Result of FASTA (omim) for
pF1KB8418
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8418, 809 aa
1>>>pF1KB8418 809 - 809 aa - 809 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3495+/-0.00112; mu= 18.7421+/- 0.070
mean_var=355.1532+/-70.412, 0's: 0 Z-trim(107.1): 2161 B-trim: 75 in 1/53
Lambda= 0.068056
statistics sampled from 12790 (15178) to 12790 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.428), E-opt: 0.2 (0.178), width: 16
Scan time: 8.540
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 5751 581.3 5.8e-165
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 5751 581.3 5.8e-165
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 5708 577.1 1.1e-163
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 5296 536.5 1.6e-151
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 5296 536.5 1.6e-151
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 3857 395.4 5.6e-109
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 3830 393.0 4.1e-108
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 3815 391.3 9.9e-108
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 3654 375.7 6.4e-103
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 3654 375.7 6.4e-103
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 3489 359.5 4.8e-98
XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 3473 357.6 1.2e-97
XP_016867772 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 3473 357.6 1.2e-97
XP_016867774 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 3473 357.6 1.2e-97
XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 3473 357.6 1.2e-97
NP_057304 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 i ( 783) 3473 357.6 1.2e-97
NP_001013768 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 783) 3473 357.6 1.2e-97
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 3450 355.7 6.9e-97
NP_001269289 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 820) 3430 353.4 2.3e-96
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 3355 346.3 4.3e-94
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 3355 346.3 4.3e-94
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 3145 325.7 7.2e-88
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 3141 325.4 9.8e-88
NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 3094 320.2 1.8e-86
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 3021 313.0 2.5e-84
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2947 305.8 3.9e-82
NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2919 303.0 2.6e-81
XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2919 303.0 2.6e-81
NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2919 303.0 2.6e-81
NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2919 303.0 2.6e-81
XP_011526745 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2919 303.0 2.6e-81
XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2919 303.0 2.6e-81
XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2919 303.0 2.6e-81
XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2919 303.0 2.6e-81
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 2841 295.3 5.1e-79
NP_001265593 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 586) 2734 284.8 7.5e-76
>>NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 isofor (809 aa)
initn: 5751 init1: 5751 opt: 5751 Z-score: 3082.6 bits: 581.3 E(85289): 5.8e-165
Smith-Waterman score: 5751; 99.9% identity (100.0% similar) in 809 aa overlap (1-809:1-809)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGPLTFMDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MGPLTFMDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKNVHLKKDHKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKNVHLKKDHKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCKECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCKECG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 WSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 WSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFTNLTTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_003 LTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 KRIHTAEKFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKLTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KRIHTAEKFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKLTH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 TGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 PYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYKC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 EECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 KAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 WSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 WSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTH
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB8 NKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
790 800
>>NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 iso (818 aa)
initn: 5751 init1: 5751 opt: 5751 Z-score: 3082.6 bits: 581.3 E(85289): 5.8e-165
Smith-Waterman score: 5751; 99.9% identity (100.0% similar) in 809 aa overlap (1-809:10-818)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGPLTFMDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPGHPGSWEMGPLTFMDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPD
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 LITCLEQEKEPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LITCLEQEKEPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VHLKKDHKSVDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHLKKDHKSVDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KLFKCKECGKSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLFKCKECGKSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 CEECGKVFNWSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CEECGKVFNWSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKEC
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 AKAFNQSSNLTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKAFNQSSNLTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 NQFTNLTTHKRIHTAEKFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSS
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQFSNLTTHKRIHTAEKFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KLTEHKLTHTGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLTEHKLTHTGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTT
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 HKRIHTAEKPYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HKRIHTAEKPYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKIT
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 HTGEKPYKCEECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTGEKPYKCEECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 KFYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KFYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYK
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 CEECGKAFKWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CEECGKAFKWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKC
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 GKAFNRSSNLIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKAFNRSSNLIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAF
730 740 750 760 770 780
780 790 800
pF1KB8 NQYSNLTTHNKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQYSNLTTHNKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
790 800 810
>>NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 iso (803 aa)
initn: 5708 init1: 5708 opt: 5708 Z-score: 3059.8 bits: 577.1 E(85289): 1.1e-163
Smith-Waterman score: 5708; 99.9% identity (100.0% similar) in 803 aa overlap (7-809:1-803)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGPLTFMDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKNVHLKKDHKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKNVHLKKDHKS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCKECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCKECG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 WSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFTNLTTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_001 LTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTH
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XP_016 LIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTH
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pF1KB8 NKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
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XP_016 NKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
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pF1KB8 MGPLTFMDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEK
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XP_011 MDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEK
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pF1KB8 EPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKNVHLKKDHKS
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XP_011 EPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKNVHLKKDHKS
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XP_011 VDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCKECG
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pF1KB8 KSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFN
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XP_011 KSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFN
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pF1KB8 WSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSN
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XP_011 WSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSN
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XP_011 LTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEK
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XP_011 NKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
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XP_016 NKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
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XP_016 TGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEK
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pF1KB8 PYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB8 EECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECG
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pF1KB8 KAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB8 LIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB8 NKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
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XP_016 NKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
780 790 800
>>XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger pro (803 aa)
initn: 5708 init1: 5708 opt: 5708 Z-score: 3059.8 bits: 577.1 E(85289): 1.1e-163
Smith-Waterman score: 5708; 99.9% identity (100.0% similar) in 803 aa overlap (7-809:1-803)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGPLTFMDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEK
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pF1KB8 EPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKNVHLKKDHKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKNVHLKKDHKS
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 VDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCKECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCKECG
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pF1KB8 KSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 WSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFTNLTTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
XP_011 LTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTH
300 310 320 330 340 350
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pF1KB8 KRIHTAEKFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKLTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KRIHTAEKFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKLTH
360 370 380 390 400 410
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pF1KB8 TGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEK
420 430 440 450 460 470
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pF1KB8 PYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYKC
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XP_011 PYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYKC
480 490 500 510 520 530
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pF1KB8 EECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECG
540 550 560 570 580 590
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pF1KB8 KAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFK
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XP_011 KAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFK
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pF1KB8 WSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSN
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XP_011 WSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSN
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pF1KB8 LIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTH
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XP_011 LIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTH
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XP_011 NKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
780 790 800
809 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]