Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8817
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8817, 381 aa
1>>>pF1KB8817 381 - 381 aa - 381 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0691+/-0.00106; mu= 18.0322+/- 0.064
mean_var=107.1086+/-30.071, 0's: 0 Z-trim(103.5): 323 B-trim: 936 in 2/49
Lambda= 0.123926
statistics sampled from 6945 (7464) to 6945 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 2478 454.5 7e-128
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 694 135.6 7.2e-32
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 618 122.0 9.6e-28
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 586 116.3 4.9e-26
CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 ( 375) 580 115.2 9.9e-26
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 578 114.8 1.3e-25
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 ( 375) 574 114.1 2.1e-25
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 540 107.9 1.2e-23
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 530 106.3 4.9e-23
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 528 105.9 6.4e-23
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 528 106.0 7.1e-23
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 526 105.5 7.6e-23
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 525 105.4 9.4e-23
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 506 102.0 9.8e-22
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 491 99.3 6.2e-21
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 482 97.7 1.9e-20
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 476 96.6 4e-20
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 475 96.4 4.4e-20
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 462 94.1 2.3e-19
CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 ( 430) 436 89.5 6e-18
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 434 89.1 7.6e-18
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 434 89.1 7.7e-18
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 434 89.3 8.7e-18
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 430 88.4 1.3e-17
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 430 88.4 1.3e-17
CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 ( 445) 426 87.7 2.1e-17
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 425 87.5 2.2e-17
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 422 87.0 3.5e-17
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 416 85.9 6.8e-17
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 411 85.0 1.2e-16
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 403 83.6 3.4e-16
CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 436) 401 83.3 4.7e-16
CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 442) 401 83.3 4.7e-16
CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 532) 401 83.4 5.3e-16
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 391 81.4 1.4e-15
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 391 81.4 1.5e-15
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 391 81.4 1.5e-15
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 387 80.7 2.6e-15
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 387 80.7 2.6e-15
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 383 79.9 3.7e-15
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 ( 415) 379 79.3 6.9e-15
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 372 78.0 1.5e-14
CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 ( 337) 368 77.2 2.4e-14
CCDS7761.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 ( 447) 368 77.4 2.8e-14
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 362 76.1 4.9e-14
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 355 75.0 1.3e-13
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 355 75.0 1.3e-13
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 355 75.0 1.3e-13
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 355 75.0 1.3e-13
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 355 75.0 1.3e-13
>>CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 (381 aa)
initn: 2478 init1: 2478 opt: 2478 Z-score: 2409.3 bits: 454.5 E(32554): 7e-128
Smith-Waterman score: 2478; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGPIGAEADENQTVEEMKVEQYGPQTTPRGELVPDPEPELIDSTKLIEVQVVLILAYCSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MGPIGAEADENQTVEEMKVEQYGPQTTPRGELVPDPEPELIDSTKLIEVQVVLILAYCSI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ILLGVIGNSLVIHVVIKFKSMRTVTNFFIANLAVADLLVNTLCLPFTLTYTLMGEWKMGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ILLGVIGNSLVIHVVIKFKSMRTVTNFFIANLAVADLLVNTLCLPFTLTYTLMGEWKMGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VLCHLVPYAQGLAVQVSTITLTVIALDRHRCIVYHLESKISKRISFLIIGLAWGISALLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VLCHLVPYAQGLAVQVSTITLTVIALDRHRCIVYHLESKISKRISFLIIGLAWGISALLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SPLAIFREYSLIEIIPDFEIVACTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLILYVLPLGIISFSYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SPLAIFREYSLIEIIPDFEIVACTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLILYVLPLGIISFSYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RIWSKLKNHVSPGAANDHYHQRRQKTTKMLVCVVVVFAVSWLPLHAFQLAVDIDSQVLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RIWSKLKNHVSPGAANDHYHQRRQKTTKMLVCVVVVFAVSWLPLHAFQLAVDIDSQVLDL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KEYKLIFTVFHIIAMCSTFANPLLYGWMNSNYRKAFLSAFRCEQRLDAIHSEVSVTFKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KEYKLIFTVFHIIAMCSTFANPLLYGWMNSNYRKAFLSAFRCEQRLDAIHSEVSVTFKAK
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB8 KNLEVRKNSGPNDSFTEATNV
:::::::::::::::::::::
CCDS37 KNLEVRKNSGPNDSFTEATNV
370 380
>>CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 (370 aa)
initn: 665 init1: 226 opt: 694 Z-score: 685.7 bits: 135.6 E(32554): 7.2e-32
Smith-Waterman score: 694; 35.6% identity (68.4% similar) in 329 aa overlap (30-352:41-362)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGPIGAEADENQTVEEMKVEQYGPQTTPRGELVPDPEPELIDSTKLI-EVQVVLILAYC
: .: : ..: .:. ... ...: :
CCDS76 VSDLFSGLPPAVTTPANQSAEASAGNGSVAGADAPAVTP--FQSLQLVHQLKGLIVLLYS
20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 SIILLGVIGNSLVIHVVIKFKSMRTVTNFFIANLAVADLLVNTLCLPFTLTYTLMGE-WK
....:..:: :.. :. . . ...::::.:.:::..:.:. : :.:.::.:.. . :
CCDS76 VVVVVGLVGNCLLVLVIARVRRLHNVTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAYAFEPRGWV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 MGPVLCHLVPYAQGLAVQVSTITLTVIALDRHRCIVYHLESKISKRISFLIIGLAWGISA
.: ::::: . : ..: ::..:::.::.::. .:. :. .:: :.: . :..::
CCDS76 FGGGLCHLVFFLQPVTVYVSVFTLTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAVLAIWALSA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LLASPLAIFREYSLIEIIPDFEIVACTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLILYVLPLGIISF
.:: : :. . .:. : .. : : : ..:.. .:. . ::. :.::: .: .
CCDS76 VLALPAAVHTYH--VELKPH-DVRLCEEFWGSQERQ--RQLYAWGLLLVTYLLPLLVILL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SYTRIWSKLKNHVSPGAAN----DHYHQRRQKTTKMLVCVVVVFAVSWLPLHAFQLAVDI
::.:. ::.:.: :: .. : . ::..: .:: .:::::: :::::.:.: :.
CCDS76 SYVRVSVKLRNRVVPGCVTQSQADWDRARRRRTFCLLVVIVVVFAVCWLPLHVFNLLRDL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DSQVLDLKEYKLIFTVFHIIAMCSTFANPLLYGWMNSNYRKAFLSAFRCEQRLDAIHSEV
: ...: . :. . : .:: :. ::..:.:.....:. . . . : : :..
CCDS76 DPHAIDPYAFGLVQLLCHWLAMSSACYNPFIYAWLHDSFREELRKLLVAWPRKIAPHGQN
310 320 330 340 350 360
360 370 380
pF1KB8 SVTFKAKKNLEVRKNSGPNDSFTEATNV
CCDS76 MTVSVVI
370
>>CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 (423 aa)
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Smith-Waterman score: 618; 35.6% identity (69.6% similar) in 303 aa overlap (49-344:70-365)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 VEQYGPQTTPRGELVPDPEPELIDSTKLIEVQVVLILAYCSIILLGVIGNSLVIHVVIKF
:...::.:: ::.....:: :: ::..:
CCDS82 HFFSWNNYTFSDWQNFVGRRRYGAESQNPTVKALLIVAYSFIIVFSLFGNVLVCHVIFKN
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 KSMRTVTNFFIANLAVADLLVNTLCLPFTLTYTLMGEWKMGPVLCHLVPYAQGLAVQVST
. :...:..::.::::::.... : ::::. . . : .: .::. .:: ...::.
CCDS82 QRMHSATSLFIVNLAVADIMITLLNTPFTLVRFVNSTWIFGKGMCHVSRFAQYCSLHVSA
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 ITLTVIALDRHRCIVYHLESKISKRISFLIIGLAWGISALLASPLAIFREYSLIEIIPDF
.:::.::.:::. :.. :. .:: . . :.. : ...... : :: .. .. :.
CCDS82 LTLTAIAVDRHQVIMHPLKPRISITKGVIYIAVIWTMATFFSLPHAICQKLFTFKYSEDI
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 EIVACTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLILYVLPLGIISFSYTRIWSKLK--NHVSPGAAN
: .: : ... .:.....::.::: ::: .:.:. .:: : .. ...
CCDS82 VRSLCLPDFP-EPADLFWKYLDLATFILLYILPLLIISVAYARVAKKLWLCNMIGDVTTE
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 DHYHQRRQK--TTKMLVCVVVVFAVSWLPLHAFQLAVDIDSQVLDLKEYKLIFTVFHIIA
... ::.: : :::. :::.::. :.::. . : ..:.: .. . .. .:: .:
CCDS82 QYFALRRKKKKTIKMLMLVVVLFALCWFPLNCYVLL--LSSKV--IRTNNALYFAFHWFA
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 MCSTFANPLLYGWMNSNYR---KAFLSAFRCEQRLDAIHSEVSVTFKAKKNLEVRKNSGP
: :: ::..: :.: :.: ::.:: :..
CCDS82 MSSTCYNPFIYCWLNENFRIELKALLSM--CQRPPKPQEDRPPSPVPSFRVAWTEKNDGQ
340 350 360 370 380 390
380
pF1KB8 NDSFTEATNV
CCDS82 RAPLANNLLPTSQLQSGKTDLSSVEPIVTMS
400 410 420
>>CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 (407 aa)
initn: 444 init1: 263 opt: 586 Z-score: 580.8 bits: 116.3 E(32554): 4.9e-26
Smith-Waterman score: 586; 30.4% identity (62.6% similar) in 342 aa overlap (31-366:10-345)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGPIGAEADENQTVEEMKVEQYGPQTTPRGELVPDPEPELIDSTKLIEV--QVVL-ILAY
.: :. . . ..... :.:: ::
CCDS19 MDNVLPVDSDLSPNISTNTSEPNQFVQPAWQIVLWAAAY
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 CSIILLGVIGNSLVIHVVIKFKSMRTVTNFFIANLAVADLLVNTLCLPFTLTYTLMGEWK
:.. .:.:: .:. ... : ::::::.:..::: :. . .. ..::.. .::
CCDS19 TVIVVTSVVGNVVVMWIILAHKRMRTVTNYFLVNLAFAEASMAAFNTVVNFTYAVHNEWY
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 MGPVLCHLVPYAQGLAVQVSTITLTVIALDRHRCIVYHLESKISKRISFLIIGLAWGISA
.: :.. . :: .: ..:..:.::. :.. :. ..: . ..: . : ..
CCDS19 YGLFYCKFHNFFPIAAVFASIYSMTAVAFDRYMAIIHPLQPRLSATATKVVICVIWVLAL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LLASPLAIFREYSLIEIIPDFEIVACTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLILYVLPLGIISF
::: : . :: : .:. :.: .:: . ..:: :: . ...: ::: .:..
CCDS19 LLAFPQGY---YSTTETMPSR--VVCMIEWPEHPNKIYEKVYHICVTVLIYFLPLLVIGY
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SYTRIWSKLKNHVSPGAANDHYHQR---RQKTTKMLVCVVVVFAVSWLPLHAFQLAVDID
.:: . : :: ..:.::.. ..:..::.. :: .::. :::.: : : :.
CCDS19 AYTVVGITLWASEIPGDSSDRYHEQVSAKRKVVKMMIVVVCTFAICWLPFHIFFLLPYIN
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 SQVLDLKEYKLIFTVFHIIAMCSTFANPLLYGWMNSNYRKAFLSAFRCEQRLDAIHSEVS
.. : . .. .. .:: ::. ::..: .:. .: .: :::: ..: : .
CCDS19 PDLYLKKFIQQVYLAIMWLAMSSTMYNPIIYCCLNDRFRLGFKHAFRCCPFISAGDYE-G
280 290 300 310 320 330
360 370 380
pF1KB8 VTFKAKKNLEVRKNSGPNDSFTEATNV
. .:. . :...
CCDS19 LEMKSTRYLQTQGSVYKVSRLETTISTVVGAHEEEPEDGPKATPSSLDLTSNCSSRSDSK
340 350 360 370 380 390
>>CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 (375 aa)
initn: 576 init1: 286 opt: 580 Z-score: 575.5 bits: 115.2 E(32554): 9.9e-26
Smith-Waterman score: 592; 32.3% identity (61.5% similar) in 371 aa overlap (24-371:15-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGPIGAEADENQTVEEMKVEQYGPQTTPRGELVPDPEPELIDSTKLIEVQVVLILAYCSI
:: :.. . : ..:.: .. .:
CCDS81 MNTSHLLALLLPKSPQGENRSKPLGTPYNFSEHCQDSVDVMVFIVTSYSIE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ILLGVIGNSLVIHVVIKFKSMRTVTNFFIANLAVADLLVNTLCLPFTLTYTLMGEWKMGP
..::.:: .. :... : .:::..::::: .:.:. :: :.: .::.: : .:
CCDS81 TVVGVLGNLCLMCVTVRQKEKANVTNLLIANLAFSDFLMCLLCQPLTAVYTIMDYWIFGE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VLCHLVPYAQGLAVQVSTITLTVIALDRHRCIVYHLESKISKRISFLIIGLAWGISALLA
.::.. . : ..: :: ..:...::.::. :. : : ..: : : : :. .:.
CCDS81 TLCKMSAFIQCMSVTVSILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB8 SPL-------AIF-REYS-LIEIIPDFEIVACTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLILYVLP
:. .: ...: .:.. : :.:::.:: .. :.:. ::. : ::
CCDS81 LPFLANSILENVFHKNHSKALEFLAD--KVVCTESWPLAHHR---TIYTTFLLLFQYCLP
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB8 LGIISFSYTRIWSKLKNH---VSPGAANDHYHQRRQKTTKMLVCVVVVFAVSWLPLHAFQ
::.: :.::. .:. . :. . . . .: .. .:: .::.::: :::::.:.
CCDS81 LGFILVCYARIYRRLQRQGRVFHKGTYSLRAGHMKQVNV-VLVVMVVAFAVLWLPLHVFN
230 240 250 260 270 280
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: ... . . .::: : :..:: :: .::..::..:.:..: . . .. :.:
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CCDS81 LEESEHLPLSTVHTEVS-----KGSLRLSGRSNPI
350 360 370
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...:.. . : . ::. .::.::: :::: :. . : . :.. ...:.: . :. :
CCDS34 DNKYRSSETKRINIMLLSIVVAFAVCWLPLTIFNTVFDWNHQIIATCNHNLLFLLCHLTA
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CCDS34 VAFKKINNNDDNEKI
370 380
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CCDS73 TLCKMSAFIQCMSVTVSILSLVLVALERHQLIINPTGWKPSISQAYLGIVLIWVIACVLS
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CCDS73 LPFLANSILENVFHKNHSKALEFLAD--KVVCTESWPLAHHR---TIYTTFLLLFQYCLP
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CCDS73 LGFILVCYARIYRCLQRQGRVFHKGTYSLRAGHMKQVNV-VLVVMVVAFAVLWLPLHVFN
230 240 250 260 270 280
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pF1KB8 LAVDIDSQVLDLKEYKLIFTVFHIIAMCSTFANPLLYGWMNSNYRKAFLS-AFRCEQR--
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CCDS73 SLEDWHHEAIPICHGNLIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAP
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CCDS73 LEESEHLPLSTVHTEVS-----KGSLRLSGRSNPI
350 360 370
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CCDS46 TVIVVTSVVGNVVVMWIILAHKRMRTVTNYFLVNLAFAEASMAAFNTVVNFTYAVHNEWY
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CCDS46 YGLFYCKFHNFFPIAAVFASIYSMTAVAFDRYMAIIHPLQPRLSATATKVVICVIWVLAL
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CCDS46 AYTVVGITLWASEIPGDSSDRYHEQVSAKRKVVKMMIVVVCTFAICWLPFHIFFLLPYIN
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CCDS46 PDLYLKKFIQQVYLAIMWLAMSSTMYNPIIYCCLNDR
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CCDS13 QNGNTSFTPNFNPPQDHASSLSFNFSYGDYDLPMDEDEDMTKTRTFFAAKIVIGIALAGI
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.:. ::: . : .. ..:..:..::..:::::..:.:: .: :: . : .. . :.
CCDS13 MLVCGIGNFVFIAALTRYKKLRNLTNLLIANLAISDFLVAIICCPFEMDYYVVRQLSWEH
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CCDS13 GHVLCASVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLKPRMNYQTASFLIALVWMVSIL
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CCDS13 IAIPSAYFATETVLFIVKSQEKIFCGQIWPVDQQ-LYYKSYFLFIFGVEFVGPVVTMTLC
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CCDS13 YARISRELWFKAVPGFQTEQIRKRLRCRRKTVLVLMCILTAYVLCWAPFYGFTIVRDFFP
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CCDS13 TVFVKEKHYLTAFYVVECIAMSNSMINTVCFVTVKNNTMKYF-------KKMMLLHWRPS
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CCDS13 QRGSKSSADLDLRTNGVPTTEEVDCIRLK
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CCDS18 TSFLSVLNPHGAHATSFPFNFSYSDYDMPLDEDEDVTNSRTFFAAKIVIGMALVGIMLVC
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CCDS18 GIGNFIFIAALVRYKKLRNLTNLLIANLAISDFLVAIVCCPFEMDYYVVRQLSWEHGHVL
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CCDS18 CTSVNYLRTVSLYVSTNALLAIAIDRYLAIVHPLRPRMKCQTATGLIALVWTVSILIAIP
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CCDS18 SAYFTTETVLVIVKSQEKIFCGQIWPVDQQLYYKS-YFLFIFGIEFVGPVVTMTLCYARI
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CCDS18 SRELWFKAVPGFQTEQIRKRLRCRRKTVLVLMCILTAYVLCWAPFYGFTIVRDFFPTVFV
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pF1KB8 DLKEYKLIFTVFHIIAMCSTFANPLLYGWMNSNYRKAFLSAFRCEQRLDAIHSEVSVTFK
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CCDS18 KEKHYLTAFYIVECIAMSNSMINTLCFVTVKNDTVKYFKKIMLLHWKASYNGGKSSADLD
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pF1KB8 AKKNLEVRKNSGPNDSFTEATNV
CCDS18 LKTIGMPATEEVDCIRLK
380 390
381 residues in 1 query sequences
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]