Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8485
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8485, 923 aa
1>>>pF1KB8485 923 - 923 aa - 923 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6390+/-0.00107; mu= 19.1787+/- 0.064
mean_var=69.4450+/-13.988, 0's: 0 Z-trim(103.4): 22 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.153905
statistics sampled from 7365 (7377) to 7365 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 4.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4407.1 HK3 gene_id:3101|Hs108|chr5 ( 923) 6076 1359.0 0
CCDS1956.1 HK2 gene_id:3099|Hs108|chr2 ( 917) 3425 770.3 0
CCDS7288.1 HKDC1 gene_id:80201|Hs108|chr10 ( 917) 3225 725.9 8.1e-209
CCDS7292.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 917) 3202 720.8 2.8e-207
CCDS7290.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 905) 3201 720.6 3.2e-207
CCDS7291.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 916) 3198 719.9 5.2e-207
CCDS7289.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 921) 3198 719.9 5.2e-207
CCDS5481.1 GCK gene_id:2645|Hs108|chr7 ( 464) 1533 350.1 5.6e-96
CCDS5479.1 GCK gene_id:2645|Hs108|chr7 ( 465) 1533 350.1 5.6e-96
CCDS5480.1 GCK gene_id:2645|Hs108|chr7 ( 466) 1533 350.1 5.6e-96
>>CCDS4407.1 HK3 gene_id:3101|Hs108|chr5 (923 aa)
initn: 6076 init1: 6076 opt: 6076 Z-score: 7283.5 bits: 1359.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6076; 100.0% identity (100.0% similar) in 923 aa overlap (1-923:1-923)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSIGSSGLRQGEETLSCSEEGLPGPSDSSELVQECLQQFKVTRAQLQQIQASLLGSMEQ
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CCDS44 MDSIGSSGLRQGEETLSCSEEGLPGPSDSSELVQECLQQFKVTRAQLQQIQASLLGSMEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ALRGQASPAPAVRMLPTYVGSTPHGTEQGDFVVLELGATGASLRVLWVTLTGIEGHRVEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ALRGQASPAPAVRMLPTYVGSTPHGTEQGDFVVLELGATGASLRVLWVTLTGIEGHRVEP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RSQEFVIPQEVMLGAGQQLFDFAAHCLSEFLDAQPVNKQGLQLGFSFSFPCHQTGLDRST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSQEFVIPQEVMLGAGQQLFDFAAHCLSEFLDAQPVNKQGLQLGFSFSFPCHQTGLDRST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LISWTKGFRCSGVEGQDVVQLLRDAIRRQGAYNIDVVAVVNDTVGTMMGCEPGVRPCEVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LVVDTGTNACYMEEARHVAVLDEDRGRVCVSVEWGSFSDDGALGPVLTTFDHTLDHESLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PGAQRFEKMIGGLYLGELVRLVLAHLARCGVLFGGCTSPALLSQGSILLEHVAEMEDPST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GAARVHAILQDLGLSPGASDVELVQHVCAAVCTRAAQLCAAALAAVLSCLQHSREQQTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GAARVHAILQDLGLSPGASDVELVQHVCAAVCTRAAQLCAAALAAVLSCLQHSREQQTLQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VAVATGGRVCERHPRFCSVLQGTVMLLAPECDVSLIPSVDGGGRGVAMVTAVAARLAAHR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 RLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGEASSLRMLPTFVRATPDGSERGDFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGEASSLRMLPTFVRATPDGSERGDFLA
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pF1KB8 LDLGGTNFRVLLVRVTTGVQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQKQGLSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LDLGGTNFRVLLVRVTTGVQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQKQGLSGQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 SLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAVELNVVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAVELNVVAI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 VNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINMEWGAFGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINMEWGAFGD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 DGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVLFRGQQIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVLFRGQQIQ
730 740 750 760 770 780
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pF1KB8 RLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVSQRAAQLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVSQRAAQLC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 GAGVAAVVEKIRENRGLEELAVSVGVDGTLYKLHPRFSSLVAATVRELAPRCVVTFLQSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GAGVAAVVEKIRENRGLEELAVSVGVDGTLYKLHPRFSSLVAATVRELAPRCVVTFLQSE
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KB8 DGSGKGAALVTAVACRLAQLTRV
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CCDS44 DGSGKGAALVTAVACRLAQLTRV
910 920
>>CCDS1956.1 HK2 gene_id:3099|Hs108|chr2 (917 aa)
initn: 3434 init1: 1707 opt: 3425 Z-score: 4102.4 bits: 770.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3425; 56.6% identity (81.6% similar) in 897 aa overlap (28-917:17-911)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSIGSSGLRQGEETLSCSEEGLPGPSDSSELVQECLQQFKVTRAQLQQIQASLLGSMEQ
:. . :.. : ..... : .:. . ::.
CCDS19 MIASHLLAYFFTELNHDQVQKVDQYLYHMRLSDETLLEISKRFRKEMEK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ALRGQASPAPAVRMLPTYVGSTPHGTEQGDFVVLELGATGASLRVLWVTLTGIEGHRVEP
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CCDS19 GLGATTHPTAAVKMLPTFVRSTPDGTEHGEFLALDLG--GTNFRVLWVKVTDNGLQKVEM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RSQEFVIPQEVMLGAGQQLFDFAAHCLSEFLDAQPVNKQGLQLGFSFSFPCHQTGLDRST
..: ..::...: :.: :::: :.::..:.: .. . : :::.:::::::: ::.:
CCDS19 ENQIYAIPEDIMRGSGTQLFDHIAECLANFMDKLQIKDKKLPLGFTFSFPCHQTKLDESF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LISWTKGFRCSGVEGQDVVQLLRDAIRRQGAYNIDVVAVVNDTVGTMMGCEPGVRPCEVG
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CCDS19 LVSWTKGFKSSGVEGRDVVALIRKAIQRRGDFDIDIVAVVNDTVGTMMTCGYDDHNCEIG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LVVDTGTNACYMEEARHVAVLDEDRGRVCVSVEWGSFSDDGALGPVLTTFDHTLDHESLN
:.: ::.::::::: ::. ... :.::.:...:::.:.:::.:. . : ::. .: :::
CCDS19 LIVGTGSNACYMEEMRHIDMVEGDEGRMCINMEWGAFGDDGSLNDIRTEFDQEIDMGSLN
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 PGAQRFEKMIGGLYLGELVRLVLAHLARCGVLFGGCTSPALLSQGSILLEHVAEMEDPST
:: : :::::.:.:.::::::.:...:. .:::: :: ::. : . . ....: .
CCDS19 PGKQLFEKMISGMYMGELVRLILVKMAKEELLFGGKLSPELLNTGRFETKDISDIEGEKD
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GAARVHAILQDLGLSPGASDVELVQHVCAAVCTRAAQLCAAALAAVLSCLQHSREQQTLQ
: ... .:. :::.: : ....: : ::.:.::::.:::::. ..... .. :.
CCDS19 GIRKAREVLMRLGLDPTQEDCVATHRICQIVSTRSASLCAATLAAVLQRIKENKGEERLR
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VAVATGGRVCERHPRFCSVLQGTVMLLAPECDVSLIPSVDGGGRGVAMVTAVAARLAAHR
.... : : ..::.: . :. :: :.: ::: .. : ::.:.:.::::::: ::: ..
CCDS19 STIGVDGSVYKKHPHFAKRLHKTVRRLVPGCDVRFLRSEDGSGKGAAMVTAVAYRLADQH
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KB8 RLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGE--ASS-LRMLPTFVRATPDGSERGD
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CCDS19 RARQKTLEHLQLSHDQLLEVKRRMKVEMERGLSKETHASAPVKMLPTYVCATPDGTEKGD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 FLALDLGGTNFRVLLVRVTTG----VQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQ
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CCDS19 FLALDLGGTNFRVLLVRVRNGKWGGVEMHNKIYAIPQEVMHGTGDELFDHIVQCIADFLE
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 KQGLSGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAV
.:..: ::::::::::::.: .::..:::.:::::::: :::.:::.::.::: ::.
CCDS19 YMGMKGVSLPLGFTFSFPCQQNSLDESILLKWTKGFKASGCEGEDVVTLLKEAIHRREEF
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 ELNVVAIVNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINM
.:.:::.:::::::::.::.:::.::.:::::::.:::::::.::: : :. ::::.::
CCDS19 DLDVVAVVNDTVGTMMTCGFEDPHCEVGLIVGTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNM
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 EWGAFGDDGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVL
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CCDS19 EWGAFGDNGCLDDFRTEFDVAVDELSLNPGKQRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLL
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 FRGQQIQRLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVS
:::. .::.:: ::.:::::.:::: ::: ::::::. ::: : ::...: ::: .:.
CCDS19 FRGRISERLKTRGIFETKFLSQIESDCLALLQVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCTVVA
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 QRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELAVSVGVDGTLYKLHPRFSSLVAATVRELAPRCV
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CCDS19 RRAAQLCGAGMAAVVDRIRENRGLDALKVTVGVDGTLYKLHPHFAKVMHETVKDLAPKCD
830 840 850 860 870 880
900 910 920
pF1KB8 VTFLQSEDGSGKGAALVTAVACRLAQLTRV
:.::::::::::::::.::::::.
CCDS19 VSFLQSEDGSGKGAALITAVACRIREAGQR
890 900 910
>>CCDS7288.1 HKDC1 gene_id:80201|Hs108|chr10 (917 aa)
initn: 3217 init1: 1643 opt: 3225 Z-score: 3862.4 bits: 725.9 E(32554): 8.1e-209
Smith-Waterman score: 3225; 54.1% identity (80.1% similar) in 899 aa overlap (28-919:17-912)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSIGSSGLRQGEETLSCSEEGLPGPSDSSELVQECLQQFKVTRAQLQQIQASLLGSMEQ
:. . :.. : ..... : .:. . . ::.
CCDS72 MFAVHLMAFYFSKLKEDQIKKVDRFLYHMRLSDDTLLDIMRRFRAEMEK
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB8 ALRGQASPAPAVRMLPTYVGSTPHGTEQGDFVVLELGATGASLRVLWVTLTGIEGHR-VE
.: ...:. ::.::::.: . : :.:.:.:. :.:: :...::: : .. ::.: :.
CCDS72 GLAKDTNPTAAVKMLPTFVRAIPDGSENGEFLSLDLG--GSKFRVLKVQVAE-EGKRHVQ
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 PRSQEFVIPQEVMLGAGQQLFDFAAHCLSEFLDAQPVNKQGLQLGFSFSFPCHQTGLDRS
.:: . :.:.. : : .::...: ::..:. .. .... : ::..:::::.:: :...
CCDS72 MESQFYPTPNEIIRGNGTELFEYVADCLADFMKTKDLKHKKLPLGLTFSFPCRQTKLEEG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TLISWTKGFRCSGVEGQDVVQLLRDAIRRQGAYNIDVVAVVNDTVGTMMGCEPGVRPCEV
.:.:::: :. ::. :::. : :.::. ...:..:.::::::::: : :::
CCDS72 VLLSWTKKFKARGVQDTDVVSRLTKAMRRHKDMDVDILALVNDTVGTMMTCAYDDPYCEV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GLVVDTGTNACYMEEARHVAVLDEDRGRVCVSVEWGSFSDDGALGPVLTTFDHTLDHESL
:... :::::::::. .. ... :.::.:...:::.:.::::: . : ::. :: ::
CCDS72 GVIIGTGTNACYMEDMSNIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGALEDIRTEFDRELDLGSL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 NPGAQRFEKMIGGLYLGELVRLVLAHLARCGVLFGGCTSPALLSQGSILLEHVAEMEDPS
::: : :::::.::::::::::.: ..:. :.:::: : :: ..:.: .::: :: .
CCDS72 NPGKQLFEKMISGLYLGELVRLILLKMAKAGLLFGGEKSSALHTKGKIETRHVAAMEKYK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 TGAARVHAILQDLGLSPGASDVELVQHVCAAVCTRAAQLCAAALAAVLSCLQHSREQQTL
: : .. :: :::: :. .: :::::. : :.:.::::::::.:. :..... . :
CCDS72 EGLANTREILVDLGLEPSEADCIAVQHVCTIVSFRSANLCAAALAAILTRLRENKKVERL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 QVAVATGGRVCERHPRFCSVLQGTVMLLAPECDVSLIPSVDGGGRGVAMVTAVAARLAAH
...:. : . . ::.. . :. .: :.: ::: .. : .:. .:.:::::::.:. :.
CCDS72 RTTVGMDGTLYKIHPQYPKRLHKVVRKLVPSCDVRFLLSESGSTKGAAMVTAVASRVQAQ
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 RRLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGEASSL---RMLPTFVRATPDGSERG
:. ....:: :.:...::. :::.:: . ::. .. .: :::::.: . :::.:.:
CCDS72 RKQIDRVLALFQLTREQLVDVQAKMRAELEYGLKKKSHGLATVRMLPTYVCGLPDGTEKG
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 DFLALDLGGTNFRVLLVRVTTG---VQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQ
::::::::::::::::.. .: :.. ..:..:: . ::.:..::::::.::.:: .
CCDS72 KFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGRRSVRMYNKIFAIPLEIMQGTGEELFDHIVQCIADFLD
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 KQGLSGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAV
.::.: ::::::::::::::...:.: :..:::::::.::::.:::..::::: ::.
CCDS72 YMGLKGASLPLGFTFSFPCRQMSIDKGTLIGWTKGFKATDCEGEDVVDMLREAIKRRNEF
590 600 610 620 630 640
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pF1KB8 ELNVVAIVNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINM
.:..::.:::::::::.:::::: ::::::.:::.: ::::..::. : : :.::::
CCDS72 DLDIVAVVNDTVGTMMTCGYEDPNCEIGLIAGTGSNMCYMEDMRNIEMVEGGEGKMCINT
650 660 670 680 690 700
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pF1KB8 EWGAFGDDGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVL
:::.:::.: . . ::.:. ::..:.::::::.::: ::::::::::.::. ::. :.:
CCDS72 EWGGFGDNGCIDDIWTRYDTEVDEGSLNPGKQRYEKMTSGMYLGEIVRQILIDLTKQGLL
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 FRGQQIQRLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVS
:::: .::.:: ::.:::::.:::: ::: ::: ::..::: : .:...: ::: :::
CCDS72 FRGQISERLRTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRRILQQLGLDSTCEDSIVVKEVCGAVS
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 QRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELAVSVGVDGTLYKLHPRFSSLVAATVRELAPRCV
.:::::::::.::.::: ::..:::.: ..::::::::::::.:: .. ::.::::::
CCDS72 RRAAQLCGAGLAAIVEKRREDQGLEHLRITVGVDGTLYKLHPHFSRILQETVKELAPRCD
830 840 850 860 870 880
900 910 920
pF1KB8 VTFLQSEDGSGKGAALVTAVACRLAQLTRV
:::. :::::::::::.:::: :: :
CCDS72 VTFMLSEDGSGKGAALITAVAKRLQQAQKEN
890 900 910
>>CCDS7292.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 (917 aa)
initn: 2958 init1: 1632 opt: 3202 Z-score: 3834.8 bits: 720.8 E(32554): 2.8e-207
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10 20 30 40 50 60
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CCDS72 VSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTEASS
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CCDS72 CINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTK
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CCDS72 KGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVC
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CCDS72 GVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELS
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CCDS72 PKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTEASS
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CCDS72 TWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLI
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CCDS72 IGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPG
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: ::::..:.::::::::.:...:. :.:: : .: ::..:.. :. .: . :
CCDS72 KQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ARVHAILQDLGLSPGASDVELVQHVCAAVCTRAAQLCAAALAAVLSCLQHSREQQTLQVA
.. :: ::. :. .: :::::. : :.:.: ::.:.:.:. :. .. :...
CCDS72 HNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTT
360 370 380 390 400 410
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:.. : . . ::.. .. :. :.:. :: .. : .:.:.:.::::::: ::: ..:
CCDS72 VGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQ
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CCDS72 IEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFL
480 490 500 510 520 530
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pF1KB8 ALDLGGTNFRVLLVRVTTG----VQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQKQ
::::::::::::::.. .: :.. ..::.:: . ::.:..::::::.:: :: . .
CCDS72 ALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYM
540 550 560 570 580 590
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:..: .::::::::::.: .:: :::..:::::::.:: :.:::.:::.:: ::. .:
CCDS72 GIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDL
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.:::.:::::::::.:.::.: ::.:::::::.:::::::..:: : ::.:.:::::::
CCDS72 DVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEW
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CCDS72 GAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFR
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pF1KB8 GQQIQRLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVSQR
:: . :.:: ::.:::::.:::: ::: ::::::..::: : ::...: :: .::.:
CCDS72 GQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRR
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::::::::.::::.::::::::..: :.::::::::::::.:: .. ::.::.:.: :.
CCDS72 AAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVS
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900 910 920
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CCDS72 FLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTEASS
900 910 920
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CCDS54 QMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILL
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CCDS54 NWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMI
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CCDS54 VGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPG
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CCDS54 QQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDR
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pF1KB8 RQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVSQRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELAVS
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CCDS54 KQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRIT
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CCDS54 VGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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pF1KB8 QMRKAMAKGLR---GEASSLRMLPTFVRATPDGSERGDFLALDLGGTNFRVLLVRVTTG-
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CCDS54 RMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGE
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:. ..::::: . :....:::.: .:: :: .:. .. ..:::::::::: :
CCDS54 EGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVR
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CCDS54 HEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYY
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:: .::.:.::::: :::::::..:: : :: ::::.: :::::::.: : . ..:
CCDS54 EDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDR
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pF1KB8 SVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVLFRGQQIQRLQTRDIFKTKFL
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CCDS54 LVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFV
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CCDS54 SQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRE
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.:. . . ..:::::..::::: :. :.::.:.: : .::..::.:::.:::::.::
CCDS54 SRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAV
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920
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::. :
CCDS54 ACKKACMLGQ
460
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pF1KB8 DVSLIPSVDGGGRGVAMVTAVAARLAAHRRLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKG
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CCDS54 MAMDVTRSQAQTALTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRG
10 20 30 40
520 530 540 550 560
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:: : .:..::::.::.::.::: ::::.::::::::::.::.: : :.
CCDS54 LRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTK
50 60 70 80 90 100
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pF1KB8 SEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQKQGLSGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGIL
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CCDS54 HQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGIL
110 120 130 140 150 160
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pF1KB8 LNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAVELNVVAIVNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGL
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CCDS54 LNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGM
170 180 190 200 210 220
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pF1KB8 IVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINMEWGAFGDDGSLAMLSTRFDASVDQASINP
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CCDS54 IVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANP
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pF1KB8 LRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVSQRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELAV
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CCDS54 TVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLG
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pF1KB8 V
CCDS54 Q
923 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sat Nov 5 15:39:32 2016 done: Sat Nov 5 15:39:33 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]