Result of FASTA (omim) for
pF1KB8725
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8725, 664 aa
1>>>pF1KB8725 664 - 664 aa - 664 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2096+/-0.000477; mu= 20.0885+/- 0.029
mean_var=69.3153+/-14.550, 0's: 0 Z-trim(108.9): 55 B-trim: 931 in 1/51
Lambda= 0.154049
statistics sampled from 16943 (16996) to 16943 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.534), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 10.700
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000334 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose cot ( 664) 4379 983.1 0
NP_001243243 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose ( 537) 3541 796.8 0
NP_003032 (OMIM: 182381,233100) sodium/glucose cot ( 672) 2809 634.2 4.6e-181
XP_011528633 (OMIM: 182380,606824) PREDICTED: sodi ( 432) 2805 633.2 6e-181
XP_006721135 (OMIM: 182381,233100) PREDICTED: sodi ( 705) 2669 603.1 1.1e-171
XP_016878391 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 2260 512.2 2.5e-144
NP_443176 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol cotra ( 675) 2260 512.2 2.5e-144
XP_016878392 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 2260 512.2 2.5e-144
XP_005255137 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 2260 512.2 2.5e-144
XP_016878390 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 2260 512.2 2.5e-144
XP_016878389 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 2260 512.2 2.5e-144
XP_016878393 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 662) 2164 490.9 6.5e-138
NP_001245342 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 611) 2110 478.8 2.5e-134
XP_016878395 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 611) 2110 478.8 2.5e-134
NP_008864 (OMIM: 600444) sodium/myo-inositol cotra ( 718) 2109 478.7 3.3e-134
NP_001245341 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 605) 1679 383.0 1.7e-105
XP_006721078 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 576) 1663 379.5 1.9e-104
XP_011544027 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 627) 1663 379.5 2e-104
XP_016878394 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 640) 1663 379.5 2.1e-104
NP_001245340 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 640) 1663 379.5 2.1e-104
XP_005255139 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 514) 1645 375.4 2.8e-103
XP_011544030 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 365) 1003 232.7 1.9e-60
XP_016878396 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 583) 864 201.9 5.5e-51
XP_016878397 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 583) 864 201.9 5.5e-51
NP_001245343 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 519) 714 168.5 5.4e-41
XP_016878398 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 548) 623 148.3 6.9e-35
NP_000444 (OMIM: 274400,601843) sodium/iodide cotr ( 643) 286 73.5 2.8e-12
XP_011526494 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 654) 286 73.5 2.8e-12
XP_011518223 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 413) 281 72.2 4.2e-12
XP_006718219 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 417) 281 72.2 4.2e-12
NP_848593 (OMIM: 612455) sodium-coupled monocarbox ( 618) 281 72.4 5.8e-12
XP_006712192 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 266 69.0 6e-11
XP_006712193 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 266 69.0 6e-11
NP_066918 (OMIM: 604024) sodium-dependent multivit ( 635) 266 69.0 6e-11
XP_006712191 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 266 69.0 6e-11
NP_068587 (OMIM: 158580,608761,617143) high affini ( 580) 265 68.8 6.5e-11
NP_001291934 (OMIM: 158580,608761,617143) high aff ( 580) 265 68.8 6.5e-11
XP_016874399 (OMIM: 608044) PREDICTED: sodium-coup ( 444) 254 66.3 2.9e-10
NP_666018 (OMIM: 608044) sodium-coupled monocarbox ( 610) 254 66.3 3.7e-10
XP_016860705 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 426) 247 64.7 8.1e-10
XP_011531448 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 412) 239 62.9 2.7e-09
XP_016882647 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 554) 195 53.2 3e-06
XP_011526495 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 565) 195 53.2 3.1e-06
XP_016860117 (OMIM: 158580,608761,617143) PREDICTE ( 542) 185 51.0 1.4e-05
XP_011509882 (OMIM: 158580,608761,617143) PREDICTE ( 496) 173 48.3 8.2e-05
NP_001291936 (OMIM: 158580,608761,617143) high aff ( 333) 167 46.8 0.00015
XP_016860118 (OMIM: 158580,608761,617143) PREDICTE ( 475) 167 46.9 0.0002
NP_001291935 (OMIM: 158580,608761,617143) high aff ( 475) 167 46.9 0.0002
XP_016872733 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 430) 163 46.0 0.00034
XP_011518222 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 430) 163 46.0 0.00034
>>NP_000334 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose cotrans (664 aa)
initn: 4379 init1: 4379 opt: 4379 Z-score: 5257.5 bits: 983.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4379; 100.0% identity (100.0% similar) in 664 aa overlap (1-664:1-664)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSSTWSPKTTAVTRPVETHELIRNAADISIIVIYFVVVMAVGLWAMFSTNRGTVGGFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MDSSTWSPKTTAVTRPVETHELIRNAADISIIVIYFVVVMAVGLWAMFSTNRGTVGGFFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 AGRSMVWWPIGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGIAIGGFEWNALVLVVVLGWLFVPIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AGRSMVWWPIGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGIAIGGFEWNALVLVVVLGWLFVPIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 PTIVSDGNTTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTDQVIVQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PTIVSDGNTTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTDQVIVQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 CLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKYCGTKVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKYCGTKVG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 CTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTMDIYAKVRKRASEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTMDIYAKVRKRASEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 ELMIAGRLFILVLIGISIAWVPIVQSAQSGQLFDYIQSITSYLGPPIAAVFLLAIFWKRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ELMIAGRLFILVLIGISIAWVPIVQSAQSGQLFDYIQSITSYLGPPIAAVFLLAIFWKRV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 NEPGAFWGLILGLLIGISRMITEFAYGTGSCMEPSNCPTIICGVHYLYFAIILFAISFIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NEPGAFWGLILGLLIGISRMITEFAYGTGSCMEPSNCPTIICGVHYLYFAIILFAISFIT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 IVVISLLTKPIPDVHLYRLCWSLRNSKEERIDLDAEEENIQEGPKETIEIETQVPEKKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IVVISLLTKPIPDVHLYRLCWSLRNSKEERIDLDAEEENIQEGPKETIEIETQVPEKKKG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 IFRRAYDLFCGLEQHGAPKMTEEEEKAMKMKMTDTSEKPLWRTVLNVNGIILVTVAVFCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IFRRAYDLFCGLEQHGAPKMTEEEEKAMKMKMTDTSEKPLWRTVLNVNGIILVTVAVFCH
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 AYFA
::::
NP_000 AYFA
>>NP_001243243 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose cotr (537 aa)
initn: 3541 init1: 3541 opt: 3541 Z-score: 4252.3 bits: 796.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3541; 100.0% identity (100.0% similar) in 537 aa overlap (128-664:1-537)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 IGGFEWNALVLVVVLGWLFVPIYIKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTK
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 ISADIFSGAIFINLALGLNLYLAIFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISADIFSGAIFINLALGLNLYLAIFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLI
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 LTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKAIPTIVSDGNTTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKAIPTIVSDGNTTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWP
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GFIFGMSILTLWYWCTDQVIVQRCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFIFGMSILTLWYWCTDQVIVQRCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRI
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 LYTEKIACVVPSECEKYCGTKVGCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LYTEKIACVVPSECEKYCGTKVGCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSI
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 FNSASTLFTMDIYAKVRKRASEKELMIAGRLFILVLIGISIAWVPIVQSAQSGQLFDYIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FNSASTLFTMDIYAKVRKRASEKELMIAGRLFILVLIGISIAWVPIVQSAQSGQLFDYIQ
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 SITSYLGPPIAAVFLLAIFWKRVNEPGAFWGLILGLLIGISRMITEFAYGTGSCMEPSNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SITSYLGPPIAAVFLLAIFWKRVNEPGAFWGLILGLLIGISRMITEFAYGTGSCMEPSNC
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 PTIICGVHYLYFAIILFAISFITIVVISLLTKPIPDVHLYRLCWSLRNSKEERIDLDAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTIICGVHYLYFAIILFAISFITIVVISLLTKPIPDVHLYRLCWSLRNSKEERIDLDAEE
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 ENIQEGPKETIEIETQVPEKKKGIFRRAYDLFCGLEQHGAPKMTEEEEKAMKMKMTDTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENIQEGPKETIEIETQVPEKKKGIFRRAYDLFCGLEQHGAPKMTEEEEKAMKMKMTDTSE
460 470 480 490 500 510
640 650 660
pF1KB8 KPLWRTVLNVNGIILVTVAVFCHAYFA
:::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPLWRTVLNVNGIILVTVAVFCHAYFA
520 530
>>NP_003032 (OMIM: 182381,233100) sodium/glucose cotrans (672 aa)
initn: 2712 init1: 1600 opt: 2809 Z-score: 3371.6 bits: 634.2 E(85289): 4.6e-181
Smith-Waterman score: 2809; 60.4% identity (85.6% similar) in 659 aa overlap (22-664:19-672)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSSTWSPKTTAVTRPVETHELIRNAADISIIVIYFVVVMAVGLWAMFSTNRGTVGGFFL
:: : ::: .:. ::..:..::::.: ::::::::.::
NP_003 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 AGRSMVWWPIGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGIAIGGFEWNALVLVVVLGWLFVPIY
:::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:..::::::: .:..:::::.:.:
NP_003 AGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYLA
. :::.:::.::::::::.::..:::.:::.::::::::.:.::::.::. ::: :.: .
NP_003 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKAI
.. ::.:: .::.::::::..::::.:: ..: :. :: :.::::::::.....::. :
NP_003 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB8 PTI-VSD----GN-TTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTD
.. ::. :: ..: :: :: ::.:..: :.:::::::....:..:.. ::::.:
NP_003 TSLTVSEDPAVGNISSF---CYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 QVIVQRCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKY
::::::::..:...:.:.:::::::::: :::.:::::::::::: ...::::: :..
NP_003 QVIVQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 CGTKVGCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTMDIYAKVR
:::.:::.::::: :::.:::::::::::.::::.:::::.:::::.:::::::::...:
NP_003 CGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGLRGLMLAVMLAALMSSLASIFNSSSTLFTMDIYTRLR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KRASEKELMIAGRLFILVLIGISIAWVPIVQSAQSGQLFDYIQSITSYLGPPIAAVFLLA
::...::...:::... .. .:.::.:.::.::.::::::::...:::.::..:::.::
NP_003 PRAGDRELLLVGRLWVVFIVVVSVAWLPVVQAAQGGQLFDYIQAVSSYLAPPVSAVFVLA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 IFWKRVNEPGAFWGLILGLLIGISRMITEFAYGTGSCMEPSNCPTIICGVHYLYFAIILF
.: :::: ::::::: :::.:..:.: ::..:.:::..:: ::...::::::::::.::
NP_003 LFVPRVNEQGAFWGLIGGLLMGLARLIPEFSFGSGSCVQPSACPAFLCGVHYLYFAIVLF
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KB8 AISFITIVVISLLTKPIPDVHLYRLCWSLRNSKEERIDLDAEEEN-----IQEG-PKETI
: . ...:: : ::: ::.:: .:::.::::: ::::.:.. .:.: :. ..
NP_003 FCSGLLTLTVSLCTAPIPRKHLHRLVFSLRHSKEEREDLDADEQQGSSLPVQNGCPESAM
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 EI-ETQVPEKKKGIFRRAYDLFCGLEQHGA---PKMTEEEEKAMKMKMTDTSEKPLWRTV
:. : :.: . .::. :::. . :. : .:.:: : .. : :: : : :
NP_003 EMNEPQAPAPS--LFRQCLLWFCGMSRGGVGSPPPLTQEEAAAAARRLEDISEDPSWARV
600 610 620 630 640 650
650 660
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.:.:......:::: ...:
NP_003 VNLNALLMMAVAVFLWGFYA
660 670
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGRSMVWWPIGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGIAIGGFEWNALVLVVVLGWLFVPIY
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XP_011 IKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYLA
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:::::::
XP_011 ELMIAGREPFGD
430
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.: ... ::.:: .::.::::::..::::.:: ..: :. :: :.::::::::.....::
XP_006 IYASVIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKY
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. : .. ::. :: ..: :: :: ::.:..: :.:::::::....:..:.. ::
XP_006 LGAATSLTVSEDPAVGNISSF---CYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWY
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...: ::...::...:::... .. .:.::.:.::.::.::::::::...:::.::..::
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XP_006 FVLALFVPRVNEQGAFWGLIGGLLMGLARLIPEFSFGSGSCVQPSACPAFLCGVHYLYFA
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XP_006 IVLFFCSGLLTLTVSLCTAPIPRKHLHRLVFSLRHSKEEREDLDADEQQGSSLPVQNGCP
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pF1KB8 KETIEIETQVPEKKKGI-------------------------FRRAYDLFCGLEQHGA--
. ..:.. ..: . :. ::. :::. . :.
XP_006 ESAMEMNGRAPCWEVGLEELSSRKLTAGPQFPSEPQAPAPSLFRQCLLWFCGMSRGGVGS
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620 630 640 650 660
pF1KB8 -PKMTEEEEKAMKMKMTDTSEKPLWRTVLNVNGIILVTVAVFCHAYFA
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XP_006 PPPLTQEEAAAAARRLEDISEDPSWARVVNLNALLMMAVAVFLWGFYA
660 670 680 690 700
>>XP_016878391 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo-inos (675 aa)
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10 20 30 40 50
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::: .:::::.::::::::.:::::.::::.:::.::.....: :.: :..:.:.:.::
XP_016 LAGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAWIFLPI
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 YIKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYL
:: . :.:::::::::::: :: . :..: :..:::::::.:...:::::. .: :.:::
XP_016 YIAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLHLDLYL
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180 190 200 210 220 230
pF1KB8 AIFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKA
:: ::::::.::..::::::::::.:::.:::.:.: : :..: :::.... :::. :
XP_016 AIVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLA
180 190 200 210 220 230
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pF1KB8 IPTIVSDGNTTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTDQVIVQ
. . :.... : :: :.:::::::::.:::::: .::::: .::::::::::::
XP_016 LASNRSENSS-----CGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVIVQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KB8 RCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKYCGTKV
: :.:::.::.::: .. .:::..:.::::.:::.::::. ...::. : :.: :..
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::..:::: ::.::.:.::::::..::.:.::::::::::::::.::::.. ..: ::::
XP_016 GCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRASE
360 370 380 390 400 410
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XP_016 FEMVQENTSKTHSCDMTPKQSKVV--KAILWLCGIQEKGKEELPARAEAII----VSLEE
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640 650 660
pF1KB8 KPLWRTVLNVNGIILVTVAVFCHAYFA
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XP_016 NPLVKTLLDVNLIFCVSCAIFIWGYFA
650 660 670
>>NP_443176 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol cotranspo (675 aa)
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Smith-Waterman score: 2322; 50.5% identity (78.6% similar) in 687 aa overlap (1-664:1-675)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDSSTWSPKTTAVTRPVETH-ELIRNAADISIIVIYFVVVMAVGLWAMFSTNRGTVGGFF
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pF1KB8 YIKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYL
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NP_443 YIAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLHLDLYL
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pF1KB8 AIFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKA
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NP_443 AIVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLA
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pF1KB8 IPTIVSDGNTTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTDQVIVQ
. . :.... : :: :.:::::::::.:::::: .::::: .::::::::::::
NP_443 LASNRSENSS-----CGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVIVQ
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pF1KB8 RCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKYCGTKV
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NP_443 RTLAAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFPGMVSRILFPDQVACADPEICQKICSNPS
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pF1KB8 GCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTMDIYAKVRKRASE
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NP_443 GCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRASE
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pF1KB8 KELMIAGRLFILVLIGISIAWVPIVQSAQSGQLFDYIQSITSYLGPPIAAVFLLAIFWKR
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NP_443 KELMIVGRVFVLLLVLVSILWIPVVQASQGGQLFIYIQSISSYLQPPVAVVFIMGCFWKR
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pF1KB8 VNEPGAFWGLILGLLIGISRMITEFAYGTGSCMEPSNCPTIICGVHYLYFAIILFAISFI
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NP_443 TNEKGAFWGLISGLLLGLVRLVLDFIYVQPRCDQPDERPVLVKSIHYLYFSMILSTVTLI
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pF1KB8 TIVVISLLTKPIPDVHLYRLCWSLRNS----KEER-----IDLDAEEENIQEGPKET-IE
:. ..: .:.: . .: : :.. ::. ..: .... :. . . ..
NP_443 TVSTVSWFTEPPSKEMVSHLTWFTRHDPVVQKEQAPPAAPLSLTLSQNGMPEASSSSSVQ
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630
pF1KB8 IET------------QVPEKKKGIFRRAYDLFCGLEQHGAPKMTEEEEKAMKMKMTDTSE
.: ..:...: . .: .::....: .. . : . .. :
NP_443 FEMVQENTSKTHSCDMTPKQSKVV--KAILWLCGIQEKGKEELPARAEAII----VSLEE
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pF1KB8 KPLWRTVLNVNGIILVTVAVFCHAYFA
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NP_443 NPLVKTLLDVNLIFCVSCAIFIWGYFA
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>>XP_016878392 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo-inos (675 aa)
initn: 2309 init1: 1338 opt: 2260 Z-score: 2712.2 bits: 512.2 E(85289): 2.5e-144
Smith-Waterman score: 2322; 50.5% identity (78.6% similar) in 687 aa overlap (1-664:1-675)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDSSTWSPKTTAVTRPVETH-ELIRNAADISIIVIYFVVVMAVGLWAMFSTNRGTVGGFF
:.:.: ::. . :... . . .::...:.::. :.:::::. .:.: :: :.:
XP_016 MESGTSSPQPPQLD-PLDAFPQKGLEPGDIAVLVLYFLFVLAVGLWSTVKTKRDTVKGYF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LAGRSMVWWPIGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGIAIGGFEWNALVLVVVLGWLFVPI
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XP_016 LAGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAWIFLPI
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pF1KB8 YIKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYL
:: . :.:::::::::::: :: . :..: :..:::::::.:...:::::. .: :.:::
XP_016 YIAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLHLDLYL
120 130 140 150 160 170
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pF1KB8 AIFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKA
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XP_016 AIVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLA
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pF1KB8 IPTIVSDGNTTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTDQVIVQ
. . :.... : :: :.:::::::::.:::::: .::::: .::::::::::::
XP_016 LASNRSENSS-----CGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVIVQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KB8 RCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKYCGTKV
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XP_016 RTLAAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFPGMVSRILFPDQVACADPEICQKICSNPS
300 310 320 330 340 350
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pF1KB8 GCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTMDIYAKVRKRASE
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XP_016 GCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRASE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KELMIAGRLFILVLIGISIAWVPIVQSAQSGQLFDYIQSITSYLGPPIAAVFLLAIFWKR
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]