Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8694
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8694, 455 aa
1>>>pF1KB8694 455 - 455 aa - 455 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2421+/-0.00104; mu= 18.2368+/- 0.062
mean_var=71.3095+/-14.124, 0's: 0 Z-trim(103.5): 69 B-trim: 70 in 2/49
Lambda= 0.151880
statistics sampled from 7394 (7464) to 7394 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 2.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 2918 649.0 2.9e-186
CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 406) 1595 359.0 5e-99
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 1220 276.9 3.1e-74
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 913 209.8 8.2e-54
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 768 178.1 3.2e-44
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 759 175.9 7e-44
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 758 175.8 1.2e-43
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 756 175.5 2.3e-43
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 756 175.5 2.3e-43
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 753 174.8 3.3e-43
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 741 172.0 1.2e-42
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 742 172.3 1.5e-42
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 742 172.3 1.5e-42
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 734 170.4 3.2e-42
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 731 169.7 5e-42
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 718 166.9 3.5e-41
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 720 167.4 3.6e-41
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 720 167.4 3.6e-41
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 715 166.5 1e-40
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 715 166.5 1e-40
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 704 164.0 4.2e-40
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 698 162.5 7.3e-40
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 698 162.6 1e-39
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 667 155.8 1.1e-37
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 614 144.2 3.7e-34
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 608 142.9 9.1e-34
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 608 142.9 9.3e-34
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 591 139.2 1.1e-32
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 585 137.8 2.4e-32
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 584 137.6 2.7e-32
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 576 136.0 1.4e-31
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 568 134.0 2.5e-31
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 557 131.7 1.7e-30
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 549 130.0 6.9e-30
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 536 127.0 3.3e-29
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 535 126.9 5.6e-29
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 519 123.3 5e-28
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 518 123.1 5.9e-28
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 518 123.1 5.9e-28
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 519 123.4 6.1e-28
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 519 123.4 7.1e-28
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 519 123.4 7.2e-28
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 519 123.4 7.4e-28
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 506 120.4 3e-27
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 442 106.6 9.8e-23
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 419 101.5 2.5e-21
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 420 101.8 2.5e-21
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 383 93.6 6.8e-19
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 383 93.7 7.3e-19
CCDS9918.1 DDX24 gene_id:57062|Hs108|chr14 ( 859) 379 92.8 1.5e-18
>>CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 (455 aa)
initn: 2918 init1: 2918 opt: 2918 Z-score: 3457.4 bits: 649.0 E(32554): 2.9e-186
Smith-Waterman score: 2918; 99.8% identity (99.8% similar) in 455 aa overlap (1-455:1-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 NMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 YYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB8 KKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
430 440 450
>>CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 (406 aa)
initn: 1587 init1: 1587 opt: 1595 Z-score: 1891.4 bits: 359.0 E(32554): 5e-99
Smith-Waterman score: 2487; 89.0% identity (89.0% similar) in 455 aa overlap (1-455:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 NMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 YYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQS
:::::::::: :
CCDS86 YYIFIPSKFK-------------------------------------------------S
250
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRS
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEK
320 330 340 350 360 370
430 440 450
pF1KB8 KKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
380 390 400
>>CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 (483 aa)
initn: 1213 init1: 591 opt: 1220 Z-score: 1446.3 bits: 276.9 E(32554): 3.1e-74
Smith-Waterman score: 1226; 44.4% identity (75.4% similar) in 439 aa overlap (26-453:4-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
: .::... : : : ::: .:: .:. :: :.
CCDS12 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCIPAILE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
::: .: :.:: :::.::.::::. : : : .: ::::::::::.::.:::..::. .:
CCDS12 GRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFRVLGKPLG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
... .::::.: ..:.: :..:::..::::::: :::.... :... ...::::::::.:
CCDS12 LKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLVMDEADRLL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB8 NM---DFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEK
.. :: .... :: ..: :.:.:::::.: ...:: : ..: ... .:::.
CCDS12 EQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQAPVSTVEQ
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGN----SFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPL
:.: :...: : ::.:::...... . :..:: .::.. : ..::...: .. :
CCDS12 LDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMMLRKFSFPTVAL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 HGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGR
:..:.:..:...: :::.. ::.:::::::::::: :.::.: . : : :::::::
CCDS12 HSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPGLPKIYIHRVGR
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 TARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARME
::::::.:.:::.:::::..: . ::. : ::: : ... ::... .: ..: ...
CCDS12 TARAGRQGQAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVLQILTQVNVVRRECEIK
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450
pF1KB8 LRE-HGEKKK---RSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
:. : ..:: . .. .. : . . ..: :.:.:.
CCDS12 LEAAHFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIKQKNRRFKEKVEETLKRQKAGR
400 410 420 430 440 450
CCDS12 AGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV
460 470 480
>>CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 (796 aa)
initn: 908 init1: 401 opt: 913 Z-score: 1079.6 bits: 209.8 E(32554): 8.2e-54
Smith-Waterman score: 913; 37.2% identity (69.3% similar) in 417 aa overlap (21-431:215-631)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKI
.:. .:.:.... : .: .:. .:: :
CCDS13 KADTLKVKDRKKKKKKGQEAGGFFEDASQYDENLSFQDMNLSRPLLKAITAMGFKQPTPI
190 200 210 220 230 240
60 70 80 90 100
pF1KB8 QIEAIPLALQGRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLETPQR---LFALVLTPTRELAFQ
: ::..: :.:: . : :: :::.:::::.:. :. :.. .:::.:::::..:
CCDS13 QKACIPVGLLGKDICACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAPVTRVLVLVPTRELGIQ
250 260 270 280 290 300
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 ISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRA
. . :.. .. . . :::.: :: :: : :.:::::::::::.: .:.: .
CCDS13 VHSVTRQLAQFCNITTCLAVGGLDVKSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLHNCPSFHLSS
310 320 330 340 350 360
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 LKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCA
.. :..:::::.:. :: .. .:... . :.:.::::::: .:. : ..:::::.
CCDS13 IEVLILDEADRMLDEYFEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLKNPVRIF
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 VSSKYQTVEKLQQYYIFI-PSKFKDTYLVY--ILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLR
:.:. ... :.: .: : :.. : . .:.. . :.: .: ....: .::
CCDS13 VNSNTDVAPFLRQEFIRIRPNREGDREAIVAALLTRTFTDHVMLFTQTKKQAHRMHILLG
430 440 450 460 470 480
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 NLGFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHS
.:. . :::..::..:: .: .:: . .::.:::::.::::: : .:.:: .:.
CCDS13 LMGLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDVAARGLDIEGVKTVINFTMPNTI
490 500 510 520 530 540
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 KDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVA
: :.:::::::::::.:.....: . . .....: . . . .: .. . ...
CCDS13 KHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGEDERKMLKEIVKAAKAPVKARILPQDVILKFRDKIE
550 560 570 580 590 600
410 420 430 440 450
pF1KB8 EAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
. .. . :. ..:.:. .. .: :
CCDS13 KMEKDVYAVLQLEAEEKEMQQSEAQINTAKRLLEKGKEAVVQEPERSWFQTKEERKKEKI
610 620 630 640 650 660
>>CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 (875 aa)
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10 20 30 40
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.. .: :.:. .. .. .. .
CCDS83 KKKQLRKQLKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLV
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50 60 70 80 90 100
pF1KB8 TKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNALLE----TPQRLFALVLTPTRE
:.:: ..: :::::.:..: :.:: ::: :: .:.:.:: . . . : .:...::::
CCDS83 TEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGVLIISPTRE
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGF
::.: : .. .:.. ....:.:: : ... .. .:.. :::::..:...: .:
CCDS83 LAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKD-LKHEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETVSF
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170 180 190 200 210 220
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. :..::.:::::::.: : .. ... .:. :.:.:::::.::.:. : : .::::
CCDS83 HATDLQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNP
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
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: ..::.: :.: :: . : . : .: .. ..: :.:...:
CCDS83 EYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLYR
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290 300 310 320 330
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.. : : . . :::...: .:. :.: : ..:.:::.:.::::.: :. :..::
CCDS83 VFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFD
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340 350 360 370 380 390
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: .. ::::.::::: ..:.:. .. . . :. :. ::.: :. .
CCDS83 CPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQ---LLQKKVP-----VKEIKIN
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400 410 420 430 440 450
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:.. ..:. . : . . :.:..
CCDS83 PEKLIDVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLG
450 460 470 480 490 500
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10 20 30 40
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPT
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CCDS11 TTATMATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPS
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CCDS11 AIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQI
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.. . :::. ..:: . .:: . . : :.. .::::..: .. ... ::.
CCDS11 QKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRR-RSLRTRAI
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170 180 190 200 210 220
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CCDS11 KMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILV
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230 240 250 260 270 280
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. :.: ..:... . . .: : . . :. .. .:::.: ... . .:. .
CCDS11 KRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREAN
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290 300 310 320 330 340
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::. .::.: :..: . ...:.. : .:..::: .::::.:.:....:.:.:.. . :
CCDS11 FTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELY
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CCDS11 IHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
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>>CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 (670 aa)
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10 20 30
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEA-SQPI--VEEEETKTFKDLG
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CCDS21 DTKKAKTENKGKSEEESAETTKETENNVEKPDNDEDESEVPSLPLGLTGAFEDTSFASLC
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:.. .: ..:.:. :.:: ..: :: :.:::... :.:: ::: :: .: .. ..
CCDS21 NLVNENTLKAIKEMGFTNMTEIQHKSIRPL-LEGRDLLAAAKTGSGKTLAFLIPAVELIV
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pF1KB8 ET---PQR-LFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKP
. :. .:.:.::::::.: .. : . ..:.:: . ... :..
CCDS21 KLRFMPRNGTGVLILSPTRELAMQTFGVLKELMTHHVHTYGLIMGGSNRSAEAQKLGNGI
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CCDS21 NIIVATPGRLLDHMQNTPGFMYKNLQCLVIDEADRILDVGFEEELKQIIKLLPTRRQTML
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::::.:.::. : : .::. :. .:.. ::. :.: :. ::. . : .:..
CCDS21 FSATQTRKVEDLARISLKKEPLYVGVDDDKANATVDGLEQGYVVCPSEKRFLLLFTFLKK
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...:.: :.: ... :: . . .. .::...:.:: .. .: . :: :
CCDS21 NRKKKLMVFFSSCMSVKYHYELLNYIDLPVLAIHGKQKQNKRTTTFFQFCNADSGTLLCT
430 440 450 460 470 480
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:::.::::::.:: .:..: : :.:::::::::: : .:.. ... :: : :
CCDS21 DVAARGLDIPEVDWIVQYDPPDDPKEYIHRVGRTAR-GLNGRGHALLILRPEELGFLR--
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.: .:.: : .. .... :.. : . : :.. ... .: : :. .
CCDS21 YLKQSKVPLSEFDFSWSKISDIQSQLEKLIEKNYF----LHKSAQEAYKSYIRAYDSHSL
540 550 560 570 580 590
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. ..: :
CCDS21 KQIFNVNNLNLPQVALSFGFKVPPFVDLNVNSNEGKQKKRGGGGGFGYQKTKKVEKSKIF
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIE
:.. . :.. . .. . :. ::: :: .
CCDS34 LAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQ
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CCDS34 AIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQI
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CCDS34 TKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLR
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. :.:.:::::...: :: .: .:. . ::.: .::::. . .. : : :..:..
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:... . ..: : : . : :. .:.. ..: .:: .. ... ::..
CCDS34 QVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFV---DKQEHADGLLKD
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: .. : ::: ..: : . .: :: . ..:.::.::.::::. :. .:::.. :.
CCDS34 LMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPN
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: .::.::.:::.::: .: : ::.:. : .... .: : : .: :
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:. . .. . .. .: . : .:.:: .. : :.:: ..:. . ...
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450
pF1KB8 AGGKMKKRKGR
. .:..
CCDS34 ESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQDVMQQAT
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIE
:.. . :.. . .. . :. ::: :: .
CCDS75 LAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQ
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::: ..:::.::.:.:: ::: :: ::.. . :: . .:...:::::::.::
CCDS75 AIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQI
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... . .....:.. . . :: : : . .::. ::::.:: : ..: :::
CCDS75 TKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLR
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pF1KB8 ALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKC
. :.:.:::::...: :: .: .:. . ::.: .::::. . .. : : :..:..
CCDS75 RVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEV
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pF1KB8 AVSSKYQTVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELA-GNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRN
:... . ..: : : . : :. .:.. ..: .:: .. ... ::..
CCDS75 QVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFV---DKQEHADGLLKD
590 600 610 620 630
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pF1KB8 LGFTAIP---LHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPT
: .. : ::: ..: : . .: :: . ..:.::.::.::::. :. .:::.. :.
CCDS75 LMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPN
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pF1KB8 HSKDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQ----YDVELFQRIEHLIGKKLP--------GFP
: .::.::.:::.::: .: : ::.:. : .... .: : : .: :
CCDS75 HYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALE-LSGTAVPPDLEKLWSDFK
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:. . .. . .. .: . : .:.:: .. : :.:: ..:. . ...
CCDS75 DQQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQI
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. .:..
CCDS75 ESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQVDVMQQA
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>>CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 (938 aa)
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CCDS32 ITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQG
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pF1KB8 IPLALQGRDIIGLAETGPGKTGAFALPILNAL-----LETPQRLFALVLTPTRELAFQIS
.:.::.:::.::.:.:: :::.:: :.: . :: . .:... ::::: ::
CCDS32 VPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIH
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pF1KB8 EQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALK
. . .:.. ...:... :: . :. :: . .:.. ::::::::... :. ::. ..
CCDS32 AECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKK-KATNLQRVS
350 360 370 380 390 400
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pF1KB8 YLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVS
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CCDS32 YLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQG
410 420 430 440 450 460
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 SKYQTVEKLQQYYIFI---PSKFKDTYLVYILNELAGN-SFMIFCSTCNNTQRTALLLRN
. .. : . : .. :::. ..:. : :.... : ..: . :... : :..
CCDS32 DIGEANEDVTQIVEILHSGPSKW--NWLTRRLVEFTSSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQ
470 480 490 500 510 520
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 LGFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSK
: . :::.:.::.: .. :: : .:.:::::.:::::: . .:.:.:.
CCDS32 EGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDID
530 540 550 560 570 580
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pF1KB8 DYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAE
. ::.:::.:::..: : :..: :
CCDS32 THTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRK
590 600 610 620 630 640
455 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]