Result of FASTA (omim) for
pF1KB8594
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8594, 480 aa
1>>>pF1KB8594 480 - 480 aa - 480 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9060+/-0.000375; mu= 6.5273+/- 0.023
mean_var=162.6933+/-33.178, 0's: 0 Z-trim(118.4): 18 B-trim: 259 in 1/57
Lambda= 0.100552
statistics sampled from 31361 (31379) to 31361 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.368), width: 16
Scan time: 9.370
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016865245 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 480) 3259 484.8 2.2e-136
XP_016865246 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 480) 3259 484.8 2.2e-136
NP_001120708 (OMIM: 608412) vasculin isoform 2 [Ho ( 480) 3259 484.8 2.2e-136
XP_016865247 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 473) 3199 476.1 9.1e-134
NP_075064 (OMIM: 608412) vasculin isoform 1 [Homo ( 473) 3199 476.1 9.1e-134
XP_016865248 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 473) 3199 476.1 9.1e-134
NP_001317966 (OMIM: 608412) vasculin isoform 5 [Ho ( 493) 2102 317.0 7.6e-86
XP_016865244 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 493) 2102 317.0 7.6e-86
XP_016865243 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 500) 2102 317.0 7.7e-86
XP_006714736 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 500) 2102 317.0 7.7e-86
NP_001190175 (OMIM: 608412) vasculin isoform 4 [Ho ( 302) 2005 302.8 8.8e-82
NP_001120707 (OMIM: 608412) vasculin isoform 3 [Ho ( 465) 1939 293.3 9.5e-79
>>XP_016865245 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (480 aa)
initn: 3259 init1: 3259 opt: 3259 Z-score: 2569.5 bits: 484.8 E(85289): 2.2e-136
Smith-Waterman score: 3259; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
430 440 450 460 470 480
>>XP_016865246 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (480 aa)
initn: 3259 init1: 3259 opt: 3259 Z-score: 2569.5 bits: 484.8 E(85289): 2.2e-136
Smith-Waterman score: 3259; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
430 440 450 460 470 480
>>NP_001120708 (OMIM: 608412) vasculin isoform 2 [Homo s (480 aa)
initn: 3259 init1: 3259 opt: 3259 Z-score: 2569.5 bits: 484.8 E(85289): 2.2e-136
Smith-Waterman score: 3259; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
430 440 450 460 470 480
>>XP_016865247 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (473 aa)
initn: 3082 init1: 3082 opt: 3199 Z-score: 2522.5 bits: 476.1 E(85289): 9.1e-134
Smith-Waterman score: 3199; 98.5% identity (98.5% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTK-------SSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
420 430 440 450 460 470
>>NP_075064 (OMIM: 608412) vasculin isoform 1 [Homo sapi (473 aa)
initn: 3082 init1: 3082 opt: 3199 Z-score: 2522.5 bits: 476.1 E(85289): 9.1e-134
Smith-Waterman score: 3199; 98.5% identity (98.5% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTK-------SSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
420 430 440 450 460 470
>>XP_016865248 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (473 aa)
initn: 3082 init1: 3082 opt: 3199 Z-score: 2522.5 bits: 476.1 E(85289): 9.1e-134
Smith-Waterman score: 3199; 98.5% identity (98.5% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTK-------SSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRML
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMG
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::::::::::::::::::::
NP_001 TTENDDTETSSSDTSDDDDV
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Smith-Waterman score: 3149; 94.6% identity (94.6% similar) in 500 aa overlap (1-480:1-493)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 SSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
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XP_016 WQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKP
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pF1KB8 TTENDDTETSSSDTSDDDDV
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XP_016 TTENDDTETSSSDTSDDDDV
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>>XP_016865243 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (500 aa)
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pF1KB8 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
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XP_016 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
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pF1KB8 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVW--------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWGLHAQTHTYPTKKI
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pF1KB8 ------EYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVP
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XP_016 SQAPLLEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVP
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XP_016 KPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSN
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XP_016 SSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHN
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pF1KB8 SNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMG
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pF1KB8 WQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKP
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XP_016 WQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKP
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pF1KB8 TTENDDTETSSSDTSDDDDV
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XP_016 TTENDDTETSSSDTSDDDDV
490 500
>>XP_006714736 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (500 aa)
initn: 2098 init1: 2098 opt: 2102 Z-score: 1662.1 bits: 317.0 E(85289): 7.7e-86
Smith-Waterman score: 3209; 96.0% identity (96.0% similar) in 500 aa overlap (1-480:1-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KB8 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVW--------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNHNKSLAAGVWGLHAQTHTYPTKKI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 ------EYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SQAPLLEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTGPSVYKGLVP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 KPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGTSFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 SSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHN
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 SNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMG
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 WQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 WQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKP
430 440 450 460 470 480
470 480
pF1KB8 TTENDDTETSSSDTSDDDDV
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XP_006 TTENDDTETSSSDTSDDDDV
490 500
480 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 13:38:31 2016 done: Fri Nov 4 13:38:32 2016
Total Scan time: 9.370 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]