Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8406
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8406, 261 aa
1>>>pF1KB8406 261 - 261 aa - 261 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5948+/-0.00168; mu= 10.3784+/- 0.098
mean_var=225.0470+/-44.806, 0's: 0 Z-trim(105.7): 957 B-trim: 17 in 1/49
Lambda= 0.085494
statistics sampled from 7562 (8589) to 7562 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 2.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9257.1 ZNF664 gene_id:144348|Hs108|chr12 ( 261) 1932 251.3 5e-67
CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10 ( 458) 1178 158.7 6.8e-39
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 1161 157.0 4.3e-38
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 1161 157.0 4.3e-38
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 1156 156.1 5.2e-38
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1153 155.6 5.8e-38
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 1148 155.2 1.1e-37
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 1145 154.9 1.5e-37
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 1145 154.9 1.5e-37
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 1145 154.9 1.6e-37
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1144 154.8 1.7e-37
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1140 154.1 1.9e-37
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 1134 153.3 3.2e-37
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1128 152.6 5.5e-37
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 1127 152.4 5.7e-37
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1127 152.6 6.3e-37
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1126 152.4 6.5e-37
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 1126 152.4 6.5e-37
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1126 152.4 6.7e-37
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1126 152.4 6.8e-37
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1127 152.7 7.1e-37
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1125 152.3 7.4e-37
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1125 152.3 7.6e-37
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1123 152.1 8.8e-37
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 1124 152.3 9.4e-37
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 1121 151.7 9.7e-37
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 1123 152.2 1e-36
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 1123 152.2 1e-36
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1122 152.0 1e-36
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1121 151.9 1.1e-36
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 1121 151.9 1.1e-36
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1121 152.0 1.3e-36
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1120 151.8 1.3e-36
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1119 151.6 1.3e-36
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1120 151.9 1.3e-36
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 1114 150.6 1.4e-36
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1118 151.6 1.5e-36
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1118 151.6 1.5e-36
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1117 151.4 1.5e-36
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 1115 151.0 1.6e-36
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1113 150.8 2.1e-36
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1113 150.9 2.1e-36
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1113 150.9 2.2e-36
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1113 150.9 2.2e-36
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1112 150.7 2.4e-36
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1112 150.8 2.4e-36
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1108 149.9 2.4e-36
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1112 150.8 2.4e-36
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 533) 1110 150.4 2.5e-36
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1108 150.0 2.7e-36
>>CCDS9257.1 ZNF664 gene_id:144348|Hs108|chr12 (261 aa)
initn: 1932 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 1316.9 bits: 251.3 E(32554): 5e-67
Smith-Waterman score: 1932; 100.0% identity (100.0% similar) in 261 aa overlap (1-261:1-261)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHKCDKCDKGFFHISELHIHWRDHTGEKVYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHKCDKCDKGFFHISELHIHWRDHTGEKVYK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 CDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYECGKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 CDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYECGKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSEC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAFRHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAFRHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQST
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KB8 SLCIHQRVHTKERNHLKISVI
:::::::::::::::::::::
CCDS92 SLCIHQRVHTKERNHLKISVI
250 260
>>CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10 (458 aa)
initn: 4092 init1: 1150 opt: 1178 Z-score: 811.8 bits: 158.7 E(32554): 6.8e-39
Smith-Waterman score: 1178; 63.2% identity (83.6% similar) in 250 aa overlap (3-252:207-456)
10 20 30
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHK
:.: .: . ::. ..:..::. :: :::.:
CCDS41 KPCDHNNCGKILNTSPDGHPYEKIHTAEKQYECSQCGKNFSQSSELLLHQRDHTEEKPYK
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 CDKCDKGFFHISELHIHWRDHTGEKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYEC
:..: ::: . : : :: :: :: :::: ::: :. ...: :. .:: :::::: .:
CCDS41 CEQCGKGFTRSSSLLIHQAVHTDEKPYKCDKCGKGFTRSSSLLIHHAVHTGEKPYKCDKC
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAF
::.:. ::.:.::.::::::::: : ::: .::. ::: .::::::::.:.:: ::::.:
CCDS41 GKGFSQSSKLHIHQRVHTGEKPYECEECGMSFSQRSNLHIHQRVHTGERPYKCGECGKGF
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 RHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQSS
..:.: .:. .:::::::.::::::.:::::.: :: :::::::::.: :::.:::::
CCDS41 SQSSNLHIHRCIHTGEKPYQCYECGKGFSQSSDLRIHLRVHTGEKPYHCGKCGKGFSQSS
360 370 380 390 400 410
220 230 240 250 260
pF1KB8 SLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
.: :::::::::::..:..:::.::::..: :::::: :.
CCDS41 KLLIHQRVHTGEKPYECSKCGKGFSQSSNLHIHQRVHKKDPR
420 430 440 450
>>CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 (907 aa)
initn: 5393 init1: 1161 opt: 1161 Z-score: 797.5 bits: 157.0 E(32554): 4.3e-38
Smith-Waterman score: 1161; 63.3% identity (81.0% similar) in 248 aa overlap (3-250:519-766)
10 20 30
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHK
::: .: . :..:. : .::..::.:::.:
CCDS12 GEKPRKEHGNGFNWSSKLKDHQRVHTGQKPYKCNICGKGFNHRSVLNVHQRVHTGEKPYK
490 500 510 520 530 540
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 CDKCDKGFFHISELHIHWRDHTGEKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYEC
:..::::: . : :. : : ::::: :::..::: :: .. :. :...:: :::::: ::
CCDS12 CEECDKGFSRSSYLQAHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSRNSYLQGHQRVHTGEKPYKCEEC
550 560 570 580 590 600
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAF
::.:. ::::: :.::::::::. : :::.::: : :: .::::::::::.:::::::.:
CCDS12 GKGFSRSSHLQGHQRVHTGEKPFKCEECGKGFSWSFNLQIHQRVHTGEKPYKCEECGKGF
610 620 630 640 650 660
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 RHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQSS
..:.: :::::::::::.: ::::.::: : : :: ::.::.:: : :::.::: .
CCDS12 SKASTLLAHQRVHTGEKPYQCDECGKSFSQRSYLQSHQSVHSGERPYICEVCGKGFSQRA
670 680 690 700 710 720
220 230 240 250 260
pF1KB8 SLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
: :::::: ::.::. :::.::::. : :.::::
CCDS12 YLQGHQRVHTRVKPYKCEMCGKGFSQSSRLEAHRRVHTGGKPYKCEVCTKGFSESSRLQA
730 740 750 760 770 780
CCDS12 HQRVHVEGRPYKCEQCGKGFSGYSSLQAHHRVHTGEKPYKCEVCGKGFSQRSNLQAHQRV
790 800 810 820 830 840
>--
initn: 1085 init1: 561 opt: 566 Z-score: 400.8 bits: 83.6 E(32554): 5.3e-16
Smith-Waterman score: 566; 59.8% identity (77.3% similar) in 132 aa overlap (111-242:767-898)
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 HTVEKPYKCYECGKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGE
: ::: : : .:::.:: : :::::.
CCDS12 HTRVKPYKCEMCGKGFSQSSRLEAHRRVHTGGKPYKCEVCTKGFSESSRLQAHQRVHVEG
740 750 760 770 780 790
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 KPFKCEECGKAFRHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYR
.:.:::.:::.: ::: :.::::::::::: :::.::: :.: :::::::::::.
CCDS12 RPYKCEQCGKGFSGYSSLQAHHRVHTGEKPYKCEVCGKGFSQRSNLQAHQRVHTGEKPYK
800 810 820 830 840 850
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 CCGCGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISV
: .:::.: ::.: ::::::...: .: .. :: . .: .:
CCDS12 CDACGKGFRWSSGLLIHQRVHSSDKFYKSEDYGKDYPSSENLHRNEDSVLF
860 870 880 890 900
pF1KB8 I
>--
initn: 1245 init1: 461 opt: 541 Z-score: 384.2 bits: 80.5 E(32554): 4.5e-15
Smith-Waterman score: 541; 42.7% identity (65.7% similar) in 213 aa overlap (14-226:308-518)
10 20 30 40
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHKCDKCDKGFFHI
: . : .:..:: ::: :: . ..: :
CCDS12 KPYTYSSCGKGCNYSSLLHIHQNIEREDDIENSHLKSYQRVHTEEKPCKCGEYGENFNHC
280 290 300 310 320 330
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 SELHIHWRDHTGEKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYECGKAFNWSSHLQ
: :. . :::: :. . : :: . :: ..:: ..:.. : ..:: :: ::
CCDS12 SPLNTYELIHTGEMSYRHNIYEKAFSHSLDLNSIFRVHTRDEPHEYEENENVFNQSSCLQ
340 350 360 370 380 390
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 IHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAFRHTSSLCMHQR
.:...:: :: :. : :..: :::: ...::: :. .. ::::..: .: . :
CCDS12 VHQKIHTEEKLYTDIEYGKSFICSSNLDIQHRVHMEENSYNSEECGNGFSLASHFQDLQI
400 410 420 430 440 450
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQSSSLCIHQRVHTG
::: :.::: : :...::.. : : ..: :::: . : : :. ::.: :::::::
CCDS12 VHTKEQPYKRYVCSNSFSHNLYLQGHPKIHIGEKPRKEHGNG--FNWSSKLKDHQRVHTG
460 470 480 490 500 510
230 240 250 260
pF1KB8 EKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
.::
CCDS12 QKPYKCNICGKGFNHRSVLNVHQRVHTGEKPYKCEECDKGFSRSSYLQAHQRVHTGEKPY
520 530 540 550 560 570
>>CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 (913 aa)
initn: 5393 init1: 1161 opt: 1161 Z-score: 797.4 bits: 157.0 E(32554): 4.3e-38
Smith-Waterman score: 1161; 63.3% identity (81.0% similar) in 248 aa overlap (3-250:525-772)
10 20 30
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHK
::: .: . :..:. : .::..::.:::.:
CCDS54 GEKPRKEHGNGFNWSSKLKDHQRVHTGQKPYKCNICGKGFNHRSVLNVHQRVHTGEKPYK
500 510 520 530 540 550
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 CDKCDKGFFHISELHIHWRDHTGEKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYEC
:..::::: . : :. : : ::::: :::..::: :: .. :. :...:: :::::: ::
CCDS54 CEECDKGFSRSSYLQAHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSRNSYLQGHQRVHTGEKPYKCEEC
560 570 580 590 600 610
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAF
::.:. ::::: :.::::::::. : :::.::: : :: .::::::::::.:::::::.:
CCDS54 GKGFSRSSHLQGHQRVHTGEKPFKCEECGKGFSWSFNLQIHQRVHTGEKPYKCEECGKGF
620 630 640 650 660 670
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 RHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQSS
..:.: :::::::::::.: ::::.::: : : :: ::.::.:: : :::.::: .
CCDS54 SKASTLLAHQRVHTGEKPYQCDECGKSFSQRSYLQSHQSVHSGERPYICEVCGKGFSQRA
680 690 700 710 720 730
220 230 240 250 260
pF1KB8 SLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
: :::::: ::.::. :::.::::. : :.::::
CCDS54 YLQGHQRVHTRVKPYKCEMCGKGFSQSSRLEAHRRVHTGGKPYKCEVCTKGFSESSRLQA
740 750 760 770 780 790
CCDS54 HQRVHVEGRPYKCEQCGKGFSGYSSLQAHHRVHTGEKPYKCEVCGKGFSQRSNLQAHQRV
800 810 820 830 840 850
>--
initn: 1085 init1: 561 opt: 566 Z-score: 400.8 bits: 83.6 E(32554): 5.3e-16
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90 100 110 120 130 140
pF1KB8 HTVEKPYKCYECGKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGE
: ::: : : .:::.:: : :::::.
CCDS54 HTRVKPYKCEMCGKGFSQSSRLEAHRRVHTGGKPYKCEVCTKGFSESSRLQAHQRVHVEG
750 760 770 780 790 800
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 KPFKCEECGKAFRHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYR
.:.:::.:::.: ::: :.::::::::::: :::.::: :.: :::::::::::.
CCDS54 RPYKCEQCGKGFSGYSSLQAHHRVHTGEKPYKCEVCGKGFSQRSNLQAHQRVHTGEKPYK
810 820 830 840 850 860
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 CCGCGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISV
: .:::.: ::.: ::::::...: .: .. :: . .: .:
CCDS54 CDACGKGFRWSSGLLIHQRVHSSDKFYKSEDYGKDYPSSENLHRNEDSVLF
870 880 890 900 910
pF1KB8 I
>--
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10 20 30 40
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHKCDKCDKGFFHI
: . : .:..:: ::: :: . ..: :
CCDS54 KPYTYSSCGKGCNYSSLLHIHQNIEREDDIENSHLKSYQRVHTEEKPCKCGEYGENFNHC
290 300 310 320 330 340
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 SELHIHWRDHTGEKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYECGKAFNWSSHLQ
: :. . :::: :. . : :: . :: ..:: ..:.. : ..:: :: ::
CCDS54 SPLNTYELIHTGEMSYRHNIYEKAFSHSLDLNSIFRVHTRDEPHEYEENENVFNQSSCLQ
350 360 370 380 390 400
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 IHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAFRHTSSLCMHQR
.:...:: :: :. : :..: :::: ...::: :. .. ::::..: .: . :
CCDS54 VHQKIHTEEKLYTDIEYGKSFICSSNLDIQHRVHMEENSYNSEECGNGFSLASHFQDLQI
410 420 430 440 450 460
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQSSSLCIHQRVHTG
::: :.::: : :...::.. : : ..: :::: . : : :. ::.: :::::::
CCDS54 VHTKEQPYKRYVCSNSFSHNLYLQGHPKIHIGEKPRKEHGNG--FNWSSKLKDHQRVHTG
470 480 490 500 510 520
230 240 250 260
pF1KB8 EKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
.::
CCDS54 QKPYKCNICGKGFNHRSVLNVHQRVHTGEKPYKCEECDKGFSRSSYLQAHQRVHTGEKPY
530 540 550 560 570 580
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10 20 30
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHKCDKCD
: . .:. . : .::..: .::: ::..:
CCDS31 CNACGKSFSQISSLHNHQRVHTEEKFYKIECDKDLSRNSLLHIHQRLHIGEKPFKCNQCG
310 320 330 340 350 360
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 KGFFHISELHIHWRDHTGEKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYECGKAFN
:.: . : ::.: : ::::: ::::.::: :: ...: :. .:: :: ::: .:::.:.
CCDS31 KSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSQSSNLRIHQLVHTGEKSYKCEDCGKGFT
370 380 390 400 410 420
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 WSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAFRHTSS
:.::::.::::::::: :..::. ::.::.: .::::::::::. : ::::.: ..:.
CCDS31 QRSNLQIHQRVHTGEKPYKCDDCGKDFSHSSDLRIHQRVHTGEKPYTCPECGKGFSKSSK
430 440 450 460 470 480
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 LCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQSSSLCIH
: ::::::::::::: ::::.::: : : ::::::::::::.: :::.::.::.: ::
CCDS31 LHTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQRSHLLIHQRVHTGEKPYKCHDCGKGFSHSSNLHIH
490 500 510 520 530 540
220 230 240 250 260
pF1KB8 QRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
:::::::::..: .:::.::.:..: ::::::. :.
CCDS31 QRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALRIHQRVHAGEKPYKCREYYKGFDHNSHLHNNHRRG
550 560 570 580 590 600
CCDS31 NL
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10 20 30
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPH
::.: .: . ::. ..:. ::.:::.:::.
CCDS44 KRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKKIYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPY
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40 50 60 70 80 90
pF1KB8 KCDKCDKGFFHISELHIHWRDHTGEKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYE
::. : : :.. : : .: : ::::: :::..::: :: . .:. :.. :: ::::.: :
CCDS44 KCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKE
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 CGKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKA
:::::. .: : : :.::::::: :.:::..:..: :: .:::.::::::..:.:::::
CCDS44 CGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKA
200 210 220 230 240 250
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pF1KB8 FRHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQS
: .. : .::: :::::::.: .::::::.::.: .::: :::::::.: :::.::::
CCDS44 FSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQS
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260
pF1KB8 SSLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
. : :::.:.: :::.:.:::::::...:: :.:.:: :.
CCDS44 TYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLT
320 330 340 350 360 370
CCDS44 VHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQR
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>--
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120 130 140 150 160 170
pF1KB8 EKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAFRHTSSLCMHQRVHTGEKPY
:..: ::: : ::: .:: .:::::::
CCDS44 VKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPY
330 340 350 360 370 380
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pF1KB8 KCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPFKCDE
.: :::::::::. : :::.:::::::.: ::::: ..::: .:::.::::::..:.:
CCDS44 ECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNE
390 400 410 420 430 440
240 250 260
pF1KB8 CGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
::::::.::.: :::.::
CCDS44 CGKAFSRSTNLTRHQRTHT
450 460
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Smith-Waterman score: 1148; 61.8% identity (80.9% similar) in 251 aa overlap (3-253:276-526)
10 20 30
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHK
::: : ::.:. : .: :.::..::.:
CCDS12 NPYKYEECGRNVGKSSHCQAPLIVHTGEKPYKCEECGVGFSQRSYLQVHLKVHTGKKPYK
250 260 270 280 290 300
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pF1KB8 CDKCDKGFFHISELHIHWRDHTGEKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYEC
:..: :.: :.:. : : ::::: :::. :::.:: ...:: : .::: :::::: ::
CCDS12 CEECGKSFSWRSRLQAHERIHTGEKPYKCNACGKSFSYSSHLNIHCRIHTGEKPYKCEEC
310 320 330 340 350 360
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pF1KB8 GKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAF
::.:. .:::: :. ::::::: : :::.:: .::: ::: ::::::..:. :::.:
CCDS12 GKGFSVGSHLQAHQISHTGEKPYKCEECGKGFCRASNLLDHQRGHTGEKPYQCDACGKGF
370 380 390 400 410 420
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pF1KB8 RHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGKAFSQSS
..:.. .: ::::::::::: ::::.:::.:.: ::: :::::::.: :::.::.::
CCDS12 SRSSDFNIHFRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLLAHQRGHTGEKPYKCGTCGKGFSRSS
430 440 450 460 470 480
220 230 240 250 260
pF1KB8 SLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
.: .: :.::::::.::..::::::: .:: .:::::: :.
CCDS12 DLNVHCRIHTGEKPYKCERCGKAFSQFSSLQVHQRVHTGEKPYQCAECGKGFSVGSQLQA
490 500 510 520 530 540
CCDS12 HQRCHTGEKPYQCEECGKGFCRASNFLAHRGVHTGEKPYRCDVCGKRFRQRSYLQAHQRV
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>--
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pF1KB8 EKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYECGKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPY
::.: ::::.:. .:.:: :.: :::::::
CCDS12 EKPYKCERCGKAFSQFSSLQVHQRVHTGEKPYQCAECGKGFSVGSQLQAHQRCHTGEKPY
500 510 520 530 540 550
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pF1KB8 VCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAFRHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYE
: :::.:: .::. :. :::::::..:. ::: ::. : : ::::::::.:::: :
CCDS12 QCEECGKGFCRASNFLAHRGVHTGEKPYRCDVCGKRFRQRSYLQAHQRVHTGERPYKCEE
560 570 580 590 600 610
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:::.:: :: : :::::::::::.: :::.:: :::: ::::::. :.: : .:
CCDS12 CGKVFSWSSYLQAHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSWSSSLIIHQRVHADDEGDKDFPSSED
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CCDS12 SHRKTR
680
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10 20 30
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHK
::: : . :: .: ::..::.:::.:
CCDS33 KPYKCGDCGKRFSCSSNLHTHQRVHTEEKPYKCDECGKCFSLSFNLHSHQRVHTGEKPYK
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:..: ::: : .. : : ::::: ..:. ::: :: .. .. :...:: :::::: :
CCDS33 CEECGKGFSSASSFQSHQRVHTGEKPFRCNVCGKGFSQSSYFQAHQRVHTGEKPYKCEVC
490 500 510 520 530 540
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:: :::: .:. :.::::::::: : :::.:::..::: :: ::::::::::. : : :
CCDS33 GKRFNWSLNLHNHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLQAHQSVHTGEKPFKCDACQKRF
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..: : ::::::::::::: ::::::: :.: .:: .::::::..: ::: :: :.
CCDS33 SQASHLQAHQRVHTGEKPYKCDTCGKAFSQRSNLQVHQIIHTGEKPFKCEECGKEFSWSA
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pF1KB8 SLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
.: ::::::::::. :..:::.:::.. . :::::: :: ..
CCDS33 GLSAHQRVHTGEKPYTCQQCGKGFSQASHFHTHQRVHTGERPYICDVCCKGFSQRSHLIY
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CCDS33 HQRVHTGGNL
730
>--
initn: 812 init1: 812 opt: 849 Z-score: 590.4 bits: 118.4 E(32554): 1.5e-26
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10 20
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFM---HQK----IHT
: .: .:. .:.: :.. .:
CCDS33 FPTGKVPNSWSKIYLNETQNYQRSCKQTQMKNKLC--IFAPYVDIFSCISHHHDDNIVHK
180 190 200 210 220 230
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pF1KB8 AEKPHKCDKCDKGFFHISELHIHWRDHTGEKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKP
.: :. . : : ...: : . :::.:.:. ..: . :. ...:. ::..: .:
CCDS33 RDKVHSNSDCGKDTLKVSPL-TQRSIHTGQKTYQGNECEEAFNDSSSLELHKQVHLGKKS
240 250 260 270 280 290
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pF1KB8 YKCYECGKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCE
: : ..:: . ... :.::.: : : :::.:::.:::: ::::::::::. :.
CCDS33 PACSTHEKDTSYSSGIPVQQSVRTGKKRYWCHECGKGFSQSSNLQTHQRVHTGEKPYTCH
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pF1KB8 ECGKAFRHTSSLCMHQRVHTGEKPYKCYECGKAFSQSSSLCIHQRVHTGEKPYRCCGCGK
::::.: ..: : : .:::::::.: :::.::.:..: :: :::::::::.: :::
CCDS33 ECGKSFNQSSHLYAHLPIHTGEKPYRCDSCGKGFSRSTDLNIHCRVHTGEKPYKCEVCGK
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pF1KB8 AFSQSSSLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
.:.: : : :.:.::::::.:: .::: :: :..: ::::::.:.
CCDS33 GFTQRSHLQAHERIHTGEKPYKCGDCGKRFSCSSNLHTHQRVHTEEKPYKCDECGKCFSL
420 430 440 450 460 470
CCDS33 SFNLHSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSSASSFQSHQRVHTGEKPFRCNVCGKGFSQSSYF
480 490 500 510 520 530
>>CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 (748 aa)
initn: 10912 init1: 1145 opt: 1145 Z-score: 787.6 bits: 154.9 E(32554): 1.5e-37
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10 20 30
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHK
::: .: . ::. . :. :...::.:::.:
CCDS74 KPYKCEECGKGFTQAAHFHIHQRVHTGEKPYKCDVCGKGFSHNSPLICHRRVHTGEKPYK
360 370 380 390 400 410
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pF1KB8 CDKCDKGFFHISELHIHWRDHTGEKVYKCDDCGKDFSTTTKLNRHKKIHTVEKPYKCYEC
:. : ::: . ..::::.: ::::: ::: .::: :: ...:. :...:: :: .:: :
CCDS74 CEACGKGFTRNTDLHIHFRVHTGEKPYKCKECGKGFSQASNLQVHQNVHTGEKRFKCETC
420 430 440 450 460 470
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pF1KB8 GKAFNWSSHLQIHMRVHTGEKPYVCSECGRGFSNSSNLCMHQRVHTGEKPFKCEECGKAF
::.:. ::.:: :.::::::::: :. ::. :: :::: .:: .::::::.:::::::.:
CCDS74 GKGFSQSSKLQTHQRVHTGEKPYRCDVCGKDFSYSSNLKLHQVIHTGEKPYKCEECGKGF
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CCDS74 SWRSNLHAHQRVHSGEKPYKCEQCDKSFSQAIDFRVHQRVHTGEKPYKCGVCGKGFSQSS
540 550 560 570 580 590
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pF1KB8 SLCIHQRVHTGEKPFKCDECGKAFSQSTSLCIHQRVHTKERNHLKISVI
.: ::::::::::.::: :::.: :... ::: :: :.
CCDS74 GLQSHQRVHTGEKPYKCDVCGKGFRYSSQFIYHQRGHTGEKPYKCEECGKGFGRSLNLRH
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CCDS74 HQRVHTGEKPHICEECGKAFSLPSNLRVHLGVHTREKLFKCEECGKGFSQSARLEAHQRV
660 670 680 690 700 710
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initn: 593 init1: 593 opt: 650 Z-score: 457.7 bits: 93.8 E(32554): 3.6e-19
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MIYKCPMCREFFSERADLFMHQKIHTAEKPHKCDKCDKGFFHISELHIHW
.::. .:::: : .: .:: . .: .:
CCDS74 KSPFHEHIKTDTEPKPCKGNEYGKIISDGSNQKLPLGEKPHPCGECGRGFSYSPRLPLHP
160 170 180 190 200 210
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::::: : :: ...: :..:: :: .:.: : :: :: .. .. ::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]