Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8649
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8649, 352 aa
1>>>pF1KB8649 352 - 352 aa - 352 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1391+/-0.00089; mu= 16.8759+/- 0.053
mean_var=62.8399+/-12.458, 0's: 0 Z-trim(105.3): 31 B-trim: 333 in 1/49
Lambda= 0.161792
statistics sampled from 8331 (8357) to 8331 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.257), width: 16
Scan time: 2.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 406) 2373 562.7 1.9e-160
CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 360) 2082 494.7 4.9e-140
CCDS54518.1 SEC14L6 gene_id:730005|Hs108|chr22 ( 397) 1914 455.5 3.4e-128
CCDS13876.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 403) 1757 418.9 3.7e-117
CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 400) 1723 410.9 9e-115
CCDS58801.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 341) 1703 406.2 2e-113
CCDS58800.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 323) 1598 381.7 4.6e-106
CCDS46685.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 392) 1564 373.8 1.3e-103
CCDS56228.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 320) 1322 317.3 1.1e-86
CCDS45403.1 SEC14L5 gene_id:9717|Hs108|chr16 ( 696) 577 143.6 4.8e-34
CCDS45789.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 681) 540 134.9 1.9e-31
CCDS11752.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 715) 540 135.0 1.9e-31
CCDS42385.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 719) 540 135.0 1.9e-31
>>CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 (406 aa)
initn: 2373 init1: 2373 opt: 2373 Z-score: 2993.9 bits: 562.7 E(32554): 1.9e-160
Smith-Waterman score: 2373; 100.0% identity (100.0% similar) in 352 aa overlap (1-352:55-406)
10 20 30
pF1KB8 MLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DLLPILPNADDYFLLRWLRARNFDLQKSEDMLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYD
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGR
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 VKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEV
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 PKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKM
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLTCLQAGVYVLRFDNTYSRMHAKKLSYTVEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLTCLQAGVYVLRFDNTYSRMHAKKLSYTVEVL
330 340 350 360 370 380
340 350
pF1KB8 LPDKASEETLQSLKAMRPSPTQ
::::::::::::::::::::::
CCDS13 LPDKASEETLQSLKAMRPSPTQ
390 400
>>CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 (360 aa)
initn: 2082 init1: 2082 opt: 2082 Z-score: 2627.6 bits: 494.7 E(32554): 4.9e-140
Smith-Waterman score: 2082; 100.0% identity (100.0% similar) in 306 aa overlap (1-306:55-360)
10 20 30
pF1KB8 MLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DLLPILPNADDYFLLRWLRARNFDLQKSEDMLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYD
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGR
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 VKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEV
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 PKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKM
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLTCLQAGVYVLRFDNTYSRMHAKKLSYTVEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLTCLQAGV
330 340 350 360
340 350
pF1KB8 LPDKASEETLQSLKAMRPSPTQ
>>CCDS54518.1 SEC14L6 gene_id:730005|Hs108|chr22 (397 aa)
initn: 1931 init1: 1908 opt: 1914 Z-score: 2415.0 bits: 455.5 E(32554): 3.4e-128
Smith-Waterman score: 1914; 79.0% identity (93.3% similar) in 343 aa overlap (1-343:55-397)
10 20 30
pF1KB8 MLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYD
:::.:::::::::: ::..::::::..::.
CCDS54 DVLSALPNPDDYFLLRWLQARSFDLQKSEDMLRKHMEFRKQQDLANILAWQPPEVVRLYN
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGR
..:.::.: :: ::...:.:::::::::::::::...: .. :::::.:::::.::::.
CCDS54 ANGICGHDGEGSPVWYHIVGSLDPKGLLLSASKQELLRDSFRSCELLLRECELQSQKLGK
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNL
..: . .: .:::.:. ::::..:. :.::: ::::::: ::.:::.:::::: :::::
CCDS54 RVEKIIAIFGLEGLGLRDLWKPGIELLQEFFSALEANYPEILKSLIVVRAPKLFAVAFNL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 VKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEV
:::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VKSYMSEETRRKVVILGDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEV
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 PKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKM
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PKSYYLCKQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKM
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLTCLQAGVYVLRFDNTYSRMHAKKLSYTVEVL
::.: :::::::::::::::::::::: ::::::: ::::: :::: .:.:..:::::::
CCDS54 GERQRAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGILTCLQAGSYVLRFYNTYSLVHSKRISYTVEVL
330 340 350 360 370 380
340 350
pF1KB8 LPDKASEETLQSLKAMRPSPTQ
:::.. : ....
CCDS54 LPDQTFMEKMEKF
390
>>CCDS13876.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 (403 aa)
initn: 1778 init1: 1757 opt: 1757 Z-score: 2216.9 bits: 418.9 E(32554): 3.7e-117
Smith-Waterman score: 1757; 68.7% identity (88.8% similar) in 348 aa overlap (1-348:55-402)
10 20 30
pF1KB8 MLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYD
:::.:.:::::.:.:::..:::::::: :
CCDS13 DVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHVEFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGR
:::.:::: .::::...::: :: ::::.::::::..: ... :::::.:: :: ::::
CCDS13 SGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDLLRTKMRECELLLQECAHQTTKLGR
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNL
:.: ...: :::.::::::::::.: .:. ..: ::::::: :.:..::::::::.::
CCDS13 KVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEENYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 VKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEV
.: :.::.::.::..:: :::. : : :::::.:::.::::::::::::: .::::::..
CCDS13 IKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVEYGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDI
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 PKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKM
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CCDS13 PRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPGCVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKM
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLTCLQAGVYVLRFDNTYSRMHAKKLSYTVEVL
::.: : :::::::.::::.:.:::::.::: . :.:::::::::: .::::...:::::
CCDS13 GERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGIYVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVL
330 340 350 360 370 380
340 350
pF1KB8 LPDKASEETLQSLKAMRPSPTQ
:::::::: ...: : :
CCDS13 LPDKASEEKMKQLGAGTPK
390 400
>>CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 (400 aa)
initn: 1720 init1: 1720 opt: 1723 Z-score: 2174.0 bits: 410.9 E(32554): 9e-115
Smith-Waterman score: 1723; 69.2% identity (91.1% similar) in 338 aa overlap (1-338:55-392)
10 20 30
pF1KB8 MLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYD
.::..::::: .:.:.:. :::::::: :
CCDS13 DVLPALPNPDDYFLLRWLRARNFDLQKSEALLRKYMEFRKTMDIDHILDWQPPEVIQKYM
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGR
::::::: .::::...::: :::::::.:..:::... ... :: .::::.:::..::.
CCDS13 PGGLCGYDRDGCPVWYDIIGPLDPKGLLFSVTKQDLLKTKMRDCERILHECDLQTERLGK
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNL
::: .:.:: :::.:::.::: :::::.::..:: ::::::: .....: :::::..::
CCDS13 KIETIVMIFDCEGLGLKHFWKPLVEVYQEFFGLLEENYPETLKFMLIVKATKLFPVGYNL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 VKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEV
.: :.::.:::::..::.:::. : :.:::..::..::::.::::::::::::::::::.
CCDS13 MKPFLSEDTRRKIIVLGNNWKEGLLKLISPEELPAQFGGTLTDPDGNPKCLTKINYGGEI
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 PKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKM
:::.:. .::. ::::. ...:::: ::: :::::::::::::.:::.::::::::::::
CCDS13 PKSMYVRDQVKTQYEHSVQINRGSSHQVEYEILFPGCVLRWQFSSDGADIGFGVFLKTKM
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLTCLQAGVYVLRFDNTYSRMHAKKLSYTVEVL
::.: : :::.::::::::::::::::.::: .::::::::::::: .::::.:.:::::
CCDS13 GERQRAGEMTDVLPSQRYNAHMVPEDGNLTCSEAGVYVLRFDNTYSFVHAKKVSFTVEVL
330 340 350 360 370 380
340 350
pF1KB8 LPDKASEETLQSLKAMRPSPTQ
:::.. ..
CCDS13 LPDEGMQKYDKELTPV
390 400
>>CCDS58801.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 (341 aa)
initn: 1723 init1: 1703 opt: 1703 Z-score: 2149.8 bits: 406.2 E(32554): 2e-113
Smith-Waterman score: 1703; 69.7% identity (91.0% similar) in 333 aa overlap (6-338:1-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYDSGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLS
::::: .:.:.:. :::::::: : ::::::: .::::...::: :::::::.:
CCDS58 MEFRKTMDIDHILDWQPPEVIQKYMPGGLCGYDRDGCPVWYDIIGPLDPKGLLFS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQF
..:::... ... :: .::::.:::..::.::: .:.:: :::.:::.::: :::::.:
CCDS58 VTKQDLLKTKMRDCERILHECDLQTERLGKKIETIVMIFDCEGLGLKHFWKPLVEVYQEF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISP
:..:: ::::::: .....: :::::..::.: :.::.:::::..::.:::. : :.:::
CCDS58 FGLLEENYPETLKFMLIVKATKLFPVGYNLMKPFLSEDTRRKIIVLGNNWKEGLLKLISP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 DQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVEN
..::..::::.::::::::::::::::::.:::.:. .::. ::::. ...:::: :::
CCDS58 EELPAQFGGTLTDPDGNPKCLTKINYGGEIPKSMYVRDQVKTQYEHSVQINRGSSHQVEY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKMGEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLT
:::::::::::::.:::.::::::::::::::.: : :::.::::::::::::::::.::
CCDS58 EILFPGCVLRWQFSSDGADIGFGVFLKTKMGERQRAGEMTDVLPSQRYNAHMVPEDGNLT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 CLQAGVYVLRFDNTYSRMHAKKLSYTVEVLLPDKASEETLQSLKAMRPSPTQ
: .::::::::::::: .::::.:.::::::::.. ..
CCDS58 CSEAGVYVLRFDNTYSFVHAKKVSFTVEVLLPDEGMQKYDKELTPV
300 310 320 330 340
>>CCDS58800.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 (323 aa)
initn: 1618 init1: 1598 opt: 1598 Z-score: 2017.7 bits: 381.7 E(32554): 4.6e-106
Smith-Waterman score: 1598; 69.7% identity (91.1% similar) in 314 aa overlap (25-338:2-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYDSGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLS
::: : ::::::: .::::...::: :::::::.:
CCDS58 MVIQKYMPGGLCGYDRDGCPVWYDIIGPLDPKGLLFS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQF
..:::... ... :: .::::.:::..::.::: .:.:: :::.:::.::: :::::.:
CCDS58 VTKQDLLKTKMRDCERILHECDLQTERLGKKIETIVMIFDCEGLGLKHFWKPLVEVYQEF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISP
:..:: ::::::: .....: :::::..::.: :.::.:::::..::.:::. : :.:::
CCDS58 FGLLEENYPETLKFMLIVKATKLFPVGYNLMKPFLSEDTRRKIIVLGNNWKEGLLKLISP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 DQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVEN
..::..::::.::::::::::::::::::.:::.:. .::. ::::. ...:::: :::
CCDS58 EELPAQFGGTLTDPDGNPKCLTKINYGGEIPKSMYVRDQVKTQYEHSVQINRGSSHQVEY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKMGEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLT
:::::::::::::.:::.::::::::::::::.: : :::.::::::::::::::::.::
CCDS58 EILFPGCVLRWQFSSDGADIGFGVFLKTKMGERQRAGEMTDVLPSQRYNAHMVPEDGNLT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
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CCDS58 CSEAGVYVLRFDNTYSFVHAKKVSFTVEVLLPDEGMQKYDKELTPV
280 290 300 310 320
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10 20 30
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40 50 60 70 80 90
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CCDS46 SGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDLLRTKMRECELLLQECAHQTTKLGR
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100 110 120 130 140 150
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CCDS46 KVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEENYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNL
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160 170 180 190 200 210
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CCDS46 IKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVEYGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDI
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220 230 240 250 260 270
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CCDS46 PRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPGCVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKM
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280 290 300 310 320 330
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CCDS46 GERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGICKYLCLGNALKPHVQLSACEVPLP
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340 350
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CCDS46 PWIFGSEC
390
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CCDS56 HLWKPAVEAYGEFLCMFEENYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLG
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:::. : : :::::.:::.::::::::::::: .::::::..:..::. .::. ::::.
CCDS56 ANWKEVLLKHISPDQVPVEYGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHS
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CCDS56 VQISRGSSHQVEYEILFPGCVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQR
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pF1KB8 YNAHMVPEDGSLTCLQAGVYVLRFDNTYSRMHAKKLSYTVEVLLPDKASEETLQSLKAMR
::.:.:::::.::: . :.:::::::::: .::::...::::::::::::: ...: :
CCDS56 YNSHLVPEDGTLTCSDPGIYVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGT
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350
pF1KB8 PSPTQ
:
CCDS56 PK
320
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10 20
pF1KB8 MLRRHMEFRKQQDLDNIV-TWQPPEVIQLY
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CCDS45 QETHKGKIPKDEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQSLSWRKQHQVDLLLQTWQPPALLEEF
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30 40 50 60 70 80
pF1KB8 DSGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLG
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CCDS45 YAGGWHYQDIDGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGEEALLRHVLSVNEEGQKRCEGSTRQLG
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pF1KB8 RKIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFN
: : ..:.:::...:::.:.:.. ... ..: :::::: :...:::..::: ..
CCDS45 RPISSWTCLLDLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEVVEDNYPETLGRLLIVRAPRVFPVLWT
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CCDS45 LISPFINENTRRKFLIYSGSNYQGPGGLVDYLDREVIP-DFLG------GESVC--NVPE
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CCDS45 GGLVPKSLYMTEEEQEHTDQLWQWSETYHSASVLRGAPHEVAVEILEGESVITWDFDILR
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CCDS45 IQGSHVTRWPGVYLLQWQMHSPPSS--VACSLP--GVDDVLTALHS--PGPKCKLLYYCE
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CCDS45 VLASEDFRGSMSSLESCTSGFSQLSAATSSSSSGQSHSSSLVSR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]