Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8538
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8538, 898 aa
1>>>pF1KB8538 898 - 898 aa - 898 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4623+/-0.00114; mu= 15.7663+/- 0.069
mean_var=101.3714+/-19.731, 0's: 0 Z-trim(104.0): 27 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.127385
statistics sampled from 7672 (7688) to 7672 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 3.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43329.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5 ( 898) 6065 1126.2 0
CCDS4016.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5 ( 890) 6005 1115.1 0
CCDS45992.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19 ( 887) 5240 974.6 0
CCDS45991.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19 ( 897) 4491 836.9 0
CCDS62228.1 KPNB1 gene_id:3837|Hs108|chr17 ( 731) 310 68.5 5.2e-11
CCDS11513.1 KPNB1 gene_id:3837|Hs108|chr17 ( 876) 310 68.5 6e-11
>>CCDS43329.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5 (898 aa)
initn: 6065 init1: 6065 opt: 6065 Z-score: 6025.8 bits: 1126.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6065; 100.0% identity (100.0% similar) in 898 aa overlap (1-898:1-898)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDED
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 PPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 YQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 VATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 ITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB8 IFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
850 860 870 880 890
>>CCDS4016.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5 (890 aa)
initn: 6005 init1: 6005 opt: 6005 Z-score: 5966.2 bits: 1115.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6005; 100.0% identity (100.0% similar) in 890 aa overlap (9-898:1-890)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDED
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 GIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWV
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 PPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 PPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSK
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 YQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 YQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSS
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 VATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLA
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPI
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTA
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 ITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDF
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890
pF1KB8 IFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 IFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
840 850 860 870 880 890
>>CCDS45992.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19 (887 aa)
initn: 3274 init1: 3274 opt: 5240 Z-score: 5206.5 bits: 974.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5240; 85.5% identity (95.7% similar) in 890 aa overlap (12-898:2-887)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
.:.::::::::.:::::.::::.:. :: ::.::.::::.:::::::::
CCDS45 MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIVQDKLKQLNQFPDFNNYLIF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
:::.:::::::::::::::::::::::.:.:: :.::::.::::::::.: :::::.::
CCDS45 VLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIKQECLNNIGDASSLIRATIGI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
:::::::::::: ::.:::.::.::.:::::::::::::::::::::.:.::::.:.:::
CCDS45 LITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGALQKICEDSSELLDSDALNRPL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.:::: .::.:::.::::: :..::::
CCDS45 NIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDNIDTFIEHLFALAVDDDPEVR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
::::::::::::::.:::.::::.:..::::::::.::::::::::::::::::::::.:
CCDS45 KNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENVALEACEFWLTLAEQPICKEV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDE-
:. :: .:::.::::::::.::::::::::::::..:::::::.::::.::::. :.
CCDS45 LASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSEQDIKPRFHKSRTVTLPHEAE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 --DGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHH
:: :. .:::: ::..:::::::::::::::::::.:.:::::.::::: ::::
CCDS45 RPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREELLPHLLPLLKGLLFHP
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 EWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWV
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS45 EWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSIACWTLSRYAHWV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 VSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFA
:::::: .::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS45 VSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLSYILDTLVFA
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 FSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLEC
:.::::::::::::::::::::::::::.::::: :::::::::: ::::::::::::::
CCDS45 FGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKWNELKDEDKDLFPLLEC
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 LSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLS
::::::::::::::::::::::::.::::::::::. . .:.::::::::::::::::::
CCDS45 LSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQYEAPDKDFMIVALDLLS
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 GLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADF
::::::::..:::::::::.::..:::::.:::::::::::::::::::: :::::::.:
CCDS45 GLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGDLTKACFIHVKPCIAEF
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 MPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLE
:::::::::::::::::::::::::: .::: :::::. :::..::::::::::::::::
CCDS45 MPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNNLVEIINRPNTPKTLLE
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 NTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::.
CCDS45 NTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICMMIGVNPGGVV
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 QDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYG
:::::::::::::..::::::::: :::::::.:::..::..::.::: ::::::::::
CCDS45 QDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQQFSEQFPPLLKERLAAFYG
830 840 850 860 870 880
pF1KB8 V
:
CCDS45 V
>>CCDS45991.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19 (897 aa)
initn: 3260 init1: 2523 opt: 4491 Z-score: 4462.5 bits: 836.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5210; 84.6% identity (94.7% similar) in 900 aa overlap (12-898:2-897)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
.:.::::::::.:::::.::::.:. :: ::.::.::::.:::::::::
CCDS45 MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIVQDKLKQLNQFPDFNNYLIF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
:::.:::::::::::::::::::::::.:.:: :.::::.::::::::.: :::::.::
CCDS45 VLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIKQECLNNIGDASSLIRATIGI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
:::::::::::: ::.:::.::.::.:::::::::::::::::::::.:.::::.:.:::
CCDS45 LITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGALQKICEDSSELLDSDALNRPL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.:::: .::.:::.::::: :..::::
CCDS45 NIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDNIDTFIEHLFALAVDDDPEVR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
::::::::::::::.:::.::::.:..::::::::.::::::::::::::::::::::.:
CCDS45 KNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENVALEACEFWLTLAEQPICKEV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDE-
:. :: .:::.::::::::.::::::::::::::..:::::::.::::.::::. :.
CCDS45 LASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSEQDIKPRFHKSRTVTLPHEAE
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:: :. .:::: ::..:::::::::::::::::::.:.:::::.::::: ::::
CCDS45 RPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREELLPHLLPLLKGLLFHP
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:::::: .::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS45 VSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLSYILDTLVFA
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CCDS45 FGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKWNELKDEDKDLFPLLEC
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::::::::::::::::::::::::.::::::::::. . .:.::::::::::::::::::
CCDS45 LSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQYEAPDKDFMIVALDLLS
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::::::::..:::::::::.::..:::::.:::::::::::::::::::: :::::::.:
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:::::::::::::::::::::::::: .::: :::::. :::..::::::::::::::::
CCDS45 MPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNNLVEIINRPNTPKTLLE
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CCDS45 LKERLAAFYGV
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. : :: :. :.: :... .. . :. : .: .. .:.
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::. :
CCDS62 VLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELRESCLEAYTGIVQGLKGDQENVHPDVMLVQPRV
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CCDS11 -----------------------PALFAITIEAMK-SDIDEVALQGIEFWSNVCDEEMDL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]