Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8761
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8761, 206 aa
1>>>pF1KB8761 206 - 206 aa - 206 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1357+/-0.000946; mu= -1.5205+/- 0.057
mean_var=272.4412+/-53.549, 0's: 0 Z-trim(115.5): 18 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.077703
statistics sampled from 16028 (16044) to 16028 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.811), E-opt: 0.2 (0.493), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35356.1 TCEAL5 gene_id:340543|Hs108|chrX ( 206) 1422 171.3 3.6e-43
CCDS14511.1 TCEAL3 gene_id:85012|Hs108|chrX ( 200) 1254 152.5 1.7e-37
CCDS43978.1 TCEAL6 gene_id:158931|Hs108|chrX ( 183) 1074 132.3 1.8e-31
CCDS14496.1 TCEAL2 gene_id:140597|Hs108|chrX ( 227) 595 78.7 3.1e-15
CCDS14510.2 TCEAL4 gene_id:79921|Hs108|chrX ( 215) 585 77.5 6.6e-15
CCDS76004.1 TCEAL4 gene_id:79921|Hs108|chrX ( 358) 585 77.8 9.4e-15
>>CCDS35356.1 TCEAL5 gene_id:340543|Hs108|chrX (206 aa)
initn: 1422 init1: 1422 opt: 1422 Z-score: 888.5 bits: 171.3 E(32554): 3.6e-43
Smith-Waterman score: 1422; 100.0% identity (100.0% similar) in 206 aa overlap (1-206:1-206)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEKLYKENEGKPENERNLESEGKPEDEGSTEDEGKSDEEEKPDMEGKTECEGKREDEGEP
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CCDS35 MEKLYKENEGKPENERNLESEGKPEDEGSTEDEGKSDEEEKPDMEGKTECEGKREDEGEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GDEGQLEDEGNQEKQGKSEGEDKPQSEGKPASQAKPESQPRAAEKRPAEDYVPRKAKRKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GDEGQLEDEGNQEKQGKSEGEDKPQSEGKPASQAKPESQPRAAEKRPAEDYVPRKAKRKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DRGTDDSPKDSQEDLQERHLSSEEMMRECGDVSRAQEELRKKQKMGGFHWMQRDVQDPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DRGTDDSPKDSQEDLQERHLSSEEMMRECGDVSRAQEELRKKQKMGGFHWMQRDVQDPFA
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KB8 PRGQRGVRGVRGGGRGQKDLEDVPYV
::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PRGQRGVRGVRGGGRGQKDLEDVPYV
190 200
>>CCDS14511.1 TCEAL3 gene_id:85012|Hs108|chrX (200 aa)
initn: 1520 init1: 1241 opt: 1254 Z-score: 786.8 bits: 152.5 E(32554): 1.7e-37
Smith-Waterman score: 1254; 88.3% identity (94.2% similar) in 206 aa overlap (1-206:1-200)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEKLYKENEGKPENERNLESEGKPEDEGSTEDEGKSDEEEKPDMEGKTECEGKREDEGEP
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CCDS14 MEKPYNKNEG------NLENEGKPEDEVEPDDEGKSDEEEKPDVEGKTECEGKREDEGEP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GDEGQLEDEGNQEKQGKSEGEDKPQSEGKPASQAKPESQPRAAEKRPAEDYVPRKAKRKT
::::::::::.:::::.:::: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GDEGQLEDEGSQEKQGRSEGEGKPQGEGKPASQAKPESQPRAAEKRPAEDYVPRKAKRKT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DRGTDDSPKDSQEDLQERHLSSEEMMRECGDVSRAQEELRKKQKMGGFHWMQRDVQDPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DRGTDDSPKDSQEDLQERHLSSEEMMRECGDVSRAQEELRKKQKMGGFHWMQRDVQDPFA
120 130 140 150 160 170
190 200
pF1KB8 PRGQRGVRGVRGGGRGQKDLEDVPYV
:::::::::::::::::. :.:.::.
CCDS14 PRGQRGVRGVRGGGRGQRGLHDIPYL
180 190 200
>>CCDS43978.1 TCEAL6 gene_id:158931|Hs108|chrX (183 aa)
initn: 1046 init1: 1046 opt: 1074 Z-score: 678.3 bits: 132.3 E(32554): 1.8e-31
Smith-Waterman score: 1074; 85.2% identity (91.0% similar) in 189 aa overlap (1-189:1-182)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEKLYKENEGKPENERNLESEGKPEDEGSTEDEGKSDEEEKPDMEGKTECEGKREDEGEP
::: :..::: :::.::::::: .:::::::::::: ::::::::::. ::::
CCDS43 MEKPYNKNEG------NLENEGKPEDEVEPDDEGKSDEEEKPDAEGKTECEGKRKAEGEP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GDEGQLEDEGNQEKQGKSEGEDKPQSEGKPASQAKPESQPRAAEKRPAEDYVPRKAKRKT
::::::::.:.:::::::::: :::.:::::::::::.:::::::::: :::::::::::
CCDS43 GDEGQLEDKGSQEKQGKSEGEGKPQGEGKPASQAKPEGQPRAAEKRPAGDYVPRKAKRKT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DRGTDDSPKDSQEDLQERHLSSEEMMRECGDVSRAQEELRKKQKMGGFHWMQRDVQDPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DRGTDDSPKDSQEDLQERHLSSEEMMRECGDVSRAQEELRKKQKMGGFHWMQRDVQDPFA
120 130 140 150 160 170
190 200
pF1KB8 PRGQRGVRGVRGGGRGQKDLEDVPYV
.:. :: :
CCDS43 -QGDNGVSGE
180
>>CCDS14496.1 TCEAL2 gene_id:140597|Hs108|chrX (227 aa)
initn: 681 init1: 364 opt: 595 Z-score: 386.9 bits: 78.7 E(32554): 3.1e-15
Smith-Waterman score: 616; 45.2% identity (70.0% similar) in 230 aa overlap (1-206:1-227)
10 20 30
pF1KB8 MEKLYKENEGKPENERNLESE------GKPE-----------DEGSTEDEGKSDEE----
::::..:::: : :. ....: :::: .::.::. :: ::
CCDS14 MEKLFNENEGMPSNQGKIDNEEQPPHEGKPEVACILEDKKLENEGNTENTGKRVEEPLKD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 -EKPDMEGKTECEGKREDEGEPGDEGQLEDEGNQEKQGKSEGEDKPQSEGKPASQAKPES
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CCDS14 KEKPESAGKAKGEGKSERKGKSEMQGGSKTEGKPERGGRAEGEGEPDSEREPESEGEPES
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 QPRAAEKRPAEDYVPRKAKRKTDRGTDDSPKDSQEDLQERHLSSEEMMRECGDVSRAQEE
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CCDS14 ETRAAGKRPAEDDIPRKAKRKTNKGLAQYLKQYKEAIHDMNFSNEDMIREFDNMARVEDK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KB8 LRK-KQKMGGFHWMQRDVQDPFAPRGQRGVRGVRGGGRG-QKDLEDVPYV
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CCDS14 RRKSKQKLGAFLWMQRNLQDPFYPRGPREFRG---GCRAPRRDTEDIPYV
190 200 210 220
>>CCDS14510.2 TCEAL4 gene_id:79921|Hs108|chrX (215 aa)
initn: 626 init1: 320 opt: 585 Z-score: 381.1 bits: 77.5 E(32554): 6.6e-15
Smith-Waterman score: 614; 48.4% identity (71.7% similar) in 219 aa overlap (1-206:1-215)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEKLYKENEGKPENERNLESEGKPEDEGSTEDEGKSDEEEKPDMEGKTECEGKREDE---
:::::.:::: :. ..:.: .:.:: . : . :..: . ::::: .:: ::
CCDS14 MEKLYSENEGMASNQGKMENEEQPQDERKPEVTC-TLEDKKLENEGKTENKGKTGDEEML
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB8 ---GEP---GD--EGQLEDEGNQEKQGKSEGEDKPQSEGKPASQAKPESQPRAAEKRPAE
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CCDS14 KDKGKPESEGEAKEGKSEREGESEMEGGSEREGKPEIEGKPESEGEPGSETRAAGKRPAE
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 DYVPRKAKRKTDRGTDDSPKDSQEDLQERHLSSEEMMRECGDVSRAQEELRK-KQKMGGF
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CCDS14 DDVPRKAKRKTNKGLAHYLKEYKEAIHDMNFSNEDMIREFDNMAKVQDEKRKSKQKLGAF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KB8 HWMQRDVQDPFAPRGQRGVRGVRGGGRG-QKDLEDVPYV
::::..:::: ::: : :: : :. ..:.::.:::
CCDS14 LWMQRNLQDPFYPRGPREFRG---GCRAPRRDIEDIPYV
180 190 200 210
>>CCDS76004.1 TCEAL4 gene_id:79921|Hs108|chrX (358 aa)
initn: 436 init1: 320 opt: 585 Z-score: 378.3 bits: 77.8 E(32554): 9.4e-15
Smith-Waterman score: 614; 48.4% identity (71.7% similar) in 219 aa overlap (1-206:144-358)
10 20 30
pF1KB8 MEKLYKENEGKPENERNLESEGKPEDEGST
:::::.:::: :. ..:.: .:.:: .
CCDS76 QRSAKPEKEEQPVQNPRRSVKDRKRRGNLDMEKLYSENEGMASNQGKMENEEQPQDERKP
120 130 140 150 160 170
40 50 60 70
pF1KB8 EDEGKSDEEEKPDMEGKTECEGKREDE------GEP---GD--EGQLEDEGNQEKQGKSE
: . :..: . ::::: .:: :: :.: :. ::. : ::..: .: ::
CCDS76 EVTC-TLEDKKLENEGKTENKGKTGDEEMLKDKGKPESEGEAKEGKSEREGESEMEGGSE
180 190 200 210 220 230
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 GEDKPQSEGKPASQAKPESQPRAAEKRPAEDYVPRKAKRKTDRGTDDSPKDSQEDLQERH
: ::. :::: :...: :. ::: :::::: :::::::::..: :. .: ... .
CCDS76 REGKPEIEGKPESEGEPGSETRAAGKRPAEDDVPRKAKRKTNKGLAHYLKEYKEAIHDMN
240 250 260 270 280 290
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 LSSEEMMRECGDVSRAQEELRK-KQKMGGFHWMQRDVQDPFAPRGQRGVRGVRGGGRG-Q
.:.:.:.:: .....:.: :: :::.:.: ::::..:::: ::: : :: : :. .
CCDS76 FSNEDMIREFDNMAKVQDEKRKSKQKLGAFLWMQRNLQDPFYPRGPREFRG---GCRAPR
300 310 320 330 340
200
pF1KB8 KDLEDVPYV
.:.::.:::
CCDS76 RDIEDIPYV
350
206 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:21:45 2016 done: Fri Nov 4 15:21:45 2016
Total Scan time: 2.420 Total Display time: -0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]