Result of FASTA (omim) for
pF1KB8736
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8736, 400 aa
1>>>pF1KB8736 400 - 400 aa - 400 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6060+/-0.000777; mu= 12.5146+/- 0.048
mean_var=303.4169+/-60.248, 0's: 0 Z-trim(111.8): 2068 B-trim: 80 in 1/52
Lambda= 0.073630
statistics sampled from 18221 (20564) to 18221 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16
Scan time: 6.300
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066575 (OMIM: 194532) zinc finger protein 8 [Ho ( 575) 1149 137.0 1.2e-31
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1138 135.8 2.6e-31
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1125 134.4 6.5e-31
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1125 134.4 6.6e-31
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1125 134.4 6.6e-31
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1108 132.7 2.4e-30
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1108 132.7 2.5e-30
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1108 132.7 2.5e-30
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1108 132.7 2.5e-30
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1108 132.7 2.5e-30
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1108 132.7 2.6e-30
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1108 132.7 2.6e-30
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1108 132.7 2.6e-30
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1108 132.7 2.6e-30
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1108 132.7 2.6e-30
NP_001278534 (OMIM: 194500) zinc finger protein 2 ( 438) 1082 129.6 1.4e-29
NP_009069 (OMIM: 603973) zinc finger protein 90 [H ( 601) 1083 130.0 1.5e-29
XP_006716174 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 1072 128.5 2.8e-29
NP_001265221 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 410) 1072 128.5 2.8e-29
NP_001265220 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 410) 1072 128.5 2.8e-29
XP_016868071 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 1072 128.5 2.8e-29
XP_016868072 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 1072 128.5 2.8e-29
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 1074 129.0 2.9e-29
NP_116313 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 iso ( 446) 1072 128.6 3e-29
NP_001265219 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 1072 128.6 3e-29
NP_001265216 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 1072 128.6 3e-29
NP_001265213 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 1072 128.6 3e-29
NP_001305064 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 1072 128.6 3e-29
NP_001305065 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 453) 1072 128.6 3e-29
NP_008892 (OMIM: 194525) zinc finger protein 19 [H ( 458) 1066 128.0 4.7e-29
XP_016882589 (OMIM: 605422) PREDICTED: zinc finger ( 532) 1065 128.0 5.4e-29
NP_067645 (OMIM: 605422) zinc finger protein 350 [ ( 532) 1065 128.0 5.4e-29
XP_016882588 (OMIM: 605422) PREDICTED: zinc finger ( 532) 1065 128.0 5.4e-29
XP_016882587 (OMIM: 605422) PREDICTED: zinc finger ( 532) 1065 128.0 5.4e-29
NP_001273627 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 364) 1061 127.3 6e-29
XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1061 127.5 6.9e-29
NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1061 127.5 6.9e-29
NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1061 127.5 6.9e-29
NP_001309189 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1061 127.5 6.9e-29
NP_009066 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 is ( 498) 1061 127.5 7e-29
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 1061 127.6 7.3e-29
XP_016882744 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1057 126.8 7.9e-29
XP_016882745 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1057 126.8 7.9e-29
NP_001275689 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1057 126.8 7.9e-29
XP_016882741 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1057 126.8 7.9e-29
XP_016882743 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1057 126.8 7.9e-29
XP_016882742 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1057 126.8 7.9e-29
NP_001275691 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1057 126.8 7.9e-29
XP_016882739 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1057 126.8 7.9e-29
XP_016882740 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1057 126.8 7.9e-29
>>NP_066575 (OMIM: 194532) zinc finger protein 8 [Homo s (575 aa)
initn: 2849 init1: 820 opt: 1149 Z-score: 689.4 bits: 137.0 E(85289): 1.2e-31
Smith-Waterman score: 1149; 43.6% identity (68.6% similar) in 401 aa overlap (1-398:25-423)
10 20 30
pF1KB8 MTFEDVAVEFSQWEWGQLNPAQKDLYREVMLENFRN
.::.::::.:.: :::::.:.:. :::.::::.: .
NP_066 MDPEDEGVAGVMSVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTQEEWGQLDPTQRILYRDVMLETFGH
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LAILGLLVSKPYVICQLEEGGEPFMVEREISTGAHSDWKRRSKSKESMPSWGISKEELFQ
: .: . :: :: :::.: : ...:: . : : :. ::.:. : :. .:: .
NP_066 LLSIGPELPKPEVISQLEQGTELWVAERGTTQGCHPAWEPRSESQASRKEEGLPEEEPSH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 VVSVEKHIQDVLQFSKLKAACGCDGQLEMQQIKQERHLKQMSTIHKSATTLSRDYKWNGF
:.. : :. . : :..: .:.. .:::. : : . .. :: .
NP_066 VTGREGFPTDAPYPTTLGKDRECQSQ--SLALKEQNNLKQLEFGLKEAPVQDQGYKTLRL
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 GRSLGLRSVLVNQHSILMGEGSYKCDTEFRQTLGGNN--SQRT-HPEKKSCKCNECGKSF
.. : : : :: : :... .. ... ::.: : :. . ..: ..
NP_066 RENCVLSSSPNPFPEISRGEYLYTYDSQITDSEHNSSLVSQQTGSPGKQPGENSDCHRDS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 HFQSELRRHQRCHTGEKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSS
. . . .. .:::.:.:::..:.: . : :.: ::::.:: :.:::.::::.:
NP_066 SQAIPITELTKSQVQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECGKAFSQNS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 SLVLHYRFHTGEKPYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIV
::: : :.:::.::::: :::..: :.. : :.: :::::::::..:::.:.:.:::
NP_066 SLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQNSSLGR
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 HYRFHTGEKPYKCNKCGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNECGRAFAHTASLIKHQRS
: : ::::::: :. ::..::... : : : :: :.::.::.::..: :..:: .:::.
NP_066 HKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSLAQHQRK
360 370 380 390 400 410
400
pF1KB8 HAGKKTL
:::.:
NP_066 HAGEKPFECRQRLIFEQTPALTKHEWTEALGCDPPLSQDERTHRSDRPFKCNQCGKCFIQ
420 430 440 450 460 470
>>NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 [Ho (572 aa)
initn: 7481 init1: 897 opt: 1138 Z-score: 683.1 bits: 135.8 E(85289): 2.6e-31
Smith-Waterman score: 1138; 44.0% identity (71.1% similar) in 405 aa overlap (1-398:13-404)
10 20 30 40
pF1KB8 MTFEDVAVEFSQWEWGQLNPAQKDLYREVMLENFRNLAILGLLVSKPY
.::.:::.::: :: :. ::..:::.:::::.:::...:. .:::
NP_001 MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLVFVGIAASKPD
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 VICQLEEGGEPFMVER-EISTGAHSDWKRRSKSKESMPSWGISKEELFQVVSVEKHIQDV
.: ::.: ::. :.: :. : .. . .. :. : :.. :: : .. . .
NP_001 LITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFA--QDLWPKQG--KKNYFQKVILRTYKKCG
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LQFSKLKAACGCDGQLEMQQIKQERH--LKQMSTIHKSATTLSRDYKWNGFGRSLGLRSV
. .:. : ... ....: . :.: : :: .. .... . . . :
NP_001 RENLQLRKYC---KSMDECKVHKECYNGLNQCLT-----TTQNKIFQYDKYVKVFHKFSN
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 LVNQHSI-LMGEGSYKC---DTEFRQTLGGNNSQRTHPEKKSCKCNECGKSFHFQSELRR
:.:.: :. :.:: . : . . .: : .: ::.::::... :.:
NP_001 -SNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEASNLST
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 HQRCHTGEKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSSSLVLHYRF
:.: :::.:::.: .::.::...: : :. :::.:::.: :::.::.::..:. : :.
NP_001 HKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRI
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 HTGEKPYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIVHYRFHTGE
:::::::::.::::::...:.: :. :.:::::.:.:::..:::::.: .: .::::
NP_001 HTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGE
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 KPYKCNKCGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNECGRAFAHTASLIKHQRSHAGKKTL
: :::..::.:::. : :: : :.:.:::::::.:::.:: ....: :.: :::.:
NP_001 KFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYK
350 360 370 380 390 400
NP_001 CEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEEC
410 420 430 440 450 460
>--
initn: 659 init1: 659 opt: 692 Z-score: 427.1 bits: 88.4 E(85289): 4.7e-17
Smith-Waterman score: 692; 55.7% identity (82.0% similar) in 167 aa overlap (232-398:406-572)
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 KSCKCNECGKSFHFQSELRRHQRCHTGEKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYE
:.: :..::...: : :.: :::::::.
NP_001 KPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYK
380 390 400 410 420 430
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 CSECGRAFSQSSSLVLHYRFHTGEKPYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECREC
: :::.::. ::.:. : .:::::::::.:::.::...:.: ::. :::::::.:.::
NP_001 CEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEEC
440 450 460 470 480 490
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 GRTFSQSSSLIVHYRFHTGEKPYKCNKCGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNECGRAF
:..:.::: : .: .:::::::::..::.::..:: :..: .::::: :: . :. :
NP_001 GKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNAC
500 510 520 530 540 550
390 400
pF1KB8 AHTASLIKHQRSHAGKKTL
. :.. :..:. ::.:
NP_001 DNIAKISKYKRNCAGEK
560 570
>>NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 737 [H (536 aa)
initn: 4179 init1: 863 opt: 1125 Z-score: 675.9 bits: 134.4 E(85289): 6.5e-31
Smith-Waterman score: 1126; 42.8% identity (67.6% similar) in 423 aa overlap (1-398:4-423)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MTFEDVAVEFSQWEWGQLNPAQKDLYREVMLENFRNLAILGLLVSKPYVICQLEEGG
. :.:::.::: :: :. ::..:::.:::::.:::..::..:::: .: ::.:
NP_001 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQGK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 EPFMVEREISTGAHSDWKRRSKSKESMPSWGISKEELFQVVSV---EKHIQDVLQFSKLK
.:. .... :. . ... : .: .. :: :.. :.. .: :::.:
NP_001 KPLTMKKH-EMVANPSVTCSHFARDLWPEQSI--KDSFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGC
70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KB8 AA---C--------GCDGQLEMQQIKQERHLKQMSTIHKSATTLSRDYKWNG---F----
. : : . : : : . : ...::: ... . . .: :
NP_001 ESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIE
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 -GRSLGLRSVLVNQHSILMGEGSYKCDT---EFRQTLGGNNSQRTHPEKKSCKCNECGKS
:.... :.:.....: :: .::. : . .. .: : .: ::..:::.
NP_001 CGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 FHFQSELRRHQRCHTGEKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQS
: : : :. :.:::::.: .::.:: . :.: :. :::::::.: :::.::..:
NP_001 FSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 SSLVLHYRFHTGEKPYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLI
: :. : .:.:::::::.:::.:: : : : :.: :::::::.:.::::.:. :::
NP_001 SILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 VHYRFHTGEKPYKCNKCGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNECGRAFAHTASLIKHQR
.: .:.:::::::..::.::. :: :: : :.:::::::::.:::.:: ...:: :.
NP_001 THKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKI
360 370 380 390 400 410
400
pF1KB8 SHAGKKTL
:.:..
NP_001 IHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTG
420 430 440 450 460 470
>--
initn: 499 init1: 499 opt: 499 Z-score: 316.5 bits: 67.9 E(85289): 6.8e-11
Smith-Waterman score: 506; 58.0% identity (82.1% similar) in 112 aa overlap (287-398:424-535)
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 EKPYECSECGRAFSQSSSLVLHYRFHTGEKPYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPY
:.::.:::.:: : : :.: :::::::
NP_001 EKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPY
400 410 420 430 440 450
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 ECRECGRTFSQSSSLIVHYRFHTGEKPYKCNKCGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNE
.:.:::..:..:: : .: :.:::::::::..::.::..: ::.: :.:::::::::.:
NP_001 KCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEE
460 470 480 490 500 510
380 390 400
pF1KB8 CGRAFAHTASLIKHQRSHAGKKTL
::..: ..: :. :.:.:
NP_001 CGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEKL
520 530
>>XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro (550 aa)
initn: 4179 init1: 863 opt: 1125 Z-score: 675.8 bits: 134.4 E(85289): 6.6e-31
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10 20 30 40 50
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.:. .... :. . ... : .: .. :: :.. :.. .: :::.:
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. : : . : : : . : ...::: ... . . .: :
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400
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:.:..
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MTFEDVAVEFSQWEWGQLNPAQKDLYREVMLENFRNLAILGLLVSKPYVICQLEEGG
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. : : . : : : . : ...::: ... . . .: :
XP_011 ESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIE
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::..: ..: :.
XP_011 CGKGFKCPSTLTTHKFFVYCREVAVLLENCYSHLYPH
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: :.::::::: :::::..:.:.::: .:.::::::::::: .::..: ::. : : :
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.:
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:: .. :.. : . : : : :. . :::.: .:. ::. . : : . . . .
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pF1KB8 GQLEMQQIKQERHLKQMSTIHKSATTLSRDYKWNGFGRSLGLRSVLVNQHSILMGEGSYK
:. : . . : : .. : . .... ::::....: : :. . :
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.::.: :.::.:.::::::.:::: :: ..: .::.:. : :.:::::::::..::
NP_001 KAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFN
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pF1KB8 HTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIVHYRFHTGEKPYKCNKCGRAFSQSSS
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>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (621 aa)
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pF1KB8 LGLRSVLVNQHSILMGEGSYKCDT---EFRQTLGGNNSQRTHPEKKSCKCNECGKSFHFQ
...:: . ... :: :.:. :::.. .. : : .: .:.::::.: .
XP_016 FSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHS
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XP_016 IHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTG
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.:
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XP_016 GCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRD
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::. :: . :: : :. . :
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. .. .: . . . ::::::.:::.::.:.:.::.:.::::::.::::.:: . : .
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: ..:.. . :. . : . :. . :.:
XP_016 CLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKS
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 LGLRSVLVNQHSILMGEGSYKCDT---EFRQTLGGNNSQRTHPEKKSCKCNECGKSFHFQ
...:: . ... :: :.:. :::.. .. : : .: .:.::::.: .
XP_016 FSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHS
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 SELRRHQRCHTGEKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSSSLV
: : .::: ::::::::: .::.:: .:. ::.:::::::::::::.:::.:::::. :.
XP_016 SSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLT
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280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LHYRFHTGEKPYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIVHYR
: :.::::::: :::::..:.:.::: .:.::::::::::: .::..: ::. : : :
XP_016 EHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQR
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340 350 360 370 380 390
pF1KB8 FHTGEKPYKCNKCGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNECGRAFAHTASLIKHQRSHAG
.:::::::.:: ::.:::.:::::.: :.:::::::.::.:::::.. : ::.::: :.:
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400
pF1KB8 KKTL
.:
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>--
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Smith-Waterman score: 576; 67.3% identity (85.5% similar) in 110 aa overlap (259-368:519-628)
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pF1KB8 EKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSSSLVLHYRFHTGEKPY
::::..::::::::: :. : :.:: ::::
XP_016 EKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPY
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pF1KB8 KCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIVHYRFHTGEKPYKCNK
:::::..:.:.::: .:.:::::::::::..::..: ::. : : :.::::::: :
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pF1KB8 CGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNECGRAFAHTASLIKHQRSHAGKKTL
::.::..:::::.: : :::
XP_016 CGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
610 620
>--
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pF1KB8 MTFEDVAVEFSQWEWGQLNPAQKDLYREVMLENFRNLAILGLLVSKPYVICQLEEGGEPF
::..:: :. .: . :: :: ::. .: .
XP_016 MLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELW
10 20 30
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pF1KB8 MVEREISTGAH------------SDWKRRSKSKESMPSWGISKEELFQVVSVEKHIQDVL
:: .. :.. :: . : : : :. . :::.: .:. ::. . : :
XP_016 AVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGL
40 50 60 70 80 90
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pF1KB8 QFSKLKAACGCDGQLEMQQIKQERHLKQMSTIHKSATTLSRDYKWNGFGRSLGLRSVLVN
. . . .:. : . . : : .. : . .... ::::....: :
XP_016 WYCR---GEDTEGHWEWSCESLES-LAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDL--
100 110 120 130 140
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pF1KB8 QHSILMGEGSYKCDTEFRQT--LGGNNSQRTHPEKKSCKCNECGKSFHFQSELRRHQRCH
:. . : ::. :. ..: .:. : :.
XP_016 PHQPMTPE---------RQSPHTWGTRGKREKPD------------------LNVLQKTC
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pF1KB8 TGEKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSSSLVLHYRFHTGEK
. ::::.:..::.::.: :.::.:.::::::.:::: :: ..: .::.:. : :.:::::
XP_016 VKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEK
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pF1KB8 PYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIVHYRFHTGEKPYKC
::::..::
XP_016 PYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYEC
240 250 260 270 280 290
>>XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (658 aa)
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110 120 130 140 150
pF1KB8 KHIQDVLQFSKLKAACGCDGQLEMQQIKQERHLKQMSTI--HKSATTLSRDYKWNGFGRS
: ..:.. . :. . : . :. . :.:
XP_016 CLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKS
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pF1KB8 LGLRSVLVNQHSILMGEGSYKCDT---EFRQTLGGNNSQRTHPEKKSCKCNECGKSFHFQ
...:: . ... :: :.:. :::.. .. : : .: .:.::::.: .
XP_016 FSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHS
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pF1KB8 SELRRHQRCHTGEKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSSSLV
: : .::: ::::::::: .::.:: .:. ::.:::::::::::::.:::.:::::. :.
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pF1KB8 LHYRFHTGEKPYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIVHYR
: :.::::::: :::::..:.:.::: .:.::::::::::: .::..: ::. : : :
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pF1KB8 FHTGEKPYKCNKCGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNECGRAFAHTASLIKHQRSHAG
.:::::::.:: ::.:::.:::::.: :.:::::::.::.:::::.. : ::.::: :.:
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pF1KB8 KKTL
.:
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>--
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pF1KB8 EKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSSSLVLHYRFHTGEKPY
::::..::::::::: :. : :.:: ::::
XP_016 EKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPY
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:::::..:.:.::: .:.:::::::::::..::..: ::. : : :.::::::: :
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pF1KB8 CGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNECGRAFAHTASLIKHQRSHAGKKTL
::.::..:::::.: : :::
XP_016 CGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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>--
initn: 704 init1: 359 opt: 364 Z-score: 238.3 bits: 53.7 E(85289): 1.6e-06
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.:::::.: ::: :::::.:::. :::.:::..:: :. .: . ::
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pF1KB8 YVICQLEEGGEPFMVEREISTGAHSDWKRRSKSKESMPSWGISKEELFQVVSVEKHIQDV
:: ::. .: . :: .. :.. : . : : : :. . :::.: .:. ::. . :
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pF1KB8 LQFSKLKAACGCDGQLEMQQIKQERHLKQMSTIHKSATTLSRDYKWNGFGRSLGLRSVLV
: . . . . .:. : . . : : .. : . .... ::::....: :
XP_016 LWYCRGEDT---EGHWEWSCESLES-LAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLP
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pF1KB8 NQHSILMGEGSYKCDTEFRQT--LGGNNSQRTHPEKKSCKCNECGKSFHFQSELRRHQRC
.: : ::. :. ..: .:. : :.
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pF1KB8 HTGEKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSSSLVLHYRFHTGE
. ::::.:..::.::.: :.::.:.::::::.:::: :: ..: .::.:. : :.::::
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pF1KB8 KPYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIVHYRFHTGEKPYK
:::::..::
XP_016 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
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>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (658 aa)
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Smith-Waterman score: 1108; 55.5% identity (78.7% similar) in 272 aa overlap (132-398:277-548)
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pF1KB8 KHIQDVLQFSKLKAACGCDGQLEMQQIKQERHLKQMSTI--HKSATTLSRDYKWNGFGRS
: ..:.. . :. . : . :. . :.:
NP_001 CLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKS
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pF1KB8 LGLRSVLVNQHSILMGEGSYKCDT---EFRQTLGGNNSQRTHPEKKSCKCNECGKSFHFQ
...:: . ... :: :.:. :::.. .. : : .: .:.::::.: .
NP_001 FSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHS
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pF1KB8 SELRRHQRCHTGEKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSSSLV
: : .::: ::::::::: .::.:: .:. ::.:::::::::::::.:::.:::::. :.
NP_001 SSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLT
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pF1KB8 LHYRFHTGEKPYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIVHYR
: :.::::::: :::::..:.:.::: .:.::::::::::: .::..: ::. : : :
NP_001 EHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQR
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pF1KB8 FHTGEKPYKCNKCGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNECGRAFAHTASLIKHQRSHAG
.:::::::.:: ::.:::.:::::.: :.:::::::.::.:::::.. : ::.::: :.:
NP_001 IHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTG
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pF1KB8 KKTL
.:
NP_001 EKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPY
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pF1KB8 EKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSSSLVLHYRFHTGEKPY
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NP_001 EKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPY
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pF1KB8 KCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIVHYRFHTGEKPYKCNK
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NP_001 GCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRD
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pF1KB8 CGRAFSQSSSLTQHYRFHTGEKPYKCNECGRAFAHTASLIKHQRSHAGKKTL
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NP_001 CGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650
>--
initn: 704 init1: 359 opt: 364 Z-score: 238.3 bits: 53.7 E(85289): 1.6e-06
Smith-Waterman score: 601; 38.5% identity (62.2% similar) in 296 aa overlap (1-294:14-276)
10 20 30 40
pF1KB8 MTFEDVAVEFSQWEWGQLNPAQKDLYREVMLENFRNLAILGLLVSKP
.:::::.: ::: :::::.:::. :::.:::..:: :. .: . ::
NP_001 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 YVICQLEEGGEPFMVEREISTGAHSDWKRRSKSKESMPSWGISKEELFQVVSVEKHIQDV
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NP_001 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDG
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pF1KB8 LQFSKLKAACGCDGQLEMQQIKQERHLKQMSTIHKSATTLSRDYKWNGFGRSLGLRSVLV
: . . . . .:. : . . : : .. : . .... ::::....: :
NP_001 LWYCRGEDT---EGHWEWSCESLES-LAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 NQHSILMGEGSYKCDTEFRQT--LGGNNSQRTHPEKKSCKCNECGKSFHFQSELRRHQRC
.: : ::. :. ..: .:. : :.
NP_001 HQPM-----------TPERQSPHTWGTRGKREKPD------------------LNVLQKT
180 190 200
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pF1KB8 HTGEKPYECSDCGRAFGHISSLIKHQRTHTGEKPYECSECGRAFSQSSSLVLHYRFHTGE
. ::::.:..::.::.: :.::.:.::::::.:::: :: ..: .::.:. : :.::::
NP_001 CVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
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pF1KB8 KPYKCNECGRAFGHTSSLIKHQRTHTGEKPYECRECGRTFSQSSSLIVHYRFHTGEKPYK
:::::..::
NP_001 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
270 280 290 300 310 320
400 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:04:59 2016 done: Fri Nov 4 15:05:00 2016
Total Scan time: 6.300 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]