FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8709, 405 aa
1>>>pF1KB8709 405 - 405 aa - 405 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6124+/-0.00131; mu= 14.7371+/- 0.078
mean_var=60.7021+/-12.238, 0's: 0 Z-trim(100.2): 55 B-trim: 122 in 1/48
Lambda= 0.164616
statistics sampled from 5965 (6020) to 5965 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16
Scan time: 2.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 2626 632.7 1.8e-181
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 1108 272.2 6.3e-73
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 1077 264.9 1e-70
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 1047 257.7 1.4e-68
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 1026 252.8 4.4e-67
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 1015 250.1 2.9e-66
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CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 966 238.5 8.8e-63
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 895 221.6 1e-57
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CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 655 164.6 1.4e-40
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 653 164.2 2.2e-40
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 636 160.2 4e-39
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 629 158.4 8.9e-39
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 615 155.1 1.1e-37
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 615 155.1 1.1e-37
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 614 154.9 1.4e-37
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 607 153.2 3.7e-37
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 558 141.6 1.2e-33
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 531 135.2 1.1e-31
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 530 135.0 1.3e-31
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 528 134.5 1.7e-31
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 528 134.5 1.7e-31
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 519 132.3 7.4e-31
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 505 129.0 7.5e-30
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 485 124.3 2e-28
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CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 457 117.6 1.9e-26
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 439 113.3 3.7e-25
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 434 112.2 9.5e-25
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 396 103.1 4.7e-22
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 396 103.1 4.8e-22
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 391 101.9 6.8e-22
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 376 98.4 1.6e-20
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 367 96.3 6e-20
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 358 94.1 3e-19
CCDS1585.1 AGT gene_id:183|Hs108|chr1 ( 485) 327 86.8 4.9e-17
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 304 81.3 1.8e-15
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 268 72.7 3.4e-13
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 253 69.2 8.4e-12
>>CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 (405 aa)
initn: 2626 init1: 2626 opt: 2626 Z-score: 3371.5 bits: 632.7 E(32554): 1.8e-181
Smith-Waterman score: 2626; 99.8% identity (100.0% similar) in 405 aa overlap (1-405:1-405)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPLLLYTCLLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MPLLLYTCLLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KNIFISPVSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KNIFISPVSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TSLEMTMGNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 TSLEMTMGNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KIVDLFSGLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KIVDLFSGLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SYLHDAELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTSSQVDLY
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SYLHDSELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTSSQVDLY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IPKVTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 IPKVTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB8 AGSTGVTLNLTSKPIILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 AGSTGVTLNLTSKPIILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
370 380 390 400
>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 (423 aa)
initn: 1104 init1: 686 opt: 1108 Z-score: 1422.8 bits: 272.2 E(32554): 6.3e-73
Smith-Waterman score: 1108; 48.5% identity (77.2% similar) in 373 aa overlap (38-404:48-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 CLLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPKKNIFISP
:::::::::::::::.:: .: ::...::
CCDS32 CPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSLYKQLVLKAPDKNVIFSP
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSDTSLEMTM
.::: :::.::::. . : ...:.:: ::::: ::.::::.:::: . . .:. :...:
CCDS32 LSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSFQHLLRTLNQSSDELQLSM
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQGKIVDLFS
:::.:. .: ::. :. : :. : ::..: .::: :.:.. ::.:::: :.:::.::..
CCDS32 GNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLINDYVKNGTRGKITDLIK
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMM-LQSSTISYLHDA
::: ...:::::::::. : .::: .:.. ::... : :::: :. :: :..:
CCDS32 DLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKKWVMVPMMSLHHLTIPYFRDE
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTSSQV-DLYIPKVT
:: : .:...:.::....:::::. ::. : : : .:..:: .: .. .::.:: .
CCDS32 ELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKRWRDSLEFREIGELYLPKFS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDTAGSTG
:: :.:.:.: ..:: . ::..:..: :: .: :.:::::::.. :::......:.
CCDS32 ISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVVHKAVLDVFEEGTEASAATA
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400
pF1KB8 VTLNLTSKPI----ILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
: ..: : . :.:::.::...: : . .:...: ::
CCDS32 VKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVTNPKQA
380 390 400 410 420
>>CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 (427 aa)
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Smith-Waterman score: 1077; 45.2% identity (76.5% similar) in 374 aa overlap (39-404:51-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 LLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPKKNIFISPV
.: ::.:::: .: ... .: ::::.::.
CCDS99 QLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANADFAFRFYYLIASETPGKNIFFSPL
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSDTSLEMTMG
::: : ::::::.:.:.:.:.:.:::::::: ::...:.::::: . . .:: .:
CCDS99 SISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHRGFQHLLHTLNLPGHGLETRVG
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQGKIVDLFSG
.::::. .:..: .: : ::.... :: : . . . ::..::..:.:::::: :
CCDS99 SALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTIQLINDHVKKETRGKIVDLVSE
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTIS-YLHDAE
: . ...::::::.::. : .:: . : ..:::::.:.:.::::::.. ::::
CCDS99 LKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENTTVRVPMMLQDQEHHWYLHDRY
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTS----SQVDLYIPK
:::....:.: :..:::::::..::: . .:. . . ::. : . ....:..::
CCDS99 LPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLMRWNNLLRKRNFYKKLELHLPK
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDTAGS
.::: : : ..: ..:..:::.. :..: ::.. .:..:: :::.:...: :...:..
CCDS99 FSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEASKSFHKATLDVDEAGTEAAAA
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400
pF1KB8 TGVTLNLTSKPI---ILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
:. .... : :::::.::...::. : : :::..:..:
CCDS99 TSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLGKVVDPTKP
390 400 410 420
>>CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 (418 aa)
initn: 1047 init1: 1047 opt: 1047 Z-score: 1344.6 bits: 257.7 E(32554): 1.4e-68
Smith-Waterman score: 1052; 42.6% identity (75.2% similar) in 411 aa overlap (3-404:11-415)
10 20 30 40
pF1KB8 MPLLLYTCLLWLPTSGLWTVQAMDP--NAAYVNMSNHHR------GLASANV
:: : : .:.: : :: .:: . ..:: . . :.
CCDS99 MPSSVSWGILLLAGLCCL-VPVS-----LAEDPQGDAAQKTDTSHHDQDHPTFNKITPNL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 -DFAFSLYKHLVALSPKKNIFISPVSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSET
.::::::..:. : . :::.:::::. :.::::::: . :. ..:.::.::::: :.
CCDS99 AEFAFSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 EIHQGFQHLHQLFAKSDTSLEMTMGNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDW
.::.:::.: . . . :..:..: ::.:::. .:.:...: :.:. :.::....:: :
CCDS99 QIHEGFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 ATASRQINSYVKNKTQGKIVDLFSGLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYV
:..:::.::.. :::::::: . :: ....::::::::: : .::.. .:.::.:.:
CCDS99 EEAKKQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEEDFHV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 DETTVVKVPMMLQSSTISYLHDAELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRD
:..:.:::::: . . .. : .: .. :.:.::.:..:.:::.::.. . :..:
CCDS99 DQVTTVKVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 TINRWSAGLTSSQVDLYIPKVTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSS
:... . ...:..::..:.:.::: .:: ..::. .:.: :..: .:..: :: :
CCDS99 IITKFLENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLKLS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 KVVHKAVLQLNEEGVDTAGSTGVTLNLTSKPIILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMN
:.:::::: ..:.:...::. . : : ..::.::....... : : ::...:.:
CCDS99 KAVHKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVVN
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 PV
:
CCDS99 PTQK
>>CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 (406 aa)
initn: 990 init1: 953 opt: 1026 Z-score: 1317.9 bits: 252.8 E(32554): 4.4e-67
Smith-Waterman score: 1026; 40.7% identity (72.2% similar) in 410 aa overlap (1-404:1-406)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MPLLLYTCLLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLA---SANVDFAFSLYKHLVAL
: :.: ::. : .: ... : . . : : . :. ::.:.::. :..
CCDS99 MQLFLLLCLVLLSPQGA-SLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRDFTFDLYRALASA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 SPKKNIFISPVSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFA
.:...::.:::::::.:::::::. . :. :.:.:::.:: . :: :.:.:::.: : .
CCDS99 APSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGFQQLLQELN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 KSDTSLEMTMGNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNK
. ......::::: : ..: ..: . .: : .... ::.: : : .:::.:: ..
CCDS99 QPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAMKQINDYVAKQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TQGKIVDLFSGLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQS
:.::::::...::: :....:::::::. : :. .:.:..::: :::.:::: .
CCDS99 TKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSETVVRVPMMSRE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 STISYLHDAELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTSSQV
. :: : .: :..: . : ::.:..::::..:::. : .::. :. .: . . :.
CCDS99 DQYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLRKWLKMFKKRQL
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300 310 320 330 340 350
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360 370 380 390 400
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20 30 40 50 60 70
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80 90 100 110 120
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130 140 150 160 170 180
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370 380 390 400
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CCDS41 IVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVENPTKS
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CCDS14 NSHVEMQTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTTTV
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CCDS14 QVPMMHQMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKKWN
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CCDS14 RLLQKGWVDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKLSNAAHKA
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CCDS14 VLHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPII-QIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVVNP
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pF1KB8 V
CCDS14 TEA
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CCDS32 YKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQGFR
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CCDS32 QLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSHKA
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.....:.:.......:. .:: : : .::.::...... : : :::..:.::
CCDS32 MVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHA-HFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVNP
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pF1KB8 V
:
CCDS32 VAG
420
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CCDS99 KGLLKPSFSPRNYKALSEVQGWKQRMAAKELARQNMDLGFKLLKKLAFYNPGRNIFLSPL
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CCDS99 SISTAFSMLCLGAQDSTLDEIKQG--FNFRKMPEKDLHEGFHYIIHELTQKTQ-DLKLSI
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CCDS99 GNTLFIDQRLQPQRKFLEDAKNFYSAETILTNFQNLEMAQKQINDFISQKTHGKINNLIE
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CCDS99 NIDPGTVMLLANYIFFRARWKHEFDPNVTKEEDFFLEKNSSVKVPMMFRSGIYQVGYDDK
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CCDS99 LSCTILEIPYQKNITAIFILPDEGKLKHLEKGLQVDTFSRWKTLLSRRVVDVSVPRLHMT
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CCDS99 TLPMET-PLVVKIDKPYLLLIYSEKIPSVLFLGKIVNPIGK
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CCDS61 TDGILFLGKVENPTKS
280
405 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 14:48:18 2016 done: Fri Nov 4 14:48:19 2016
Total Scan time: 2.540 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]