Result of FASTA (omim) for
pF1KB8674
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8674, 525 aa
1>>>pF1KB8674 525 - 525 aa - 525 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2874+/-0.000507; mu= 0.6585+/- 0.031
mean_var=361.4990+/-83.380, 0's: 0 Z-trim(116.7): 83 B-trim: 34 in 1/56
Lambda= 0.067456
statistics sampled from 27943 (28022) to 27943 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.329), width: 16
Scan time: 10.770
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005834 (OMIM: 606244) signal transducing adapte ( 525) 3430 348.6 2.7e-95
NP_001311217 (OMIM: 601899) signal transducing ada ( 412) 1127 124.3 6.9e-28
NP_001311218 (OMIM: 601899) signal transducing ada ( 412) 1127 124.3 6.9e-28
XP_016872174 (OMIM: 601899) PREDICTED: signal tran ( 412) 1127 124.3 6.9e-28
NP_001311216 (OMIM: 601899) signal transducing ada ( 429) 1124 124.1 8.6e-28
NP_001311215 (OMIM: 601899) signal transducing ada ( 443) 1124 124.1 8.8e-28
NP_001311214 (OMIM: 601899) signal transducing ada ( 490) 1124 124.1 9.4e-28
NP_001311213 (OMIM: 601899) signal transducing ada ( 490) 1124 124.1 9.4e-28
NP_001311212 (OMIM: 601899) signal transducing ada ( 490) 1124 124.1 9.4e-28
NP_001311211 (OMIM: 601899) signal transducing ada ( 508) 1124 124.2 9.6e-28
NP_003464 (OMIM: 601899) signal transducing adapte ( 540) 1124 124.2 1e-27
XP_011517997 (OMIM: 601899) PREDICTED: signal tran ( 498) 1046 116.6 1.8e-25
NP_005479 (OMIM: 604700) target of Myb protein 1 i ( 492) 334 47.3 0.00013
NP_001129204 (OMIM: 604700) target of Myb protein ( 493) 334 47.3 0.00013
NP_001275715 (OMIM: 615519) TOM1-like protein 2 is ( 483) 327 46.6 0.00021
XP_005256520 (OMIM: 615519) PREDICTED: TOM1-like p ( 487) 318 45.7 0.00038
NP_001076437 (OMIM: 615519) TOM1-like protein 2 is ( 507) 318 45.7 0.00039
XP_005256518 (OMIM: 615519) PREDICTED: TOM1-like p ( 536) 318 45.7 0.00041
NP_004703 (OMIM: 604375) hepatocyte growth factor- ( 777) 287 42.9 0.0042
XP_011523765 (OMIM: 604375) PREDICTED: hepatocyte ( 777) 287 42.9 0.0042
NP_001308102 (OMIM: 604701) TOM1-like protein 1 is ( 346) 277 41.5 0.0049
NP_005477 (OMIM: 604701) TOM1-like protein 1 isofo ( 476) 277 41.7 0.006
XP_016880786 (OMIM: 604375) PREDICTED: hepatocyte ( 768) 275 41.8 0.0093
>>NP_005834 (OMIM: 606244) signal transducing adapter mo (525 aa)
initn: 3430 init1: 3430 opt: 3430 Z-score: 1831.8 bits: 348.6 E(85289): 2.7e-95
Smith-Waterman score: 3430; 99.2% identity (99.8% similar) in 525 aa overlap (1-525:1-525)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPLFTANPFEQDVEKATNEYNTTEDWSLIMDICDKVGSTPNGAKDCLKAIMKRVNHKVPH
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NP_005 MPLFTANPFEQDVEKATNEYNTTEDWSLIMDICDKVGSTPNGAKDCLKAIMKRVNHKVPH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VALQALTLLGACVANCGKIFRLGVCSRDFATEVRAVIKNKAHPKVCEKLKSLMVEWSEEF
::::::::::::::::::::.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VALQALTLLGACVANCGKIFHLEVCSRDFATEVRAVIKNKAHPKVCEKLKSLMVEWSEEF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QKDPQFSLISATIKSMKEEGITFPPAGSQTVSAAAKNGTSSNKNKEDEDIAKAIELSLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QKDPQFSLISATIKSMKEEGITFPPAGSQTVSAAAKNGTSSNKNKEDEDIAKAIELSLQE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QKQQHTETKSLYPSSEIQLNNKVARKVRALYDFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QKQQHTETKSLYPSSEIQLNNKVARKVRALYDFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KGENHRGIGLFPSDFVTTNLNIETEVAAVDKLNVIDDDVEEIKKSEPEPVYIDEDKMDRA
:::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KGENHRGIGLFPSNFVTTNLNIETEAAAVDKLNVIDDDVEEIKKSEPEPVYIDEDKMDRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LQVLQSIDPTDSKPDSQDLLDLEDICQQMGPMIDEKLEEIDRKHSELSELNVKVLEALEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LQVLQSIDPTDSKPDSQDLLDLEDICQQMGPMIDEKLEEIDRKHSELSELNVKVLEALEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 YNKLVNEAPVYSVYSKLHPPAHYPPASSGVPMQTYPVQSHGGNYMGQSIHQVTVAQSYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YNKLVNEAPVYSVYSKLHPPAHYPPASSGVPMQTYPVQSHGGNYMGQSIHQVTVAQSYSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 GPDQIGPLRSLPPNVNSSVTAQPAQTSYLSTGQDTVSNPTYMNQNSNLQSATGTTAYTQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GPDQIGPLRSLPPNVNSSVTAQPAQTSYLSTGQDTVSNPTYMNQNSNLQSATGTTAYTQQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB8 MGMSVDMSSYQNTTSNLPQLAGFPVTVPAHPVAQQHTNYHQQPLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MGMSVDMSSYQNTTSNLPQLAGFPVTVPAHPVAQQHTNYHQQPLL
490 500 510 520
>>NP_001311217 (OMIM: 601899) signal transducing adapter (412 aa)
initn: 671 init1: 533 opt: 1127 Z-score: 621.7 bits: 124.3 E(85289): 6.9e-28
Smith-Waterman score: 1127; 48.4% identity (73.8% similar) in 409 aa overlap (128-523:3-405)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KNKAHPKVCEKLKSLMVEWSEEFQKDPQFSLISATIKSMKEEGITFPPAGSQTVSA---A
..: .. :. : .. :. :. .. .
NP_001 MLILSPVFFSLPESAFFVREAAEQAKASPALV
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 AKN-GTSSNKNKEDEDIAKAIELSLQEQKQQHTETKSLYPSSEIQLNNKV--ARKVRALY
::. :: .:: ::.::.::::::::.::.:: : ..::::. :.:. .:::::.:
NP_001 AKDPGTVANK-KEEEDLAKAIELSLKEQRQQSTTLSTLYPSTSSLLTNHQHEGRKVRAIY
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 DFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWWKGENHRGIGLFPSDFVTTNLNIETEVAAVDK
::::.:::::::: :::: :::::: ::::::.:.:::::::.:::..:. : :. ..:
NP_001 DFEAAEDNELTFKAGEIITVLDDSDPNWWKGETHQGIGLFPSNFVTADLTAEPEMIKTEK
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320
pF1KB8 LNV-IDDDVE-EIKKSEPEPVYIDEDKMDRALQVLQSIDPTDSKPDSQDLLDLEDICQQM
.: ..:::. : . ::::..:::::::. ::.::: ::.:..:: .:: :: .:.::
NP_001 KTVQFSDDVQVETIEPEPEPAFIDEDKMDQLLQMLQSTDPSDDQPDLPELLHLEAMCHQM
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 GPMIDEKLEEIDRKHSELSELNVKVLEALELYNKLVNEAPVYSVYSKLHPPAHYPPASSG
::.::::::.:::::::::::::::.::: ::.::.:: :.::.:.::. .: :::
NP_001 GPLIDEKLEDIDRKHSELSELNVKVMEALSLYTKLMNEDPMYSMYAKLQNQPYYMQ-SSG
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 VP-MQTYPVQSHGGNYMGQSIHQVTVAQSYSLGPDQIGPLRS--LPPNVNSSVTAQPAQT
: :.: .: :. . :.. ::::: :.:.. : . .::..: .. .: .:.
NP_001 VSGSQVYAGPPPSGAYLVAGNAQMSHLQSYSLPPEQLSSLSQAVVPPSANPALPSQQTQA
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 SYLSTGQDTVSNPTYMNQNSNLQSATGTTAYTQQMGMSVDMSSYQNTTSNLPQLAGFPVT
.: .: ..:.. :: .: . ..:: . ..:.. :::. :.::. .. .:
NP_001 AYPNTMVSSVQGNTYPSQAPVYSPPPAATA----AAATADVTLYQNAGPNMPQVPNYNLT
340 350 360 370 380
510 520
pF1KB8 VPA--HPVAQQHTNYHQQPLL
. .: ..:. :::
NP_001 SSTLPQPGGSQQPPQPQQPYSQKALL
390 400 410
>>NP_001311218 (OMIM: 601899) signal transducing adapter (412 aa)
initn: 671 init1: 533 opt: 1127 Z-score: 621.7 bits: 124.3 E(85289): 6.9e-28
Smith-Waterman score: 1127; 48.4% identity (73.8% similar) in 409 aa overlap (128-523:3-405)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KNKAHPKVCEKLKSLMVEWSEEFQKDPQFSLISATIKSMKEEGITFPPAGSQTVSA---A
..: .. :. : .. :. :. .. .
NP_001 MLILSPVFFSLPESAFFVREAAEQAKASPALV
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 AKN-GTSSNKNKEDEDIAKAIELSLQEQKQQHTETKSLYPSSEIQLNNKV--ARKVRALY
::. :: .:: ::.::.::::::::.::.:: : ..::::. :.:. .:::::.:
NP_001 AKDPGTVANK-KEEEDLAKAIELSLKEQRQQSTTLSTLYPSTSSLLTNHQHEGRKVRAIY
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 DFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWWKGENHRGIGLFPSDFVTTNLNIETEVAAVDK
::::.:::::::: :::: :::::: ::::::.:.:::::::.:::..:. : :. ..:
NP_001 DFEAAEDNELTFKAGEIITVLDDSDPNWWKGETHQGIGLFPSNFVTADLTAEPEMIKTEK
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320
pF1KB8 LNV-IDDDVE-EIKKSEPEPVYIDEDKMDRALQVLQSIDPTDSKPDSQDLLDLEDICQQM
.: ..:::. : . ::::..:::::::. ::.::: ::.:..:: .:: :: .:.::
NP_001 KTVQFSDDVQVETIEPEPEPAFIDEDKMDQLLQMLQSTDPSDDQPDLPELLHLEAMCHQM
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 GPMIDEKLEEIDRKHSELSELNVKVLEALELYNKLVNEAPVYSVYSKLHPPAHYPPASSG
::.::::::.:::::::::::::::.::: ::.::.:: :.::.:.::. .: :::
NP_001 GPLIDEKLEDIDRKHSELSELNVKVMEALSLYTKLMNEDPMYSMYAKLQNQPYYMQ-SSG
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 VP-MQTYPVQSHGGNYMGQSIHQVTVAQSYSLGPDQIGPLRS--LPPNVNSSVTAQPAQT
: :.: .: :. . :.. ::::: :.:.. : . .::..: .. .: .:.
NP_001 VSGSQVYAGPPPSGAYLVAGNAQMSHLQSYSLPPEQLSSLSQAVVPPSANPALPSQQTQA
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 SYLSTGQDTVSNPTYMNQNSNLQSATGTTAYTQQMGMSVDMSSYQNTTSNLPQLAGFPVT
.: .: ..:.. :: .: . ..:: . ..:.. :::. :.::. .. .:
NP_001 AYPNTMVSSVQGNTYPSQAPVYSPPPAATA----AAATADVTLYQNAGPNMPQVPNYNLT
340 350 360 370 380
510 520
pF1KB8 VPA--HPVAQQHTNYHQQPLL
. .: ..:. :::
NP_001 SSTLPQPGGSQQPPQPQQPYSQKALL
390 400 410
>>XP_016872174 (OMIM: 601899) PREDICTED: signal transduc (412 aa)
initn: 671 init1: 533 opt: 1127 Z-score: 621.7 bits: 124.3 E(85289): 6.9e-28
Smith-Waterman score: 1127; 48.4% identity (73.8% similar) in 409 aa overlap (128-523:3-405)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KNKAHPKVCEKLKSLMVEWSEEFQKDPQFSLISATIKSMKEEGITFPPAGSQTVSA---A
..: .. :. : .. :. :. .. .
XP_016 MLILSPVFFSLPESAFFVREAAEQAKASPALV
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 AKN-GTSSNKNKEDEDIAKAIELSLQEQKQQHTETKSLYPSSEIQLNNKV--ARKVRALY
::. :: .:: ::.::.::::::::.::.:: : ..::::. :.:. .:::::.:
XP_016 AKDPGTVANK-KEEEDLAKAIELSLKEQRQQSTTLSTLYPSTSSLLTNHQHEGRKVRAIY
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 DFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWWKGENHRGIGLFPSDFVTTNLNIETEVAAVDK
::::.:::::::: :::: :::::: ::::::.:.:::::::.:::..:. : :. ..:
XP_016 DFEAAEDNELTFKAGEIITVLDDSDPNWWKGETHQGIGLFPSNFVTADLTAEPEMIKTEK
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320
pF1KB8 LNV-IDDDVE-EIKKSEPEPVYIDEDKMDRALQVLQSIDPTDSKPDSQDLLDLEDICQQM
.: ..:::. : . ::::..:::::::. ::.::: ::.:..:: .:: :: .:.::
XP_016 KTVQFSDDVQVETIEPEPEPAFIDEDKMDQLLQMLQSTDPSDDQPDLPELLHLEAMCHQM
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 GPMIDEKLEEIDRKHSELSELNVKVLEALELYNKLVNEAPVYSVYSKLHPPAHYPPASSG
::.::::::.:::::::::::::::.::: ::.::.:: :.::.:.::. .: :::
XP_016 GPLIDEKLEDIDRKHSELSELNVKVMEALSLYTKLMNEDPMYSMYAKLQNQPYYMQ-SSG
220 230 240 250 260 270
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pF1KB8 VP-MQTYPVQSHGGNYMGQSIHQVTVAQSYSLGPDQIGPLRS--LPPNVNSSVTAQPAQT
: :.: .: :. . :.. ::::: :.:.. : . .::..: .. .: .:.
XP_016 VSGSQVYAGPPPSGAYLVAGNAQMSHLQSYSLPPEQLSSLSQAVVPPSANPALPSQQTQA
280 290 300 310 320 330
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pF1KB8 SYLSTGQDTVSNPTYMNQNSNLQSATGTTAYTQQMGMSVDMSSYQNTTSNLPQLAGFPVT
.: .: ..:.. :: .: . ..:: . ..:.. :::. :.::. .. .:
XP_016 AYPNTMVSSVQGNTYPSQAPVYSPPPAATA----AAATADVTLYQNAGPNMPQVPNYNLT
340 350 360 370 380
510 520
pF1KB8 VPA--HPVAQQHTNYHQQPLL
. .: ..:. :::
XP_016 SSTLPQPGGSQQPPQPQQPYSQKALL
390 400 410
>>NP_001311216 (OMIM: 601899) signal transducing adapter (429 aa)
initn: 845 init1: 533 opt: 1124 Z-score: 619.9 bits: 124.1 E(85289): 8.6e-28
Smith-Waterman score: 1288; 51.3% identity (75.3% similar) in 429 aa overlap (113-523:1-422)
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 GVCSRDFATEVRAVIKNKAHPKVCEKLKSLMVEWSEEFQKDPQFSLISATIKSMKEEGIT
::::..::..:::.::::: ::..::.:.:
NP_001 MVEWTDEFKNDPQLSLISAMIKNLKEQGVT
10 20 30
150 160 170 180 190
pF1KB8 FPPAGSQTVSAA-------AKN-GTSSNKNKEDEDIAKAIELSLQEQKQQHTETKSLYPS
:: :::.. : ::. :: .:: ::.::.::::::::.::.:: : ..::::
NP_001 FPAIGSQAAEQAKASPALVAKDPGTVANK-KEEEDLAKAIELSLKEQRQQSTTLSTLYPS
40 50 60 70 80
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 SEIQLNNKV--ARKVRALYDFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWWKGENHRGIGLFP
. :.:. .:::::.:::::.:::::::: :::: :::::: ::::::.:.::::::
NP_001 TSSLLTNHQHEGRKVRAIYDFEAAEDNELTFKAGEIITVLDDSDPNWWKGETHQGIGLFP
90 100 110 120 130 140
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pF1KB8 SDFVTTNLNIETEVAAVDKLNV-IDDDVE-EIKKSEPEPVYIDEDKMDRALQVLQSIDPT
:.:::..:. : :. ..: .: ..:::. : . ::::..:::::::. ::.::: ::.
NP_001 SNFVTADLTAEPEMIKTEKKTVQFSDDVQVETIEPEPEPAFIDEDKMDQLLQMLQSTDPS
150 160 170 180 190 200
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pF1KB8 DSKPDSQDLLDLEDICQQMGPMIDEKLEEIDRKHSELSELNVKVLEALELYNKLVNEAPV
:..:: .:: :: .:.::::.::::::.:::::::::::::::.::: ::.::.:: :.
NP_001 DDQPDLPELLHLEAMCHQMGPLIDEKLEDIDRKHSELSELNVKVMEALSLYTKLMNEDPM
210 220 230 240 250 260
380 390 400 410 420
pF1KB8 YSVYSKLHPPAHYPPASSGVP-MQTYPVQSHGGNYMGQSIHQVTVAQSYSLGPDQIGPLR
::.:.::. .: :::: :.: .: :. . :.. ::::: :.:.. :
NP_001 YSMYAKLQNQPYYMQ-SSGVSGSQVYAGPPPSGAYLVAGNAQMSHLQSYSLPPEQLSSLS
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 S--LPPNVNSSVTAQPAQTSYLSTGQDTVSNPTYMNQNSNLQSATGTTAYTQQMGMSVDM
. .::..: .. .: .:..: .: ..:.. :: .: . ..:: . ..:.
NP_001 QAVVPPSANPALPSQQTQAAYPNTMVSSVQGNTYPSQAPVYSPPPAATA----AAATADV
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520
pF1KB8 SSYQNTTSNLPQLAGFPVT---VPAHPVAQQHTNYHQQPLL
. :::. :.::. .. .: .: .: ..:. :::
NP_001 TLYQNAGPNMPQVPNYNLTSSTLP-QPGGSQQPPQPQQPYSQKALL
390 400 410 420
>>NP_001311215 (OMIM: 601899) signal transducing adapter (443 aa)
initn: 918 init1: 533 opt: 1124 Z-score: 619.7 bits: 124.1 E(85289): 8.8e-28
Smith-Waterman score: 1361; 52.2% identity (75.9% similar) in 439 aa overlap (102-523:4-436)
80 90 100 110 120 130
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NP_001 PYSQKALL
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]