Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8592
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8592, 789 aa
1>>>pF1KB8592 789 - 789 aa - 789 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1160+/-0.00137; mu= -6.3000+/- 0.081
mean_var=340.7279+/-73.172, 0's: 0 Z-trim(108.8): 122 B-trim: 63 in 1/51
Lambda= 0.069482
statistics sampled from 10346 (10439) to 10346 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16
Scan time: 3.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5415.1 TAX1BP1 gene_id:8887|Hs108|chr7 ( 789) 5256 541.8 1.6e-153
CCDS43561.1 TAX1BP1 gene_id:8887|Hs108|chr7 ( 747) 3894 405.2 2e-112
CCDS56471.1 TAX1BP1 gene_id:8887|Hs108|chr7 ( 590) 2808 296.3 9.7e-80
CCDS8864.1 CALCOCO1 gene_id:57658|Hs108|chr12 ( 691) 736 88.7 3.6e-17
CCDS58560.1 CALCOCO2 gene_id:10241|Hs108|chr17 ( 404) 527 67.5 4.9e-11
CCDS11538.1 CALCOCO2 gene_id:10241|Hs108|chr17 ( 446) 518 66.7 9.8e-11
>>CCDS5415.1 TAX1BP1 gene_id:8887|Hs108|chr7 (789 aa)
initn: 5256 init1: 5256 opt: 5256 Z-score: 2869.5 bits: 541.8 E(32554): 1.6e-153
Smith-Waterman score: 5256; 100.0% identity (100.0% similar) in 789 aa overlap (1-789:1-789)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTPYIHPHPKDWVGIFKVGWSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTPYIHPHPKDWVGIFKVGWSTA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLELKIEKTMKEKEELLKLIAVLEKETAQLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLELKIEKTMKEKEELLKLIAVLEKETAQLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QVGRMERELNHEKERCDQLQAEQKGLTEVTQSLKMENEEFKKRFSDATSKAHQLEEDIVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QVGRMERELNHEKERCDQLQAEQKGLTEVTQSLKMENEEFKKRFSDATSKAHQLEEDIVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VTHKAIEKETELDSLKDKLKKAQHEREQLECQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLMSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VQTLKNLDGNKESVITHFKEEIGRLQLCLAEKENLQRTFLLTTSSKEDTCFLKEQLRKAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDRTMADLHTARLENEKVKKQLADAVAELKLNAMKKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 QDKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSDQSANNNNVFTKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QDKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSDQSANNNNVFTKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 TGNQQKVNDASVNTDPATSASTVDVKPSPSAAEADFDIVTKGQVCEMTKEIADKTEKYNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TGNQQKVNDASVNTDPATSASTVDVKPSPSAAEADFDIVTKGQVCEMTKEIADKTEKYNK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 CKQLLQDEKAKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAENVKLELAEVQDNYKELKRSLENPAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CKQLLQDEKAKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAENVKLELAEVQDNYKELKRSLENPAER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 KMEGQNSQSPQCFKTCSEQNGYVLTLSNAQPVLQYGNPYASQETRDGADGAFYPDEIQRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KMEGQNSQSPQCFKTCSEQNGYVLTLSNAQPVLQYGNPYASQETRDGADGAFYPDEIQRP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 PVRVPSWGLEDNVVCSQPARNFSRPDGLEDSEDSKEDENVPTAPDPPSQHLRGHGTGFCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PVRVPSWGLEDNVVCSQPARNFSRPDGLEDSEDSKEDENVPTAPDPPSQHLRGHGTGFCF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 DSSFDVHKKCPLCELMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQQVFERHVQTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSSFDVHKKCPLCELMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQQVFERHVQTH
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 FDQNVLNFD
:::::::::
CCDS54 FDQNVLNFD
>>CCDS43561.1 TAX1BP1 gene_id:8887|Hs108|chr7 (747 aa)
initn: 4005 init1: 3890 opt: 3894 Z-score: 2132.0 bits: 405.2 E(32554): 2e-112
Smith-Waterman score: 4873; 94.7% identity (94.7% similar) in 789 aa overlap (1-789:1-747)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTPYIHPHPKDWVGIFKVGWSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTPYIHPHPKDWVGIFKVGWSTA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLELKIEKTMKEKEELLKLIAVLEKETAQLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLELKIEKTMKEKEELLKLIAVLEKETAQLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QVGRMERELNHEKERCDQLQAEQKGLTEVTQSLKMENEEFKKRFSDATSKAHQLEEDIVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QVGRMERELNHEKERCDQLQAEQKGLTEVTQSLKMENEEFKKRFSDATSKAHQLEEDIVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VTHKAIEKETELDSLKDKLKKAQHEREQLECQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLMSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VTHKAIEKETELDSLKDKLKKAQHEREQLECQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLMSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VQTLKNLDGNKESVITHFKEEIGRLQLCLAEKENLQRTFLLTTSSKEDTCFLKEQLRKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VQTLKNLDGNKESVITHFKEEIGRLQLCLAEKENLQRTFLLTTSSKEDTCFLKEQLRKAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 EQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDRTMADLHTARLENEKVKKQLADAVAELKLNAMKKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDRTMADLHTARLENEKVKKQLADAVAELKLNAMKKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 QDKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSDQSANNNNVFTKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QDKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSDQSANNNNVFTKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 TGNQQKVNDASVNTDPATSASTVDVKPSPSAAEADFDIVTKGQVCEMTKEIADKTEKYNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TGNQQKVNDASVNTDPATSASTVDVKPSPSAAEADFDIVTKGQVCEMTKEIADKTEKYNK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 CKQLLQDEKAKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAENVKLELAEVQDNYKELKRSLENPAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CKQLLQDEKAKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAENVKLELAEVQDNYKELKRSLENPAER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 KMEGQNSQSPQCFKTCSEQNGYVLTLSNAQPVLQYGNPYASQETRDGADGAFYPDEIQRP
::: :::::::::::::::
CCDS43 KME------------------------------------------DGADGAFYPDEIQRP
610
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 PVRVPSWGLEDNVVCSQPARNFSRPDGLEDSEDSKEDENVPTAPDPPSQHLRGHGTGFCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVRVPSWGLEDNVVCSQPARNFSRPDGLEDSEDSKEDENVPTAPDPPSQHLRGHGTGFCF
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 DSSFDVHKKCPLCELMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQQVFERHVQTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DSSFDVHKKCPLCELMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQQVFERHVQTH
680 690 700 710 720 730
pF1KB8 FDQNVLNFD
:::::::::
CCDS43 FDQNVLNFD
740
>>CCDS56471.1 TAX1BP1 gene_id:8887|Hs108|chr7 (590 aa)
initn: 2919 init1: 2804 opt: 2808 Z-score: 1545.1 bits: 296.3 E(32554): 9.7e-80
Smith-Waterman score: 3787; 93.4% identity (93.4% similar) in 632 aa overlap (158-789:1-590)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLELKIEKTMKEKEELLKLIAVLEKETAQLREQVGRMER
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MKEKEELLKLIAVLEKETAQLREQVGRMER
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ELNHEKERCDQLQAEQKGLTEVTQSLKMENEEFKKRFSDATSKAHQLEEDIVSVTHKAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ELNHEKERCDQLQAEQKGLTEVTQSLKMENEEFKKRFSDATSKAHQLEEDIVSVTHKAIE
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KETELDSLKDKLKKAQHEREQLECQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLMSEVQTLKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KETELDSLKDKLKKAQHEREQLECQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLMSEVQTLKNL
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DGNKESVITHFKEEIGRLQLCLAEKENLQRTFLLTTSSKEDTCFLKEQLRKAEEQVQATR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DGNKESVITHFKEEIGRLQLCLAEKENLQRTFLLTTSSKEDTCFLKEQLRKAEEQVQATR
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QEVVFLAKELSDAVNVRDRTMADLHTARLENEKVKKQLADAVAELKLNAMKKDQDKTDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QEVVFLAKELSDAVNVRDRTMADLHTARLENEKVKKQLADAVAELKLNAMKKDQDKTDTL
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSDQSANNNNVFTKKTGNQQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSDQSANNNNVFTKKTGNQQKV
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 NDASVNTDPATSASTVDVKPSPSAAEADFDIVTKGQVCEMTKEIADKTEKYNKCKQLLQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NDASVNTDPATSASTVDVKPSPSAAEADFDIVTKGQVCEMTKEIADKTEKYNKCKQLLQD
340 350 360 370 380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 EKAKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAENVKLELAEVQDNYKELKRSLENPAERKMEGQNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EKAKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAENVKLELAEVQDNYKELKRSLENPAERKME----
400 410 420 430 440
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 QSPQCFKTCSEQNGYVLTLSNAQPVLQYGNPYASQETRDGADGAFYPDEIQRPPVRVPSW
::::::::::::::::::::::
CCDS56 --------------------------------------DGADGAFYPDEIQRPPVRVPSW
450 460
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 GLEDNVVCSQPARNFSRPDGLEDSEDSKEDENVPTAPDPPSQHLRGHGTGFCFDSSFDVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GLEDNVVCSQPARNFSRPDGLEDSEDSKEDENVPTAPDPPSQHLRGHGTGFCFDSSFDVH
470 480 490 500 510 520
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 KKCPLCELMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQQVFERHVQTHFDQNVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KKCPLCELMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQQVFERHVQTHFDQNVLN
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 FD
::
CCDS56 FD
590
>>CCDS8864.1 CALCOCO1 gene_id:57658|Hs108|chr12 (691 aa)
initn: 993 init1: 428 opt: 736 Z-score: 421.6 bits: 88.7 E(32554): 3.6e-17
Smith-Waterman score: 949; 28.1% identity (60.8% similar) in 758 aa overlap (5-754:2-680)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MTSFQEVPLQTS-NFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTPYIHPHPKDWVGIFKVGWST
.: ::. . . . : : :::..:.::...:::::: : : .::.::::: .
CCDS88 MEESPLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAAC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 ARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQ
.:::.::.:: .:: ..:: .. . ::. :::. ...::: ::...:.. : : :::
CCDS88 VRDYHTFVWSSVPESTTDGSPIHTSVQFQASYLPKPGAQLYQFRYVNRQGQVCGQSPPFQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 FRASSPVEELLTMED-EGNSDMLVVTTKAGLLELKIEKTMKEKEELLKLIAVLEKETAQL
:: :..::.:.:. .:.::.:.:. :: .:. .......:...:..: :: ....:
CCDS88 FREPRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGQVTEL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 REQVGRMERELNHEKERCDQLQAEQKGLTEVTQSLKMENEEFKKRFSDATSKAHQLEEDI
: .: ..:: : ... .:. . ::... . : . .... .: ... .::.::
CCDS88 RSRVQELERALATARQEHTELMEQYKGISRSHGEITEERDILSRQQGDHVARILELEDDI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VSVTHKAIEKETELDSLKDKLKKAQHEREQLECQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLM
....:.. ::.::: :.: .: .:.:.: ::: . .:: ...:. .. :: .:
CCDS88 QTISEKVLTKEVELDRLRDTVKALTREQEKLLGQLKEVQADKEQSEAELQVAQQENHHLN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 SEVQTLKNLDGNKESVITHFKEEIGRLQLCLAEKENLQRTFLLTTSSKEDTCFLKEQLRK
... :. . .. . ..:....... :.. . ::. : ::::::
CCDS88 LDLKEAKSWQEEQSAQAQRLKDKVAQMKDTLGQAQ--QRVAELEP--------LKEQLRG
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 AEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDRTMADLHTARLENEKVKKQLADAVAELKLNAMK
:.: . ...:....:..::..:. .::::.:.:: .::: .:. .::. .:: . .
CCDS88 AQELAASSQQKATLLGEELASAAAARDRTIAELHRSRLEVAEVNGRLAELGLHLKEEKCQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KDQDKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSDQSANNNNVFT
..... :. :.: :. :...: : ::.: ... : :.::
CCDS88 WSKERAGLLQSV---EAEKDKI-LKLSA--------EILRLEKAVQEERTQ----NQVFK
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 KKTGNQQKVNDASVNTDPATSASTVDVKPSPSAAEADFDIVTKGQVCEMTKEIADKTEKY
. . .. :.:. :. : : : .. . .: . :: . :.
CCDS88 TELAREK---DSSL------------VQLSESKRELT-ELRSALRV--LQKEKEQLQEEK
460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 NKCKQLLQDEKAKCNKYADELAKMELKWKEQVKIA-ENVKLEL---AEVQDNYKELKRSL
.. . .. .:. .: ::: ::.:.. :.. . : : . :. : ...
CCDS88 QELLEYMRKLEARLEKVADE------KWNEDATTEDEEAAVGLSCPAALTDSEDESPEDM
500 510 520 530 540
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 ENPAERKME-GQNSQSPQCFKTCSEQNGYVLTLSNAQPVLQYGNPYASQETRDGADGAFY
. : : :. ..:: . : ....:. :. .:. : ..:... .
CCDS88 RLPPYGLCERGDPGSSPAGPREASP----LVVISQPAPI----SPHLSGPAEDSSSDSEA
550 560 570 580 590
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 PDEIQRPPVRVPSWGLEDNVVCSQPARNF-SRPDGLEDSEDSKEDENVPTAPDPPSQHLR
:: . . : : : : :.. . . : . .:. . :. . . :..:
CCDS88 EDEKSVLMAAVQSGGEEANLLLPELGSAFYDMASGFTVGTLSETSTGGPATP--------
600 610 620 630 640 650
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 GHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCELMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQQV
. :.::.:. :: . :.. .:.:...:.
CCDS88 -------------TWKECPICKERFPAESDKDALEDHMDGHFFFSTQDPFTFE
660 670 680 690
780
pF1KB8 FERHVQTHFDQNVLNFD
>>CCDS58560.1 CALCOCO2 gene_id:10241|Hs108|chr17 (404 aa)
initn: 427 init1: 303 opt: 527 Z-score: 311.6 bits: 67.5 E(32554): 4.9e-11
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>>CCDS11538.1 CALCOCO2 gene_id:10241|Hs108|chr17 (446 aa)
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CCDS11 VGWKTTREYYTFMWVTLPIDLNNKSAKQQEVQFKAYYLPKDD-EYYQFCYVDEDGVVRGA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]