FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8622, 839 aa
1>>>pF1KB8622 839 - 839 aa - 839 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3415+/-0.00125; mu= 6.8499+/- 0.074
mean_var=243.9092+/-53.832, 0's: 0 Z-trim(109.1): 166 B-trim: 380 in 2/50
Lambda= 0.082122
statistics sampled from 10438 (10629) to 10438 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16
Scan time: 3.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 ( 839) 5729 693.2 5e-199
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CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 845) 2808 347.1 7.5e-95
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CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 823) 2235 279.2 2e-74
CCDS59342.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 813) 1924 242.3 2.5e-63
CCDS44181.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 ( 287) 792 107.8 2.9e-23
>>CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 (839 aa)
initn: 5729 init1: 5729 opt: 5729 Z-score: 3686.7 bits: 693.2 E(32554): 5e-199
Smith-Waterman score: 5729; 100.0% identity (100.0% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEHDLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKVEV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFINLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DLIKVHHSFLRAIDVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLLASRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKEALEA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRGTFYQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTSPADLDASGAGPGPKMVAMQNYHGNPAPPGKPVLT
550 560 570 580 590 600
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pF1KB8 FQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCPVDGRPPISRPPSREIDYTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCPVDGRPPISRPPSREIDYTA
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pF1KB8 YPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIH
670 680 690 700 710 720
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pF1KB8 ITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRERSASRASSRSPVFTPRVIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRERSASRASSRSPVFTPRVIG
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pF1KB8 TAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
790 800 810 820 830
>>CCDS48053.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 (878 aa)
initn: 3897 init1: 2173 opt: 3986 Z-score: 2570.4 bits: 486.7 E(32554): 7.5e-137
Smith-Waterman score: 5621; 95.6% identity (95.6% similar) in 878 aa overlap (1-839:1-878)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEHDLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKVEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEHDLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKVEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB8 QQPM-----KMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAV
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QQPMIRYMQKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 FINLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FINLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 EALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNH
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 TKQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKK-----WSYGFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS48 TKQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKSHGKMWSYGFY
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pF1KB8 LIHLQGKQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LIHLQGKQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKAC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB8 PAPPGKPVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCPVDGRPPISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PAPPGKPVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCPVDGRPPISR
610 620 630 640 650 660
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pF1KB8 PPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISIKFNDEVKHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISIKFNDEVKHI
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pF1KB8 KVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRERSASRASSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRERSASRASSR
730 740 750 760 770 780
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pF1KB8 SP-----------------------------VFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREG
:: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SPASCASYNFSFLSPQGLSFASQGPSAPFWSVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREG
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810 820 830
pF1KB8 DVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
850 860 870
>>CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 (845 aa)
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Smith-Waterman score: 2995; 52.0% identity (78.5% similar) in 856 aa overlap (1-836:1-840)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
:: :::: .:::.:.::::.:::.: .: : .:::::::::::::::.:: : .:.:...
CCDS12 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
:.:::::::::::::::::..: .::::. ::::. ::::::.:::::: ..: :: :
CCDS12 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
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pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSL-EELADEHDLGEDIYDCVPCEDG-GDDIYEDIIKV
:::.:: :::.:: . .:.:.: .: ... : . ::.:::: :.. ::.::::...
CCDS12 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
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pF1KB8 E-VQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFI
: :..: :: :: ::: ::: :::.:: :: :: .:......::. :.: :. .::
CCDS12 EPVSMPPKM--TEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFI
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 NLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMV-GGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLL
:.:::..:: ::. . .. . :...: .::. .:::.:.::.:::..: :.. :...
CCDS12 NIEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 ASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKE
:.::: ..:.:::. ....:.: :.:::.:::::::::::::.::..:. : :...:.
CCDS12 AAREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRL
300 310 320 330 340 350
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pF1KB8 ALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHT
::.::.:::. .::::::.::::.:..:: :::::. .: ..::::::::::. :. ..
CCDS12 ALDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRS
360 370 380 390 400 410
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pF1KB8 KQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQG
:.::: ::.::....:::.: ::.::....: .. :: ...: ::::. : ::. ::
CCDS12 KMDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQG
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pF1KB8 KQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRG
::...: ::...:.:::::::::.::: :..:.:: :.:::..:..::.::::.:.:::
CCDS12 AQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRG
480 490 500 510 520 530
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pF1KB8 TFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTS---PADL----------DASGAGPG-PKMV
:::::: : .: ..:::::: .::: . :. . : . : :::
CCDS12 TFYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKME
540 550 560 570 580 590
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pF1KB8 AMQNYHGNPAPPGK--PVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPC
..:.:.: : ::: : : .. ::..:: ... :. ::::: ..: . :.:: . :::
CCDS12 VFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPY
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pF1KB8 PVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAIS
: : ::. : ... :.:: ::: ....: ....::.:.:.: .: .::::
CCDS12 -VHG------PPQ---DLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAIS
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pF1KB8 IKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSR
::.: ::::::.. .. .::: : : .: ::::.:: .:::. ::.:::::..:.:
CCDS12 IKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEP
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KB8 ERSASRASSRSPVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGE
:. :. :: : . . .::: :::.: ::: ::::.:::...: .. :.::::.::
CCDS12 EK---RTISRPAVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNK-KGQQGWWRGE
770 780 790 800 810 820
830
pF1KB8 TNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
::.::::..::::.
CCDS12 IYGRVGWFPANYVEEDYSEYC
830 840
>>CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 (847 aa)
initn: 2524 init1: 1847 opt: 2287 Z-score: 1482.7 bits: 285.4 E(32554): 2.9e-76
Smith-Waterman score: 3179; 54.1% identity (80.1% similar) in 861 aa overlap (1-836:1-846)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
:: :.::..::: ::::: ::::.: :: ::::::.:::::::::::.:: ::.::.:
CCDS78 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
:.::::::::::::::::: .: . ::.:.::::. ::::::::::::: ..:::: :
CCDS78 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEH--DLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKV
: ::::::.::. ::.:.:..: .: :: . ::.:::: :: : ..:::..:.
CCDS78 ALATGIRPFPTEESI-NDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGEDEGGEVYEDLMKA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 E-VQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFI
: ..:: :.: :.::: ::..:: :: .:::.::: .:.::. :. :.. .:::
CCDS78 EEAHQPK---CPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 NLEDLIKVHHSFLRAI-DVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLL
:. .:.:.:..... : : : . ..: .::...::::.:::.::: .: : ..:. .
CCDS78 NIPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYIS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 ASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKE
..:: . :.:::. ....::: :.:::::::::::::::::.::..:... :. .::
CCDS78 KTKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
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CCDS59 VHG------PPQ---DLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISI
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CCDS59 KYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPE
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CCDS59 K---RTISRPAVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNK-KGQQGWWRGEI
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CCDS59 YGRVGWFPANYVEEDYSEYC
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CCDS44 MPIFTFLSEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVIRNYSG
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CCDS44 TP-PPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPCVPKP
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CCDS44 ---------VDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNE
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CCDS44 VGWFPSTYVEEDE
280
839 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 19:47:09 2016 done: Sat Nov 5 19:47:09 2016
Total Scan time: 3.330 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]