Result of FASTA (omim) for
pF1KB8539
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8539, 955 aa
1>>>pF1KB8539 955 - 955 aa - 955 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8148+/-0.000444; mu= 6.2149+/- 0.028
mean_var=219.1696+/-45.965, 0's: 0 Z-trim(116.9): 62 B-trim: 1483 in 1/59
Lambda= 0.086633
statistics sampled from 28361 (28423) to 28361 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16
Scan time: 14.360
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_570603 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alph ( 955) 6243 794.2 0
XP_011524859 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 comple ( 972) 6092 775.3 0
NP_055018 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alph ( 977) 4596 588.3 6.3e-167
XP_011524858 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 comple ( 994) 4445 569.5 3.1e-161
NP_001229766 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit a ( 940) 3984 511.8 6.5e-144
NP_036437 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit alph ( 939) 3966 509.6 3.1e-143
XP_011518232 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 comple ( 666) 3805 489.3 2.7e-137
XP_011518231 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 comple ( 864) 3480 448.8 5.6e-125
NP_001025178 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit g ( 825) 584 86.8 4.9e-16
NP_001119 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamm ( 822) 562 84.1 3.3e-15
XP_005268239 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 575) 492 75.2 1.1e-12
XP_005268237 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 640) 492 75.2 1.2e-12
XP_005268235 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 492 75.2 1.2e-12
XP_005268234 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 492 75.2 1.2e-12
XP_005268236 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 492 75.2 1.2e-12
XP_005268232 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 492 75.3 1.3e-12
XP_005268231 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 492 75.3 1.3e-12
XP_016877231 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 492 75.3 1.3e-12
NP_001269404 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit g ( 713) 492 75.3 1.3e-12
NP_003908 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit gamm ( 785) 492 75.3 1.4e-12
XP_005268230 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 785) 492 75.3 1.4e-12
XP_005268229 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 785) 492 75.3 1.4e-12
XP_016877230 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 795) 492 75.3 1.4e-12
XP_016877229 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 804) 492 75.3 1.4e-12
XP_005268226 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 492 75.3 1.4e-12
XP_006720364 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 492 75.3 1.4e-12
XP_005268225 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 492 75.3 1.4e-12
XP_005268224 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 492 75.3 1.4e-12
XP_005268227 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 492 75.3 1.4e-12
XP_011535585 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 807) 426 67.1 4.3e-10
XP_016877234 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 494) 393 62.8 5.1e-09
XP_016877233 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 495) 393 62.8 5.1e-09
NP_031373 (OMIM: 184450,607244,613744) AP-4 comple (1137) 361 59.1 1.5e-07
XP_005254321 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE (1062) 322 54.2 4.3e-06
NP_001239056 (OMIM: 184450,607244,613744) AP-4 com (1062) 322 54.2 4.3e-06
XP_006720510 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE (1062) 322 54.2 4.3e-06
XP_016877232 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 552) 304 51.7 1.2e-05
NP_003929 (OMIM: 607246,617050) AP-3 complex subun (1153) 292 50.4 6.1e-05
XP_006722995 (OMIM: 607246,617050) PREDICTED: AP-3 (1203) 292 50.5 6.4e-05
NP_001248755 (OMIM: 607246,617050) AP-3 complex su (1215) 292 50.5 6.4e-05
NP_001269403 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit g ( 404) 273 47.7 0.00014
XP_011535588 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 273 47.7 0.00014
XP_016877235 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 273 47.7 0.00014
XP_016877237 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 273 47.7 0.00014
XP_016877236 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 273 47.7 0.00014
NP_663782 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit beta ( 939) 261 46.5 0.00077
NP_001159491 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit b ( 919) 259 46.2 0.0009
XP_016877531 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE ( 843) 258 46.1 0.00092
NP_001118 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit beta ( 949) 259 46.2 0.00092
XP_016882911 (OMIM: 607246,617050) PREDICTED: AP-3 ( 987) 237 43.5 0.0064
>>NP_570603 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alpha-1 (955 aa)
initn: 6243 init1: 6243 opt: 6243 Z-score: 4230.5 bits: 794.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6243; 100.0% identity (100.0% similar) in 955 aa overlap (1-955:1-955)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFKTCVSLAVSRLSRIVSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFKTCVSLAVSRLSRIVSSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 QHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 QHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
310 320 330 340 350 360
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pF1KB8 FSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLETADYAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 FSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLETADYAI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 REEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDVQGYAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 REEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDVQGYAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLLHSKFHLCSVATRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLLHSKFHLCSVATRAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 LLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTLSSVASTDVLATVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 LLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTLSSVASTDVLATVLE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 EMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEPTPSTVSTPSPSADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 EMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEPTPSTVSTPSPSADL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 LGLRAAPPPAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAFLSPGPEDIGPPIPEADE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 LGLRAAPPPAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAFLSPGPEDIGPPIPEADE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 LLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 TQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLLSVRFRYGGAPQALTLKLPVTIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 TQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLLSVRFRYGGAPQALTLKLPVTIN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 KFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMDAEVTKAKLLGFGSALLDNVDPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMDAEVTKAKLLGFGSALLDNVDPN
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910 920 930 940 950
pF1KB8 PENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTSKEPVSRHLCELLAQQF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 PENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTSKEPVSRHLCELLAQQF
910 920 930 940 950
>>XP_011524859 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 complex su (972 aa)
initn: 6086 init1: 6086 opt: 6092 Z-score: 4128.4 bits: 775.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6092; 98.9% identity (99.5% similar) in 944 aa overlap (15-955:29-972)
10 20 30 40
pF1KB8 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNC---KSKEAEIKRINKELANIRSK
:.. ...: ::::::::::::::::::::
XP_011 METRGRQEGWRGGCFTDLSERAWDLDEVVIVEVLKTCSEGKSKEAEIKRINKELANIRSK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 FKGDKALDGYSKKKYVCKLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FKGDKALDGYSKKKYVCKLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 SNSELIRLINNAIKNDLASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNSELIRLINNAIKNDLASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VKQSAALCLLRLYKASPDLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VKQSAALCLLRLYKASPDLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 TCVSLAVSRLSRIVSSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TCVSLAVSRLSRIVSSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVEC
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 LETVLNKAQEPPKSKKVQHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LETVLNKAQEPPKSKKVQHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRET
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 NLRYLALESMCTLASSEFSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLRYLALESMCTLASSEFSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAK
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 QIVSEMLRYLETADYAIREEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QIVSEMLRYLETADYAIREEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWY
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470 480 490 500 510 520
pF1KB8 RVLQIVTNRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RVLQIVTNRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQF
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 SLLHSKFHLCSVATRALLLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLLHSKFHLCSVATRALLLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEY
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 LTLSSVASTDVLATVLEEMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LTLSSVASTDVLATVLEEMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGG
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 MEPTPSTVSTPSPSADLLGLRAAPPPAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEPTPSTVSTPSPSADLLGLRAAPPPAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAF
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 LSPGPEDIGPPIPEADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSPGPEDIGPPIPEADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTS
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB8 VQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLLSVRFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLLSVRFR
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KB8 YGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMDAEVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMDAEVTK
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KB8 AKLLGFGSALLDNVDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTSKEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKLLGFGSALLDNVDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTSKEPV
910 920 930 940 950 960
950
pF1KB8 SRHLCELLAQQF
::::::::::::
XP_011 SRHLCELLAQQF
970
>>NP_055018 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alpha-1 (977 aa)
initn: 6229 init1: 4574 opt: 4596 Z-score: 3117.9 bits: 588.3 E(85289): 6.3e-167
Smith-Waterman score: 6189; 97.7% identity (97.7% similar) in 977 aa overlap (1-955:1-977)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFKTCVSLAVSRLSRIVSSA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLETADYAI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 REEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDVQGYAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLLHSKFHLCSVATRAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTLSSVASTDVLATVLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEPTPSTVSTPSPSADL
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LGLRAAPPPAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAFLSELEPPAPESPMALLA
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GNKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SVRFRYGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AEVTKAKLLGFGSALLDNVDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRT
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:::::::::::::::::
NP_055 SKEPVSRHLCELLAQQF
970
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pF1KB8 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNC---KSKEAEIKRINKELANIRSK
:.. ...: ::::::::::::::::::::
XP_011 METRGRQEGWRGGCFTDLSERAWDLDEVVIVEVLKTCSEGKSKEAEIKRINKELANIRSK
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XP_011 FKGDKALDGYSKKKYVCKLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNSELIRLINNAIKNDLASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TCVSLAVSRLSRIVSSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVEC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QIVSEMLRYLETADYAIREEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLLHSKFHLCSVATRALLLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEPTPSTVSTPSPSADLLGLRAAPPPAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAF
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:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB8 GVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQ
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810 820 830 840 850 860
pF1KB8 QVLNIECLRDFLTPPLLSVRFRYGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QVLNIECLRDFLTPPLLSVRFRYGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLS
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870 880 890 900 910 920
pF1KB8 LPQQEAQKIFKANHPMDAEVTKAKLLGFGSALLDNVDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPQQEAQKIFKANHPMDAEVTKAKLLGFGSALLDNVDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLL
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930 940 950
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::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLEPNAQAQMYRLTLRTSKEPVSRHLCELLAQQF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB8 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
:::::::: :::::::.::::::.::::..::..:::::.::::::::::::::::..::
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::::::.::.::::::::::.::::::.:::: : .:::..::: ::::::::::::.::
NP_001 DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
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pF1KB8 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.:::::.:::::::::::::
NP_001 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
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pF1KB8 QHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
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pF1KB8 FSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLETADYAI
::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::: :::.::: :::::::.:
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pF1KB8 REEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDVQGYAA
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::: ::::::::::
NP_001 REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
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pF1KB8 KTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLLHSKFHLCSVATRAL
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .:: ::::::::::: ::::
NP_001 KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
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pF1KB8 LLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTLSSVASTDVLATVLE
::::::::.:::::.: ::: :::. :::::::::::::::::: ::.:::::.::::::
NP_001 LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
550 560 570 580 590 600
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pF1KB8 EMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEPTP---STVSTPSPS
:::::::::::::::::.::::.. . :.: .:: : :.::: ::.: :.:::::::
NP_001 EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRD-RSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPS
610 620 630 640 650
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pF1KB8 ADLLGLRAAPP-PAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAFLSPGPEDIGPPIP
:::::: :::: ::.:: :.:...::::::. :. ..: :.:: ::
NP_001 ADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSAS--VVAP------LAPGSEDN-----
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pF1KB8 EADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHP
. .::::::::::::::::::.:::::::::::..:::::::.:: ::.::..
NP_001 -----FARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICS
710 720 730 740 750 760
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pF1KB8 GDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLLSVRFRYGGAPQALTLKLP
::: .: .::: : :.::::::::.::::. :: :.:...:::::. : ....::
NP_001 DDLQPNLNLQTKPVDPTVEGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLP
770 780 790 800 810 820
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pF1KB8 VTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMDAEVTKAKLLGFGSALLDN
.:.::::::::::.::::::::::: ::::.:.::::.::::.::::::..:::::::..
NP_001 ITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEE
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pF1KB8 VDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTSKEPVSRHLCELLAQQF
::::: ::::::::.::. :.::::::::: :::::::::::::: ::..:::::. ::
NP_001 VDPNPANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
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>>NP_036437 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit alpha-2 (939 aa)
initn: 3452 init1: 2151 opt: 3966 Z-score: 2692.6 bits: 509.6 E(85289): 3.1e-143
Smith-Waterman score: 5113; 82.2% identity (92.2% similar) in 959 aa overlap (1-955:1-939)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
:::::::: :::::::.::::::.::::..::..:::::.::::::::::::::::..::
NP_036 ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFKTCVSLAVSRLSRIVSSA
::::::.::.::::::::::.::::::.:::: : .:::..::: ::::::::::::.::
NP_036 DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::: : ::.:::.:::::.:::::::::::::
NP_036 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPP-DPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 QHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
300 310 320 330 340 350
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pF1KB8 FSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLETADYAI
::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::: :::.::: :::::::.:
NP_036 FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 REEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDVQGYAA
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::: ::::::::::
NP_036 REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
420 430 440 450 460 470
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pF1KB8 KTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLLHSKFHLCSVATRAL
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .:: ::::::::::: ::::
NP_036 KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 LLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTLSSVASTDVLATVLE
::::::::.:::::.: ::: :::. :::::::::::::::::: ::.:::::.::::::
NP_036 LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650
pF1KB8 EMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEPTP---STVSTPSPS
:::::::::::::::::.::::.. . :.: .:: : :.::: ::.: :.:::::::
NP_036 EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRD-RSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPS
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 ADLLGLRAAPP-PAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAFLSPGPEDIGPPIP
:::::: :::: ::.:: :.:...::::::. :. ..: :.:: ::
NP_036 ADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSAS--VVAP------LAPGSEDN-----
660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 EADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHP
. .::::::::::::::::::.:::::::::::..:::::::.:: ::.::..
NP_036 -----FARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICS
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 GDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLLSVRFRYGGAPQALTLKLP
::: .: .::: : :.::::::::.::::. :: :.:...:::::. : ....::
NP_036 DDLQPNLNLQTKPVDPTVEGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLP
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 VTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMDAEVTKAKLLGFGSALLDN
.:.::::::::::.::::::::::: ::::.:.::::.::::.::::::..:::::::..
NP_036 ITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEE
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KB8 VDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTSKEPVSRHLCELLAQQF
::::: ::::::::.::. :.::::::::: :::::::::::::: ::..:::::. ::
NP_036 VDPNPANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
890 900 910 920 930
>>XP_011518232 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 complex su (666 aa)
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Smith-Waterman score: 3805; 89.3% identity (96.6% similar) in 652 aa overlap (1-652:1-651)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
:::::::: :::::::.::::::.::::..::..:::::.::::::::::::::::..::
XP_011 ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
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pF1KB8 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFKTCVSLAVSRLSRIVSSA
::::::.::.::::::::::.::::::.:::: : .:::..::: ::::::::::::.::
XP_011 DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
190 200 210 220 230 240
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pF1KB8 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.:::::.:::::::::::::
XP_011 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290 300
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pF1KB8 QHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
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pF1KB8 FSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLETADYAI
::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::: :::.::: :::::::.:
XP_011 FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
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pF1KB8 REEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDVQGYAA
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::: ::::::::::
XP_011 REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
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pF1KB8 KTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLLHSKFHLCSVATRAL
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .:: ::::::::::: ::::
XP_011 KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 LLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTLSSVASTDVLATVLE
::::::::.:::::.: ::: :::. :::::::::::::::::: ::.:::::.::::::
XP_011 LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
550 560 570 580 590 600
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pF1KB8 EMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEPTPSTVSTPSPSADL
:::::::::::::::::.::::.. . :.: .:: : :.::: ::.:...:
XP_011 EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRD-RSVDVNGGPEPAPASTSAVVSGGRN
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pF1KB8 LGLRAAPPPAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAFLSPGPEDIGPPIPEADE
XP_011 LLVEICL
660
>>XP_011518231 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 complex su (864 aa)
initn: 4578 init1: 3277 opt: 3480 Z-score: 2364.8 bits: 448.8 E(85289): 5.6e-125
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50 60 70 80 90 100
pF1KB8 DKALDGYSKKKYVCKLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNS
::::::::::.:::::::::::::::::::
XP_011 MEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNS
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pF1KB8 ELIRLINNAIKNDLASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQ
:::::::::::::::::::::: :::::::.::::::.::::..::..:::::.::::::
XP_011 ELIRLINNAIKNDLASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQ
40 50 60 70 80 90
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pF1KB8 SAALCLLRLYKASPDLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFKTCV
::::::::::..::::::::.::.::::::::::.::::::.:::: : .:::..::: :
XP_011 SAALCLLRLYRTSPDLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSV
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pF1KB8 SLAVSRLSRIVSSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLET
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.:::::
XP_011 SLAVSRLSRIVTSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDPAVRGRLTECLET
160 170 180 190 200 210
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pF1KB8 VLNKAQEPPKSKKVQHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLR
.:::::::::::::::::::::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILNKAQEPPKSKKVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLR
220 230 240 250 260 270
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pF1KB8 YLALESMCTLASSEFSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIV
::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::: :::
XP_011 YLALESMCTLASSEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIV
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pF1KB8 SEMLRYLETADYAIREEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVL
.::: :::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.
XP_011 AEMLSYLETADYSIREEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVI
340 350 360 370 380 390
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pF1KB8 QIVTNRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLL
::: :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .:: ::
XP_011 QIVINRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLL
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 HSKFHLCSVATRALLLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTL
::::::::: ::::::::::::.:::::.: ::: :::. :::::::::::::::::: :
XP_011 HSKFHLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRL
460 470 480 490 500 510
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pF1KB8 SSVASTDVLATVLEEMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEP
:.:::::.:::::::::::::::::::::::.::::.. . :.: .:: : :.::: ::
XP_011 STVASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRD-RSVDVNGGPEP
520 530 540 550 560
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pF1KB8 TP---STVSTPSPSADLLGLRAAPP-PAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEA
.: :.::::::::::::: :::: ::.:: :.:...::::::. :. ..:
XP_011 APASTSAVSTPSPSADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSAS--VVAP-----
570 580 590 600 610 620
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 FLSPGPEDIGPPIPEADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKT
:.:: :: . .::::::::::::::::::.:::::::::::..::::::
XP_011 -LAPGSEDN----------FARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKT
630 640 650 660 670
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pF1KB8 SVQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLLSVRF
:.:: ::.::.. ::: .: .::: : :.::::::::.::::. :: :.:...:
XP_011 STQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVEGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQF
680 690 700 710 720 730
830 840 850 860 870 880
pF1KB8 RYGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMDAEVT
::::. : ....::.:.::::::::::.::::::::::: ::::.:.::::.::::.:::
XP_011 RYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVT
740 750 760 770 780 790
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pF1KB8 KAKLLGFGSALLDNVDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTSKEP
:::..:::::::..::::: ::::::::.::. :.::::::::: ::::::::::::::
XP_011 KAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEA
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950
pF1KB8 VSRHLCELLAQQF
::..:::::. ::
XP_011 VSQRLCELLSAQF
860
>>NP_001025178 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamma (825 aa)
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Smith-Waterman score: 988; 28.6% identity (60.4% similar) in 826 aa overlap (16-805:10-789)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
.: ::. ... : . :.:: : :::.:. . :. . . :
NP_001 MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREE---DNTYRCRNVA
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pF1KB8 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
:::.. .::. ::..: ..:..:.:.:.:.:::: .:.. ... :..: :::::
NP_001 KLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
. . ::: .. .:: :: . .:... ..: ...:. ....:::: ... . :
NP_001 NHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSY--LRKKAALCAVHVIRKVP
120 130 140 150 160
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pF1KB8 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPD---DFKTCVSLAVSRLSRIV
.:. : . . .:::... ::. ..: :.: .:...:: :. .: : .: ::.
NP_001 ELMEM--FLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKNEKL-VPQLVRIL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SS--ASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPP
.. : .. . :.:.:..::::. .: . : .. .: ..
NP_001 KNLIMSGYSPEHDVSGISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSS-----EAMNDILAQVATNT
230 240 250 260 270 280
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pF1KB8 KSKKVQHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCT
...: :. ::::.::. :. :: .: : : : ::.:: . . :.::.:: :.
NP_001 ETSK----NVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSL--
290 300 310 320 330
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pF1KB8 LASSEFSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLET
: . . .:.::. : .:... :: . :::...:: .: .:. . .: . ...:.: .:..
NP_001 LKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLK-DLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDS
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 ADYAIREEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDV
. .. . . . . ::::: . :..:::. .. ::.:: ... ..:..:: ..
NP_001 CEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEM
400 410 420 430 440 450
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pF1KB8 QGYAAKTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNL-IAGDPRSSPPVQFS------LLHS
..:... ...:. . .. .:.:... .::.:.: ..:. . :.: . .:.:
NP_001 HAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILES
460 470 480 490 500 510
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pF1KB8 KF--HLCSVATRALLLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRA-GSQLRNADVELQQRAVEYLT
. .. . .::. :.. .:. . : : :. :. ::.. ::::::::::: .
NP_001 VLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGSSI---DVELQQRAVEYNA
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 LSSVASTDVLATVLEEMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGME
: . . ...::.:: . . .. ... . .: . :. . : : : .
NP_001 LFK-KYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGPTEIVQTNGETEPAPLE--TKPPPS-----GPQ
580 590 600 610 620
650 660 670 680 690
pF1KB8 PTPSTVSTPSPSADLLGLRAAPP--PAAP---PASAGAGNLL-----VDVFDGPAAQPSL
:: : . :::: : :.:: :.::: :.:: ... .::: :.
NP_001 PT----SQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAG-GELLDLLGDINLTGAPAAAPAP
630 640 650 660 670
700 710 720 730 740
pF1KB8 GPTPE---EAFLSPG----P--EDIGPPIPEADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSE
. .:. :: : : .::. :: ..::. .: . .:.
NP_001 ASVPQISQPPFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAY------SKNGLKIEFTF----ERSN
680 690 700 710 720
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 FRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGA--QVQQVL
.. . . .:.: ... .: .. : .: :: .. .. . :. :: .::
NP_001 TNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKTFQLQLLSPSSSIVPAFNTGTITQVIKVL
730 740 750 760 770 780
810 820 830 840 850 860
pF1KB8 NIECLRDFLTPPLLSVRFRYGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQ
:
NP_001 NPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFPPQSWQ
790 800 810 820
>>NP_001119 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamma-1 (822 aa)
initn: 692 init1: 267 opt: 562 Z-score: 394.0 bits: 84.1 E(85289): 3.3e-15
Smith-Waterman score: 1001; 28.5% identity (60.4% similar) in 824 aa overlap (16-805:10-786)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
.: ::. ... : . :.:: : :::.:. . :. . . :
NP_001 MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREE---DNTYRCRNVA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
:::.. .::. ::..: ..:..:.:.:.:.:::: .:.. ... :..: :::::
NP_001 KLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
. . ::: .. .:: :: . .:... ..: ...:. ....:::: ... . :
NP_001 NHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSY--LRKKAALCAVHVIRKVP
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB8 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPD---DFKTCVSLAVSRLSRIV
.:. : . . .:::... ::. ..: :.: .:...:: :. : : :. ..
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