Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8697
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8697, 546 aa
1>>>pF1KB8697 546 - 546 aa - 546 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1963+/-0.00105; mu= -5.1930+/- 0.063
mean_var=414.9419+/-86.971, 0's: 0 Z-trim(115.1): 48 B-trim: 263 in 1/54
Lambda= 0.062962
statistics sampled from 15667 (15702) to 15667 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.777), E-opt: 0.2 (0.482), width: 16
Scan time: 3.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS353.1 TXLNA gene_id:200081|Hs108|chr1 ( 546) 3544 336.1 6.7e-92
CCDS14178.1 TXLNG gene_id:55787|Hs108|chrX ( 528) 1612 160.5 4.4e-39
CCDS34545.1 TXLNB gene_id:167838|Hs108|chr6 ( 684) 1501 150.6 5.7e-36
CCDS55373.1 TXLNG gene_id:55787|Hs108|chrX ( 396) 1413 142.3 9.9e-34
>>CCDS353.1 TXLNA gene_id:200081|Hs108|chr1 (546 aa)
initn: 3544 init1: 3544 opt: 3544 Z-score: 1763.4 bits: 336.1 E(32554): 6.7e-92
Smith-Waterman score: 3544; 99.6% identity (100.0% similar) in 546 aa overlap (1-546:1-546)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKNQDKKNGAAQQSNPKSSPGQPEAGPEGAQERPSQAAPAVEAEGPGSSQAPRKPEGAQA
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MKNQDKKNGAAKQSNPKSSPGQPEAGPEGAQERPSQAAPAVEAEGPGSSQAPRKPEGAQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RTAQSGALRDVSEELSRQLEDILSTYCVDNNQGGPGEDGAQGEPAEPEDAEKSRTYVARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RTAQSGALRDVSEELSRQLEDILSTYCVDNNQGGPGEDGAQGEPAEPEDAEKSRTYVARN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GEPEPTPVVNGEKEPSKGDPNTEEIRQSDEVGDRDHRRPQEKKKAKGLGKEITLLMQTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GEPEPTPVVNGEKEPSKGDPNTEEIRQSDEVGDRDHRRPQEKKKAKGLGKEITLLMQTLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TLSTPEEKLAALCKKYAELLEEHRNSQKQMKLLQKKQSQLVQEKDHLRGEHSKAVLARSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TLSTPEEKLAALCKKYAELLEEHRNSQKQMKLLQKKQSQLVQEKDHLRGEHSKAVLARSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LESLCRELQRHNRSLKEEGVQRAREEEEKRKEVTSHFQVTLNDIQLQMEQHNERNSKLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LESLCRELQRHNRSLKEEGVQRAREEEEKRKEVTSHFQVTLNDIQLQMEQHNERNSKLRQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ENMELAERLKKLIEQYELREEHIDKVFKHKDLQQQLVDAKLQQAQEMLKEAEERHQREKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ENMELAERLKKLIEQYELREEHIDKVFKHKDLQQQLVDAKLQQAQEMLKEAEERHQREKD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 FLLKEAVESQRMCELMKQQETHLKQQLALYTEKFEEFQNTLSKSSEVFTTFEQEMEKMTK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS35 FLLKEAVESQRMCELMKQQETHLKQQLALYTEKFEEFQNTLSKSSEVFTTFKQEMEKMTK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 KIKKLEKETTMYRSRWESSNKALLEMAEEKTVRDKELEGLQVKIQRLEKLCRALQTERND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KIKKLEKETTMYRSRWESSNKALLEMAEEKTVRDKELEGLQVKIQRLEKLCRALQTERND
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LNKRVQDLSAGGQGSLTDSGPERRPEGPGAQAPSSPRVTEAPCYPGAPSTEASGQTGPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LNKRVQDLSAGGQGSLTDSGPERRPEGPGAQAPSSPRVTEAPCYPGAPSTEASGQTGPQE
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 PTSARA
::::::
CCDS35 PTSARA
>>CCDS14178.1 TXLNG gene_id:55787|Hs108|chrX (528 aa)
initn: 1602 init1: 1602 opt: 1612 Z-score: 815.1 bits: 160.5 E(32554): 4.4e-39
Smith-Waterman score: 1631; 58.5% identity (80.8% similar) in 463 aa overlap (28-488:7-455)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MKNQDKKNGAAQQSNPKSSPGQPEAGPEGAQERPSQAAPAVEAEGPGSSQAPRKPE--GA
:.:. : . : :.:: : ..::. :.
CCDS14 MATRVEEAARGRGGGAEEATEAGRGGRRRSPRQKFEIGT
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 QARTAQSGALRDVSEELSRQLEDILSTYCVDNNQGGPGEDGAQGEPAEPEDAEKSRTYVA
. ... : .. . : .:::. .: :: .. . : . ..:. :.
CCDS14 MEEAGICGLGVKADMLCNSQSNDILQHQ--GSNCGGTSNKHSLEEDEGSDFITENRNLVS
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 RNGEPEPTPVVNGEKEPSKGDPNTEEIRQSDEVGDRDHRRPQEKKKAKGLGKEITLLMQT
:. .. .: : : : . :..: . ...: : ::::. ::::.
CCDS14 ------PAYCTQESREEIPGG----EARTDPPDGQQDSE--CNRNKEKTLGKEVLLLMQA
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LNTLSTPEEKLAALCKKYAELLEEHRNSQKQMKLLQKKQSQLVQEKDHLRGEHSKAVLAR
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CCDS14 LNTLSTPEEKLAALCKKYADLLEESRSVQKQMKILQKKQAQIVKEKVHLQSEHSKAILAR
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SKLESLCRELQRHNRSLKEEGVQRAREEEEKRKEVTSHFQVTLNDIQLQMEQHNERNSKL
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CCDS14 SKLESLCRELQRHNKTLKEENMQQAREEEERRKEATAHFQITLNEIQAQLEQHDIHNAKL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 RQENMELAERLKKLIEQYELREEHIDKVFKHKDLQQQLVDAKLQQAQEMLKEAEERHQRE
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CCDS14 RQENIELGEKLKKLIEQYALREEHIDKVFKHKELQQQLVDAKLQQTTQLIKEADEKHQRE
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 KDFLLKEAVESQRMCELMKQQETHLKQQLALYTEKFEEFQNTLSKSSEVFTTFEQEMEKM
..::::::.::.. : :::::..:::::.:: .::::::.:..::.:.::::.::::::
CCDS14 REFLLKEATESRHKYEQMKQQEVQLKQQLSLYMDKFEEFQTTMAKSNELFTTFRQEMEKM
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 TKKIKKLEKETTMYRSRWESSNKALLEMAEEKTVRDKELEGLQVKIQRLEKLCRALQTER
::::::::::: ..:..::..:::::.::::::::::: ..::.:..:::::::::::::
CCDS14 TKKIKKLEKETIIWRTKWENNNKALLQMAEEKTVRDKEYKALQIKLERLEKLCRALQTER
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 NDLNKRVQDLSAGGQGSLTDSGPERRPEGPGAQAPSSPRVTEAPCYPGAPSTEASGQTGP
:.::..:. :
CCDS14 NELNEKVEVLKEQVSIKAAIKAANRDLATPVMQPCTALDSHKELNTSSKRALGAHLEAEP
450 460 470 480 490 500
>>CCDS34545.1 TXLNB gene_id:167838|Hs108|chr6 (684 aa)
initn: 1563 init1: 1454 opt: 1501 Z-score: 759.2 bits: 150.6 E(32554): 5.7e-36
Smith-Waterman score: 1587; 52.6% identity (78.6% similar) in 504 aa overlap (3-506:4-479)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MKNQDKKNGAAQQSNPKSSPGQPEAGPEGAQERPSQAAPAVEAEGPGSSQAPRKPEGAQ
:.... .: .::.: ::. .. ::. . .: : .: .: .: .
CCDS34 MEANHSEQLSAERQSTP---PGD-------SSSLPSHNG--LEKEDGQDSPTPVQPPEKE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 ARTAQSGALRDVSEELSRQLEDILSTYCVDNNQGGPGEDGAQGEPAEPEDAEKSRTYVAR
: . :.::::.::::::..:: . . :..:. .::.::. . .
CCDS34 ASVHP-----DISEELNRQLEDIINTY--GSAASTAGKEGSARASEQPENAESPDN---E
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 NGEPEPTPVVNGEKEPSKGDPNTEEIRQSDEVGDRDHRRPQEKKKAKGLGKEITLLMQTL
.:. : : :.. ..:.: : . . :...... ::: :::::: .::::.:
CCDS34 DGDCEETTEEAGREPVASGEPPTVK----EPVSNKEQK--LEKKILKGLGKEANLLMQNL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 NTLSTPEEKLAALCKKYAELLEEHRNSQKQMKLLQKKQSQLVQEKDHLRGEHSKAVLARS
: :.:::::. : :::::::.:::. ::..::::::: :. .:::.:.::::.:.::::
CCDS34 NKLQTPEEKFDFLFKKYAELLDEHRTEQKKLKLLQKKQVQIQKEKDQLQGEHSRAILARS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KLESLCRELQRHNRSLKEEGVQRAREEEEKRKEVTSHFQVTLNDIQLQMEQHNERNSKLR
:::::::::::::..::::..::::::::::::.::::: ::.::: :.::..::: ::
CCDS34 KLESLCRELQRHNKTLKEEALQRAREEEEKRKEITSHFQSTLTDIQGQIEQQSERNMKLC
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 QENMELAERLKKLIEQYELREEHIDKVFKHKDLQQQLVDAKLQQAQEMLKEAEERHQREK
::: ::::.::..:.::::::::.::.:::..:::.::::::.:::::.:::::::.:::
CCDS34 QENTELAEKLKSIIDQYELREEHLDKIFKHRELQQKLVDAKLEQAQEMMKEAEERHKREK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 DFLLKEAVESQRMCELMKQQETHLKQQLALYTEKFEEFQNTLSKSSEVFTTFEQEMEKMT
..::..:.: . . ...:.::: :. ::.::. .:::::.::.::.:::.::.:::.: :
CCDS34 EYLLNQAAEWKLQAKVLKEQETVLQAQLTLYSGRFEEFQSTLTKSNEVFATFKQEMDKTT
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KKIKKLEKETTMYRSRWESSNKALLEMAEEKTVRDKELEGLQVKIQRLEKLCRALQTERN
::.:::::.:. ...:.:. :::::.: :::..: :: : . .:: :::.:::::: :::
CCDS34 KKMKKLEKDTATWKARFENCNKALLDMIEEKALRAKEYECFVMKIGRLENLCRALQEERN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 DLNKRVQDLSAGGQGSLTDSGPERRPEGPGAQAPSSPRVTEAPCYPGAPSTEASGQTGPQ
.:.:...: . . . .. . ...::
CCDS34 ELHKKIRDAEISEKDDQSQHNSDEEPESNVSVDQEIDAEEVNSVQTAVKNLATAFMIIHH
460 470 480 490 500 510
>>CCDS55373.1 TXLNG gene_id:55787|Hs108|chrX (396 aa)
initn: 1413 init1: 1413 opt: 1413 Z-score: 719.0 bits: 142.3 E(32554): 9.9e-34
Smith-Waterman score: 1413; 73.4% identity (95.2% similar) in 289 aa overlap (200-488:35-323)
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 KEITLLMQTLNTLSTPEEKLAALCKKYAELLEEHRNSQKQMKLLQKKQSQLVQEKDHLRG
::: :. :::::.:::::.:.:.:: ::..
CCDS55 VEEAARGRGGGAEEATEAGRGGRRRSPRQKLEESRSVQKQMKILQKKQAQIVKEKVHLQS
10 20 30 40 50 60
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 EHSKAVLARSKLESLCRELQRHNRSLKEEGVQRAREEEEKRKEVTSHFQVTLNDIQLQME
:::::.:::::::::::::::::..::::..:.::::::.:::.:.:::.:::.:: :.:
CCDS55 EHSKAILARSKLESLCRELQRHNKTLKEENMQQAREEEERRKEATAHFQITLNEIQAQLE
70 80 90 100 110 120
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 QHNERNSKLRQENMELAERLKKLIEQYELREEHIDKVFKHKDLQQQLVDAKLQQAQEMLK
::. .:.::::::.::.:.:::::::: :::::::::::::.::::::::::::. ...:
CCDS55 QHDIHNAKLRQENIELGEKLKKLIEQYALREEHIDKVFKHKELQQQLVDAKLQQTTQLIK
130 140 150 160 170 180
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 EAEERHQREKDFLLKEAVESQRMCELMKQQETHLKQQLALYTEKFEEFQNTLSKSSEVFT
::.:.::::..::::::.::.. : :::::..:::::.:: .::::::.:..::.:.::
CCDS55 EADEKHQREREFLLKEATESRHKYEQMKQQEVQLKQQLSLYMDKFEEFQTTMAKSNELFT
190 200 210 220 230 240
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 TFEQEMEKMTKKIKKLEKETTMYRSRWESSNKALLEMAEEKTVRDKELEGLQVKIQRLEK
::.::::::::::::::::: ..:..::..:::::.::::::::::: ..::.:..::::
CCDS55 TFRQEMEKMTKKIKKLEKETIIWRTKWENNNKALLQMAEEKTVRDKEYKALQIKLERLEK
250 260 270 280 290 300
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 LCRALQTERNDLNKRVQDLSAGGQGSLTDSGPERRPEGPGAQAPSSPRVTEAPCYPGAPS
::::::::::.::..:. :
CCDS55 LCRALQTERNELNEKVEVLKEQVSIKAAIKAANRDLATPVMQPCTALDSHKELNTSSKRA
310 320 330 340 350 360
546 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 14:42:26 2016 done: Fri Nov 4 14:42:27 2016
Total Scan time: 3.690 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]