Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8807
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8807, 355 aa
1>>>pF1KB8807 355 - 355 aa - 355 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2551+/-0.00113; mu= 16.2069+/- 0.066
mean_var=109.3116+/-33.477, 0's: 0 Z-trim(103.0): 294 B-trim: 1007 in 2/48
Lambda= 0.122671
statistics sampled from 6713 (7213) to 6713 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 2346 426.8 1.4e-119
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 2346 426.8 1.4e-119
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 1528 282.0 5.1e-76
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 1235 230.2 2.1e-60
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 1230 229.3 3.8e-60
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 1152 215.5 5.7e-56
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 1069 200.8 1.5e-51
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 925 175.3 6.8e-44
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 902 171.3 1.1e-42
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 902 171.3 1.2e-42
CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 344) 853 162.6 4.6e-40
CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 356) 853 162.6 4.7e-40
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 782 150.1 3e-36
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 748 144.0 1.8e-34
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 748 144.0 1.9e-34
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 742 143.0 4e-34
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 711 137.5 1.8e-32
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 711 137.5 1.8e-32
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 677 131.4 1.1e-30
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 677 131.4 1.1e-30
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 677 131.4 1.1e-30
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 647 126.1 4.4e-29
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 643 125.4 7.4e-29
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 643 125.5 8e-29
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 623 121.9 8.3e-28
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 607 119.1 6.2e-27
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 595 117.0 2.8e-26
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 595 117.0 2.8e-26
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 592 116.4 3.8e-26
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 585 115.2 9e-26
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 560 110.8 2e-24
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 553 109.5 4.4e-24
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 552 109.3 5.2e-24
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 549 108.8 7.8e-24
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 549 108.8 7.8e-24
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 549 108.8 7.9e-24
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 549 108.8 7.9e-24
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 549 108.8 8e-24
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 549 108.8 8e-24
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 549 108.9 8.2e-24
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 549 108.9 8.2e-24
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 549 108.9 8.5e-24
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 549 108.9 9.1e-24
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 538 106.8 2.9e-23
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 503 100.7 2.1e-21
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 496 99.4 5.2e-21
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 493 98.8 6.8e-21
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 493 98.9 7e-21
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 490 98.4 1.1e-20
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 489 98.2 1.2e-20
>>CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 2346 init1: 2346 opt: 2346 Z-score: 2260.6 bits: 426.8 E(32554): 1.4e-119
Smith-Waterman score: 2346; 100.0% identity (100.0% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 YAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELSIVF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 YAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELSIVF
310 320 330 340 350
>>CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 (376 aa)
initn: 2346 init1: 2346 opt: 2346 Z-score: 2260.3 bits: 426.8 E(32554): 1.4e-119
Smith-Waterman score: 2346; 100.0% identity (100.0% similar) in 355 aa overlap (1-355:22-376)
10 20 30
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MPFGIRMLLRAHKPGSSRRSEMTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LYSLVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LYSLVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNW
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 VFGHGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFGHGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 LAVLAALPEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAVLAALPEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 TGIIKTLLRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TGIIKTLLRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 DLVMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DLVMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERT
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KB8 SSVSPSTAEPELSIVF
::::::::::::::::
CCDS54 SSVSPSTAEPELSIVF
370
>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 1510 init1: 1510 opt: 1528 Z-score: 1478.2 bits: 282.0 E(32554): 5.1e-76
Smith-Waterman score: 1528; 63.2% identity (86.3% similar) in 351 aa overlap (6-355:5-355)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMIL
.:.: . ::. .: . :.:.. ::. ::..::::::::..::.::..::..:
CCDS27 METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILVVLVL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 IKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYS
..:.::. ::.:::::::::::::: :::::: : .:::: .:::.:::::.:::::
CCDS27 VQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGFYYTGLYS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 EIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.::.::..: . : .:. :
CCDS27 EIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQWEFT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIR
. :: .:.... :. :..:....: :::::::: :::::::: ::: :..:: ::.:
CCDS27 HHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNEKKSKAVR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPV
:::::: .::.::::::..::.: .:..:: ..::.:.::::.. :::::::.:::.:::
CCDS27 LIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAYTHCCVNPV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 IYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELSIVF
::::::::::::::..:::.. .:: ...::: ..:::.::.::::.: ::: :
CCDS27 IYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEHELSAGF
300 310 320 330 340 350
>>CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 1228 init1: 374 opt: 1235 Z-score: 1197.9 bits: 230.2 E(32554): 2.1e-60
Smith-Waterman score: 1235; 52.8% identity (82.2% similar) in 343 aa overlap (14-352:21-357)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGN
:...: : : :.: :.. . ::..:::::::: :..::
CCDS46 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGF
..::.:::. ..:. .:.::::::::::::::.:::.: : . ...::::..::::..:.
CCDS46 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSA-ANEWVFGNAMCKLFTGL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 YHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFY
:: : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::..:: .::.:..: .::
CCDS46 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPS-
. .. .:. .:. .: .:::. .:. ::::::.:.:::.::.:::::: .
CCDS46 KCQKEDSVYVCGPYFPR----GWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFG-NDCERSKHLDLVMLVTEVIA
::...:.:.::.:: :.:.::::::..:::...: .:: ..:: ...:: . :::...
CCDS46 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQE-FFGLSNCESTSQLDQATQVTETLG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB8 YSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLER-TSSVSPSTAEP
..:::.::.:::::::.::.:: ::..:. .. . : . : .. ::. .:::.:
CCDS46 MTHCCINPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTSTNTPSTGEQ
300 310 320 330 340 350
350
pF1KB8 ELSIVF
:.:
CCDS46 EVSAGL
360
>>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 (352 aa)
initn: 570 init1: 570 opt: 1230 Z-score: 1193.2 bits: 229.3 E(32554): 3.8e-60
Smith-Waterman score: 1230; 53.8% identity (83.8% similar) in 333 aa overlap (24-353:20-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILI
:.: ... . :...:::::::: :..::..:..:::
CCDS27 MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVILILI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSE
. .::. ::.:::::::::::.::.:.::: ::. .. : ::. ::.::.:.: :..:
CCDS27 NCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQ-WDFGNTMCQLLTGLYFIGFFSG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFEE
::::::::::::::.:::::::.::::::::.::..:: .::.:.:: .:: .... .
CCDS27 IFFIILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGIIFTRSQKEGLH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB8 TLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPS-KKKYKAIR
::. .: . :..:.::...:. ::::::::.:::.::.:::::: . ::...:.:
CCDS27 YTCSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHRAVR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFG-NDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNP
:::.:: :.:.::.:::...::...: .:: :.: :..:: .: :::.....:::.::
CCDS27 LIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQE-FFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCINP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSV-SPSTAEPELSIVF
.:::::::.::.:: ::..:. .. . .. .: ::.::: . ::.: :.:.
CCDS27 IIYAFVGEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQEISVGL
300 310 320 330 340 350
>>CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 (374 aa)
initn: 994 init1: 379 opt: 1152 Z-score: 1118.3 bits: 215.5 E(32554): 5.7e-56
Smith-Waterman score: 1152; 54.7% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (14-317:21-317)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGN
:...: : : :.: :.. . ::..:::::::: :..::
CCDS43 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGF
..::.:::. ..:. .:.::::::::::::::.:::.: : . ...::::..::::..:.
CCDS43 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSA-ANEWVFGNAMCKLFTGL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 YHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFY
:: : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::..:: .::.:..: .::
CCDS43 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPS-
. .. .:. .:. .: .:::. .:. ::::::.:.:::.::.:::::: .
CCDS43 KCQKEDSVYVCGPYFPR----GWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFG-NDCERSKHLDLVMLVTEVIA
::...:.:.::.:: :.:.::::::..:::...: .:: ..:: ...:: . :::...
CCDS43 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQE-FFGLSNCESTSQLDQATQVTETLG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 YSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPE
..:::.::.:::::::.::. .::
CCDS43 MTHCCINPIIYAFVGEKFRS----LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGL
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 728 init1: 384 opt: 1069 Z-score: 1039.1 bits: 200.8 E(32554): 1.5e-51
Smith-Waterman score: 1069; 46.2% identity (77.1% similar) in 353 aa overlap (3-351:9-356)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSY-YDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNV
:.:: :.. .. : :... : : .:. :.::::::::. :::::
CCDS26 MNPTDIADTTLD--ESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFGLLGNS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFY
:::..:.::.::: ::..::::::::::::. .:::: .:. . .:::: :.::..: .:
CCDS26 VVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYA-ADQWVFGLGLCKMISWMY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 HTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYE
.:.:: :::..:..::::::::::::.:::::.:.:::::..::..::.:.:: :.:
CCDS26 LVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFST
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKK
..: :.. : ... .:. . .:...:. ::.:: .: .::. ::.:: .: ..:
CCDS26 CYTERNHTYCKTKYSLNST-TWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSH
: ::...::.....:. ::::::....: . . .:: ..:: .. .::..:. :
CCDS26 KNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCTFERYLDYAIQATETLAFVH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 CCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFH--RHLLMHLGRYIPFLPSEKLER-TSSVSPSTAEPE
::.::.:: :.::.::::. ..:. : :.. : .: .: . . .:: . :: . .
CCDS26 CCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFV-LCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHD
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 LSIVF
:
CCDS26 LHDAL
360
>>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 882 init1: 415 opt: 925 Z-score: 901.5 bits: 175.3 E(32554): 6.8e-44
Smith-Waterman score: 925; 39.3% identity (73.4% similar) in 349 aa overlap (1-341:1-340)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYDDV-GLLCE----KADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVV
: .:: : : :: :. . :. ... . :.: : : :.:. .:::: .:
CCDS26 MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQTNGKLLLAVF----YCLLFVFSLLGNSLV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHT
...:. ..:: .:..::::::.:::::. ..:: .:. . :::: :::..::::.
CCDS26 ILVLVVCKKLRSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQTYYLLDQ-WVFGTVMCKVVSGFYYI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETE
:.:: .::: :...:::::.::::.::..::. .:. ...: :..:..: ..::..
CCDS26 GFYSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIMATIPLLVFYQVA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKY
: ..: ..:. .:. : ...:.:. :..:. .. .:: :.. : :: ...:
CCDS26 SEDGVLQCYSFYNQQTL-KWKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKILHQLKRCQNHNKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCC
:::::..... . ..::.:.::...:.: .:. . . : :..: . :::.:...:::
CCDS26 KAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYATHVTEIISFTHCC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 MNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHR---HLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELS
.::::::::::.:.:.: ..:.. ... .::: .: :. :..::
CCDS26 VNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQ---MPRESCEKSSSCQQHSSRSSSV
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 IVF
CCDS26 DYIL
>>CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 901 init1: 457 opt: 902 Z-score: 879.5 bits: 171.3 E(32554): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 902; 42.2% identity (72.9% similar) in 332 aa overlap (17-345:14-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILI
:::.. : .: .. . :. .::..:..::.::..::. :
CCDS43 MDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSE
. .. . .:.:::::::.:::::..::::: ::. ... . ..:::. ..:. :...
CCDS43 NSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLH-NAMCKFTTAFFFIGFFGS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFEE
:::: ...:::::::: :. .. ::: :: :. .:. :.:.: :.:.: . .:
CCDS43 IFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKE----
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIRL
. : . ::: : ..... ... ..::::.:. :: ::.::. : ..:: :::.:
CCDS43 NECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPVI
:.... :::.::::::: :.: . . : .:. : : :.. :::..:.::::.::.:
CCDS43 ILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVTETVAFSHCCLNPLI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 YAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGR--YIPFLPSEKLE-RTSSVSPSTAEPELSIVF
:::.::.::.:: :.. . : . :: .. : ::. . : .:: :
CCDS43 YAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGDAL
300 310 320 330 340 350
CCDS43 LLL
>>CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 (387 aa)
initn: 901 init1: 457 opt: 902 Z-score: 879.0 bits: 171.3 E(32554): 1.2e-42
Smith-Waterman score: 902; 42.2% identity (72.9% similar) in 332 aa overlap (17-345:46-372)
10 20 30 40
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFT
:::.. : .: .. . :. .::..:.
CCDS54 RKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFA
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 VGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMC
.::.::..::. : . .. . .:.:::::::.:::::..::::: ::. ... . ..::
CCDS54 IGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLH-NAMC
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 KLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAAL
:. ..:. :... :::: ...:::::::: :. .. ::: :: :. .:. :.:.:
CCDS54 KFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAA
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 PEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTL
:.:.: . .: . : . ::: : ..... ... ..::::.:. :: ::.::
CCDS54 PQFMFTKQKE----NECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTL
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVT
. : ..:: :::.::.... :::.::::::: :.: . . : .:. : : :.. ::
CCDS54 FSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVT
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 EVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGR--YIPFLPSEKLE-RTSSVS
:..:.::::.::.::::.::.::.:: :.. . : . :: .. : ::. . : .::
CCDS54 ETVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVL
320 330 340 350 360 370
350
pF1KB8 PSTAEPELSIVF
:
CCDS54 SSNFTYHTSDGDALLLL
380
355 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:44:55 2016 done: Fri Nov 4 15:44:55 2016
Total Scan time: 2.330 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]