Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8754
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8754, 198 aa
1>>>pF1KB8754 198 - 198 aa - 198 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3181+/-0.00108; mu= 13.4621+/- 0.065
mean_var=75.8923+/-14.947, 0's: 0 Z-trim(104.4): 192 B-trim: 238 in 1/49
Lambda= 0.147223
statistics sampled from 7675 (7885) to 7675 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 1.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19 ( 198) 1286 282.4 1.2e-76
CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9 ( 199) 1065 235.5 1.6e-62
CCDS641.1 DIRAS3 gene_id:9077|Hs108|chr1 ( 229) 578 132.1 2.5e-31
CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13 ( 183) 516 118.9 1.9e-27
CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX ( 183) 511 117.8 4e-27
CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3 ( 183) 504 116.3 1.1e-26
CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1 ( 184) 497 114.8 3.2e-26
CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 ( 184) 496 114.6 3.7e-26
CCDS8702.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 188) 475 110.2 8.3e-25
CCDS8703.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 189) 444 103.6 8e-23
CCDS12774.1 RRAS gene_id:6237|Hs108|chr19 ( 218) 439 102.6 1.9e-22
CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 ( 217) 435 101.7 3.3e-22
CCDS877.1 NRAS gene_id:4893|Hs108|chr1 ( 189) 429 100.4 7.2e-22
CCDS7698.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11 ( 189) 426 99.8 1.1e-21
CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2 ( 206) 418 98.1 3.9e-21
CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 ( 204) 412 96.8 9.4e-21
CCDS7699.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11 ( 170) 410 96.3 1.1e-20
CCDS1123.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 219) 407 95.8 2.1e-20
CCDS58037.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 236) 407 95.8 2.2e-20
CCDS5460.1 RALA gene_id:5898|Hs108|chr7 ( 206) 390 92.2 2.4e-19
CCDS5927.1 RHEB gene_id:6009|Hs108|chr7 ( 184) 383 90.6 6.2e-19
CCDS8673.1 RERG gene_id:85004|Hs108|chr12 ( 199) 369 87.7 5.2e-18
CCDS11185.1 RASD1 gene_id:51655|Hs108|chr17 ( 281) 366 87.2 1.1e-17
CCDS3100.1 MRAS gene_id:22808|Hs108|chr3 ( 208) 354 84.5 4.9e-17
CCDS13916.1 RASD2 gene_id:23551|Hs108|chr22 ( 266) 355 84.8 5.1e-17
CCDS8778.1 RHEBL1 gene_id:121268|Hs108|chr12 ( 183) 339 81.3 4e-16
CCDS62431.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 ( 153) 331 79.5 1.1e-15
CCDS58036.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 183) 328 78.9 2e-15
CCDS53603.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 ( 169) 318 76.8 8.3e-15
CCDS2520.1 RAB17 gene_id:64284|Hs108|chr2 ( 212) 309 75.0 3.7e-14
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1 ( 203) 302 73.5 1e-13
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 ( 201) 298 72.6 1.8e-13
CCDS13181.1 REM1 gene_id:28954|Hs108|chr20 ( 298) 296 72.3 3.3e-13
CCDS6261.1 GEM gene_id:2669|Hs108|chr8 ( 296) 294 71.9 4.4e-13
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 ( 205) 292 71.3 4.4e-13
CCDS4962.1 RAB23 gene_id:51715|Hs108|chr6 ( 237) 289 70.7 7.7e-13
CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3 ( 215) 288 70.5 8.3e-13
CCDS76024.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX ( 117) 284 69.5 9.3e-13
CCDS35246.1 ERAS gene_id:3266|Hs108|chrX ( 233) 287 70.3 1e-12
CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 216) 285 69.9 1.3e-12
CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18 ( 244) 285 69.9 1.4e-12
CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 249) 285 69.9 1.4e-12
CCDS58254.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 ( 142) 280 68.7 1.9e-12
CCDS10824.1 RRAD gene_id:6236|Hs108|chr16 ( 308) 283 69.6 2.3e-12
CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12 ( 215) 281 69.0 2.3e-12
CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 280 68.8 2.6e-12
CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1 ( 219) 280 68.8 2.7e-12
CCDS10200.1 RASL12 gene_id:51285|Hs108|chr15 ( 266) 281 69.1 2.7e-12
CCDS9321.1 RASL11A gene_id:387496|Hs108|chr13 ( 242) 280 68.8 3e-12
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 ( 201) 278 68.4 3.4e-12
>>CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19 (198 aa)
initn: 1286 init1: 1286 opt: 1286 Z-score: 1489.5 bits: 282.4 E(32554): 1.2e-76
Smith-Waterman score: 1286; 100.0% identity (100.0% similar) in 198 aa overlap (1-198:1-198)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTYIPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTYIPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEELGPIYKLIVQIKGSVEDIPVMLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEELGPIYKLIVQIKGSVEDIPVMLVG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NKCDETQREVDTREAQAVAQEWKCAFMETSAKMNYNVKELFQELLTLETRRNMSLNIDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NKCDETQREVDTREAQAVAQEWKCAFMETSAKMNYNVKELFQELLTLETRRNMSLNIDGK
130 140 150 160 170 180
190
pF1KB8 RSGKQKRTDRVKGKCTLM
::::::::::::::::::
CCDS12 RSGKQKRTDRVKGKCTLM
190
>>CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9 (199 aa)
initn: 1063 init1: 744 opt: 1065 Z-score: 1235.8 bits: 235.5 E(32554): 1.6e-62
Smith-Waterman score: 1065; 78.9% identity (95.5% similar) in 199 aa overlap (1-198:1-199)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTYIPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQIT
::::::::::.::::::::::::::::::::::..::::.:::::::::::::.::::::
CCDS66 MPEQSNDYRVAVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRESYIPTVEDTYRQVISCDKSICTLQIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEELGPIYKLIVQIKGSVEDIPVMLVG
:::::::::::::::::::::::::.:.::.:::::: :::. : .:::.::.::.::::
CCDS66 DTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVYSITSRQSLEELKPIYEQICEIKGDVESIPIMLVG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 NKCDET-QREVDTREAQAVAQEWKCAFMETSAKMNYNVKELFQELLTLETRRNMSLNIDG
:::::. .:::.. ::.:.:. :::::::::::.:.::::::::::.:: ::..::.:::
CCDS66 NKCDESPSREVQSSEAEALARTWKCAFMETSAKLNHNVKELFQELLNLEKRRTVSLQIDG
130 140 150 160 170 180
180 190
pF1KB8 KRSGKQKRTDRVKGKCTLM
:.: .::: ...::::..:
CCDS66 KKSKQQKRKEKLKGKCVIM
190
>>CCDS641.1 DIRAS3 gene_id:9077|Hs108|chr1 (229 aa)
initn: 561 init1: 356 opt: 578 Z-score: 675.9 bits: 132.1 E(32554): 2.5e-31
Smith-Waterman score: 578; 46.6% identity (78.2% similar) in 193 aa overlap (7-198:37-229)
10 20 30
pF1KB8 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTY
:::::: :..:::::.:. ....:.:: :
CCDS64 GSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRHEY
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 IPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQITDTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEE
.::::.:: :...:...: .:.:::. .. :.:: :..::::.::.:::.:..:::
CCDS64 LPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETLEE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 LGPIYKLIVQIKGS-VEDIPVMLVGNKCDETQREVDTREAQAVAQEWKCAFMETSAKMNY
: .:.:: .:::. .. .:..::::: :.:.::: .. . :.::.::::: ::: .
CCDS64 LKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSDDTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAKTDV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190
pF1KB8 NVKELFQELLTLETRRNMSLNIDGKRSGKQKRTDRVKGKCTLM
::.:::. ::. . . . .:. :.: . :... :: .:
CCDS64 NVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
190 200 210 220
>>CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13 (183 aa)
initn: 497 init1: 441 opt: 516 Z-score: 606.1 bits: 118.9 E(32554): 1.9e-27
Smith-Waterman score: 516; 50.0% identity (80.0% similar) in 160 aa overlap (7-165:3-161)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTYIPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQIT
.:.:::.:.::::::.:...:: ::: . : ::::: ::. : :.: .:.:
CCDS94 MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIEKYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEELGPIYKLIVQIKGSVEDIPVMLVG
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CCDS94 DTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQIIRVK-RYEKVPVILVG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 NKCD-ETQREVDTREAQAVAQEWKCAFMETSAKMNYNVKELFQELLTLETRRNMSLNIDG
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CCDS94 NKVDLESEREVSSSEGRALAEEWGCPFMETSAKSKTMVDELFAEIVRQMNYAAQPDKDDP
120 130 140 150 160 170
180 190
pF1KB8 KRSGKQKRTDRVKGKCTLM
CCDS94 CCSACNIQ
180
>>CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX (183 aa)
initn: 478 init1: 439 opt: 511 Z-score: 600.4 bits: 117.8 E(32554): 4e-27
Smith-Waterman score: 511; 50.6% identity (78.8% similar) in 160 aa overlap (7-165:3-161)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTYIPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQIT
.:.:::.:.::::::.:...:: ::: . : ::::: ::. : :.: .:.:
CCDS14 MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIEKYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEELGPIYKLIVQIKGSVEDIPVMLVG
::.:..:: .:. : :..:..::::.:....::.... :. ::..: : .:..:::
CCDS14 DTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQIVRVK-RYEKVPLILVG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 NKCD-ETQREVDTREAQAVAQEWKCAFMETSAKMNYNVKELFQELLTLETRRNMSLNIDG
:: : : .::: . :..:.:::: : ::::::: . : ::: :..
CCDS14 NKVDLEPEREVMSSEGRALAQEWGCPFMETSAKSKSMVDELFAEIVRQMNYSSLPEKQDQ
120 130 140 150 160 170
180 190
pF1KB8 KRSGKQKRTDRVKGKCTLM
CCDS14 CCTTCVVQ
180
>>CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3 (183 aa)
initn: 472 init1: 433 opt: 504 Z-score: 592.3 bits: 116.3 E(32554): 1.1e-26
Smith-Waterman score: 504; 48.8% identity (80.0% similar) in 160 aa overlap (7-165:3-161)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTYIPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQIT
.:.:::.:.::::::.:...:: :.: . : ::::: ::. : :.: .:.:
CCDS31 MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGSFIEKYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEELGPIYKLIVQIKGSVEDIPVMLVG
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CCDS31 DTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQIIRVK-RYERVPMILVG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 NKCD-ETQREVDTREAQAVAQEWKCAFMETSAKMNYNVKELFQELLTLETRRNMSLNIDG
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CCDS31 NKVDLEGEREVSYGEGKALAEEWSCPFMETSAKNKASVDELFAEIVRQMNYAAQPNGDEG
120 130 140 150 160 170
180 190
pF1KB8 KRSGKQKRTDRVKGKCTLM
CCDS31 CCSACVIL
180
>>CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1 (184 aa)
initn: 457 init1: 302 opt: 497 Z-score: 584.3 bits: 114.8 E(32554): 3.2e-26
Smith-Waterman score: 497; 43.7% identity (79.6% similar) in 167 aa overlap (7-171:3-168)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTYIPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQIT
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CCDS84 MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEELGPIYKLIVQIKGSVEDIPVMLVG
::.:..:: ::. : ...:..: ::.:.:.......: . . :...: . ::.:..:::
CCDS84 DTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDT-EDVPMILVG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 NKCD-ETQREVDTREAQAVAQEW-KCAFMETSAKMNYNVKELFQELLTLETRRNMSLNID
:::: : .: : ...: .:..: .:::.:.::: . ::.:.: .:. .:.
CCDS84 NKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKK
120 130 140 150 160 170
180 190
pF1KB8 GKRSGKQKRTDRVKGKCTLM
CCDS84 PKKKSCLLL
180
>>CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 (184 aa)
initn: 455 init1: 304 opt: 496 Z-score: 583.1 bits: 114.6 E(32554): 3.7e-26
Smith-Waterman score: 496; 41.4% identity (77.3% similar) in 181 aa overlap (7-185:3-182)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTYIPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQIT
.:..::.:.::::::.:...::.: : . : :::::.::. . : . : :.:
CCDS89 MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEELGPIYKLIVQIKGSVEDIPVMLVG
::.:..:: ::. : ...:..: ::.:.:.......: . . :...: . .:.:..:::
CCDS89 DTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDT-DDVPMILVG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 NKCD-ETQREVDTREAQAVAQEWK-CAFMETSAKMNYNVKELFQELLTLETRRNMSLNID
:::: : .: : ...: .:..:. :::.:.::: . ::.:.: .:. .:.. .
CCDS89 NKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKA
120 130 140 150 160 170
180 190
pF1KB8 GKRSGKQKRTDRVKGKCTLM
:.:. :
CCDS89 RKKSSCQLL
180
>>CCDS8702.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 (188 aa)
initn: 455 init1: 253 opt: 475 Z-score: 558.9 bits: 110.2 E(32554): 8.3e-25
Smith-Waterman score: 475; 38.5% identity (71.4% similar) in 192 aa overlap (7-198:3-188)
10 20 30 40 50 60
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