Result of FASTA (omim) for
pF1KB8492
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8492, 858 aa
1>>>pF1KB8492 858 - 858 aa - 858 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3080+/-0.000435; mu= 20.7753+/- 0.027
mean_var=71.1970+/-14.790, 0's: 0 Z-trim(110.3): 70 B-trim: 435 in 1/46
Lambda= 0.152000
statistics sampled from 18537 (18595) to 18537 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 12.160
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001952 (OMIM: 130610,609306) elongation factor ( 858) 5711 1262.5 0
NP_001136077 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 smal ( 937) 1738 391.3 1.1e-107
NP_001245283 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 smal ( 962) 1738 391.3 1.2e-107
NP_004238 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small n ( 972) 1738 391.3 1.2e-107
NP_001245282 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 smal ( 972) 1738 391.3 1.2e-107
NP_733781 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor ( 513) 225 59.3 5.3e-08
XP_011541993 (OMIM: 606544) PREDICTED: ribosome-re ( 564) 225 59.3 5.7e-08
NP_733792 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor ( 732) 225 59.4 7.1e-08
XP_016865475 (OMIM: 606544) PREDICTED: ribosome-re ( 779) 225 59.4 7.4e-08
NP_115756 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor ( 779) 225 59.4 7.4e-08
NP_001268231 (OMIM: 606544) ribosome-releasing fac ( 811) 225 59.4 7.7e-08
XP_006713858 (OMIM: 606639,609060) PREDICTED: elon ( 712) 200 53.9 3.1e-06
NP_001295095 (OMIM: 606639,609060) elongation fact ( 591) 197 53.2 4.2e-06
NP_079272 (OMIM: 606639,609060) elongation factor ( 751) 197 53.3 5.1e-06
NP_001295093 (OMIM: 606639,609060) elongation fact ( 770) 197 53.3 5.2e-06
NP_001332797 (OMIM: 617064,617065) translation fac ( 629) 181 49.7 5e-05
NP_068746 (OMIM: 617064,617065) translation factor ( 669) 181 49.7 5.3e-05
NP_001393 (OMIM: 130590) elongation factor 1-alpha ( 462) 145 41.7 0.0093
XP_011533816 (OMIM: 130590) PREDICTED: elongation ( 462) 145 41.7 0.0093
>>NP_001952 (OMIM: 130610,609306) elongation factor 2 [H (858 aa)
initn: 5711 init1: 5711 opt: 5711 Z-score: 6763.1 bits: 1262.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5711; 100.0% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 SGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 ILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 IIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 MFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVAETRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVAETRK
790 800 810 820 830 840
850
pF1KB8 RKGLKEGIPALDNFLDKL
::::::::::::::::::
NP_001 RKGLKEGIPALDNFLDKL
850
>>NP_001136077 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small nu (937 aa)
initn: 2117 init1: 637 opt: 1738 Z-score: 2054.0 bits: 391.3 E(85289): 1.1e-107
Smith-Waterman score: 2153; 39.2% identity (69.6% similar) in 873 aa overlap (4-856:79-919)
10 20 30
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
. .: . .::.. :::... .:. :::.
NP_001 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETR-FTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQS
..: :. .. : . .:: :::: . :::: ... . ..
NP_001 CFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDT
110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIK
: : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::.
NP_001 K-GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLA
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 PVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTV
.. .::.:: .:::.: : . : ...::..:: .:: :. : :....:.::.:
NP_001 VTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNV
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGK
:.:. .. ::: .::..:. : :... : ::. :::: ::.: . :
NP_001 CFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRK
280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 FSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEG
:.:.: . .. :.: ..::.:..:.. ... . ...: :.: .:. .
NP_001 FTKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNI
330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 KPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKG
.:::. : .... ....: . :.::: .. : . : : : :.. . ....::: :
NP_001 RPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDG
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 PLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTIL
::: . .:: :.: .:.:::::.:: . .: :...: ::: .:: . . : .
NP_001 PLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWI
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500
pF1KB8 MMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAV
..:: .. :: :: : . :::: .:::.::: :.:. .: .::... :...::
NP_001 SVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV
500 510 520 530 540 550
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 EAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIP
: ::..:::...::... :: : . .::::::.: :.:::.:. ..::.. .. :
NP_001 EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEID
560 570 580 590 600 610
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 IKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELK
:: .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:. ::::::.. :. . :
NP_001 IKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRK
620 630 640 650 660 670
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 QRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQW
. .... ::.::. ::.:: ::::.::::::.: : . :. .:::.: ::::
NP_001 KLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQW
680 690 700 710 720 730
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 ATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIY
.:.:: ::.: .:.:.: . :... . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :
NP_001 GTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYY
740 750 760 770 780 790
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 LVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTG
.::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..:
NP_001 FVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQ
800 810 820 830 840 850
810 820 830 840 850
pF1KB8 GQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSS--RP----------SQVVAETRKRKGLKEGIPALDN
:::: :: ::::.::::.:.: :: . . .::.::::.: . ....
NP_001 GQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISK
860 870 880 890 900 910
pF1KB8 FLDKL
:.:
NP_001 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
920 930
>>NP_001245283 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small nu (962 aa)
initn: 2101 init1: 637 opt: 1738 Z-score: 2053.8 bits: 391.3 E(85289): 1.2e-107
Smith-Waterman score: 2118; 39.0% identity (69.0% similar) in 872 aa overlap (4-856:114-944)
10 20 30
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
. .: . .::.. :::... .:. :::.
NP_001 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSK
: . . .:: :::: . :::: ... . ..:
NP_001 HPE---------IRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDTK
150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 DGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKP
: ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::.
NP_001 -GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAV
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 VLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVG
.. .::.:: .:::.: : . : ...::..:: .:: :. : :....:.::.:
NP_001 TVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNVC
250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 FGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKF
:.:. .. ::: .::..:. : :... : ::. :::: ::.: . ::
NP_001 FSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRKF
300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 SKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGK
.:.: . .. :.: ..::.:..:.. ... . ...: :.: .:. . .
NP_001 TKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIR
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 PLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGP
:::. : .... ....: . :.::: .. : . : : : :.. . ....::: ::
NP_001 PLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGP
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 LMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILM
:: . .:: :.: .:.:::::.:: . .: :...: ::: .:: . . : .
NP_001 LMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWIS
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 MGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVE
..:: .. :: :: : . :::: .:::.::: :.:. .: .::... :...:::
NP_001 VARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVE
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 AKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPI
::..:::...::... :: : . .::::::.: :.:::.:. ..::.. .. : :
NP_001 PVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDI
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 KKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQ
: .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:. ::::::.. :. . :.
NP_001 KVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKK
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680
pF1KB8 RARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQWA
.... ::.::. ::.:: ::::.::::::.: : . :. .:::.: ::::.
NP_001 LGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWG
710 720 730 740 750 760
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 TKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYL
:.:: ::.: .:.:.: . :... . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :.
NP_001 TREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYF
770 780 790 800 810 820
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 VEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGG
::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..: :
NP_001 VEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQG
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NP_001 GQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISK
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NP_001 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
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pF1KB8 IAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGES--GPMGNIM
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pF1KB8 IDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDR
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pF1KB8 YFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLD
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pF1KB8 IKSCDPK--GPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDL
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XP_011 FKVLHDKQRGPLV-----------------FMRIYSGTIKPQLAIHNINGNCT-------
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.: .: .. .. .. :: ..: . . : : ..:: : . :: .. ..
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10 20
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKK-ANIRNMSVIAHVD
... . ....:.. :.:::....::.:
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30 40 50 60 70 80
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::.: :. .. .: : . :.: :: .:.:: :::.:.:...
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90 100 110 120 130 140
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: :. .::::.::::::. :: ::: :::..: : .:: .:: :: :::
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150 160 170 180 190 200
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. : . ..::::.. .. : . . .. ... : ::... : . .:
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. : . .::.. . : : :. :: .:: . .
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: :.: .::: :: :..:::: : ::
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.. ::... : .:. . . .: . ..::: : . . .:.
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:: ..: . . : : ..:: : . :: .. .. .::. .. : ::::.::
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...... . . :.:::: .: .. . .: : . .
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:: :: .. . :.. ::. :..:. :. ..
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.. :.. : .: : .. : .:::. .:: : . . .: ::. ..
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pF1KB8 AQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFG
:. ...::.. .:. .. .. . . : ..::.. .: :. :. ...:. : .:
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... ::. :.:.: .. .: . .: :...
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pF1KB8 DKL
>>XP_016865475 (OMIM: 606544) PREDICTED: ribosome-releas (779 aa)
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10 20
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKK-ANIRNMSVIAHVD
... . ....:.. :.:::....::.:
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30 40 50 60 70 80
pF1KB8 HGKSTLTDSLVCKAGIIAS---ARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDL
::.: :. .. .: : . :.: :: .:.:: :::.:.:...
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90 100 110 120 130 140
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XP_016 -------DWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQA
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150 160 170 180 190 200
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. : . ..::::.. .. : . . .. ... : ::... : . .:
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pF1KB8 IDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDR
. .: . . ..: : : . :: .. : . ..: :. :.
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270 280 290 300 310 320
pF1KB8 YFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLD
. : . .::.. . : : :. :: .:: . .
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: :.: .::: :: :..:::: ..:. :. :: :..
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.: : :::. : :..:: .. : .. .. : :
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. :.: .: . ..:: : .. :::. ::. . . ...
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pF1KB8 ---EHAHNMRVMKFSVS------PVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIE
.: .: .. .. .. :: ..: . . : : ..:: : . :: .. ..
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pF1KB8 -ESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNK
.::. .. : ::::.:: ...... . . :.:::: .: .. .
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.: : . . :: :: .. . :.. ::.
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pF1KB8 PNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGG
:..:. :. .... :.. : .: : .. : .:::. .:: :
XP_016 ------INEGL--LKVSQEAIENGIHSACLQGPLLGSPIQDV-----AITLHSLTIHPGT
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pF1KB8 GQIIPTA--RRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQV
. . .: ::. .. :. ...::.. .:. .. .. . . : ..::.. .: :.
XP_016 STTMISACVSRCVQKALKKADKQVLEPLMNLEVTVARDYLSPVLADLAQRRGNI-QEIQT
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pF1KB8 AGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVA
:. ...:. : .:... ::. :.:.: .. .: . .: :...
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pF1KB8 ETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL
XP_016 LT
>>NP_115756 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor 2, (779 aa)
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10 20
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKK-ANIRNMSVIAHVD
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NP_115 NNICCYKIRASLKRLKPHVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHID
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30 40 50 60 70 80
pF1KB8 HGKSTLTDSLVCKAGIIAS---ARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDL
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NP_115 AGKTTTTERILYYSGYTRSLGDVDDGDT-VTDFMAQERERGITIQSAAVTF---------
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pF1KB8 NFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQA
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NP_115 -------DWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQA
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150 160 170 180 190 200
pF1KB8 IAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGES--GPMGNIM
. : . ..::::.. .. : . . .. ... : ::... : . .:
NP_115 DKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIREKLKAKPLLLQLPI---GEAKTFKGVVDVVM
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 IDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDR
. .: . . ..: : : . :: .. : . ..: :. :.
NP_115 KEKLLWNCNSNDGKD---FERKPLLEMNDPELLK--ETTEARNALIEQVADL-----DDE
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270 280 290 300 310 320
pF1KB8 YFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLD
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NP_115 FADLVLEEFSEN---------------FDLLPAEKLQTAIHRVTLAQTA-----VPVLCG
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pF1KB8 SEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMG
: :.: .::: :: :..:::: ..:. :. :: :..
NP_115 SALKNKGIQPLLDAV---------------TMYLPSP-EERNYEFLQWYK---DDLCALA
340 350 360 370
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pF1KB8 IKSCDPK--GPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDL
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NP_115 FKVLHDKQRGPLV-----------------FMRIYSGTIKPQLAIHNINGNCT-------
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NP_115 --ERISRLLLPFADQHVE-IPSLTAGNIALTVGLKHTATGDTIVSSKSSALAAARRAERE
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pF1KB8 ---EHAHNMRVMKFSVS------PVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIE
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NP_115 GEKKHRQNNEAERLLLAGVEIPEPVFFCTIEPPSLSKQPDLEHALKCLQREDPSLKVRLD
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pF1KB8 -ESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNK
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NP_115 PDSGQTVLCGMGELHIEIIHDRIKREYG-LETYLGPLQVAYRET------ILNSVRATDT
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NP_115 RQDNKVVI-GFVPLAEIMGYSTVLRTLTSGSATFALELSTYQAM--NPQDQNTLLNRRSG
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NP_115 LT
858 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]