Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8402
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8402, 782 aa
1>>>pF1KB8402 782 - 782 aa - 782 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1721+/-0.00147; mu= 19.8400+/- 0.089
mean_var=285.3877+/-51.198, 0's: 0 Z-trim(111.0): 928 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.075920
statistics sampled from 11013 (12050) to 11013 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16
Scan time: 3.670
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS63235.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 591) 1357 163.2 1.1e-39
>>CCDS47738.1 ZNF786 gene_id:136051|Hs108|chr7 (782 aa)
initn: 5744 init1: 5744 opt: 5744 Z-score: 3421.8 bits: 643.9 E(32554): 2.8e-184
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MAEPPRLPLTFEDVAIYFSEQEWQDLEAWQKELYKHVMRSNYETLVSLDDGLPKPELISW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IEHGGEPFRKWRESQKSGNIICSSVDMHFDPGFEEQLFWGSQQAMNSGKTKSHFQLDPES
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RCGVCGKSFRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNADGEMCFRHELTHPSHRLPQQGEKPAQCTP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CGKRSLPVDSTQARRCQHSREGPASWREGRGASSSVHSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDTEA
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CCDS47 GERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSCECGKGFVKH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
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pF1KB8 RHQRIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKLAEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RHQRIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKLAEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEAD
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pF1KB8 WS
::
CCDS47 WS
>>CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090 aa)
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pF1KB8 MAEPPRLPLTFEDVAIYFSEQEWQDLEAWQKELYKHVMRSNYETLVSLDDGLPKPELISW
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pF1KB8 IEHGGEPFRKWRESQ----KSGNIICSSVDMHFDPGFEEQLF--WGSQQAMNS--GKT--
.:.: ::. :. ..... :.. : . . : : .. .: :..
CCDS59 LEQGKEPWMVSRDVLGGWCRDSEFRCKTKDSCLPKEIYEVTSSQWVRMEKCHSLVGSSVR
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pF1KB8 -----KSHFQLDPESQCSF--GSFVSFRPDQGITLGSPQRHDARAPPPLACGPSESTLKE
:..:: . .: . ...... . : . : : : . :
CCDS59 DDWECKGQFQHQDINQERYLEKAIMTYETTPTFCLQTSLTLHHRIHP----GEKLYKSTE
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pF1KB8 GIPGPRNLDLPGLWDVPAWESTQHPWPVCGESCWENNHLVMHQRGHSKDRT---RRAWEK
. . .: .. . :. . ::.. . ..:: ::: :. .. .. .
CCDS59 CMAFKYGSELTQQQETHTGEKL-YKCKECGKAFHHFSYLVKHQRIHTGEKPCACKEYGKA
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pF1KB8 FNKRAETQMPWSSPRVQRHFRCGVCGKSFRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNADGEMCFRHE
: . .. . . .: .: :.:: . :..: ::: :.. . :
CCDS59 FISGSHLIQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIHTGDKPYECKECGKSFTSG
240 250 260 270 280 290
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: .:. . :::: .: ::: :. : :: :. : :. : : . .: :.. .:
CCDS59 STLNQHQQIHTGEKPYHCKQCGK-SFTVGSTLIRHQQIHTGEKPYDCKECGKSFAS----
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:: : . ::. : .: : .:.:::. . . : : ::::::..
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pF1KB8 CAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFRCAKC
: .: : : .: : :: : ::.:..:..:::.:. : .: :.:.::::. : .:
CCDS59 CKECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKPYDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKEC
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:..: . . ::.:::.:: :::. : ::: :: ..: :. : ::.:..:.:::..:
CCDS59 GKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYCCKECGKSFTFRSTRNRHQRIHTGEKPYNCKECGKSF
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pF1KB8 THQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQS
. : .: :.:.::.:..: .: : : ... : .:: .:. :.:..: ::::.:: .:
CCDS59 ASGSALLQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRS
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pF1KB8 KLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKA
: .: :.:.::.:..: ::..:: . . ::.::..::::.:..: :: : .:.. .
CCDS59 ALIQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTVGSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQ
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pF1KB8 HQLLHSGEMPFSC-ECGKGFVKHSKLIEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSFRLKAQLLSHQGL
:: .:.:: :..: ::::.::. : : .: : ::::::..:: : :.:: .. : .:. .
CCDS59 HQQIHTGEKPYQCQECGKAFVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRI
640 650 660 670 680 690
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pF1KB8 HTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQRIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKLAEHIRVHTKS
::::.:..: :: :.: . ...::. : :.:. .:::.: .: : .: ..::
CCDS59 HTGEKPYECKECGKSFTFCSGLIQHQQNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGE
700 710 720 730 740 750
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pF1KB8 CPAPNELDIKKRLSQLFAMIEADWS
:
CCDS59 KPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYH
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>--
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Smith-Waterman score: 1247; 45.5% identity (75.6% similar) in 332 aa overlap (425-754:757-1087)
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pF1KB8 KPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFR
..:..:::.:... : .: ..:.::: .
CCDS59 KPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYD
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pF1KB8 CAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSEC
: .::..: ... :..:: ::: :::..: ::: :: :.: : :: : ::. .::.::
CCDS59 CKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKEC
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pF1KB8 GRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGF
:..:: . : :: :.:.::.:..: .: : : ... . :.. :. :.:..: ::::.:
CCDS59 GKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFAFRSAIIQHRRIHTGEKPYDCKECGKAF
850 860 870 880 890 900
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pF1KB8 TRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSF-RLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVK
:.::::.: :.:.::.:..: ::...: :..: : .:. .::::.:..: : : .: .
CCDS59 RRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSG-LTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQR
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CCDS59 THLTLHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYDCKECGKAFRCPSQLS
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CCDS59 QHKRIHTGEKTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQR
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CCDS59 IHDLT
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CCDS54 GFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECGKGFSM
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CCDS54 KPYKCKECGKTFIKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYK
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CCDS54 CEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSVLTKHKVIHTGEKPYKCEEC
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CCDS54 GKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKAFNRSAILIKHKRIHTDEKPYKCEECGKTF
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. : .:...:.::.:..: :: : : . . . .:. :: :.:. : .:::.. . :
CCDS54 SKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPS
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CCDS54 TLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSK
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CCDS54 HKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKI
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CCDS54 HTVEKPYKCEECGKGFVMFSILAKHKVIHTGEKLYKCEECGKAYKWPSTLRYHKKIHTGE
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CCDS54 KPYKCEECGKAFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKIHTGEKL
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CCDS82 HKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGN
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CCDS82 QRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVH
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CCDS82 GKSFHRSSSLLRHQRVHTERSPYK
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CCDS42 GKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSF
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CCDS42 TLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQ
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CCDS42 RPYECRECGKFF---SSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYE
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CCDS42 CS-ECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKSFHRSSSLLRHQRVHTERSPYK
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CCDS82 NWVLISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDIL-
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CCDS82 ---HLADHQGTHHKQKLHRCEAWGNKLYDSSNR-PHQNQYLGEKPY-------RSSVEEA
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pF1KB8 TQARRCQ-H-SREGPASWREGRG--ASSSV------HSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDT--
..::. : :.:. . :. ::.. :.:.: .:. :. . : :::
CCDS82 LFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSK-PECESPFQWGDTHY
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pF1KB8 ---EALQHGAEG---------P----CSCSECGERSPMSARLASPCRAHTGEKPFQCAHC
: ..:.. : : : :::. ... :.:::..:..:..:
CCDS82 SCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGEC
230 240 250 260 270 280
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CCDS82 GKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSF
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CCDS82 SQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKG
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CCDS82 TLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQ
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CCDS33 HLANHQRIHTGVKPYMCNECGKAFSVYSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLAR
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CCDS33 HRGIHTGEKPYKCNECGKVFRHNSYLSRHQRIHTGEKPYKYNEYGKAFSEHSNLTTHQVI
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CCDS33 HTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRRVHTGGKPYQCNECGKAFSQTSKLARHQRVHTGE
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CCDS33 KPYECNQCGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYK
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CCDS33 CNECGKAFSQTSKLARHQRIHTGEKPYECGKPFSICSSLTTHQTIHTGGKPYKCNVWKVL
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