Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8432
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8432, 933 aa
1>>>pF1KB8432 933 - 933 aa - 933 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4594+/-0.000829; mu= 20.1708+/- 0.050
mean_var=63.7470+/-12.608, 0's: 0 Z-trim(106.4): 15 B-trim: 523 in 1/50
Lambda= 0.160637
statistics sampled from 8954 (8960) to 8954 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 4.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11057.1 PLD2 gene_id:5338|Hs108|chr17 ( 933) 6328 1475.6 0
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CCDS46957.1 PLD1 gene_id:5337|Hs108|chr3 (1036) 1842 436.0 1.8e-121
>>CCDS11057.1 PLD2 gene_id:5338|Hs108|chr17 (933 aa)
initn: 6328 init1: 6328 opt: 6328 Z-score: 7913.7 bits: 1475.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6328; 99.8% identity (99.8% similar) in 933 aa overlap (1-933:1-933)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTATPESLFPTGDELDSSQLQMESDEVDTLKEGEDPADRMHPFLAIYELQSLKVHPLVFA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS11 MSLLPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAASKQKYLENYLNRLLTMSFYR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGVRIDTSHRSLILKCSSYRQAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIF
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKRAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTDLGDSSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRMPW
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS11 RDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPTYPYLLPKSTSTANQLPFTLPGGQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 CTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 IVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 GKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRDPICD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRDPICD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 DFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KB8 GHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
910 920 930
>>CCDS58507.1 PLD2 gene_id:5338|Hs108|chr17 (922 aa)
initn: 5486 init1: 5486 opt: 5486 Z-score: 6859.2 bits: 1280.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6209; 98.5% identity (98.6% similar) in 933 aa overlap (1-933:1-922)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTATPESLFPTGDELDSSQLQMESDEVDTLKEGEDPADRMHPFLAIYELQSLKVHPLVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MTATPESLFPTGDELDSSQLQMESDEVDTLKEGEDPADRMHPFLAIYELQSLKVHPLVFA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MSLLPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAASKQKYLENYLNCLLTMSFYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS58 MSLLPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAASKQKYLENYLNRLLTMSFYR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGVRIDTSHRSLILKCSSYRQAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGVRIDTSHRSLILKCSSYRQAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 WWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKRAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTDLGDSSE
430 440 450 460 470 480
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pF1KB8 SAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRMPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRMPW
490 500 510 520 530 540
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPTYPYLLPKSTSTANQLPFTLPGGQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 CTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 IVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 GKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRDPICD
::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::
CCDS58 GKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAG-----------SVILGANTRPDLDLRDPICD
790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 DFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQ
830 840 850 860 870 880
910 920 930
pF1KB8 GHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
890 900 910 920
>>CCDS3216.1 PLD1 gene_id:5337|Hs108|chr3 (1074 aa)
initn: 3060 init1: 1041 opt: 1846 Z-score: 2299.1 bits: 436.9 E(32554): 9.6e-122
Smith-Waterman score: 3257; 52.1% identity (72.8% similar) in 968 aa overlap (93-933:109-1074)
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVLMS
::.:.: .:.:..::::.::.::..:...
CCDS32 CPIKAQVLEVERFTSTTRVPSINLYTIELTHGEFKWQVKRKFKHFQEFHRELLKYKAFIR
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KB8 L-LPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAA--SKQKYLENYLNCLLTMSFY
. .: : . . .:. ::::::::.. :. :. ...: ::.::. .: : .:
CCDS32 IPIPTRRHTFRRQNVREEP-REMPSLPRSS-ENMIREEQFLGRRKQLEDYLTKILKMPMY
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 RNYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLV
::::: ::::..:::::: ::: ::.:::: :::::::.:::.:::. ..:::::::::.
CCDS32 RNYHATTEFLDISQLSFIHDLGPKGIEGMIMKRSGGHRIPGLNCCGQGRACYRWSKRWLI
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VKDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGVRIDTSHRSLILKCSSYRQA
::::::::: ..:::.:: : : :...:::. ::...:.:::. :.:::::.:::.:
CCDS32 VKDSFLLYMKPDSGAIAFVLLVDKEFKIKVGKKETETKYGIRIDNLSRTLILKCNSYRHA
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 RWWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEI
:::. : :. : : .::. :: ::: . ..::.:.::. ::: ::.:. .:.:::
CCDS32 RWWGGAIEEFIQKHGTNFLKDHRFGSYAAIQENALAKWYVNAKGYFEDVANAMEEANEEI
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 FITDWWLSPEVYLKRPA-HSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKR
::::::::::..::::. ... :::: .:::::..:::. :.:.::::::::::: :.::
CCDS32 FITDWWLSPEIFLKRPVVEGNRWRLDCILKRKAQQGVRIFIMLYKEVELALGINSEYTKR
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 ALMLLHPNIKVMRHPDQVT----LWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTD
.:: ::::::::::::.:. ::::::::...:: :::.::.::::::::: ..::::
CCDS32 TLMRLHPNIKVMRHPDHVSSTVYLWAHHEKLVIIDQSVAFVGGIDLAYGRWDDNEHRLTD
440 450 460 470 480 490
480 490
pF1KB8 LGD-----SSESAASQPPT--------------------------------------PRP
.:. :. : .: ::. ::
CCDS32 VGSVKRVTSGPSLGSLPPAAMESMESLRLKDKNEPVQNLPIQKSIDDVDSKLKGIGKPRK
500 510 520 530 540 550
500
pF1KB8 ------------------DSPATPDLSHNQF-----------------------------
:: .. : . . :
CCDS32 FSKFSLYKQLHRHHLHDADSISSIDSTSSYFNHYRSHHNLIHGLKPHFKLFHPSSESEQG
560 570 580 590 600 610
510 520 530
pF1KB8 --------------------------FWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRM
:: :::: :.. :::::::.:: ::::: .::::
CCDS32 LTRPHADTGSIRSLQTGVGELHGETRFWHGKDYCNFVFKDWVQLDKPFADFIDRYSTPRM
620 630 640 650 660 670
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 PWRDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPIYPYLLPKSTSTANQLPFTLPG
::.:.. .::: :::.:::::::::::: :.::.. ::.::::: .::..: . .::
CCDS32 PWHDIASAVHGKAARDVARHFIQRWNFTKIMKSKYRSLSYPFLLPKSQTTAHELRYQVPG
680 690 700 710 720 730
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 GQCTTVQVLRSVDRWSAGTL--ENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNK
. ..::.:::. :::: :.:: ::.:.:..:.:..::::::::::.: ..:.::
CCDS32 SVHANVQLLRSAADWSAGIKYHEESIHAAYVHVIENSRHYIYIENQFFISCADDKVVFNK
740 750 760 770 780 790
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 VGDEIVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYS
.:: :..::::::... :::::..::::::::::::::::..:::.::.:::.:::: :
CCDS32 IGDAIAQRILKAHRENQKYRVYVVIPLLPGFEGDISTGGGNALQAIMHFNYRTMCRGENS
800 810 820 830 840 850
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 ILHRLKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANIND
:: .::: .:. : .:::.::::::.:: :. :.::::.:::.::::: :::::::::::
CCDS32 ILGQLKAELGNQWINYISFCGLRTHAELEGNLVTELIYVHSKLLIADDNTVIIGSANIND
860 870 880 890 900 910
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 RSLLGKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRD
::.:::::::.::...:::: ::.:.: :::::::: .:: .:: :.:: :. :..:
CCDS32 RSMLGKRDSEMAVIVQDTETVPSVMDGKEYQAGRFARGLRLQCFRVVLGYLDDPSEDIQD
920 930 940 950 960 970
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 PICDDFFQ-LWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSE
:. : ::. .: . : ::.::...:::::.. ...: ::... :: .: :. :
CCDS32 PVSDKFFKEVWVSTAARNATIYDKVFRCLPNDEVHNLIQLRDFINKPVLAKEDPIRAEEE
980 990 1000 1010 1020 1030
900 910 920 930
pF1KB8 LTQVQGHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
: ...: ::.::. :: .::::: .:.::...:.::::
CCDS32 LKKIRGFLVQFPFYFLSEESLLPSVGTKEAIVPMEVWT
1040 1050 1060 1070
>>CCDS46957.1 PLD1 gene_id:5337|Hs108|chr3 (1036 aa)
initn: 3271 init1: 1041 opt: 1842 Z-score: 2294.4 bits: 436.0 E(32554): 1.8e-121
Smith-Waterman score: 3426; 53.7% identity (75.7% similar) in 964 aa overlap (59-933:75-1036)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 TLKEGEDPADRMHPFLAIYELQSLKVHPLVFAPGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYS
. : :. :::. .::.:: ..: . .::.
CCDS46 SPSDPKIQEVYIPFSAIYNTQGFKEPNIQTYLSGCPIKAQVLEVERFTSTTRVPSINLYT
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 VRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVLMSL-LPLARFAVAYSPARDAGNREMPSL
..::::.:.: .:.:..::::.::.::..:... . .: : . . .:. ::::::
CCDS46 IELTHGEFKWQVKRKFKHFQEFHRELLKYKAFIRIPIPTRRHTFRRQNVREEP-REMPSL
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 PRAGPEGSTRHAA--SKQKYLENYLNCLLTMSFYRNYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGL
::.. :. :. ...: ::.::. .: : .:::::: ::::..:::::: ::: ::.
CCDS46 PRSS-ENMIREEQFLGRRKQLEDYLTKILKMPMYRNYHATTEFLDISQLSFIHDLGPKGI
170 180 190 200 210 220
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