4 5.8e-38
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1433 158.4 5.8e-38
XP_016878355 (OMIM: 604752) PREDICTED: zinc finger ( 487) 1426 157.4 7.7e-38
XP_016878354 (OMIM: 604752) PREDICTED: zinc finger ( 711) 1426 157.7 9.2e-38
>>XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger pro (569 aa)
initn: 2941 init1: 1718 opt: 2041 Z-score: 1131.3 bits: 218.8 E(85289): 2.8e-56
Smith-Waterman score: 2041; 62.6% identity (81.2% similar) in 441 aa overlap (3-434:92-532)
10 20
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLN---KK
... : . :.:::::::::.: :: ::
XP_006 NLTSVGKSWKDQNIEYEYQNPRRNFRSLIEKKVNEIKDDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKK
70 80 90 100 110 120
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 TLPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHC
. : .:::.: .:::. .: :::: ::: : ::. .. :.. :: : .: .::. .
XP_006 ASPEIKSCDSFVCGEVGLGNSSFNMNIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYHPS
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 FRTHERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTH
::: .: :: :::. :::: :.::: .::.:..: :::::::::::::::. :::::: :
XP_006 FRTPQRDHTGEKPYACKECGKTFISHSSIQRHVVMHSGDGPYKCKFCGKAFHCLSLYLIH
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 ERTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTH
:: ::::: ::::::::.::. ...:::::::::::::::..:::.:. .::::: :
XP_006 ERIHTGEKPYECKQCGKSFSYSATLRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSPRCYRRHERIH
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 TGEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGER
:::: :.::::::::.::. . :::::. .::::: ::::: : ::. :.:::.:::
XP_006 TGEKAYQCKECGKAFTCPQYVRIHERTHSRKKPYECTQCGKALSSLTSFQTHIRMHSGER
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 PHKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGC
:..::::::.: : .::::::..:.:::::::::::::: :.:..:::: :::::: :
XP_006 PYECKICGKGFCSANSFQRHEKTHSGEKPYKCKQCGKAFIHSSSLRYHERIHTGEKPYEC
370 380 390 400 410 420
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 KQCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERT------HAGEKPY
:::::::::......:::::::::::::..:::::. ..... :::: :.::.::
XP_006 KQCGKAFRSSSHLQLHGRTHTGEKPYECQECGKAFRSMKNLQSHERTQTHVRIHSGERPY
430 440 450 460 470 480
390 400 410 420 430
pF1KB8 ECKHCGKAFTCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
.:: :::.: : .. ::. ::::: :.::.::.:: :: : ::::::
XP_006 KCKLCGKGFYCPKSLQRHEKTHTGEKLYECKQCGEAFSSSSSFRYHERTHTGEKPYKCKQ
490 500 510 520 530 540
XP_006 CGKAFRAASVLRMHGRTHPEDKPYECKQ
550 560
>>NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 iso (529 aa)
initn: 1914 init1: 1914 opt: 1962 Z-score: 1088.9 bits: 210.9 E(85289): 6.5e-54
Smith-Waterman score: 1962; 60.6% identity (81.6% similar) in 434 aa overlap (1-434:66-498)
10 20 30
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKT
: :.: :: :. .:::.:.:. .::::.::
NP_001 TFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYKNPRRNLSLMREKLCESKESHHCGESFNQIADDMLNRKT
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCF
:::. :::..:::. :.::.: .::.::::. . :.. :.::..:. .::.:. :
NP_001 LPGITPCESSVCGEVGTGHSSLNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFSYLDSF
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 RTHERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHE
..:.. :.:::.: ::: ..::: . :.:. : :::::::::::::::. :.: : ::
NP_001 QSHDKACTKEKPYDGKECTETFISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNLCLIHE
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 RTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHT
: ::: : :.::::::::. ... .::::::: . ::::::..:.: : .:::.:.::
NP_001 RIHTGVKPYKCKQCGKAFTRSTTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRHKRSHT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERP
:::::.::.:::.: ::.. :. ::::::::::: :::. ...: : ::::.:
NP_001 GEKPYECKQCGKVFISFSSIQYHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTHTGEKP
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 HKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCK
..:. ::::: :..::::..:: .::: ::::::.: :....: :::::.:::: ::
NP_001 YECRQCGKAFRCTSDLQRHEKTHTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEKPHECK
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 QCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGK
.:::.:. . .::: ::::::::.:::::::::. ::.: :::::.:.:::::: :::
NP_001 ECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYECKVCGK
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430
pF1KB8 AFTCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
::::: :: ::: :::::::.::.:::::: :.: : ::::::
NP_001 AFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECKHCGKAFI-SNYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGKAFIR
460 470 480 490 500 510
NP_001 ASSCREHERTHTINR
520
>>NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 isofor (532 aa)
initn: 1914 init1: 1914 opt: 1962 Z-score: 1088.9 bits: 210.9 E(85289): 6.5e-54
Smith-Waterman score: 1962; 60.6% identity (81.6% similar) in 434 aa overlap (1-434:69-501)
10 20 30
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKT
: :.: :: :. .:::.:.:. .::::.::
NP_066 TFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYKNPRRNLSLMREKLCESKESHHCGESFNQIADDMLNRKT
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCF
:::. :::..:::. :.::.: .::.::::. . :.. :.::..:. .::.:. :
NP_066 LPGITPCESSVCGEVGTGHSSLNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFSYLDSF
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 RTHERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHE
..:.. :.:::.: ::: ..::: . :.:. : :::::::::::::::. :.: : ::
NP_066 QSHDKACTKEKPYDGKECTETFISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNLCLIHE
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 RTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHT
: ::: : :.::::::::. ... .::::::: . ::::::..:.: : .:::.:.::
NP_066 RIHTGVKPYKCKQCGKAFTRSTTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRHKRSHT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERP
:::::.::.:::.: ::.. :. ::::::::::: :::. ...: : ::::.:
NP_066 GEKPYECKQCGKVFISFSSIQYHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTHTGEKP
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 HKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCK
..:. ::::: :..::::..:: .::: ::::::.: :....: :::::.:::: ::
NP_066 YECRQCGKAFRCTSDLQRHEKTHTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEKPHECK
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 QCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGK
.:::.:. . .::: ::::::::.:::::::::. ::.: :::::.:.:::::: :::
NP_066 ECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYECKVCGK
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430
pF1KB8 AFTCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
::::: :: ::: :::::::.::.:::::: :.: : ::::::
NP_066 AFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECKHCGKAFI-SNYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGKAFIR
460 470 480 490 500 510
NP_066 ASSCREHERTHTINR
520 530
>>XP_016882732 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger pro (474 aa)
initn: 1779 init1: 1779 opt: 1843 Z-score: 1025.2 bits: 198.9 E(85289): 2.3e-50
Smith-Waterman score: 1843; 60.4% identity (77.0% similar) in 434 aa overlap (1-434:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKTLPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDT
: :::... .::: : :.: .. :.:: .:::: ::: . ::. :: ::.::.:. .
XP_016 MLERLYQTKDGSQRGGIFSQFANQNLSKK-IPGVKLCESIVYGEVSMGQSSLNRHIKDHS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCFRTHERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRR
::.:.. :.. ::: ..: : .: : ::::: :: :: .::::: :.:.: :::
XP_016 GHEPKEYQEYGEKPDTRNQCWKPFSSHHSFRTHEIIHTGEKLYDCKECGKTFFSLKRIRR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 YMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERT
...:::: ::::: ::::.: : . ::::.::::: :::..:::::. .::: :
XP_016 HIITHSGYTPYKCKVCGKAFDYPSRFRTHERSHTGEKPYECQECGKAFTCITSVRRHMIK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 HTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGE
:::. ::.:: ::: :. :::. ::: ::::::.:::.:::::.: ... ::::::::
XP_016 HTGDGPYKCKVCGKPFHSLSSFQVHERIHTGEKPFKCKQCGKAFSCSPTLRIHERTHTGE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYK
:::::: :::.: : :.: : :.::::.: :: ::::: : :.:: :::.:::::::.
XP_016 KPYECKQCGKAFSYLPSLRLHERIHTGEKPFVCKQCGKAFRSASTFQIHERTHTGEKPYE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 CKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCKQCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQC
::.::.::.: :.. : :::: : :: ::: :.: . .::: ::::::::: ::.:
XP_016 CKECGEAFSCIPSMRRHMIKHTGEGPYKCKVCGKPFHSLSPFRIHERTHTGEKPYVCKHC
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGKAFTCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAF
:::: .:.. :::::.::::::::.:::::. .: :: :::::::..::.:::::
XP_016 GKAFVSSTSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSYLNSFRTHEMIHTGEKPFECKRCGKAF
360 370 380 390 400 410
430
pF1KB8 IRSSYCRKHERTHTINI
:: : ::::::
XP_016 RSSSSFRLHERTHTGQKPYHCKECGKAYSCRASFQRHMLTHAEDGPPYKCMWESL
420 430 440 450 460 470
>>XP_011526571 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger pro (508 aa)
initn: 1779 init1: 1779 opt: 1843 Z-score: 1025.0 bits: 199.0 E(85289): 2.4e-50
Smith-Waterman score: 1843; 60.4% identity (77.0% similar) in 434 aa overlap (1-434:35-467)
10 20 30
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKT
: :::... .::: : :.: .. :.::
XP_011 MRNLASIGKKWKDQNIKDHYKHRGRNLRSHMLERLYQTKDGSQRGGIFSQFANQNLSKK-
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCF
.:::: ::: . ::. :: ::.::.:. .::.:.. :.. ::: ..: : .: : :
XP_011 IPGVKLCESIVYGEVSMGQSSLNRHIKDHSGHEPKEYQEYGEKPDTRNQCWKPFSSHHSF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 RTHERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHE
:::: :: :: .::::: :.:.: :::...:::: ::::: ::::.: : . :::
XP_011 RTHEIIHTGEKLYDCKECGKTFFSLKRIRRHIITHSGYTPYKCKVCGKAFDYPSRFRTHE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 RTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHT
:.::::: :::..:::::. .::: : :::. ::.:: ::: :. :::. ::: ::
XP_011 RSHTGEKPYECQECGKAFTCITSVRRHMIKHTGDGPYKCKVCGKPFHSLSSFQVHERIHT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERP
::::.:::.:::::.: ... :::::::::::::: :::.: : :.: : :.::::.:
XP_011 GEKPFKCKQCGKAFSCSPTLRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSYLPSLRLHERIHTGEKP
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 HKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCK
:: ::::: : :.:: :::.:::::::.::.::.::.: :.. : :::: : ::
XP_011 FVCKQCGKAFRSASTFQIHERTHTGEKPYECKECGEAFSCIPSMRRHMIKHTGEGPYKCK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 QCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGK
::: :.: . .::: ::::::::: ::.::::: .:.. :::::.::::::::.:::
XP_011 VCGKPFHSLSPFRIHERTHTGEKPYVCKHCGKAFVSSTSIRIHERTHTGEKPYECKQCGK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KB8 AFTCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
::. .: :: :::::::..::.::::: :: : ::::::
XP_011 AFSYLNSFRTHEMIHTGEKPFECKRCGKAFRSSSSFRLHERTHTGQKPYHCKECGKAYSC
430 440 450 460 470 480
XP_011 RASFQRHMLTHAEDGPPYKCMWESL
490 500
>>NP_003428 (OMIM: 604078) zinc finger protein 136 [Homo (540 aa)
initn: 1779 init1: 1779 opt: 1843 Z-score: 1024.7 bits: 199.0 E(85289): 2.4e-50
Smith-Waterman score: 1843; 60.4% identity (77.0% similar) in 434 aa overlap (1-434:67-499)
10 20 30
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKT
: :::... .::: : :.: .. :.::
NP_003 MRNLASIGKKWKDQNIKDHYKHRGRNLRSHMLERLYQTKDGSQRGGIFSQFANQNLSKK-
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCF
.:::: ::: . ::. :: ::.::.:. .::.:.. :.. ::: ..: : .: : :
NP_003 IPGVKLCESIVYGEVSMGQSSLNRHIKDHSGHEPKEYQEYGEKPDTRNQCWKPFSSHHSF
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 RTHERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHE
:::: :: :: .::::: :.:.: :::...:::: ::::: ::::.: : . :::
NP_003 RTHEIIHTGEKLYDCKECGKTFFSLKRIRRHIITHSGYTPYKCKVCGKAFDYPSRFRTHE
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 RTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHT
:.::::: :::..:::::. .::: : :::. ::.:: ::: :. :::. ::: ::
NP_003 RSHTGEKPYECQECGKAFTCITSVRRHMIKHTGDGPYKCKVCGKPFHSLSSFQVHERIHT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERP
::::.:::.:::::.: ... :::::::::::::: :::.: : :.: : :.::::.:
NP_003 GEKPFKCKQCGKAFSCSPTLRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSYLPSLRLHERIHTGEKP
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 HKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCK
:: ::::: : :.:: :::.:::::::.::.::.::.: :.. : :::: : ::
NP_003 FVCKQCGKAFRSASTFQIHERTHTGEKPYECKECGEAFSCIPSMRRHMIKHTGEGPYKCK
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 QCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGK
::: :.: . .::: ::::::::: ::.::::: .:.. :::::.::::::::.:::
NP_003 VCGKPFHSLSPFRIHERTHTGEKPYVCKHCGKAFVSSTSIRIHERTHTGEKPYECKQCGK
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430
pF1KB8 AFTCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
::. .: :: :::::::..::.::::: :: : ::::::
NP_003 AFSYLNSFRTHEMIHTGEKPFECKRCGKAFRSSSSFRLHERTHTGQKPYHCKECGKAYSC
460 470 480 490 500 510
NP_003 RASFQRHMLTHAEDGPPYKCMWESL
520 530 540
>>XP_011526368 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger pro (571 aa)
initn: 1652 init1: 1652 opt: 1824 Z-score: 1014.3 bits: 197.2 E(85289): 9.3e-50
Smith-Waterman score: 1824; 58.8% identity (79.4% similar) in 432 aa overlap (3-434:25-455)
10 20 30
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKTLPGVKSCE
::. .: .:::::::..:. ....::.: : .:
XP_011 MKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSIVNKNTPARVDACG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCFRTHERPHT
:.. ::..::.::.: ::.::::. ..:... :: : ::: :.::. : :.: :::::
XP_011 SSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLSYRHSFQTCERPHT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 REKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERTHTGEKR
.::.::::: :.: ::...::.::...:::::::..::::. :: :::::::::
XP_011 GKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSLLRMHERTHTGEKP
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 YECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGEKPYKCK
::::::.::: .:: ::. ::::::::::.:.:.: ::. :::::::::::::::
XP_011 YECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLRHERTHTGEKPYKCK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 ECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHKCKICGK
.:::::. .:.. ::: ::::::: :: :::. .: ::.::: ::.:. :::::::::
XP_011 QCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMHSGDGPHKCKICGK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 AFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCKQCGKAFRS
.: :.: . :: .:: ::::.:::::: .. .::. : .:::. : : ::::: :
XP_011 GFDFPGSARIHEGTHTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVCGKAFDS
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 AKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGKAFTCSIYI
. .. : ::::::::::::::::::. ::...:: ::.::.::.:: :::::. . .
XP_011 PSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKCK-CGKAFSDLFSF
370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KB8 RIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
. :: :. :.::.:::::::: .: .:::::.
XP_011 QSHETTHSEEEPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHE
420 430 440 450 460 470
XP_011 RTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHT
480 490 500 510 520 530
>--
initn: 999 init1: 537 opt: 537 Z-score: 320.5 bits: 68.8 E(85289): 4.1e-11
Smith-Waterman score: 537; 69.2% identity (85.0% similar) in 107 aa overlap (131-237:460-566)
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 KPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERTHTGEKRYE
:.:..::::.. .: :::::::.:: ::
XP_011 EPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYE
430 440 450 460 470 480
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 CKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGEKPYKCKEC
:::: ::: : : . ::::::::.:::::.:::.:. :: :.:::::::::::.::::
XP_011 CKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKEC
490 500 510 520 530 540
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 GKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHKCKICGKAF
::::. :::.::.:::
XP_011 GKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL
550 560 570
>>XP_016882359 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger pro (583 aa)
initn: 1652 init1: 1652 opt: 1824 Z-score: 1014.2 bits: 197.2 E(85289): 9.4e-50
Smith-Waterman score: 1824; 58.8% identity (79.4% similar) in 432 aa overlap (3-434:37-467)
10 20 30
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKTLP
::. .: .:::::::..:. ....::.:
XP_016 NLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSIVNKNTPA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 GVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCFRT
: .: :.. ::..::.::.: ::.::::. ..:... :: : ::: :.::. : :.:
XP_016 RVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLSYRHSFQT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 HERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERT
::::: .::.::::: :.: ::...::.::...:::::::..::::. :: ::::
XP_016 CERPHTGKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSLLRMHERT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 HTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGE
::::: ::::::.::: .:: ::. ::::::::::.:.:.: ::. :::::::::
XP_016 HTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLRHERTHTGE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 KPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHK
::::::.:::::. .:.. ::: ::::::: :: :::. .: ::.::: ::.:. :::
XP_016 KPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMHSGDGPHK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 CKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCKQC
::::::.: :.: . :: .:: ::::.:::::: .. .::. : .:::. : : :
XP_016 CKICGKGFDFPGSARIHEGTHTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVC
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 GKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGKAF
:::: : . .. : ::::::::::::::::::. ::...:: ::.::.::.:: :::::
XP_016 GKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKCK-CGKAF
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KB8 TCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
. . .. :: :. :.::.:::::::: .: .:::::.
XP_016 SDLFSFQSHETTHSEEEPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFS
430 440 450 460 470 480
XP_016 YLKTHERTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCRE
490 500 510 520 530 540
>--
initn: 999 init1: 537 opt: 537 Z-score: 320.5 bits: 68.8 E(85289): 4.1e-11
Smith-Waterman score: 537; 69.2% identity (85.0% similar) in 107 aa overlap (131-237:472-578)
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 KPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERTHTGEKRYE
:.:..::::.. .: :::::::.:: ::
XP_016 EPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYE
450 460 470 480 490 500
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 CKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGEKPYKCKEC
:::: ::: : : . ::::::::.:::::.:::.:. :: :.:::::::::::.::::
XP_016 CKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKEC
510 520 530 540 550 560
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 GKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHKCKICGKAF
::::. :::.::.:::
XP_016 GKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL
570 580
>>NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 isofor (615 aa)
initn: 1652 init1: 1652 opt: 1824 Z-score: 1014.0 bits: 197.2 E(85289): 9.7e-50
Smith-Waterman score: 1824; 58.8% identity (79.4% similar) in 432 aa overlap (3-434:69-499)
10 20 30
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKTLP
::. .: .:::::::..:. ....::.:
NP_057 NLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSIVNKNTPA
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 GVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCFRT
: .: :.. ::..::.::.: ::.::::. ..:... :: : ::: :.::. : :.:
NP_057 RVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLSYRHSFQT
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 HERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERT
::::: .::.::::: :.: ::...::.::...:::::::..::::. :: ::::
NP_057 CERPHTGKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSLLRMHERT
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 HTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGE
::::: ::::::.::: .:: ::. ::::::::::.:.:.: ::. :::::::::
NP_057 HTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLRHERTHTGE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 KPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHK
::::::.:::::. .:.. ::: ::::::: :: :::. .: ::.::: ::.:. :::
NP_057 KPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMHSGDGPHK
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 CKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCKQC
::::::.: :.: . :: .:: ::::.:::::: .. .::. : .:::. : : :
NP_057 CKICGKGFDFPGSARIHEGTHTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVC
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 GKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGKAF
:::: : . .. : ::::::::::::::::::. ::...:: ::.::.::.:: :::::
NP_057 GKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKCK-CGKAF
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430
pF1KB8 TCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
. . .. :: :. :.::.:::::::: .: .:::::.
NP_057 SDLFSFQSHETTHSEEEPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFS
460 470 480 490 500 510
NP_057 YLKTHERTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCRE
520 530 540 550 560 570
>--
initn: 999 init1: 537 opt: 537 Z-score: 320.3 bits: 68.9 E(85289): 4.2e-11
Smith-Waterman score: 537; 69.2% identity (85.0% similar) in 107 aa overlap (131-237:504-610)
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 KPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERTHTGEKRYE
:.:..::::.. .: :::::::.:: ::
NP_057 EPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYE
480 490 500 510 520 530
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 CKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGEKPYKCKEC
:::: ::: : : . ::::::::.:::::.:::.:. :: :.:::::::::::.::::
NP_057 CKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKEC
540 550 560 570 580 590
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 GKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHKCKICGKAF
::::. :::.::.:::
NP_057 GKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL
600 610
>>XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger pro (616 aa)
initn: 1652 init1: 1652 opt: 1824 Z-score: 1014.0 bits: 197.2 E(85289): 9.7e-50
Smith-Waterman score: 1824; 58.8% identity (79.4% similar) in 432 aa overlap (3-434:70-500)
10 20 30
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKTLP
::. .: .:::::::..:. ....::.:
XP_011 NLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSIVNKNTPA
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 GVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCFRT
: .: :.. ::..::.::.: ::.::::. ..:... :: : ::: :.::. : :.:
XP_011 RVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLSYRHSFQT
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 HERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERT
::::: .::.::::: :.: ::...::.::...:::::::..::::. :: ::::
XP_011 CERPHTGKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSLLRMHERT
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 HTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGE
::::: ::::::.::: .:: ::. ::::::::::.:.:.: ::. :::::::::
XP_011 HTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLRHERTHTGE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 KPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHK
::::::.:::::. .:.. ::: ::::::: :: :::. .: ::.::: ::.:. :::
XP_011 KPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMHSGDGPHK
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 CKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCKQC
::::::.: :.: . :: .:: ::::.:::::: .. .::. : .:::. : : :
XP_011 CKICGKGFDFPGSARIHEGTHTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVC
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 GKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGKAF
:::: : . .. : ::::::::::::::::::. ::...:: ::.::.::.:: :::::
XP_011 GKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKCK-CGKAF
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430
pF1KB8 TCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
. . .. :: :. :.::.:::::::: .: .:::::.
XP_011 SDLFSFQSHETTHSEEEPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFS
460 470 480 490 500 510
XP_011 YLKTHERTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCRE
520 530 540 550 560 570
>--
initn: 999 init1: 537 opt: 537 Z-score: 320.2 bits: 68.9 E(85289): 4.2e-11
Smith-Waterman score: 537; 69.2% identity (85.0% similar) in 107 aa overlap (131-237:505-611)
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 KPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERTHTGEKRYE
:.:..::::.. .: :::::::.:: ::
XP_011 EPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYE
480 490 500 510 520 530
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 CKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGEKPYKCKEC
:::: ::: : : . ::::::::.:::::.:::.:. :: :.:::::::::::.::::
XP_011 CKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKEC
540 550 560 570 580 590
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 GKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHKCKICGKAF
::::. :::.::.:::
XP_011 GKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL
600 610
437 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 09:41:53 2016 done: Sat Nov 5 09:41:54 2016
Total Scan time: 6.810 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]