Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8749
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8749, 418 aa
1>>>pF1KB8749 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9015+/-0.00102; mu= 13.1339+/- 0.061
mean_var=60.0778+/-12.109, 0's: 0 Z-trim(102.8): 25 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.165469
statistics sampled from 7103 (7125) to 7103 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 418) 2798 676.7 1.1e-194
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 2798 676.7 1.2e-194
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 ( 427) 1108 273.3 3.1e-73
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 ( 433) 1072 264.7 1.2e-70
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 ( 433) 1072 264.7 1.2e-70
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 ( 436) 1038 256.6 3.4e-68
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 ( 393) 977 242.0 7.4e-64
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 ( 423) 961 238.2 1.1e-62
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 ( 419) 952 236.1 4.9e-62
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 501) 912 226.5 4.4e-59
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 390) 895 222.5 5.7e-58
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 372) 858 213.6 2.5e-55
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 391) 858 213.6 2.6e-55
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 ( 445) 824 205.5 8.3e-53
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 775 193.8 2.3e-49
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 ( 375) 744 186.4 3.9e-47
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 303) 688 173.0 3.4e-43
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 672 169.2 6.6e-42
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 235) 645 162.8 3.2e-40
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 567 144.2 2e-34
>>CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 (418 aa)
initn: 2798 init1: 2798 opt: 2798 Z-score: 3608.8 bits: 676.7 E(32554): 1.1e-194
Smith-Waterman score: 2798; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSYYGSSYHIINADAKYPGYPPEHIIAEKRRARRRLLHKDGSCNVYFKHIFGEWGSYVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSYYGSSYHIINADAKYPGYPPEHIIAEKRRARRRLLHKDGSCNVYFKHIFGEWGSYVVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGSVFWLIAFHHGDLLNDPDITPCVDNVHSFTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGSVFWLIAFHHGDLLNDPDITPCVDNVHSFTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMVILQSILSCIINTFIIGAALAKMATARKRAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMVILQSILSCIINTFIIGAALAKMATARKRAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNHVVEGTVRAQLLRYTEDSEGRMTMAFKDLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNHVVEGTVRAQLLRYTEDSEGRMTMAFKDLKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VNDQIILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKAVAKDNFEILVTFIYTGDSTGTSHQSRSSYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VNDQIILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKAVAKDNFEILVTFIYTGDSTGTSHQSRSSYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 PREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEGSVEVYAPFCSAKQLDWKDQQLHIEKAPPVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEGSVEVYAPFCSAKQLDWKDQQLHIEKAPPVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB8 ESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETTTSATHEYRETPYQKALLTLNRISVESQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETTTSATHEYRETPYQKALLTLNRISVESQM
370 380 390 400 410
>>CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 (453 aa)
initn: 2798 init1: 2798 opt: 2798 Z-score: 3608.2 bits: 676.7 E(32554): 1.2e-194
Smith-Waterman score: 2798; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:36-453)
10 20 30
pF1KB8 MSYYGSSYHIINADAKYPGYPPEHIIAEKR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LTENPNQEIATSLEFLLLQNSPGSLRAQQRMSYYGSSYHIINADAKYPGYPPEHIIAEKR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 RARRRLLHKDGSCNVYFKHIFGEWGSYVVDIFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RARRRLLHKDGSCNVYFKHIFGEWGSYVVDIFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 VFWLIAFHHGDLLNDPDITPCVDNVHSFTGAFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VFWLIAFHHGDLLNDPDITPCVDNVHSFTGAFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 ILQSILSCIINTFIIGAALAKMATARKRAQTIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ILQSILSCIINTFIIGAALAKMATARKRAQTIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNH
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 VVEGTVRAQLLRYTEDSEGRMTMAFKDLKLVNDQIILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VVEGTVRAQLLRYTEDSEGRMTMAFKDLKLVNDQIILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 VAKDNFEILVTFIYTGDSTGTSHQSRSSYVPREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VAKDNFEILVTFIYTGDSTGTSHQSRSSYVPREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEG
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 SVEVYAPFCSAKQLDWKDQQLHIEKAPPVRESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SVEVYAPFCSAKQLDWKDQQLHIEKAPPVRESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETT
370 380 390 400 410 420
400 410
pF1KB8 TSATHEYRETPYQKALLTLNRISVESQM
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TSATHEYRETPYQKALLTLNRISVESQM
430 440 450
>>CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 (427 aa)
initn: 1085 init1: 818 opt: 1108 Z-score: 1428.3 bits: 273.3 E(32554): 3.1e-73
Smith-Waterman score: 1108; 47.6% identity (75.1% similar) in 370 aa overlap (26-388:37-405)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSYYGSSYHIINADAKYPGYPPEHIIAEKRRARRRLLHKDGSCNVYFKHIFGEWG
. ... : :...::: ::: : .. :: :
CCDS11 NRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINV-GEKG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 S-YVVDIFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGSVFWLIAFHHGDLLNDPDITPCVDN
. :..::::: :: .:: :.::: :...::::.:: ::::::. :::: . . ::..
CCDS11 QRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKEGKACVSE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VHSFTGAFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMVILQSILSCIINTFIIGAALAKMAT
:.:::.:::::.:::::::::.::::.:: .::.::..:::..:::..:::::..::::
CCDS11 VNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ARKRAQTIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNHVVEGTVRAQLLRYTEDSEGR-MTM
.:: .:. ::. :.:.:::::::::::.:..: .:.::. ::::::. :::. . .
CCDS11 PKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEYIPL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB8 AFKDLKLV----NDQIILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKAVAKDNFEILVTFIYTGDST
:... :.:.::.:.:::::::..:::: :... . . .:::.: . ..:
CCDS11 DQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMVEAT
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 GTSHQSRSSYVPREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEGSVEV-YAPFCSAKQLDWKD
. . : ::::. :::::::.. :: ...::::. .:. . :: .:.:::..: :
CCDS11 AMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLAEKK
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 QQLHIEKAPPVRESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETTTSATHEYRETPYQKALLT
: .. .. . .: . : ..: .: ..: .
CCDS11 YILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPLRRES
370 380 390 400 410 420
410
pF1KB8 LNRISVESQM
CCDS11 EI
>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 1072 init1: 541 opt: 1072 Z-score: 1381.7 bits: 264.7 E(32554): 1.2e-70
Smith-Waterman score: 1072; 49.7% identity (76.7% similar) in 330 aa overlap (26-344:36-362)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSYYGSSYHIINADAKYPGYPPEHIIAEKRRARRRLLHKDGSCNVYFKHIFGEWG
. .:: : :...:.:.::. : .. .
CCDS11 RANPYSIVSSEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIEFANMDEKSQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 SYVVDIFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGSVFWLIAFHHGDLLNDP----DITPC
:..:.::: :: .::.:..::::... :::.:: .::.:: :::: .: :::
CCDS11 RYLADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDL--EPAEGRGRTPC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VDNVHSFTGAFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMVILQSILSCIINTFIIGAALAK
: .::.: .:::::.::::::::: ::::::: :::.::. :::..:::..:.::: .::
CCDS11 VMQVHGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB8 MATARKRAQTIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNHVVEGTVRAQLL--RYTEDSEG
:: .:::::. ::. :....::::::::::.:..: .:.::. :::::. : ::..:
CCDS11 MARPKKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGE-
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 RMTMAFKDLKLVNDQ----IILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKAVAKDNFEILVTFIYT
. . :. . :. :.::.:.::.::::. :::....:. . :.:::.: .
CCDS11 YIPLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGM
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 GDSTGTSHQSRSSYVPREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEGSVEVYA-PFCSAKQL
..:. . :.::::. ::::::::. :: ... ::.. .:. . :: . : ::::.:
CCDS11 VEATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 DWKDQQLHIEKAPPVRESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETTTSATHEYRETPYQK
CCDS11 VENKFLLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVL
370 380 390 400 410 420
>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 1071 init1: 539 opt: 1072 Z-score: 1381.7 bits: 264.7 E(32554): 1.2e-70
Smith-Waterman score: 1072; 49.7% identity (76.8% similar) in 328 aa overlap (26-344:36-362)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSYYGSSYHIINADAKYPGYPPEHIIAEKRRARRRLLHKDGSCNVYFKHIFGEWG
. .:: : :...:.:.::. : .. .
CCDS74 RANPYSIVSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFANMDEKSQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 SYVVDIFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGSVFWLIAFHHGDL--LNDPDITPCVD
:..:.::: :: .::.:..::::... :::.:: .::.:: :::: . ::::
CCDS74 RYLADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGDLEPAEGHGRTPCVM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 NVHSFTGAFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMVILQSILSCIINTFIIGAALAKMA
.::.: .:::::.::::::::: ::::::: :::.::. :::..:::..:.::: .::::
CCDS74 QVHGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TARKRAQTIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNHVVEGTVRAQLL--RYTEDSEGRM
.:::::. ::. :....::::::::::.:..: .:.::. :::::. : ::..: .
CCDS74 RPKKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGE-YI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB8 TMAFKDLKLVNDQ----IILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKAVAKDNFEILVTFIYTGD
. :. . :. :.::.:.::.::::. :::....:. . :.:::.: . .
CCDS74 PLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 STGTSHQSRSSYVPREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEGSVEVYA-PFCSAKQLDW
.:. . :.::::. ::::::::. :: ... ::.. .:. . :: . : ::::.:
CCDS74 ATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 KDQQLHIEKAPPVRESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETTTSATHEYRETPYQKAL
CCDS74 NKFLLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQ
370 380 390 400 410 420
>>CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 (436 aa)
initn: 1036 init1: 730 opt: 1038 Z-score: 1337.8 bits: 256.6 E(32554): 3.4e-68
Smith-Waterman score: 1038; 46.7% identity (72.5% similar) in 338 aa overlap (19-350:35-372)
10 20 30 40
pF1KB8 MSYYGSSYHIINADAKYPGYPPEHIIAEKRRARRRLLHKDGSCNVYFK
:. : . . : : :...::: ::: :
CCDS12 RALRRLSGALDSGDSRAGDEEEAGPGLCRNGWAPAPVQSPVGRRRGRFVKKDGHCNVRFV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 HIFGEWGSYVVDIFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGSVFWLIAFHHGDLLNDPDI
.. :. . :. :.::: ::..:: : ..:: :.. :::.:: .::::: :::: :
CCDS12 NLGGQGARYLSDLFTTCVDVRWRWMCLLFSCSFLASWLLFGLAFWLIASLHGDLAAPPPP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 TPCVDNVHSFTGAFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMVILQSILSCIINTFIIGAA
.:: ..: :: .::::.:::::.:::: : ::::: .:: :.:: : .:....:..::.
CCDS12 APCFSHVASFLAAFLFALETQTSIGYGVRSVTEECPAAVAAVVLQCIAGCVLDAFVVGAV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 LAKMATARKRAQTIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNHVVEGTVRAQLLRYTEDSE
.:::: .:: .:. :: :....:: .::::::.:..: .:.::. ::::::. :
CCDS12 MAKMAKPKKRNETLVFSENAVVALRDHRLCLMWRVGNLRRSHLVEAHVRAQLLQPRVTPE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 GR-MTMAFKDLKLV----NDQIILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKAVAKDNFEILVTFI
:. . . .:. . .:.:.::.:.::::::: :::: : : .:. .::..: .
CCDS12 GEYIPLDHQDVDVGFDGGTDRIFLVSPITIVHEIDSASPLYELGRAELARADFELVVILE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 YTGDSTGTSHQSRSSYVPREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEGSVEVYA-PFCSAK
..:. . : ::::.: :.::::::. :: . . :.:. .:. . :: . : ::::
CCDS12 GMVEATAMTTQCRSSYLPGELLWGHRFEPVLFQRGSQYEVDYRHFHRTYEVPGTPVCSAK
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 QLDWKDQQLHIEKAPPVRESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETTTSATHEYRETPY
.:: . .:
CCDS12 ELDERAEQASHSLKSSFPGSLTAFCYENELALSCCQEEDEDDETEEGNGVETEDGAASPR
370 380 390 400 410 420
>>CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 967 init1: 444 opt: 977 Z-score: 1259.9 bits: 242.0 E(32554): 7.4e-64
Smith-Waterman score: 977; 42.1% identity (73.7% similar) in 354 aa overlap (18-360:10-356)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSYYGSSYHIINADAKYPGY--PPEHIIAEKRRARRRLLHKDGSCNVYFKHIFGEWGSYV
:: :: .::.:.: ..::: ::: .. : :.
CCDS11 MAQENAAFSPGQEEPP------RRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVR-ETYRYL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VDIFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGSVFWLIAFHHGDL--LNDPDITPCVDNVH
.:.:::::: .:: ...: :.: :.::.::...::::. .::: :.: ::::.:..
CCDS11 TDLFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLN
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SFTGAFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMVILQSILSCIINTFIIGAALAKMATAR
.:..:::::.::.::::::.: .:..: ......::.::. ..:.:..: ..:..
CCDS11 GFVAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPN
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KRAQTIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNHVVEGTVRAQLLRYTEDSEGR-MTMAF
::: :. :: :....:::.::::.:.::.: .:.::...::.:.: . ::. . .
CCDS11 KRAATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQ
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KDLKLV----NDQIILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKAVAKDNFEILVTFIYTGDSTGT
::.. .:...::.:..: :::: ::.. .:.:. .:.:::.: . ..::
CCDS11 TDLSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGM
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 SHQSRSSYVPREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEGSVEVYAPFCSAKQLDWKDQQL
. :.::::. :.::::::..:: .. .:.:. .:. . :: .: :::..: .:
CCDS11 TCQARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAEAAARL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB8 --HIEKAPPVRESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETTTSATHEYRETPYQKALLTL
:. . : :
CCDS11 DAHLYWSIPSRLDEKVEEEGAGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
350 360 370 380 390
>>CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 (423 aa)
initn: 784 init1: 490 opt: 961 Z-score: 1238.7 bits: 238.2 E(32554): 1.1e-62
Smith-Waterman score: 961; 42.3% identity (77.0% similar) in 331 aa overlap (22-344:41-370)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSYYGSSYHIINADAKYPGYPPEHIIAEK-RRARRRLLHKDGSCNVYFKHI
:.:: .. .: .: ..:::.:::. ..
CCDS42 VLEGDSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKDGKCNVHHGNV
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100
pF1KB8 FGEWGSYVVDIFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGSVFWLIAFHHGDL--LNDPDI
: :..:::::::: ::: ..:: . : ..::.:: ..::::. .::. ..::.
CCDS42 R-ETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDMDHIEDPSW
80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 TPCVDNVHSFTGAFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMVILQSILSCIINTFIIGAA
:::: :...:..:::::.::.:::::::: .:..: .......::.:. :.:.:..:
CCDS42 TPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSIVNAFMVGCM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 LAKMATARKRAQTIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNHVVEGTVRAQLLRYTEDSE
..:.. .:::.:. :: :.:.:::::::::.:.::.: .:.::...::.:.. . ::
CCDS42 FVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSKQTSE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 GR-MTMAFKDLKLV----NDQIILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKAVAKDNFEILVTFI
:. . . :... .:...::.:. : :::...::.. ... . :...::.: .
CCDS42 GEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKEELEIVVILE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 YTGDSTGTSHQSRSSYVPREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEGSVEVYAPFCSAKQ
..:: . :.::::. :::::.::. :: .. .:.:. .:. . :. .: :::.
CCDS42 GMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYETSTPSLSAKE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 LDWKDQQLHIEKAPPVRESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETTTSATHEYRETPYQ
:
CCDS42 LAELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGDVANLENESKV
370 380 390 400 410 420
>>CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 764 init1: 453 opt: 952 Z-score: 1227.2 bits: 236.1 E(32554): 4.9e-62
Smith-Waterman score: 952; 39.0% identity (74.8% similar) in 349 aa overlap (25-363:42-389)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSYYGSSYHIINADAKYPGYPPEHIIAEKRRARRRLLHKDGSCNVYFKHIFGEW
..:: .. :.: ..:.:.:::. .. :
CCDS84 DMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNV-QET
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GSYVVDIFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGSVFWLIAFHHGDL--LNDPDITPCV
:. :.:::::: ::: ...:.. : ..::.:: ..::::. .::: ..: . :::
CCDS84 YRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCV
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DNVHSFTGAFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMVILQSILSCIINTFIIGAALAKM
.:. .:..:::::.::.::::::.: .::.: .......:.::. :.:.:..: ..:.
CCDS84 ENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKI
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ATARKRAQTIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNHVVEGTVRAQLLRYTEDSEGR-M
. .:::.:. :: :.:.::: :::::.:.::.: .:.::...::.:.. . .::. .
CCDS84 SQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFI
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280
pF1KB8 TMAFKDLKLV----NDQIILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKAVAKDNFEILVTFIYTGD
. :... .:...::.:. : :::...::.. ... . ...::..: . .
CCDS84 PLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINQKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVE
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 STGTSHQSRSSYVPREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEGSVEVYAPFCSAKQLDWK
.:: . :.::::. :.::::::. :: ... .:.:. :. . :. .: : ::.:
CCDS84 ATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTPSCCAKELAEM
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 DQQ---LHIEKAPPVRESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETTTSATHEYRETPYQK
.. :. .::. .:
CCDS84 KREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
380 390 400 410
>>CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 (501 aa)
initn: 897 init1: 415 opt: 912 Z-score: 1174.2 bits: 226.5 E(32554): 4.4e-59
Smith-Waterman score: 912; 37.8% identity (71.0% similar) in 386 aa overlap (4-373:8-385)
10 20 30 40
pF1KB8 MSYYGSSYHIINADA-------KYPGYPPEHIIAEKRRARRRLLHKDGSCNVYFKH
.:..:....... . :: :.. .. :.. :.:.. :.: ::: .
CCDS22 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQQLVPKKK-RQRFVDKNGRCNVQHGN
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 IFGEWGSYVVDIFTTLVDTKWRHMFVIFSLSYILSWLIFGSVFWLIAFHHGDLLNDPDI-
. .: . :. :.:::::: ::: . :: :.: ..::...:..:.::. .::: : .
CCDS22 LGSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDL-NKAHVG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 --TPCVDNVHSFTGAFLFSLETQTTIGYGYRCVTEECSVAVLMVILQSILSCIINTFIIG
:::: ::..: .:::: .::..::::::: .:..: .... ..::::. :...:.::
CCDS22 NYTPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFLIG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 AALAKMATARKRAQTIRFSYFALIGMRDGKLCLMWRIGDFRPNHVVEGTVRAQLLRYTED
. ::. .:::.:. :: :.:.:::::: ::.:.:..: .:.: . .: .::. .
CCDS22 CMFIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKSRQT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 SEGRMTMAFKDLKL-VN-----DQIILVTPVTIVHEIDHESPLYALDRKAVAKDNFEILV
::.. . . .:.: :. ::..::.:.:: : :: .::.: :..... ..:::.:
CCDS22 PEGEF-LPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQTEQFEIVV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 TFIYTGDSTGTSHQSRSSYVPREILWGHRFNDVLEVKRKYYKVNCLQFEGSVEVYAPFCS
. ..:: . :.:.::. :.:::::: :. ... ..::. ::... :: .: :
CCDS22 ILEGIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQFHATFEVPTPPYS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 AKQLDWKDQQLHIEKAPPVRESCTSDTKARRRSFSAVAIVSSCENPEETTTSATHEYRET
.:. :. . . :. ...: :. :
CCDS22 VKE-----QEEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQKITGREDF
360 370 380 390 400 410
410
pF1KB8 PYQKALLTLNRISVESQM
CCDS22 PKKLLRMSSTTSEKAYSLGDLPMKLQRISSVPGNSEEKLVSKTTKMLSDPMSQSVADLPP
420 430 440 450 460 470
418 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:12:10 2016 done: Fri Nov 4 15:12:10 2016
Total Scan time: 2.240 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]