Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8506
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8506, 866 aa
1>>>pF1KB8506 866 - 866 aa - 866 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0867+/-0.000918; mu= 12.9214+/- 0.055
mean_var=128.9049+/-25.101, 0's: 0 Z-trim(110.1): 49 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.112964
statistics sampled from 11332 (11378) to 11332 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.35), width: 16
Scan time: 4.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2867.1 SFMBT1 gene_id:51460|Hs108|chr3 ( 866) 5972 985.2 0
CCDS31138.1 SFMBT2 gene_id:57713|Hs108|chr10 ( 894) 3268 544.6 3e-154
CCDS14011.1 L3MBTL2 gene_id:83746|Hs108|chr22 ( 705) 447 84.7 6.2e-16
CCDS11581.2 MBTD1 gene_id:54799|Hs108|chr17 ( 628) 425 81.1 6.7e-15
CCDS13319.1 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 ( 772) 397 76.6 1.9e-13
CCDS46602.2 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 ( 840) 397 76.6 2e-13
>>CCDS2867.1 SFMBT1 gene_id:51460|Hs108|chr3 (866 aa)
initn: 5972 init1: 5972 opt: 5972 Z-score: 5264.6 bits: 985.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5972; 100.0% identity (100.0% similar) in 866 aa overlap (1-866:1-866)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MNGEQQLDADAGSGMEEVELSWEDYLEETGSTAVPYGSFKHVDTRLQNGFAPGMKLEVAV
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CCDS28 MNGEQQLDADAGSGMEEVELSWEDYLEETGSTAVPYGSFKHVDTRLQNGFAPGMKLEVAV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RTDPETYWVATVITTCEQLLLLRYDGYGEDRRADFWCDIRKADLYPIGWCEQNKKTLEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 RTDPETYWVATVITTCEQLLLLRYDGYGEDRRADFWCDIRKADLYPIGWCEQNKKTLEAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EGIRDKVSDWDEFLRQTLIGACSPPVPLLEGLRNGRNPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 EGIRDKVSDWDEFLRQTLIGACSPPVPLLEGLRNGRNPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IVTVVENIGGRLKLRYEGLESSDNYEHWLYYLDPFLHHVGWAAQQGYELQPPSAIRHLKN
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CCDS28 IVTVVENIGGRLKLRYEGLESSDNYEHWLYYLDPFLHHVGWAAQQGYELQPPSAIRHLKN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EAEWQEILAKVKEEEEEPLPSYLFKDKQVIGIHTFSVNMKLEAVDPWSPFGISPATVVKV
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CCDS28 EAEWQEILAKVKEEEEEPLPSYLFKDKQVIGIHTFSVNMKLEAVDPWSPFGISPATVVKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FDEKYFLVEMDDLRPENHARRSFVCHADSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWAD
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CCDS28 FDEKYFLVEMDDLRPENHARRSFVCHADSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWAD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 YLKQCGAEAAPQRCFPPLISEHEFKENMKLEAVNPILPEEVCVATITAVRGSYLWLQLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 YLKQCGAEAAPQRCFPPLISEHEFKENMKLEAVNPILPEEVCVATITAVRGSYLWLQLEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCETNGHPLSTPRRARVYKQRKIAVVQPEKQVPSSRTVH
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CCDS28 SKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCETNGHPLSTPRRARVYKQRKIAVVQPEKQVPSSRTVH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 EGLRNQELNSTESVMINGKYCCPKIYFNHRCFSGPYLNKGRIAELPQCVGPGNCVLVLRE
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CCDS28 EGLRNQELNSTESVMINGKYCCPKIYFNHRCFSGPYLNKGRIAELPQCVGPGNCVLVLRE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 VLTLLINAAYKPSRVLRELQLDKDSVWHGCGEVLKAKYKGKSYRATVEIVKTADRVTEFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 VLTLLINAAYKPSRVLRELQLDKDSVWHGCGEVLKAKYKGKSYRATVEIVKTADRVTEFC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RQTCIKLECCPNLFGPRMVLDKCSENCSVLTKTKYTHYYGKKKNKRIGRPPGGHSNLACA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 RQTCIKLECCPNLFGPRMVLDKCSENCSVLTKTKYTHYYGKKKNKRIGRPPGGHSNLACA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 LKKASKRRKRRKNVFVHKKKRSSASVDNTPAGSPQGSGGEDEDDPDEGDDDSLSEGSTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 LKKASKRRKRRKNVFVHKKKRSSASVDNTPAGSPQGSGGEDEDDPDEGDDDSLSEGSTSE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 QQDELQEESEMSEKKSCSSSPTQSEISTSLPPDRQRRKRELRTFSFSDDENKPPSPKEIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 QQDELQEESEMSEKKSCSSSPTQSEISTSLPPDRQRRKRELRTFSFSDDENKPPSPKEIR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 IEVAERLHLDSNPLKWSVADVVRFIRSTDCAPLARIFLDQEIDGQALLLLTLPTVQECMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 IEVAERLHLDSNPLKWSVADVVRFIRSTDCAPLARIFLDQEIDGQALLLLTLPTVQECMD
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KB8 LKLGPAIKLCHHIERIKFAFYEQFAN
::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 LKLGPAIKLCHHIERIKFAFYEQFAN
850 860
>>CCDS31138.1 SFMBT2 gene_id:57713|Hs108|chr10 (894 aa)
initn: 2886 init1: 1581 opt: 3268 Z-score: 2882.8 bits: 544.6 E(32554): 3e-154
Smith-Waterman score: 3268; 55.4% identity (77.8% similar) in 882 aa overlap (2-866:26-894)
10 20 30
pF1KB8 MNGEQQLDADAGSGMEEVELSWEDYLEETGSTAVPY
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CCDS31 MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 GSFKHVDTRLQNGFAPGMKLEVAVRTDPETYWVATVITTCEQLLLLRYDGYGEDRRADFW
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CCDS31 TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 CDIRKADLYPIGWCEQNKKTLEAPEGIRDKVSDWDEFLRQTLIGACSPPVPLLEGLRNGR
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CCDS31 CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 NPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTWIVTVVENIGGRLKLRYEGLESSDNYEHWLYYLDPFL
.:.:::. :: .: : :. .. :::.:.::.::::.::: :::....:..::.::: :
CCDS31 GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 HHVGWAAQQGYELQPPSAIRHLKNEAEWQEILAK-VKEEEEEPLPSYLFKDKQVIGIHTF
. ::: .. :...::: : :: .::. : : . . . ::: .:::. . : :
CCDS31 RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 SVNMKLEAVDPWSPFGISPATVVKVFDEKYFLVEMDDLRPENHARRSFVCHADSPGIFPV
.:.::::.:. :: ::::.:.:::....: : .:::::: .. :..::::: ::.::
CCDS31 TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEP-SKLSMLCHADSLGILPV
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 QWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQRCFPPLISEHEFKENMKLEAVNP
:: ::::. ..:: :: .:::::::: :: ::. :: :: . : .:::::::::
CCDS31 QWCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNP
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 ILPEEVCVATITAVRGSYLWLQLEGSKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCETNGHPLSTPRR
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CCDS31 RNPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHK
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 ARVYKQRKIAVVQPEKQVPSSRTV----HEGLRNQELNSTESVMINGKYCCPKIYFNHRC
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CCDS31 TVSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTV--NGKYCCPQLFINHRC
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 FSGPYLNKGRIAELPQCVGPGNCVLVLREVLTLLINAAYKPSRVLRELQLDKDSVWHGCG
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CCDS31 FSGPYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQE
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 EVLKAKYKGKSYRATVEIVKTADRVTEFCRQTCIKLECCPNLFGPRMVLDKCSENCSVLT
:.:::::.::.:::.:.::.:.:.:..:::..: :::::::::.: .. ..: ::::. :
CCDS31 ETLKAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPVLISENCPENCSIHT
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 KTKYTHYYGKKKNKRIGRPPGGHSNLACALKKASKRRKRRKNVFVHKKKRSSASVDNTPA
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CCDS31 KTKYTYYYGKRK--KISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSA-VDFT-A
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740
pF1KB8 GSPQGSGGEDEDDPDEGDDDSLSEGSTSEQQDELQEESEMSEKKSCSSSPTQ-------S
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CCDS31 GSGEES---EEEDADAMDDDTASEETGSELRD---DQTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGS
720 730 740 750 760
750 760 770 780 790
pF1KB8 EISTSLPPDRQRRKRELRTFSFSDDENK-PPSPKE----IRIEVAERLHLDSNPLKWSVA
: ::.: :: : . : ... .: ::. : . : ::: :.::::.:.:.
CCDS31 EPVRRPPPERTRRGRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVT
770 780 790 800 810 820
800 810 820 830 840 850
pF1KB8 DVVRFIRSTDCAPLARIFLDQEIDGQALLLLTLPTVQECMDLKLGPAIKLCHHIERIKFA
::::::. :::::::.:: .:.::::::::::::::::::.:::::::::::.:::.: :
CCDS31 DVVRFIKLTDCAPLAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVA
830 840 850 860 870 880
860
pF1KB8 FYEQFAN
:: :.::
CCDS31 FYAQYAN
890
>>CCDS14011.1 L3MBTL2 gene_id:83746|Hs108|chr22 (705 aa)
initn: 665 init1: 267 opt: 447 Z-score: 399.6 bits: 84.7 E(32554): 6.2e-16
Smith-Waterman score: 863; 31.6% identity (58.9% similar) in 557 aa overlap (3-529:160-696)
10 20 30
pF1KB8 MNGEQQLDADAGSGMEEVELS--WEDYLEETG
: :: . .:.. . :. : .:.. .
CCDS14 RLQGKPPTKKAKVLHKAAWSAKIGAFLHSQGTGQLADGTPTGQDALVLGFDWGKFLKDHS
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70 80
pF1KB8 STAVPYGSFKHVDTRLQ-NGFAPGMKLEVAVRTD---P-ETYWVATVITTCEQLLLLRYD
:.: . :::: : . :::.:: . .: : ..::.:.:: : .::::.
CCDS14 YKAAPVSCFKHVPLYDQWEDVMKGMKVEV-LNSDAVLPSRVYWIASVIQTAGYRVLLRYE
190 200 210 220 230 240
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 GYGEDRRADFWCDIRKADLYPIGWCEQNKKTLEAPEGIRDKVSDWDEFLRQTLIGACSPP
:. .: ::::.. .:..::::: :.: : :. :. : .:: .: . :.:. . :
CCDS14 GFENDASHDFWCNLGTVDVHPIGWCAINSKILVPPRTIHAKFTDWKGYLMKRLVGSRTLP
250 260 270 280 290 300
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 VPL-LEGLRNGRNPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTWIVTVVENIGGRLKLRYEGLESSDN
: . .. ... . :. : ::: .. : ...: :::::.: :: .:.:.
CCDS14 VDFHIKMVESMKYPFR---QGMRLEVVDKSQVSRTRMAVVDTVIGGRLRLLYEDGDSDDD
310 320 330 340 350 360
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 YEHWLYYLDPFLHHVGWAAQQGYELQPPSAIRHLKNEAEWQEILAKVKEEEEEPLPSYLF
. : .. .:..: :::. . :. .. . .. ...: . .: :::
CCDS14 F--WCHMWSPLIHPVGWSRRVGHGIKMSERRSDMAHHPTFRKIYC-------DAVP-YLF
370 380 390 400 410
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 KDKQVIGIHT----FSVNMKLEAVDPWSPFGISPATVVKVFDEKYFLVEMDDLRPENHAR
: .: ...: : .:::::.:: . .: ::: ::. . :... .: : . .
CCDS14 K--KVRAVYTEGGWFEEGMKLEAIDPLNLGNICVATVCKVLLDGYLMICVDG-GPSTDGL
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 RSFVCHADSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQRCFPPLIS
: ::.: .:::. . :: ....:: :: .: :.: .::.. ..:::.: :
CCDS14 DWFCYHASSHAIFPATFCQKNDIELTPPKGYEAQTFNWENYLEKTKSKAAPSRLFNMDCP
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 EHEFKENMKLEAVNPILPEEVCVATITAVRGSYLWLQLEGSKKPIPECIVSVESMDIFPL
.: :: .::::::. . :. .::::. : : ....: . . :. :: ::.:.
CCDS14 NHGFKVGMKLEAVDLMEPRLICVATVKRVVHRLLSIHFDGWDSEYDQ-WVDCESPDIYPV
540 550 560 570 580 590
450 460 470 480
pF1KB8 GWCETNGHPL--------STPRRAR-VYKQRKIAVVQPEKQVPSSRT--VHEGLRNQELN
:::: .:. : .:: .:. . :..: . .:..: ..: ...: .. :.
CCDS14 GWCELTGYQLQPPVAAEPATPLKAKEATKKKKKQFGKKRKRIPPTKTRPLRQGSKKPLLE
600 610 620 630 640 650
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 STE-------SVMINGKYCCPKIYFNHRCFSGPYLNKGRIAELPQCVGPGNCVLVLREVL
. : . :. .. .: ..: .:. ::: :
CCDS14 DDPQGARKISSEPVPGEIIAVRVKEEHLDVASP--DKASSPELPVSVENIKQETDD
660 670 680 690 700
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 TLLINAAYKPSRVLRELQLDKDSVWHGCGEVLKAKYKGKSYRATVEIVKTADRVTEFCRQ
>>CCDS11581.2 MBTD1 gene_id:54799|Hs108|chr17 (628 aa)
initn: 545 init1: 259 opt: 425 Z-score: 380.9 bits: 81.1 E(32554): 6.7e-15
Smith-Waterman score: 773; 30.0% identity (58.3% similar) in 494 aa overlap (4-488:127-595)
10 20 30
pF1KB8 MNGEQQLDADAGSGMEEVELSWEDYLEETGSTA
..: . :. .:: .:: .:.. .. :
CCDS11 GKPPTKKAKVLQKQPLVAKLAAYAQYQATLQNQAKTKAAVSME--GFSWGNYINSNSFIA
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80
pF1KB8 VPYGSFKHVDTRLQNG-FAPGMKLEVAVRTD---P-ETYWVATVITTCEQLLLLRYDGYG
.: :::. : .. ....:: :: : ...:.: .. ::::.:.
CCDS11 APVTCFKHAPMGTCWGDISENVRVEVP-NTDCSLPTKVFWIAGIVKLAGYNALLRYEGFE
160 170 180 190 200 210
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 EDRRADFWCDIRKADLYPIGWCEQNKKTLEAPEGIRDKVSDWDEFLRQTLIGACSPPVPL
.: ::::.: .:..:.::: . : : :. :. : ..: :: . : :: . : .
CCDS11 NDSGLDFWCNICGSDIHPVGWCAASGKPLVPPRTIQHKYTNWKAFLVKRLTGAKTLPPDF
220 230 240 250 260 270
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 LEGLRNG-RNPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTWIVTVVENIGGRLKLRYEGLESSDNYEH
. . .. . :. : :.: . : ...: :::::.: :: :: : .
CCDS11 SQKVSESMQYPFK---PCMRVEVVDKRHLCRTRVAVVESVIGGRLRLVYE--ESEDRTDD
280 290 300 310 320
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 -WLYYLDPFLHHVGWAAQQGYELQPPSAIRHLKNEAEWQ-EILAKVKEEEEEPLPSYLFK
: .. .:..::.::. . :.... . .. .. . ...::::: .. . ::
CCDS11 FWCHMHSPLIHHIGWSRSIGHRFKRSDITKKQDGHFDTPPHLFAKVKEVDQ---SGEWFK
330 340 350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 DKQVIGIHTFSVNMKLEAVDPWSPFGISPATVVKVFDEKYFLVEMDDLRPENHARRSFVC
. .:::::.:: . : ::. ::. . .... .: : .. :
CCDS11 E-----------GMKLEAIDPLNLSTICVATIRKVLADGFLMIGIDG--SEAADGSDWFC
390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 -HADSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQRCFPPLISEHEF
:: ::.:::: . : ....:: :: . : : :::.. :. ::: . : . .: :
CCDS11 YHATSPSIFPVGFCEINMIELTPPRGYTKLPFKWFDYLRETGSIAAPVKLFNKDVPNHGF
440 450 460 470 480 490
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 KENMKLEAVNPILPEEVCVATITAVRGSYLWLQLEGSKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCE
. .::::::. . :. .::::.: . : ....: .. . :. :: :..:.:::.
CCDS11 RVGMKLEAVDLMEPRLICVATVTRIIHRLLRIHFDGWEEEYDQ-WVDCESPDLYPVGWCQ
500 510 520 530 540 550
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 TNGHPLSTPRRARVYKQRKIAVVQPEKQVPSSRTVHEGLRNQELNSTESVMINGKYCCPK
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CCDS11 LTGYQLQPPASQSSRENQSASSKQKKKAKSQQYKGHKKMTTLQLKEELLDGEDYNFLQGA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]