Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8436
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8436, 359 aa
1>>>pF1KB8436 359 - 359 aa - 359 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6667+/-0.00107; mu= 14.9264+/- 0.064
mean_var=76.7190+/-15.222, 0's: 0 Z-trim(103.7): 48 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.146428
statistics sampled from 7502 (7545) to 7502 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 ( 359) 2361 508.5 3.6e-144
CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 ( 359) 2159 465.8 2.5e-131
CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 ( 355) 1956 422.9 2e-118
CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 ( 374) 1229 269.4 3.6e-72
CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 354) 1166 256.0 3.5e-68
CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 ( 354) 1144 251.4 8.7e-67
CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1143 251.2 1e-66
CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 355) 1142 251.0 1.2e-66
CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1116 245.5 5.3e-65
CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 ( 354) 1110 244.2 1.3e-64
CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 ( 354) 1106 243.4 2.3e-64
CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 ( 350) 1093 240.6 1.5e-63
CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 377) 1054 232.4 4.9e-61
CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 318) 1042 229.8 2.4e-60
CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 339) 1042 229.8 2.6e-60
CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22 ( 355) 1034 228.2 8.7e-60
CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 381) 999 220.8 1.5e-57
CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 302) 991 219.0 4.1e-57
CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 303) 974 215.4 5e-56
CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 282) 829 184.8 7.8e-47
CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 458) 822 183.4 3.2e-46
CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 379) 805 179.8 3.3e-45
CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 380) 799 178.5 8.1e-45
CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 381) 798 178.3 9.3e-45
CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 322) 791 176.8 2.3e-44
CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 305) 646 146.1 3.6e-35
CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 394) 620 140.7 2e-33
CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 (1037) 620 141.0 4.5e-33
CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 395) 612 139.0 6.5e-33
CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 174) 343 82.0 4.2e-16
>>CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 (359 aa)
initn: 2361 init1: 2361 opt: 2361 Z-score: 2701.8 bits: 508.5 E(32554): 3.6e-144
Smith-Waterman score: 2361; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
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CCDS66 MTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVDVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVDVEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VSAFENPYVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPTQQDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VSAFENPYVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPTQQDVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEYDGPQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEYDGPQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
310 320 330 340 350
>>CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 (359 aa)
initn: 2159 init1: 2159 opt: 2159 Z-score: 2471.2 bits: 465.8 E(32554): 2.5e-131
Smith-Waterman score: 2159; 90.3% identity (98.3% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
:::::.::::::.:.::..::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MTLESMMACCLSDEVKESKRINAEIEKQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVDVEK
::::.:::.:::::::::::::::::::::::::.:::: ::::.:::.: :.:::::::
CCDS12 IIHGAGYSEEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMETLKILYKYEQNKANALLIREVDVEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VSAFENPYVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPTQQDVL
:..::. ::.:::.::.:::::::::::::::::::.::::.:.::.: .:::::::::
CCDS12 VTTFEHQYVSAIKTLWEDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDVDRIATLGYLPTQQDVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
::::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEYDGPQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::.:::::
CCDS12 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEDKILYSHLVDYFPEFDGPQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
310 320 330 340 350
>>CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 (355 aa)
initn: 1956 init1: 1956 opt: 1956 Z-score: 2239.5 bits: 422.9 E(32554): 2e-118
Smith-Waterman score: 1956; 81.8% identity (94.9% similar) in 351 aa overlap (9-359:5-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
:::: : ::..::. ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVDVEK
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CCDS66 IIHGSGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENAQIIREVEVDK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VSAFENPYVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPTQQDVL
:: . :.:::.::.:::::::::::::::::::.::::.:.::.: :...:::::::
CCDS66 VSMLSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
::::::::::::::::...::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::.
CCDS66 RVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEYDGPQR
: :::::::::::::.:::::::: :::::::::::::::::::::::..::::: ::..
CCDS66 ECDNENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQ
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
:..:::.::::.. : :::..:.:::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::
CCDS66 DVRAARDFILKLYQDQNPDKEKVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
300 310 320 330 340 350
>>CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 (374 aa)
initn: 1345 init1: 1229 opt: 1229 Z-score: 1409.2 bits: 269.4 E(32554): 3.6e-72
Smith-Waterman score: 1336; 55.8% identity (80.9% similar) in 362 aa overlap (10-359:13-374)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIK
::.:. : : :...::.: : ..:.. : :::::::: ::::::::::
CCDS12 MARSLTWRCCPWCLTEDEKAAARVDQEINRILLEQKKQDRGELKLLLLGPGESGKSTFIK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 QMRIIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVD
:::::::.:::.:...:: :::::::..:.:::.::. :.::.. ..: ::.:: :
CCDS12 QMRIIHGAGYSEEERKGFRPLVYQNIFVSMRAMIEAMERLQIPFSRPESKHHASLVMSQD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VEKVSAFENPYVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPTQQ
::..::. :. :.. :: : ::. ::.::::..: ::. :::. :.:... .:.:: :
CCDS12 PYKVTTFEKRYAAAMQWLWRDAGIRACYERRREFHLLDSAVYYLSHLERITEEGYVPTAQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 DVLRVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQ
:::: :.::::: :: :..:.. .:.::::::.:::.::::::::: ....:..::::::
CCDS12 DVLRSRMPTTGINEYCFSVQKTNLRIVDVGGQKSERKKWIHCFENVIALIYLASLSEYDQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VLVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEYDG
: :...::::.:: ::: ::. :::...:::::::: :.::::: :::. ::: ..:
CCDS12 CLEENNQENRMKESLALFGTILELPWFKSTSVILFLNKTDILEEKIPTSHLATYFPSFQG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB8 PQRDAQAAREFILKMFVDL------NPDSDKI------IYSHFTCATDTENIRFVFAAVK
:..::.::..::: :.. . .:...: ..::.::::::.::: :: :.
CCDS12 PKQDAEAAKRFILDMYTRMYTGCVDGPEGSKKGARSRRLFSHYTCATDTQNIRKVFKDVR
310 320 330 340 350 360
350
pF1KB8 DTILQLNLKEYNLV
:..: : : ::.
CCDS12 DSVLARYLDEINLL
370
>>CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1136 init1: 849 opt: 1166 Z-score: 1337.6 bits: 256.0 E(32554): 3.5e-68
Smith-Waterman score: 1166; 53.4% identity (76.8% similar) in 358 aa overlap (7-358:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
:.: :: : : : . . :.:.::.: . : ::.::::::.:::::::..:::.
CCDS55 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVDVEK
::: .:::.:. . . .::.: . .. :.:::: ::: . ..:.:. .:.. :
CCDS55 IIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFG---DSARADDARQLFVL-
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 VSAFENPYVDA-----IKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPT
..: :. .. : :: ::.: :.: :..: :::::.::. ::::::::.:.: :.::
CCDS55 AGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QQDVLRVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEY
::::::.:: ::::.: : .... :.: :::::::::.:::::::.::.:.: ::::.:
CCDS55 QQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 DQVLVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEY
: ::.:... :::.:: :: .: . :: ..:.:::::::::.:::: : :. .:::
CCDS55 DLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DGPQRDAQAAREFILKMFVDLNPDSD-KIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLK
: . .:: .: .: ::: .: : ::.::::::::.:..::: :: :.:.. :::
CCDS55 AGSNTYEEAA-AYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLK
300 310 320 330 340
pF1KB8 EYNLV
. .:
CCDS55 DCGLF
350
>>CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 1113 init1: 837 opt: 1144 Z-score: 1312.5 bits: 251.4 E(32554): 8.7e-67
Smith-Waterman score: 1144; 52.9% identity (76.2% similar) in 357 aa overlap (7-358:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
:.: :: : : : . . :.:.::.: . : .:.::::::.:::::::..:::.
CCDS80 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVDVEK
::: .:::... . . .::.: . .. :.:::: ::: . . :.:. .:.. :
CCDS80 IIHEDGYSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFG---EAARADDARQLFVLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 VSAFEN---PYV-DAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPTQ
:: :. : . .:: :: : :.: :..: :::::.::..::::::::... :.:::
CCDS80 GSAEEGVMTPELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QDVLRVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYD
:::::.:: ::::.: : .... :.: :::::::::.:::::::.::.:.: ::::.::
CCDS80 QDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 QVLVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEYD
::.:... :::.:: :: .: . :: ..:.:::::::::.:::: : :. .:::
CCDS80 LVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 GPQRDAQAAREFILKMFVDLNPDSD-KIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKE
: . .:: .: .: ::: .: : ::.::::::::.:..::: :: :.:.. ::::
CCDS80 GSNTYEEAA-AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKE
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 YNLV
.:
CCDS80 CGLY
>>CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 (354 aa)
initn: 1113 init1: 709 opt: 1143 Z-score: 1311.3 bits: 251.2 E(32554): 1e-66
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CCDS10 Y
>>CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (355 aa)
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Smith-Waterman score: 1142; 50.7% identity (76.1% similar) in 355 aa overlap (7-358:1-354)
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 LV
:
CCDS28 LF
>>CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 (354 aa)
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CCDS10 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMK
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CCDS10 IIHEDGFSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRM
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CCDS10 EDTEPFSAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQD
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CCDS10 ILRTRVKTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQV
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pF1KB8 V
CCDS10 Y
>>CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 1096 init1: 825 opt: 1110 Z-score: 1273.7 bits: 244.2 E(32554): 1.3e-64
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CCDS80 VLRSRVKTTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]